Le conseil d’administration comprend 16 membres de droit (le Recteur, le Vice-chancelier des universités, le directeur des services fiscaux pour la Région Île-de-France ainsi que les présidents des 13 universités propriétaires) et 8 membres désignés par le Recteur chancelier en raison de leur prééminence dans les domaines de l’enseignement, de la recherche, de la culture, de la finance ou de l’administration.
Les cinq destinations du budget de la Chancellerie sont : recherche et vie étudiante (Prix de la Chancellerie, Subventions laboratoires, Bourses) ; valorisation du patrimoine historique (Site Sorbonne, Domaine de Richelieu, Ensemble immobilier de Vézelay, Villa Finaly, Bibliothèque Littéraire Jacques Doucet) ; gestion des sites universitaires (Site Sorbonne, Site Sainte-Barbe, Site Le France, Cité Internationale Universitaire de Paris, 96 Boulevard Raspail, Villa Finaly, Bibliothèque Littéraire Jacques Doucet, Ilot Champollion, Jacob) ; optimisation du patrimoine locatif (Groupe Champollion, Groupe Legs, Groupe Jacob) ; pilotage (Développement, Formation du personnel, Informatique, Logistique).
La chancellerie des universités de Paris est un établissement public doté d'une personnalité morale et de l'autonomie financière sous la tutelle du ministère chargé de l'enseignement supérieur.
La Division administrative de la chancellerie (DAC) est dotée de missions plurielles. Elle assure la coordination des établissements d'enseignement supérieur, elle définit les objectifs de la politique académique et assure la gestion des biens et charges indivis entre les universités d’Île-de-France issues de l'ancienne Université de Paris, de ses biens propres et de ses charges spécifiques.
La division de l'administration de la chancellerie a vu ses missions évoluer, tout comme sa dénomination. La DACAFU, qui avait succédé au service B (1960-1971), devient, à la fin des années 1970, la Division de l'administration de la chancellerie. En 1987, cette division devient le service d'administration et de gestion de la chancellerie (SAGC) avant de redevenir, en 1997, la DAC. Chargée de la gestion de la chancellerie des universités de Paris, elle doit par conséquent assurer le secrétariat du conseil d'administration de la chancellerie et la préparation et l'exécution du budget de la chancellerie et des budgets annexes. Elle doit également veiller à la tenue de la comptabilité de l'ordonnateur et à l'administration du patrimoine (mobilier et immobilier) et des personnels attachés à celui-ci. Elle s'occupe aussi de la gestion des charges communes de l'immeuble Sorbonne et des bâtiments administratifs et également de l'attribution des revenus des libéralités sous forme de bourses, prix, prêts d'honneur, et autres subventions. Pour finir, elle gère l'organisation administrative des cérémonies se déroulant à la Sorbonne.
La division de l'administration de la cancellerie est une partie de la Chancellerie des universités de Paris.