Les secrétaires généraux puis directeurs généraux de la Marine marchande successifs de 1944 à 1981 :
Il a été choisi de rassembler sous cette notice l'ensemble des périodes d'existence du Secrétariat général de la Marine marchande et de la direction générale de la Marine marchande, c'est-à-dire les périodes où l'administration de la Marine marchande n'était pas une entité ministérielle ou un secrétariat d'Etat. Ces périodes sont entrecoupées par des périodes où l'entité ministérielle ou le secrétariat d'Etat sont brièvement recréés.
A la fin de la Seconde Guerre mondiale, un secrétariat général de la Marine marchande est institué par le Gouvernement provisoire de la république française, le 8 septembre 1944. La marine marchande est rattachée en 1940 au secrétariat d’État à la Marine, sous hiérarchie militaire, mais dès 1943, le gouvernement d’Alger conduit par le Général de Gaulle crée une direction de la Marine marchande et des Transports maritimes au sein du Commissariat aux Communications et à la Marine marchande (ordonnance du 7 juillet 1943).
Par ordonnance du 18 janvier 1945, l’administration de la marine marchande est réorganisée consécutivement à son rattachement au ministère des Travaux publics et des Transports en 1944.
Sa mission est notamment de définir et mettre en œuvre le plan de reconstruction de la flotte marchande française, ainsi que d’accompagner le redémarrage des transports maritimes après la fin de la guerre.
Six directions sont alors définies et placées sous l’autorité d’un secrétaire général de la Marine marchande :
De 1948 à 1958, dans le contexte d’instabilité ministérielle propre à la IVe République, l’administration centrale de la Marine marchande perdure, tantôt ministère, tantôt secrétariat d’Etat, voire sous-secrétariat d’Etat. C’est le cas sous les gouvernements Queuille (11 septembre 1948 – 28 octobre 1949), Bidault 2 (28 octobre 1949 – 7 février 1950), Queuille, Pleven et Faure (2 juillet 1950 – 6 mars 1952), Mayer et Laniel (8 janvier 1953 – 12 juin 1954), Faure, Mollet, Bourgès-Maunoury et Gaillard (23 février 1955 au 15 avril 1958). En-dehors de ces périodes, c'est le secrétariat général qui tient le rôle de l'entité ministérielle.
A partir de 1958, on parle à nouveau de secrétariat général de la Marine marchande. Il n’existe plus d’entité ministérielle à proprement parler pour la marine marchande, le secrétariat général étant rattaché au ministère en charge des Transports, mais les directions sectorielles qui le composent restent relativement stables jusqu’en 1978.
L’année 1978 marque un tournant dans l’histoire de la Marine marchande. Le secrétariat général devient une direction générale de la Marine marchande, dépendant du ministère des Transports.
C'est à ce moment que sont rassemblés, pour la première fois, les domaines terrestre et maritime : d’une part les services concernant les ports, le balisage, mis en oeuvre dès leur origine par les Travaux publics ou les Ponts-et-Chaussées devenus l’Équipement, et d’autre part les services traditionnellement rattachés à la Marine marchande.
En effet, la direction de la flotte de commerce fusionne avec les ports maritimes, auparavant dépendants du ministère de l'Équipement. C’est la création de la direction des ports et de la navigation maritime (DPNM). Les voies navigables intérieures, qui composent également l’ancienne direction du ministère de l’Équipement, rejoignent la direction des transports terrestres (DTT) du ministère des Transports.
La direction générale de la Marine marchande regroupe donc en 1978 les services suivants :
Cette organisation perdure jusqu’en mai 1981, lorsqu’est créé le ministère de la Mer.
Au sortir de la Seconde Guerre mondiale la Marine marchande est réorganisée sous l'égide du ministère des Travaux publics et des Transports.
Lorsque le ministère des Travaux publics se transforme en ministère de l'Equipement.
Lorsque le ministère des Transports est créé.