Institué par l’arrêté du 1er décembre 2014, OJI5 est le successeur du bureau du suivi des applications informatiques des services judiciaires créé par l’arrêté du 25 octobre 2010 fixant l'organisation en bureaux de la direction des services judiciaires (DSJ). Il est rattaché à la sous-direction de la performance et des méthodes. Dès 1988, par l’arrêté du 1er mars, un bureau de l’informatisation des juridictions est créé. En 1993, ce bureau est rattaché au département de l'informatique judiciaire, puis à la sous-direction des greffes en 1997, enfin à la sous-direction de l'organisation judiciaire et de la programmation par l'arrêté du 10 octobre 2001 relatif à l'organisation en bureaux des sous-directions de la direction des services judiciaires et de la mission modernisation.
Il devient ensuite le département de l'appui aux juridictions créé par l'arrêté du 9 juillet 2008 fixant l'organisation en départements du service de l'organisation et du fonctionnement des juridictions de la direction des services judiciaires.
Ce département disparaît lors de la réorganisation de la DSJ en 2010 et une partie de ses missions est transférée au bureau du suivi des applications informatiques des services judiciaires créé par l'arrêté du 25 octobre.
OJI5 assure la maîtrise d’ouvrage de l’ensemble des applicatifs informatiques des services judiciaires relatifs au champ d’activité civile, et apporte son concours aux équipes du projet Portalis en assurant les travaux préparatoires et en veillant à la cohérence des évolutions des applications actuelles avec le futur outil.
Le bureau des applications informatiques civiles succède au bureau du suivi des applications informatiques des services judiciaires