# 科研骨架（Research Backbone）全貌索引
> 一句话：模块化科研工具链，每个模块 = **skill + 脚本/MCP + 跨模型验证**。此文件是新 session / 新协作者的第一入口。
## 模块总览
| # | 模块 | 触发 | 入口 | 后端/依赖 | 验证方式 |
|---|------|------|------|-----------|----------|
| 1 | 识图/复核 | 看图/OCR/读图表 | **原生读图**（模型自带视觉）· 复核走 `vision` 命令 | 宿主模型（DeepSeek V4.1+ 原生）；复核 Qwen3-VL-32B | 跨模型独立复核（同模型自评有共同盲点） |
| 2 | 生图 | 概念图/封面/graphical abstract | generate_image MCP | gpt-image-2（私有供应商走 env） | 原生读图初检 + vision 独立复检 |
| 3 | 评审 | 对抗审查/语义复核 | `review` 命令 | Qwen3.5-397B（SiliconFlow） | kill-argument 结构化 JSON |
| 4 | 绘图 | 架构/流程/数据图 | drawio MCP / fig2drawio / data-plot | 多后端 | consistency-check 一致性 + 原生读图复核 |
| 5 | 文献 | 读论文/写阅读报告 | paper-reading skill | arxiv_fetch.py（仓库外，可选） | 置信度 frontmatter + review 复核 |
| 6 | 写作 PDF | 论文/报告/学位论文 | paper-writing skill | latex-templates + latex-build | review 评审 + 页数检查 |
| 7 | 写作 Office | Word/PPT/Excel | office-tools skill | office_tools.py + pandoc | 公式→OMML 原生方程 |
| — | 审计（横向） | 安全审计 | code-security-audit skill | security_audit_tools.py | review 跨模型对抗 |
> **识图模块的定位变更（2026-09-12）**：宿主模型（DeepSeek V4.1+）已自带原生视觉，原先
> "模型无视觉 → 靠 vision.py 代理"的前提失效。现在**看懂一张图直接用原生读图**；
> `vision.py` 保留但重新定位为**跨模型独立复核**——它服务的是"验证环"的独立性，
> 而不是补足看的能力。（能力被宿主吸收 ≠ 工具作废，而是角色改变；详见 README 设计原则。）
## 典型跨模块流程
- **论文写作一条龙**：读文献(5) → 绘图(4) → 写作 PDF(6) 或 Office(7) → 评审(3) → 修订重编译
- **制图闭环**：生图(2) → 识图(1) 读结构 → fig2drawio(4) 复刻矢量 → consistency-check 一致性 diff
- **审计闭环**：code-security-audit → review(3) 对抗攻击 findings → 误报过滤
## 安装与命令
```bash
pip install -e . # 装 console 命令（推荐，不依赖 junction）
review file.md --json # 结构化评审（kill-argument）
vision img.png "描述" # 识图
office-tools md2docx a.md b.docx
latex-build list
```
脚本也可 `python bin/