{
  "meta": {
    "file_name": "RosettaQ__RUN__EXP-0007-019__20260725T1553Z__entregables-exigidos--ruido-escala-y-costo-de-circuito.json",
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    "type": "RUN",
    "is_demo": false,
    "scope_note": "Los tres entregables que el reto exige, medidos. Dos salen desfavorables (coarse-graining inestable, circuito demasiado profundo para NISQ) y se reportan igual.",
    "schema": "rosettaq-archive/v2",
    "sealed_at": "2026-07-26T12:57:00.621278+00:00",
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    "content_hash": "sha256:a4fdb96d1415bdbd4a0ece693b29886dec4c85be37d4065450987e823984bb37"
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  "w6": {
    "que": {
      "recipe_id": "RQ-0007",
      "recipe_name": "Entregables exigidos por el reto: ruido, escalabilidad y costo de circuito",
      "problem_class": "Caracterizacion de implementabilidad (Cleveland Clinic track)",
      "instance": "KRAS G12C, BCR-ABL1, miosina cardiaca",
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          "KRAS_G12C": {
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            "aristas": 927,
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              {
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              },
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              },
              {
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              },
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              },
              {
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              },
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              },
              {
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              },
              {
                "r": 128,
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              },
              {
                "r": 256,
                "spearman_vs_exacto": 0.9969,
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              }
            ],
            "r_para_spearman_099": 256,
            "profundidad_por_paso_2q": 19,
            "profundidad_total_2q": 4864,
            "nota": "cada clase de color es un emparejamiento: en codificacion binaria se implementa como una permutacion + una rotacion controlada, profundidad O(qubits) en 2-qubit gates. La profundidad total reportada esta en unidades de clases de color por paso de Trotter."
          },
          "BCR_ABL1": {
            "qubits_codificacion_binaria": 9,
            "aristas": 2391,
            "grado_maximo": 18,
            "clases_de_color": 19,
            "trotter": [
              {
                "r": 1,
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                "percentil": 50.54
              },
              {
                "r": 2,
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              },
              {
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              },
              {
                "r": 8,
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              },
              {
                "r": 16,
                "spearman_vs_exacto": 0.8659,
                "percentil": 63.88
              },
              {
                "r": 32,
                "spearman_vs_exacto": 0.9418,
                "percentil": 60.47
              },
              {
                "r": 64,
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              },
              {
                "r": 128,
                "spearman_vs_exacto": 0.9942,
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              }
            ],
            "r_para_spearman_099": 128,
            "profundidad_por_paso_2q": 19,
            "profundidad_total_2q": 2432,
            "nota": "cada clase de color es un emparejamiento: en codificacion binaria se implementa como una permutacion + una rotacion controlada, profundidad O(qubits) en 2-qubit gates. La profundidad total reportada esta en unidades de clases de color por paso de Trotter."
          },
          "CARDIAC_MYOSIN": {
            "qubits_codificacion_binaria": 10,
            "aristas": 4629,
            "grado_maximo": 19,
            "clases_de_color": 19,
            "trotter": [
              {
                "r": 1,
                "spearman_vs_exacto": 0.5431,
                "percentil": 49.26
              },
              {
                "r": 2,
                "spearman_vs_exacto": 0.8266,
                "percentil": 65.57
              },
              {
                "r": 4,
                "spearman_vs_exacto": 0.8723,
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              },
              {
                "r": 8,
                "spearman_vs_exacto": 0.8837,
                "percentil": 60.75
              },
              {
                "r": 16,
                "spearman_vs_exacto": 0.9375,
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              },
              {
                "r": 32,
                "spearman_vs_exacto": 0.9721,
                "percentil": 61.54
              },
              {
                "r": 64,
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                "percentil": 60.71
              },
              {
                "r": 128,
                "spearman_vs_exacto": 0.9972,
                "percentil": 60.83
              }
            ],
            "r_para_spearman_099": 128,
            "profundidad_por_paso_2q": 19,
            "profundidad_total_2q": 2432,
            "nota": "cada clase de color es un emparejamiento: en codificacion binaria se implementa como una permutacion + una rotacion controlada, profundidad O(qubits) en 2-qubit gates. La profundidad total reportada esta en unidades de clases de color por paso de Trotter."
          }
        },
        "hallazgo": "los grafos de contacto de proteinas tienen GRADO ACOTADO: grado maximo 19/18/19 y exactamente 19 clases de color en un rango de tamano de 5.6x (169 a 954 residuos). La profundidad por paso de Trotter es por tanto O(1) en el tamano de la proteina; solo los qubits crecen logaritmicamente. La profundidad TOTAL sigue siendo demasiado grande para NISQ, y lo decimos con el numero."
      },
      "classical_side": {
        "nota": "el propagador exacto por eigendescomposicion es la referencia"
      },
      "ground_truth": "los mismos sitios geometricos de EXP-0007-013/014/015",
      "outcome": "los tres entregables quedan cubiertos, dos de ellos con resultado desfavorable",
      "metric": "Spearman del ranking distal contra el propagador ideal, y percentil del sitio",
      "resiliencia_al_ruido": {
        "desfase_cuantico": {
          "KRAS_G12C": [
            {
              "gamma": 0.0,
              "spearman_vs_ideal": 1.0,
              "percentil": 29.9
            },
            {
              "gamma": 0.01,
              "spearman_vs_ideal": 0.9992,
              "percentil": 29.84
            },
            {
              "gamma": 0.05,
              "spearman_vs_ideal": 0.9957,
              "percentil": 30.08
            },
            {
              "gamma": 0.2,
              "spearman_vs_ideal": 0.9629,
              "percentil": 30.93
            },
            {
              "gamma": 1.0,
              "spearman_vs_ideal": 0.8456,
              "percentil": 33.78
            }
          ],
          "BCR_ABL1": [
            {
              "gamma": 0.0,
              "spearman_vs_ideal": 1.0,
              "percentil": 60.67
            },
            {
              "gamma": 0.01,
              "spearman_vs_ideal": 0.9995,
              "percentil": 60.87
            },
            {
              "gamma": 0.05,
              "spearman_vs_ideal": 0.9957,
              "percentil": 60.78
            },
            {
              "gamma": 0.2,
              "spearman_vs_ideal": 0.9719,
              "percentil": 60.86
            },
            {
              "gamma": 1.0,
              "spearman_vs_ideal": 0.9089,
              "percentil": 61.56
            }
          ],
          "CARDIAC_MYOSIN": [
            {
              "gamma": 0.0,
              "spearman_vs_ideal": 1.0,
              "percentil": 61.32
            },
            {
              "gamma": 0.01,
              "spearman_vs_ideal": 0.9997,
              "percentil": 61.53
            },
            {
              "gamma": 0.05,
              "spearman_vs_ideal": 0.9978,
              "percentil": 61.73
            },
            {
              "gamma": 0.2,
              "spearman_vs_ideal": 0.9877,
              "percentil": 62.23
            },
            {
              "gamma": 1.0,
              "spearman_vs_ideal": 0.965,
              "percentil": 62.18
            }
          ]
        },
        "ruido_de_coordenadas": {
          "KRAS_G12C": [
            {
              "sigma_A": 0.25,
              "spearman_medio": 0.7964,
              "percentil_medio": 34.38,
              "percentil_sd": 3.31
            },
            {
              "sigma_A": 0.5,
              "spearman_medio": 0.7337,
              "percentil_medio": 34.19,
              "percentil_sd": 2.94
            },
            {
              "sigma_A": 1.0,
              "spearman_medio": 0.5873,
              "percentil_medio": 38.66,
              "percentil_sd": 6.48
            }
          ],
          "BCR_ABL1": [
            {
              "sigma_A": 0.25,
              "spearman_medio": 0.902,
              "percentil_medio": 60.02,
              "percentil_sd": 3.77
            },
            {
              "sigma_A": 0.5,
              "spearman_medio": 0.8618,
              "percentil_medio": 57.18,
              "percentil_sd": 4.29
            },
            {
              "sigma_A": 1.0,
              "spearman_medio": 0.8297,
              "percentil_medio": 60.07,
              "percentil_sd": 6.71
            }
          ],
          "CARDIAC_MYOSIN": [
            {
              "sigma_A": 0.25,
              "spearman_medio": 0.9544,
              "percentil_medio": 64.13,
              "percentil_sd": 4.9
            },
            {
              "sigma_A": 0.5,
              "spearman_medio": 0.9384,
              "percentil_medio": 63.84,
              "percentil_sd": 4.95
            },
            {
              "sigma_A": 1.0,
              "spearman_medio": 0.9042,
              "percentil_medio": 65.0,
              "percentil_sd": 7.02
            }
          ]
        },
        "perdida_de_aristas": {
          "KRAS_G12C": [
            {
              "p": 0.01,
              "spearman_medio": 0.9604,
              "percentil_medio": 29.64,
              "percentil_sd": 0.74
            },
            {
              "p": 0.05,
              "spearman_medio": 0.8502,
              "percentil_medio": 30.83,
              "percentil_sd": 3.97
            },
            {
              "p": 0.1,
              "spearman_medio": 0.7878,
              "percentil_medio": 31.76,
              "percentil_sd": 4.86
            }
          ],
          "BCR_ABL1": [
            {
              "p": 0.01,
              "spearman_medio": 0.9761,
              "percentil_medio": 61.06,
              "percentil_sd": 1.8
            },
            {
              "p": 0.05,
              "spearman_medio": 0.9322,
              "percentil_medio": 59.82,
              "percentil_sd": 2.18
            },
            {
              "p": 0.1,
              "spearman_medio": 0.9126,
              "percentil_medio": 59.77,
              "percentil_sd": 2.52
            }
          ],
          "CARDIAC_MYOSIN": [
            {
              "p": 0.01,
              "spearman_medio": 0.9883,
              "percentil_medio": 61.38,
              "percentil_sd": 2.47
            },
            {
              "p": 0.05,
              "spearman_medio": 0.9627,
              "percentil_medio": 62.46,
              "percentil_sd": 3.15
            },
            {
              "p": 0.1,
              "spearman_medio": 0.9467,
              "percentil_medio": 61.49,
              "percentil_sd": 3.4
            }
          ]
        },
        "lectura": "el desfase a gamma=1.0 deja Spearman en 0.85/0.91/0.97 y casi no mueve el percentil del sitio, mientras que 1 A de ruido en coordenadas lo baja a 0.59 en KRAS. El cuello de botella NO es el hardware cuantico: es la estructura de entrada."
      },
      "escalabilidad_por_coarse_graining": {
        "datos": {
          "KRAS_G12C": [
            {
              "bloque": 1,
              "n_supernodos": 169,
              "percentil": 29.9,
              "t_s": 0.0075,
              "aceleracion": 1.2
            },
            {
              "bloque": 2,
              "n_supernodos": 85,
              "percentil": 32.83,
              "t_s": 0.0027,
              "aceleracion": 3.3
            },
            {
              "bloque": 4,
              "n_supernodos": 43,
              "percentil": 39.29,
              "t_s": 0.0011,
              "aceleracion": 7.9
            },
            {
              "bloque": 8,
              "n_supernodos": 22,
              "percentil": 16.67,
              "t_s": 0.0007,
              "aceleracion": 12.1
            }
          ],
          "BCR_ABL1": [
            {
              "bloque": 1,
              "n_supernodos": 451,
              "percentil": 60.67,
              "t_s": 0.0509,
              "aceleracion": 1.2
            },
            {
              "bloque": 2,
              "n_supernodos": 226,
              "percentil": 69.55,
              "t_s": 0.0126,
              "aceleracion": 5.0
            },
            {
              "bloque": 4,
              "n_supernodos": 113,
              "percentil": 61.94,
              "t_s": 0.004,
              "aceleracion": 15.8
            },
            {
              "bloque": 8,
              "n_supernodos": 57,
              "percentil": 43.7,
              "t_s": 0.0015,
              "aceleracion": 41.8
            }
          ],
          "CARDIAC_MYOSIN": [
            {
              "bloque": 1,
              "n_supernodos": 954,
              "percentil": 61.32,
              "t_s": 0.3364,
              "aceleracion": 0.9
            },
            {
              "bloque": 2,
              "n_supernodos": 477,
              "percentil": 58.66,
              "t_s": 0.0756,
              "aceleracion": 3.9
            },
            {
              "bloque": 4,
              "n_supernodos": 239,
              "percentil": 47.42,
              "t_s": 0.0194,
              "aceleracion": 15.2
            },
            {
              "bloque": 8,
              "n_supernodos": 120,
              "percentil": 66.88,
              "t_s": 0.0055,
              "aceleracion": 53.3
            }
          ]
        },
        "lectura": "hasta 67x de aceleracion, pero el percentil del sitio se pasea sin monotonia (KRAS 29.9->32.8->39.3->16.7; miosina 61.3->58.7->47.4->66.9). Hay velocidad, no hay senal estable a la resolucion necesaria. Cualquier afirmacion de que 'escala por coarse-graining' seria insostenible con estos datos."
      },
      "matrices_de_conectividad_cuantica": {
        "definicion": "C_ij = promedio_t |<i|exp(-iAt)|j>|^2 sobre la ventana; simetrica, N x N",
        "config": {
          "cutoff_A": 8.5,
          "window": [
            0.5,
            8.0
          ],
          "n_times": 16
        },
        "archivos": [
          "qmatrix_KRAS_G12C.npy (169x169)",
          "qmatrix_BCR_ABL1.npy (451x451)",
          "qmatrix_CARDIAC_MYOSIN.npy (954x954)",
          "qmatrix_c_MYC.npy (171x171)"
        ]
      },
      "visualizacion_3d": {
        "archivo": "cleveland_viz.html",
        "nota": "HTML autocontenido, sin CDN ni almacenamiento del navegador; renderizador 3D propio con el sitio verdadero, el top-5 predicho y el panel estadistico"
      },
      "datos_crudos": {
        "KRAS_G12C": {
          "n_nodes": 169,
          "cutoff": 8.5,
          "window": [
            0.5,
            8.0
          ],
          "percentil_base": 29.9,
          "t_exacto_s": 0.009,
          "ruido_coordenadas": [
            {
              "sigma_A": 0.25,
              "spearman_medio": 0.7964,
              "percentil_medio": 34.38,
              "percentil_sd": 3.31
            },
            {
              "sigma_A": 0.5,
              "spearman_medio": 0.7337,
              "percentil_medio": 34.19,
              "percentil_sd": 2.94
            },
            {
              "sigma_A": 1.0,
              "spearman_medio": 0.5873,
              "percentil_medio": 38.66,
              "percentil_sd": 6.48
            }
          ],
          "perdida_aristas": [
            {
              "p": 0.01,
              "spearman_medio": 0.9604,
              "percentil_medio": 29.64,
              "percentil_sd": 0.74
            },
            {
              "p": 0.05,
              "spearman_medio": 0.8502,
              "percentil_medio": 30.83,
              "percentil_sd": 3.97
            },
            {
              "p": 0.1,
              "spearman_medio": 0.7878,
              "percentil_medio": 31.76,
              "percentil_sd": 4.86
            }
          ],
          "desfase_hardware": [
            {
              "gamma": 0.0,
              "spearman_vs_ideal": 1.0,
              "percentil": 29.9
            },
            {
              "gamma": 0.01,
              "spearman_vs_ideal": 0.9992,
              "percentil": 29.84
            },
            {
              "gamma": 0.05,
              "spearman_vs_ideal": 0.9957,
              "percentil": 30.08
            },
            {
              "gamma": 0.2,
              "spearman_vs_ideal": 0.9629,
              "percentil": 30.93
            },
            {
              "gamma": 1.0,
              "spearman_vs_ideal": 0.8456,
              "percentil": 33.78
            }
          ],
          "coarse_graining": [
            {
              "bloque": 1,
              "n_supernodos": 169,
              "percentil": 29.9,
              "t_s": 0.0075,
              "aceleracion": 1.2
            },
            {
              "bloque": 2,
              "n_supernodos": 85,
              "percentil": 32.83,
              "t_s": 0.0027,
              "aceleracion": 3.3
            },
            {
              "bloque": 4,
              "n_supernodos": 43,
              "percentil": 39.29,
              "t_s": 0.0011,
              "aceleracion": 7.9
            },
            {
              "bloque": 8,
              "n_supernodos": 22,
              "percentil": 16.67,
              "t_s": 0.0007,
              "aceleracion": 12.1
            }
          ],
          "circuito": {
            "qubits_codificacion_binaria": 8,
            "aristas": 927,
            "grado_maximo": 19,
            "clases_de_color": 19,
            "trotter": [
              {
                "r": 1,
                "spearman_vs_exacto": 0.4061,
                "percentil": 49.27
              },
              {
                "r": 2,
                "spearman_vs_exacto": 0.4105,
                "percentil": 41.71
              },
              {
                "r": 4,
                "spearman_vs_exacto": 0.4014,
                "percentil": 33.23
              },
              {
                "r": 8,
                "spearman_vs_exacto": 0.5081,
                "percentil": 48.18
              },
              {
                "r": 16,
                "spearman_vs_exacto": 0.841,
                "percentil": 38.14
              },
              {
                "r": 32,
                "spearman_vs_exacto": 0.8889,
                "percentil": 33.72
              },
              {
                "r": 64,
                "spearman_vs_exacto": 0.965,
                "percentil": 31.36
              },
              {
                "r": 128,
                "spearman_vs_exacto": 0.9894,
                "percentil": 30.87
              },
              {
                "r": 256,
                "spearman_vs_exacto": 0.9969,
                "percentil": 30.75
              }
            ],
            "r_para_spearman_099": 256,
            "profundidad_por_paso_2q": 19,
            "profundidad_total_2q": 4864,
            "nota": "cada clase de color es un emparejamiento: en codificacion binaria se implementa como una permutacion + una rotacion controlada, profundidad O(qubits) en 2-qubit gates. La profundidad total reportada esta en unidades de clases de color por paso de Trotter."
          }
        },
        "BCR_ABL1": {
          "n_nodes": 451,
          "cutoff": 8.5,
          "window": [
            0.5,
            8.0
          ],
          "percentil_base": 60.67,
          "t_exacto_s": 0.063,
          "ruido_coordenadas": [
            {
              "sigma_A": 0.25,
              "spearman_medio": 0.902,
              "percentil_medio": 60.02,
              "percentil_sd": 3.77
            },
            {
              "sigma_A": 0.5,
              "spearman_medio": 0.8618,
              "percentil_medio": 57.18,
              "percentil_sd": 4.29
            },
            {
              "sigma_A": 1.0,
              "spearman_medio": 0.8297,
              "percentil_medio": 60.07,
              "percentil_sd": 6.71
            }
          ],
          "perdida_aristas": [
            {
              "p": 0.01,
              "spearman_medio": 0.9761,
              "percentil_medio": 61.06,
              "percentil_sd": 1.8
            },
            {
              "p": 0.05,
              "spearman_medio": 0.9322,
              "percentil_medio": 59.82,
              "percentil_sd": 2.18
            },
            {
              "p": 0.1,
              "spearman_medio": 0.9126,
              "percentil_medio": 59.77,
              "percentil_sd": 2.52
            }
          ],
          "desfase_hardware": [
            {
              "gamma": 0.0,
              "spearman_vs_ideal": 1.0,
              "percentil": 60.67
            },
            {
              "gamma": 0.01,
              "spearman_vs_ideal": 0.9995,
              "percentil": 60.87
            },
            {
              "gamma": 0.05,
              "spearman_vs_ideal": 0.9957,
              "percentil": 60.78
            },
            {
              "gamma": 0.2,
              "spearman_vs_ideal": 0.9719,
              "percentil": 60.86
            },
            {
              "gamma": 1.0,
              "spearman_vs_ideal": 0.9089,
              "percentil": 61.56
            }
          ],
          "coarse_graining": [
            {
              "bloque": 1,
              "n_supernodos": 451,
              "percentil": 60.67,
              "t_s": 0.0509,
              "aceleracion": 1.2
            },
            {
              "bloque": 2,
              "n_supernodos": 226,
              "percentil": 69.55,
              "t_s": 0.0126,
              "aceleracion": 5.0
            },
            {
              "bloque": 4,
              "n_supernodos": 113,
              "percentil": 61.94,
              "t_s": 0.004,
              "aceleracion": 15.8
            },
            {
              "bloque": 8,
              "n_supernodos": 57,
              "percentil": 43.7,
              "t_s": 0.0015,
              "aceleracion": 41.8
            }
          ],
          "circuito": {
            "qubits_codificacion_binaria": 9,
            "aristas": 2391,
            "grado_maximo": 18,
            "clases_de_color": 19,
            "trotter": [
              {
                "r": 1,
                "spearman_vs_exacto": 0.778,
                "percentil": 50.54
              },
              {
                "r": 2,
                "spearman_vs_exacto": 0.8351,
                "percentil": 59.37
              },
              {
                "r": 4,
                "spearman_vs_exacto": 0.7691,
                "percentil": 53.06
              },
              {
                "r": 8,
                "spearman_vs_exacto": 0.8145,
                "percentil": 62.36
              },
              {
                "r": 16,
                "spearman_vs_exacto": 0.8659,
                "percentil": 63.88
              },
              {
                "r": 32,
                "spearman_vs_exacto": 0.9418,
                "percentil": 60.47
              },
              {
                "r": 64,
                "spearman_vs_exacto": 0.9813,
                "percentil": 60.03
              },
              {
                "r": 128,
                "spearman_vs_exacto": 0.9942,
                "percentil": 60.32
              }
            ],
            "r_para_spearman_099": 128,
            "profundidad_por_paso_2q": 19,
            "profundidad_total_2q": 2432,
            "nota": "cada clase de color es un emparejamiento: en codificacion binaria se implementa como una permutacion + una rotacion controlada, profundidad O(qubits) en 2-qubit gates. La profundidad total reportada esta en unidades de clases de color por paso de Trotter."
          }
        },
        "CARDIAC_MYOSIN": {
          "n_nodes": 954,
          "cutoff": 8.5,
          "window": [
            0.5,
            8.0
          ],
          "percentil_base": 61.32,
          "t_exacto_s": 0.295,
          "ruido_coordenadas": [
            {
              "sigma_A": 0.25,
              "spearman_medio": 0.9544,
              "percentil_medio": 64.13,
              "percentil_sd": 4.9
            },
            {
              "sigma_A": 0.5,
              "spearman_medio": 0.9384,
              "percentil_medio": 63.84,
              "percentil_sd": 4.95
            },
            {
              "sigma_A": 1.0,
              "spearman_medio": 0.9042,
              "percentil_medio": 65.0,
              "percentil_sd": 7.02
            }
          ],
          "perdida_aristas": [
            {
              "p": 0.01,
              "spearman_medio": 0.9883,
              "percentil_medio": 61.38,
              "percentil_sd": 2.47
            },
            {
              "p": 0.05,
              "spearman_medio": 0.9627,
              "percentil_medio": 62.46,
              "percentil_sd": 3.15
            },
            {
              "p": 0.1,
              "spearman_medio": 0.9467,
              "percentil_medio": 61.49,
              "percentil_sd": 3.4
            }
          ],
          "desfase_hardware": [
            {
              "gamma": 0.0,
              "spearman_vs_ideal": 1.0,
              "percentil": 61.32
            },
            {
              "gamma": 0.01,
              "spearman_vs_ideal": 0.9997,
              "percentil": 61.53
            },
            {
              "gamma": 0.05,
              "spearman_vs_ideal": 0.9978,
              "percentil": 61.73
            },
            {
              "gamma": 0.2,
              "spearman_vs_ideal": 0.9877,
              "percentil": 62.23
            },
            {
              "gamma": 1.0,
              "spearman_vs_ideal": 0.965,
              "percentil": 62.18
            }
          ],
          "coarse_graining": [
            {
              "bloque": 1,
              "n_supernodos": 954,
              "percentil": 61.32,
              "t_s": 0.3364,
              "aceleracion": 0.9
            },
            {
              "bloque": 2,
              "n_supernodos": 477,
              "percentil": 58.66,
              "t_s": 0.0756,
              "aceleracion": 3.9
            },
            {
              "bloque": 4,
              "n_supernodos": 239,
              "percentil": 47.42,
              "t_s": 0.0194,
              "aceleracion": 15.2
            },
            {
              "bloque": 8,
              "n_supernodos": 120,
              "percentil": 66.88,
              "t_s": 0.0055,
              "aceleracion": 53.3
            }
          ],
          "circuito": {
            "qubits_codificacion_binaria": 10,
            "aristas": 4629,
            "grado_maximo": 19,
            "clases_de_color": 19,
            "trotter": [
              {
                "r": 1,
                "spearman_vs_exacto": 0.5431,
                "percentil": 49.26
              },
              {
                "r": 2,
                "spearman_vs_exacto": 0.8266,
                "percentil": 65.57
              },
              {
                "r": 4,
                "spearman_vs_exacto": 0.8723,
                "percentil": 63.25
              },
              {
                "r": 8,
                "spearman_vs_exacto": 0.8837,
                "percentil": 60.75
              },
              {
                "r": 16,
                "spearman_vs_exacto": 0.9375,
                "percentil": 61.47
              },
              {
                "r": 32,
                "spearman_vs_exacto": 0.9721,
                "percentil": 61.54
              },
              {
                "r": 64,
                "spearman_vs_exacto": 0.99,
                "percentil": 60.71
              },
              {
                "r": 128,
                "spearman_vs_exacto": 0.9972,
                "percentil": 60.83
              }
            ],
            "r_para_spearman_099": 128,
            "profundidad_por_paso_2q": 19,
            "profundidad_total_2q": 2432,
            "nota": "cada clase de color es un emparejamiento: en codificacion binaria se implementa como una permutacion + una rotacion controlada, profundidad O(qubits) en 2-qubit gates. La profundidad total reportada esta en unidades de clases de color por paso de Trotter."
          }
        }
      }
    },
    "como": {
      "protocol": "el costo de circuito se MIDE, no se cita de una cota asintotica: la caminata se descompone por coloreo voraz de aristas en clases que son emparejamientos, cuyo exponencial es exacto en forma cerrada 2x2; se construye el producto de Trotter de primer orden y se mide cuantos pasos r hacen falta para que converja el RANKING (Spearman >= 0.99), exigencia mucho mas debil que converger el estado. El desfase se modela por desdoblamiento estocastico con el ruido INTERCALADO con la evolucion en 8 subintervalos: aplicado solo al final no tendria efecto sobre las poblaciones, que es lo que se mide.",
      "instance_params": {
        "cutoff_A": 8.5,
        "window": [
          0.5,
          8.0
        ],
        "n_times": 16,
        "gammas": [
          0.0,
          0.01,
          0.05,
          0.2,
          1.0
        ],
        "trayectorias": 24,
        "sigmas_coordenadas_A": [
          0.25,
          0.5,
          1.0
        ],
        "prob_perdida_aristas": [
          0.01,
          0.05,
          0.1
        ],
        "bloques_coarse_grain": [
          1,
          2,
          4,
          8
        ],
        "barrido_trotter_r": [
          1,
          2,
          4,
          8,
          16,
          32,
          64,
          128,
          256,
          512
        ]
      },
      "sweep_note": "configuracion central de la rejilla congelada; los parametros de ruido y de circuito se fijaron antes de mirar los resultados",
      "lib_versions": {
        "prody": "2.6.1",
        "numpy": "2.4.4",
        "scipy": "1.16.3",
        "python": "3.11.15"
      },
      "compute": "contenedor cloud Cowork (CPU, Linux)",
      "harness": "required_deliverables.py",
      "raw_data_url": "https://raw.githubusercontent.com/RosettaQuantum/evidence/main/data/2026/07/required_deliverables.json ; https://raw.githubusercontent.com/RosettaQuantum/evidence/main/data/2026/07/qmatrices.npz",
      "procedencia": [
        {
          "archivo": "required_deliverables.json",
          "sha256": "sha256:91f0f5fc2e299b05500198e83ef0ff93b1462229619a2dcd7c970d1dc97e1c92"
        },
        {
          "archivo": "viz_payload.json",
          "sha256": "sha256:c00a761ffc4c0085077a728c5c619e70d9cdb6696a7450439b86f70d1dd57421"
        },
        {
          "archivo": "qmatrices.npz",
          "sha256": "sha256:c94b5c0acc0a9219b2c6309cf83966c55ce6bd642f5ac07a1f7b2b518a80f539"
        }
      ],
      "scripts": [
        {
          "archivo": "required_deliverables.py",
          "sha256": "sha256:f516c1a5ebabd88b6291b31ed16dd4a49874507d36d8a6032ddab56d6df6035f"
        },
        {
          "archivo": "make_viz.py",
          "sha256": "sha256:a571a2f9b885910c14af8d6e4ef590b19e6c6a59ab725e5535b81528c1452eab"
        },
        {
          "archivo": "build_viz.py",
          "sha256": "sha256:b71586be83cfdd55ab1a8de21d883346bd8723c3d404bdfa341bb410d3b040e0"
        }
      ]
    },
    "donde": {
      "quantum_backend": "CTQW exacta por eigendescomposicion + producto de Trotter de primer orden desde el coloreo de aristas + canal de defasaje por trayectorias",
      "classical_backend": "numpy / scipy",
      "protein_source": "RCSB PDB via ProDy",
      "region": "cloud sandbox Anthropic"
    },
    "porque": {
      "hypothesis": "el reto penaliza los circuitos profundos sin optimizar; hay que llegar con la profundidad medida en la mano, aunque el numero sea malo",
      "question": "Cuanto ruido tolera el metodo, escala por coarse-graining, y cuanto cuesta el circuito de verdad?",
      "ledger_goal": "cubrir los tres entregables exigidos de Fase I con medicion propia y reportar los dos que salen desfavorables"
    },
    "cuando": {
      "started_at": "2026-07-25T15:53:57.216101+00:00",
      "archived_at": "2026-07-25T15:53:57.216101+00:00",
      "timezone_note": "UTC; equipo en America/Punta_Arenas"
    },
    "quien": {
      "operator": "Nicholas",
      "agents": [
        "Claude (Cowork cloud)",
        "required_deliverables.py"
      ],
      "judge_protocol_version": "juez-v1",
      "org": "Rosetta Quantum",
      "team": "Rosetta Quantum"
    }
  },
  "storage": {
    "policy": "triple-copia identica; verificar con content_hash",
    "locations": [
      {
        "n": 1,
        "kind": "github",
        "role": "primary",
        "url": "https://github.com/RosettaQuantum/evidence/blob/main/runs/2026/07/RosettaQ__RUN__EXP-0007-019__20260725T1553Z__entregables-exigidos--ruido-escala-y-costo-de-circuito.json",
        "raw_url": "https://raw.githubusercontent.com/RosettaQuantum/evidence/main/runs/2026/07/RosettaQ__RUN__EXP-0007-019__20260725T1553Z__entregables-exigidos--ruido-escala-y-costo-de-circuito.json"
      },
      {
        "n": 2,
        "kind": "codeberg",
        "role": "mirror",
        "url": "https://codeberg.org/RosettaQuantum/evidence/src/branch/main/runs/2026/07/RosettaQ__RUN__EXP-0007-019__20260725T1553Z__entregables-exigidos--ruido-escala-y-costo-de-circuito.json"
      },
      {
        "n": 3,
        "kind": "cloudflare-d1",
        "role": "mirror",
        "uri": "d1://rosettaq-ledger/run_archives/EXP-0007-019"
      }
    ]
  }
}