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000016738.fixed493	CTGTAAAGGTTG	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	unknown	unknown	unknown	y	8/21/14	Housing...	35.0	77.0	unknown	no_data	16738	no	UBERON:feces	Other	unknown	no	Caffeine	2059.5	Daily	unknown	no	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	USA	0	Never	148025847	3591296870	no_data	no	no_data	311172B	-105.4	no	unknown	no_data	unknown	unknown	Knight_Cleanse_1	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	Daily	no	American_Gut_round_13	unknown	PS14F4	no_data	unknown	no_data	Filtered	None	GAZ:United States of America	Not in the last year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	In the past year	no	yes	25.10186936	ENVO:urban biome	A9	Daily	unknown	unknown	CCME	CCME	no	GT	unknown	unknown	yes	years	unknown	Regularly (3-5 times/week)	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	no	Within the past 3 months	V4	American Gut Project	69.0	unknown	Contact...	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	Both	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	6/3/14	no	I use an antiperspirant	unknown	male	unknown	unknown	16S rRNA	unknown	no	unknown	unknown	no_data	.1,g	Occasionally (1-2 times/week)	170.0	unknown	Regularly (3-5 times/week)	CO	True	CCME	UBERON:feces	right	unknown	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	Omega-3, Probiotic	no_data	8:00 AM	no	Within the past year	EMP	unknown	7-8 hours	16738	y	Omnivore	CCME	unknown	CCME	no	175.0	unknown	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	unknown	no	unknown	unknown	EZL	AG13	2014-06-03 08:00:00	unknown	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	Caucasian	Contact..., Housing...	yes	NEWE	unknown	no	7	no	unknown	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Remained stable	71514	unknown	I do not have diabetes	Dehydration	no	Occasionally (1-2 times/week)	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	no	40.0	unknown	no	no	American Gut Project Stool sample
000013116.1257202	no_data	no_data	48	no_data	no_data	y	no_data	Indoor	50.0	57.0	no_data	1244993	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	no	no_data	61.0	Daily	17	yes	no_data	USA	100	Never	145049333	2234:1496225820	ERC000011	no	000013116	311169B	-71.3	yes	no_data	13116	no_data	no_data	AG37	no	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	40	PS13J2	no_data	no_data	Stool	City	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	Not in the last year	no	no	22.49458302	ENVO:urban biome	A4	Daily	no_data	no_data	no_data	no_data	yes	no_data	Spouse	no_data	no	years	no_data	Daily	human	no	no_data	ENVO:feces	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	no	More than one year ago	no_data	American Gut Project	63	no_data	Moderate	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	49158	Both	no_data	1/9/14	no	I do not use deoderant or antiperspirant	no_data	no_data	25 to 50%	35	no_data	no_data	no_data	no	no_data	no_data	.1,g	Never	127	no_data	Occasionally (1-2 times/week)	NH	no_data	no_data	UBERON:feces	right	peppers	RNBC2791	no	no	ENVO:human-associated habitat	no_data	7422858	7:00 AM	no	More than one year ago	no_data	no_data	6-7 hours	13116	y	Omnivore	no_data	no_data	no_data	no	160.0	no_data	I do not have IBD	409185Z	0	RIKE	9606	no_data	408170	no_data	no_data	21 to 30	no_data	26	no_data	JG	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	bird, cockatiel, Moderate, Indoor	yes	HOWE	yes	no	3	no	60	no_data	311318B	no_data	no_data	no_data	Remained stable	22114	wheat flour	I do not have diabetes	no_data	no	Never	no_data	no	no_data	no_data	no	42.8	no_data	yes	yes	American Gut Project Stool sample
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BLANK.41.8F.fixed916	no_data	no_data	unknown	unknown	unknown	y	no_data	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	no_data	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	1629.7	unknown	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	unknown	no_data	BLANK.41.8F	ERC000011	unknown	no_data	no_data	-105.3	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	unknown	no_data	Control	unknown	unknown	no_data	unknown	no_data	no_data	unknown	no_data	unknown	no_data	GAZ:United States of America	unknown	unknown	unclassified metagenome	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	unknown	unknown	ENVO:aquatic biome	no_data	unknown	unknown	unknown	no_data	UCSD	unknown	no_data	unknown	unknown	unknown	years	unknown	unknown	Control	unknown	unknown	ENVO:sterile water	unknown	unknown	0.0	unknown	unknown	unknown	no_data	American Gut Project	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	unknown	True	no_data	unknown	no_data	8/21/14	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	no_data	unknown	unknown	unknown	unknown	CO	True	no_data	unknown	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	ENVO:water	unknown	no_data	unknown	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	BLANK.41.8F	y	unknown	no_data	unknown	no_data	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	0	no_data	408169	no_data	no_data	unknown	completed	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	no_data	2014-08-21 12:00:00	unknown	no_data	no_data	no_data	unknown	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	no_data	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	unknown	40.0	unknown	unknown	unknown	Description
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000013539.1261937	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	y	no_data	Housing...	48.0	100.0	no_data	1249518	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	no	no_data	153.0	Daily	no_data	no	no_data	USA	0	Never	148014030	2254:280349938	ERC000011	no	000013539	311172B	-77.2	yes	no_data	13539	no_data	no_data	AG_43	no	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	PS14A22	no_data	no_data	Stool	Filtered	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	Not in the last year	no	no	31.85020408	ENVO:urban biome	E5	Daily	no_data	no_data	no_data	no_data	yes	no_data	Wife	no_data	no	years	no_data	Regularly (3-5 times/week)	human	no	no_data	ENVO:feces	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	yes	More than one year ago	no_data	American Gut Project	70	no_data	Contact...	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	23644	Indoors	no_data	3/3/14	no	I use an antiperspirant	no_data	male	no_data	no_data	no_data	no_data	no	yes	no_data	no_data	0.1, gram	Never	222	no_data	Never	MD	no_data	no_data	UBERON:feces	right	no_data	RNBC9352	yes	no	ENVO:human-associated habitat	no_data	3570244	8:00 PM	no	More than one year ago	no_data	no_data	6-7 hours	13539	y	Omnivore	no_data	Low carbohydrate	no_data	no	178.0	no_data	I do not have IBD	311426B	0	JERE	9606	no_data	408170	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	GG	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	yes	NEWE	no_data	no	8	no	no_data	no_data	111569B	no_data	no_data	no_data	Decreased more than 10 pounds	22114	no_data	I do not have diabetes	no_data	no	Rarely (few times/month)	no_data	no	no_data	no_data	no_data	39.1	no_data	yes	yes	American Gut Project Stool sample
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000015180.fixed143	no_data	no_data	unknown	unknown	unknown	y	no_data	Housing...	24	83	unknown	no_data	no_data	no	UBERON:hand	unknown	unknown	no	unknown	3.0	Regularly (3-5 times/week)	unknown	no	no_data	USA	0	Rarely (few times/month)	no_data	2778810485	ERC000011	no	no_data	no_data	-71.1	yes	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	no	unknown	no_data	UBERON:sebum	no_data	Right hand	unknown	unknown	no_data	unknown	no_data	no_data	unknown	no_data	City	no_data	GAZ:United States of America	In the past 6 months	unknown	human skin metagenome	unknown	unknown	no_data	In the past 6 months	no	no	32.76769967	ENVO:urban biome	no_data	Regularly (3-5 times/week)	unknown	I use some other type of birth control	no_data	CCME	no	no_data	unknown	unknown	no	years	unknown	Occasionally (1-2 times/week)	human	yes	yes	ENVO:sebum	unknown	Eczema	0.0	unknown	yes	Within the past month	no_data	American Gut Project	63	urinary tract infection	Contact...	unknown	unknown	no_data	unknown	True	56092	Depends on the season	no_data	4/29/14	no	Not sure, but I use some form of deoderant/antiperspirant	unknown	female	unknown	unknown	no_data	unknown	no	no	unknown	no_data	no_data	Rarely (few times/month)	185	unknown	Occasionally (1-2 times/week)	MASSACHUSETTS	True	no_data	UBERON:skin	right	unknown	no_data	unknown	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	8469892	4:20 PM	yes	More than one year ago	no_data	unknown	6-7 hours	15180	y	Vegetarian but eat seafood	no_data	unknown	no_data	no	160	bactrim	I do not have IBD	no_data	0	no_data	9606	no_data	no_data	unknown	completed	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	no_data	2014-04-29 16:20:00	yes	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	no	no_data	unknown	no	no_data	no	unknown	no_data	no_data	unknown	no_data	unknown	Increased more than 10 pounds	no_data	unknown	I do not have diabetes	unknown	no	Never	no_data	no	unknown	no_data	no	42.4	unknown	no	no	None
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000001367.1075806	no_data	no_data	50	yes	no_data	n	no_data	no_data	56.0	61.0	no_data	1068496	1367	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	yes	no_data	no_data	Regularly (3-5 times/week)	20	no	no_data	USA	100	Daily	no_data	1925:3512178413	ERC000011	no	000001367	no_data	-93.5	no	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	50	no_data	no_data	no_data	Stool	Filtered	no_data	GAZ:United States of America	In the past year	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	Not in the last year	unknown	no	21.78719008264462809917355371900826446283	ENVO:human-associated habitat	D11	Daily	no_data	No	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	yes	years	no_data	Daily	human	no_data	no_data	ENVO:feces	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	yes	Within the past year	no_data	American Gut Project	66	Flu	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	19993	Depends on the season	no_data	04/15/2013	no_data	I use an antiperspirant	no_data	female	25 to 50%	30	no_data	no_data	no	no	no_data	no_data	0.1, gram	Never	135	no_data	Daily	MN	no_data	no_data	UBERON:feces	right	Peppers	no_data	no	no_data	ENVO:human-associated habitat	no_data	3010920	04:05 PM	no	More than one year ago	no_data	no_data	8 or more hours	000001367	n	Omnivore	no_data	no_data	no_data	no	168.0	no_data	I do not have IBD	no_data	0	no_data	9606	no_data	408170	no_data	no_data	11 to 20	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no	no_data	AGFecal1	no_data	Caucasian	no_data	yes	no_data	no_data	no	1	no	50	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	Remained stable	no_data	no_data	I do not have diabetes	no_data	no	Rarely (few times/month)	no_data	no	no_data	no_data	no	44.8	no_data	yes	no	American Gut Project Stool sample
000015074.fixed319	AGCGACGAAGAC	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	45.0	unknown	unknown	y	8/21/14	Housing...	35.0	69.0	unknown	no_data	15074	no	UBERON:feces	Stress	Other	no	Lack of sleep	34.4	Rarely (few times/month)	35.0	no	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	France	100	Rarely (few times/month)	148025847	2101822668	no_data	no	no_data	311169B	-0.1	no	unknown	no_data	no	unknown	Diet_Int_2	no	Sun	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	A few times a year	notsure	American_Gut_round_13	45.0	PS14F4	no_data	yes	no_data	City	None	GAZ:United Kingdom	In the past year	unknown	human gut metagenome	unknown	yes	sequencing by synthesis	Not in the last year	no	yes	24.53076217	ENVO:urban biome	C1	Daily	unknown	unknown	CCME	CCME	no	GT	unknown	unknown	no	years	unknown	Occasionally (1-2 times/week)	human	no	yes	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	no	Within the past year	V4	American Gut Project	66.0	unknown	Moderate	unknown	Two	None	yes	True	no_data	Outdoors	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	6/27/14	no	Not sure, but I use some form of deoderant/antiperspirant	unknown	unknown	51 to 75%	20.0	16S rRNA	unknown	yes	yes	unknown	no_data	.1,g	Never	152.0	unknown	Rarely (few times/month)	CAMDEN TOWN	True	CCME	UBERON:feces	right	lettuce	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	9:00 AM	yes	More than one year ago	EMP	no	7-8 hours	15074	y	Omnivore	CCME	unknown	CCME	no	170.0	unknown	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	11 to 20	no	unknown	PC or TV screen	JG	AG13	2014-06-27 09:00:00	yes	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	Caucasian	1, Moderate, Housing...	no	HOWE	unknown	no	5	no	55.0	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	yes	Remained stable	71514	bread	I do not have diabetes	unknown	no	Rarely (few times/month)	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	yes	51.5	unknown	yes	yes	American Gut Project Stool sample
BLANK.12E.fixed591	TGCAAGCTAAGT	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	unknown	unknown	unknown	y	8/21/14	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	BLANK.12E	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	1624.1	unknown	unknown	unknown	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	unknown	unknown	unknown	148025847	BLANK.12E	no_data	unknown	no_data	311172B	-105.3	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	Knight_Cleanse_1	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	American_Gut_round_13	unknown	PS14F4	no_data	unknown	no_data	unknown	None	GAZ:United States of America	unknown	unknown	unclassified metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	unknown	unknown	unknown	unknown	ENVO:aquatic biome	E12	unknown	unknown	unknown	CCME	CCME	unknown	GT	unknown	unknown	unknown	years	unknown	unknown	blank	unknown	unknown	ENVO:sterile water	unknown	unknown	0.0	unknown	unknown	unknown	V4	American Gut Project	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	unknown	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	8/21/14	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	16S rRNA	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	.1,g	unknown	unknown	unknown	unknown	CO	True	CCME	unknown	unknown	unknown	RNBC9352	unknown	unknown	ENVO:water	unknown	no_data	12:00 PM	unknown	unknown	EMP	unknown	unknown	BLANK.12E	y	unknown	CCME	unknown	CCME	unknown	unknown	unknown	unknown	3111426B	0	JERE	408169	MiSeq	408169	unknown	completed	unknown	unknown	unknown	unknown	EZL	AG13	2014-08-21 12:00:00	unknown	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	unknown	unknown	unknown	NEWE	unknown	unknown	7	unknown	unknown	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	unknown	71514	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	unknown	unknown	no_data	unknown	40.0	unknown	unknown	unknown	American Gut Project Stool sample
000006971.1131657	no_data	no_data	40	no_data	no_data	n	no_data	no_data	59.0	59.0	no_data	1123137	no_data	no	UBERON:tongue	no_data	no_data	no	no_data	no_data	Daily	40	no	no_data	USA	100	Never	145032369	2037:873725475	ERC000011	no	000006971	311172B	-122.5	yes	no_data	no_data	no_data	no_data	Oral18	no	no_data	no_data	UBERON:saliva	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	60	12411155	6971	no_data	Mouth	Filtered	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	no_data	human oral metagenome	no_data	no_data	no_data	Not in the last year	no_data	no	22.31201172	ENVO:human-associated habitat	C7	Daily	no_data	No	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	no	years	no_data	Rarely (few times/month)	human	no	no_data	ENVO:saliva	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	no	More than one year ago	no_data	American Gut Project	64	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	22263	Both	no_data	7/1/13	no	I do not use deoderant or antiperspirant	no_data	female	Less than 25%	20	no_data	no_data	no_data	no	no_data	Oral18_6971_C7	0.1,g	Never	130	no_data	Never	WA	no_data	no_data	UBERON:oral cavity	right	salad greens	RNBC2791.091039	yes	no	ENVO:human-associated habitat	no_data	3361713	10:20 AM	no	More than one year ago	no_data	no_data	8 or more hours	6971	n	Omnivore	no_data	no sugar, fruit, alcohol, caffeine, preservatives,	no_data	no	163.0	no_data	I do not have IBD	311426B	0	RikE	9606	no_data	447426	no_data	no_data	11 to 20	no_data	no_data	no_data	MM	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	no_data	no	NEWE	no_data	no	7	no	40	MiSeq 1	311318B	no_data	no_data	no_data	Remained stable	52813	rice	I do not have diabetes	no_data	no	Never	no_data	no	no_data	no_data	no	47.6	no_data	yes	no	American Gut Project Mouth sample
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000001585.1212947	no_data	no_data	37	yes	no_data	n	no_data	no_data	68.0	81.0	no_data	1204554	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	443.6	Daily	16	no	no_data	USA	100	Occasionally (1-2 times/week)	no_data	2191:396855132	ERC000011	yes	000001585	no_data	-111.9	yes	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	yes	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	20	no_data	1585	no_data	Stool	Filtered	no_data	GAZ:United States of America	In the past month	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	Not in the last year	no_data	no	28.88820018	ENVO:urban biome	no_data	Daily	no_data	No	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	yes	years	no_data	Daily	human	no	no_data	ENVO:feces	no_data	Psoriasis	0.0	no_data	yes	no_data	no_data	American Gut Project	66	dental implant surgery	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	15765	Both	no_data	2/15/13	no	I use deoderant	no_data	female	Less than 25%	47	no_data	no_data	no	no	no_data	no_data	.1,g	Never	179	no_data	Rarely (few times/month)	AZ	no_data	no_data	UBERON:feces	right	greens	no_data	yes	no	ENVO:human-associated habitat	krill oil, vitamin D3, vitamin k2, magnesium citrate, ubiquinol, chlorella, aller-max w/quercetin & NAC, mercole joint formula w/HA & biovaflex	2373681	11:00 AM	yes	More than one year ago	no_data	no_data	6-7 hours	1585	y	Omnivore	no_data	low carb, no legumes, no grains except occasional rice	no_data	yes	168.0	amoxicillin	I do not have IBD	no_data	0	no_data	9606	MiSeq	408170	no_data	no_data	11 to 20	no_data	309	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	Caucasian	no_data	no	no_data	no_data	no	no_data	no	80	MiSeq1	no_data	no_data	no_data	no_data	Increased more than 10 pounds	no_data	vegetable & fruit	I do not have diabetes	no_data	yes	Rarely (few times/month)	no_data	no	no_data	no_data	no	33.6	no_data	yes	yes	American Gut Project Stool sample
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000017216.fixed534	GTCAACGCTGTC	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	56.0	unknown	yes	y	8/21/14	unknown	49.0	56.0	unknown	no_data	17216	no	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	1624.1	Daily	20.0	no	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	Poland	100	Daily	148025847	729959902	no_data	no	no_data	311172B	-105.3	no	unknown	no_data	yes	unknown	Knight_Cleanse_1	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	50.0	PS14F4	no_data	unknown	no_data	City	None	GAZ:United States of America	Not in the last year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	Not in the last year	unknown	no	21.45385742	ENVO:urban biome	B10	Daily	unknown	No	CCME	CCME	no	GT	unknown	unknown	no	years	unknown	Daily	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	no	Within the past 3 months	V4	American Gut Project	64.0	unknown	unknown	unknown	One	None	unknown	True	no_data	Outdoors	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	6/8/14	no	I use deoderant	unknown	female	Less than 25%	24.0	16S rRNA	unknown	yes	no	unknown	no_data	.1,g	Never	125.0	unknown	Occasionally (1-2 times/week)	CO	True	CCME	UBERON:feces	right	leafy greens	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	7:50 PM	no	Within the past 3 months	EMP	yes	7-8 hours	17216	y	Omnivore but no red meat	CCME	unknown	CCME	no	165.0	unknown	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	21 to 30	unknown	310.0	unknown	EZL	AG13	2014-06-08 19:50:00	no	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	Caucasian	unknown	no	NEWE	unknown	no	7	no	50.0	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Remained stable	71514	oatmeal, grains	I do not have diabetes	unknown	no	Never	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	no	40.0	unknown	yes	no	American Gut Project Stool sample
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BLANK.1.1G.fixed589	AACCGATGTACC	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	unknown	unknown	unknown	y	8/21/14	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	BLANK.1.1G	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	1624.1	unknown	unknown	unknown	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	unknown	unknown	unknown	148025847	BLANK.1.1G	no_data	unknown	no_data	311169B	-105.3	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	Diet_Int_1	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	American_Gut_round_13	unknown	PS14F4	no_data	unknown	no_data	unknown	None	GAZ:United States of America	unknown	unknown	unclassified metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	unknown	unknown	unknown	unknown	ENVO:aquatic biome	G1	unknown	unknown	unknown	CCME	CCME	unknown	GT	unknown	unknown	unknown	years	unknown	unknown	blank	unknown	unknown	ENVO:sterile water	unknown	unknown	0.0	unknown	unknown	unknown	V4	American Gut Project	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	unknown	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	8/21/14	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	16S rRNA	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	.1,g	unknown	unknown	unknown	unknown	CO	True	CCME	unknown	unknown	unknown	RNBC9352	unknown	unknown	ENVO:water	unknown	no_data	12:00 PM	unknown	unknown	EMP	unknown	unknown	BLANK.1.1G	y	unknown	CCME	unknown	CCME	unknown	unknown	unknown	unknown	3111426B	0	JERE	408169	MiSeq	408169	unknown	completed	unknown	unknown	unknown	unknown	JG	AG13	2014-08-21 12:00:00	unknown	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	unknown	unknown	unknown	HOWE	unknown	unknown	4	unknown	unknown	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	unknown	71514	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	unknown	unknown	no_data	unknown	40.0	unknown	unknown	unknown	American Gut Project Stool sample
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000007840.fixed1039	no_data	no_data	45	unknown	unknown	y	no_data	Housing...	37	72	unknown	no_data	no_data	no	UBERON:feces	unknown	unknown	yes	unknown	101.9	Never	22	unknown	no_data	Belgium	95	Daily	no_data	2461235470	ERC000011	no	no_data	no_data	4.4	no	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	no	unknown	no_data	UBERON:feces	no_data	Stool	unknown	unknown	no_data	20	no_data	no_data	unknown	no_data	Filtered	no_data	GAZ:Belgium	Not in the last year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	no_data	Not in the last year	no	no	23.32997269481201428271371560596513337535	ENVO:urban biome	no_data	Daily	unknown	unknown	no_data	UCSD	yes	no_data	daughter, daughter, wife	unknown	yes	years	unknown	Occasionally (1-2 times/week)	human	no	yes	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	no	Within the past month	no_data	American Gut Project	69	unknown	Contact...	unknown	unknown	no_data	unknown	True	no_data	Indoors	no_data	08/18/2013	no	Not sure, but I use some form of deoderant/antiperspirant	unknown	male	Less than 25%	28	no_data	unknown	no	no	unknown	no_data	no_data	Never	158	unknown	Regularly (3-5 times/week)	unknown	True	no_data	UBERON:feces	right	Tomatoes, Cuncumber	no_data	no	no	ENVO:human-associated habitat	Probactiol plus (L.acidophilus and B. lactis BI07) 50x10ex9 per day, Magnesium 1800mg	no_data	09:00 PM	yes	More than one year ago	no_data	unknown	Less than 5 hours	000007840	y	Omnivore	no_data	unknown	no_data	no	177	unknown	I do not have IBD	no_data	0	no_data	9606	no_data	no_data	unknown	completed	6 to 10	unknown	283	unknown	no_data	no_data	2013-08-18 09:00:00	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	yes	no_data	unknown	no	no_data	yes	80	no_data	no_data	unknown	no_data	unknown	Remained stable	no_data	Bread, Fruits	I do not have diabetes	unknown	no	Never	no_data	no	unknown	no_data	no	50.8	unknown	yes	no	Description
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BLANK106.1259755	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	y	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	1247494	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	1624.1	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	145049333	2246:unknown	ERC000011	no_data	BLANK106	108379Z	-105.3	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	AG_31	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	BP1214A22	no_data	no_data	control	no_data	no_data	GAZ:United States of America	no_data	no_data	unclassified metagenome	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	ENVO:aquatic biome	H9	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	years	no_data	no_data	unclassified	no_data	no_data	ENVO:sterile water	no_data	no_data	0.0	no_data	no_data	no_data	no_data	American Gut Project	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	11	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	.1,g	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	RNBC3267	no_data	no_data	ENVO:water	no_data	1661	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	BLANK106	y	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	311426B	0	JERE	408169	no_data	408169	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	JG	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	HOWE	no_data	no_data	5	no_data	no_data	no_data	111569B	no_data	no_data	no_data	no_data	101013	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	round9	no_data	40.0	no_data	no_data	no_data	American Gut Project control
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Blank17.G5.1130331	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	n	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	1121930	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	1630.1	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	145036613	2065:unknown	ERC000011	no_data	Blank17.G5	311169B	-105.3	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	Skin17	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	13131155	no_data	no_data	control	no_data	no_data	GAZ:United States of America	no_data	no_data	unclassified metagenome	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	ENVO:aquatic biome	G5	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	ENVO:sterile water	no_data	no_data	0.0	no_data	no_data	no_data	no_data	American Gut Project	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	248	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	Skin17_Blank17.G5_G5	.1,g	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	RNBC2791.100813	no_data	no_data	ENVO:water	no_data	37193	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	Blank17.G5	y	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	311426B	0	RobE	408169	no_data	408169	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	JG	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	HowE	no_data	no_data	2	no_data	no_data	no_data	311318B	no_data	no_data	no_data	no_data	52813	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	40.0	no_data	no_data	no_data	Extraction blank
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Blank18.E6.1131814	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	n	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	1123501	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	145032369	2037:unknown	ERC000011	no_data	Blank18.E6	311172B	107.3	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	Oral18	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	12411155	Blank18.E6	no_data	control	no_data	no_data	GAZ:United States of America	no_data	no_data	unclassified metagenome	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	ENVO:aquatic biome	E6	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	years	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	ENVO:sterile water	no_data	no_data	0.0	no_data	no_data	no_data	no_data	American Gut Project	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	3403	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	Oral18_Blank18.E6_E6	0.1,g	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	RNBC2791.091062	no_data	no_data	ENVO:water	no_data	513853	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	Blank18.E6	n	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	311426B	0	RikE	408169	no_data	408169	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	MM	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	NEWE	no_data	no_data	7	no_data	no_data	MiSeq 1	311318B	no_data	no_data	no_data	no_data	52813	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	40.0	no_data	no_data	no_data	American Gut Project Stool sample
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000001626.1212997	no_data	no_data	30	no_data	no_data	n	no_data	no_data	75.0	104.0	no_data	1204526	no_data	yes	UBERON:feces	no_data	no_data	yes	no_data	6.0	Regularly (3-5 times/week)	60	no	no_data	USA	100	Never	no_data	2191:2030696252	ERC000011	no	000001626	no_data	-118.1	no	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	50	no_data	1626	no_data	Stool	Filtered	no_data	GAZ:United States of America	In the past 6 months	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	In the past 6 months	no	no	31.19020062	ENVO:urban biome	no_data	Daily	no_data	no_data	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	yes	years	no_data	Occasionally (1-2 times/week)	human	no	yes	ENVO:feces	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	yes	Within the past year	no_data	American Gut Project	72	after surgery	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	21024	Indoors	no_data	8/9/13	no	I use deoderant	no_data	male	25 to 50%	10	no_data	no_data	no	yes	no_data	no_data	.1,g	Never	230	no_data	Rarely (few times/month)	CA	no_data	no_data	UBERON:feces	right	lettuce	no_data	no	no	ENVO:human-associated habitat	krill, vit c, multi, beta carotene	3165386	9:10 AM	no	More than one year ago	no_data	no_data	7-8 hours	1626	y	Omnivore	no_data	no_data	no_data	no	183.0	cipro	I do not have IBD	no_data	0	no_data	9606	MiSeq	408170	no_data	no_data	6 to 10	no_data	100	no_data	no_data	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	fish	yes	no_data	no_data	no	no_data	no	50	MiSeq1	no_data	no_data	no_data	no_data	Decreased more than 10 pounds	no_data	bread	I do not have diabetes	no_data	no	Rarely (few times/month)	no_data	no	no_data	no_data	no_data	33.8	no_data	yes	yes	American Gut Project Stool sample
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000012034.1257115	no_data	no_data	50	no_data	no_data	y	no_data	Housing...	51.0	74.0	no_data	1244846	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	no	no_data	57.7	Daily	30	no	no_data	USA	100	Never	145049333	2234:562089120	ERC000011	no	000012034	311172B	-122.5	no	no_data	12034	no_data	no_data	AG39	no	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	25	PS14A22	no_data	no_data	Stool	City	no_data	GAZ:United States of America	no_data	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	no_data	no	no	23.01031541	ENVO:urban biome	E5	Daily	no_data	no_data	no_data	no_data	yes	no_data	Spouse	no_data	no	years	no_data	Daily	human	no	no_data	ENVO:feces	no_data	Rosacea	0.0	yes	no	no_data	no_data	American Gut Project	71	no_data	Contact...	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	32855	Indoors	no_data	1/26/14	no	I use deoderant	no_data	male	Less than 25%	20	no_data	no_data	no	yes	no_data	no_data	.1,g	Never	165	no_data	Occasionally (1-2 times/week)	CA	no_data	no_data	UBERON:feces	right	Leafy greens	RNBC2791	no	no	ENVO:human-associated habitat	no_data	4961105	10:30 PM	no	More than one year ago	no_data	no_data	6-7 hours	12034	y	Omnivore	no_data	no_data	no_data	no	180.0	no_data	no_data	111569B	0	JERE	9606	no_data	408170	no_data	no_data	11 to 20	no_data	450	no_data	GG	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	no	NEWE	no_data	yes	9	no	75	no_data	311426B	no_data	no_data	no_data	Remained stable	101013	Fruit	I do not have diabetes	no_data	yes	Regularly (3-5 times/week)	no_data	no	no_data	no_data	no	37.8	no_data	yes	yes	American Gut Project Stool sample
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000007856.fixed943	no_data	no_data	46	unknown	unknown	y	no_data	Housing...	36	51	unknown	no_data	no_data	no	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	101.9	Never	15	no	no_data	Belgium	91	Daily	no_data	1833989590	ERC000011	no	no_data	no_data	4.4	no	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	no	unknown	no_data	UBERON:feces	no_data	Stool	unknown	unknown	no_data	15	no_data	no_data	unknown	no_data	Filtered	no_data	GAZ:Belgium	Not in the last year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	no_data	Not in the last year	no	no	18.07529843893480257116620752984389348026	ENVO:urban biome	no_data	Daily	unknown	I take the pill	no_data	UCSD	yes	no_data	Husband, Daughter, Daughter	unknown	no	years	unknown	Never	human	no	yes	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	no	Within the past month	no_data	American Gut Project	66	unknown	Contact...	unknown	unknown	no_data	unknown	True	no_data	None of the above	no_data	08/18/2013	no	Not sure, but I use some form of deoderant/antiperspirant	unknown	female	Less than 25%	30	no_data	unknown	no	no	unknown	no_data	no_data	Never	112	unknown	Regularly (3-5 times/week)	unknown	True	no_data	UBERON:feces	right	Tomatoes	no_data	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	09:00 PM	no	More than one year ago	no_data	unknown	7-8 hours	000007856	y	Omnivore	no_data	unknown	no_data	no	169	unknown	I do not have IBD	no_data	0	no_data	9606	no_data	no_data	unknown	completed	Less than 5	unknown	106	unknown	no_data	no_data	2013-08-18 09:00:00	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	no	no_data	unknown	no	no_data	no	85	no_data	no_data	unknown	no_data	unknown	Remained stable	no_data	Pasta, fruits	I do not have diabetes	unknown	no	Never	no_data	no	unknown	no_data	no	50.8	unknown	yes	no	Description
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000016715.fixed473	ACAGGAGGGTGT	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	52.0	unknown	unknown	y	8/21/14	Housing...	32.0	54.0	unknown	no_data	16715	no	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	2059.5	Regularly (3-5 times/week)	20.0	no	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	USA	100	Occasionally (1-2 times/week)	148025847	1315765006	no_data	no	no_data	311172B	-105.4	no	unknown	no_data	unknown	unknown	Knight_Cleanse_1	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	15.0	PS14F4	no_data	unknown	no_data	City	None	GAZ:United States of America	Not in the last year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	Not in the last year	no	no	20.59570313	ENVO:urban biome	B11	Daily	unknown	No	CCME	CCME	no	GT	unknown	unknown	no	years	unknown	Rarely (few times/month)	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	yes	Never	V4	American Gut Project	64.0	unknown	Contact...	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	Outdoors	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	7/11/14	no	I use deoderant	unknown	female	Less than 25%	28.0	16S rRNA	unknown	no	yes	unknown	no_data	.1,g	Daily	120.0	unknown	Never	CO	True	CCME	UBERON:feces	right	kale	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	5:05 AM	no	Within the past 6 months	EMP	unknown	7-8 hours	16715	y	Omnivore	CCME	unknown	CCME	no	163.0	unknown	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	More than 30	unknown	84.0	unknown	EZL	AG13	2014-07-11 05:05:00	yes	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	Caucasian	Contact..., Housing...	no	NEWE	unknown	yes	7	yes	85.0	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Remained stable	71514	wheat	I do not have diabetes	unknown	no	Never	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	yes	40.0	unknown	yes	no	American Gut Project Stool sample
000015284.fixed53	no_data	no_data	55	yes	unknown	y	no_data	Housing...	60	62	unknown	no_data	no_data	no	UBERON:feces	unknown	unknown	yes	unknown	3.0	Daily	20	no	no_data	USA	100	Never	no_data	593268927	ERC000011	no	no_data	no_data	-71.1	no	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	no	unknown	no_data	UBERON:feces	no_data	Stool	unknown	unknown	no_data	80	no_data	no_data	unknown	no_data	Filtered	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	no_data	Not in the last year	no	no	20.98053633	ENVO:urban biome	no_data	Daily	unknown	unknown	no_data	CCME	no	no_data	unknown	unknown	yes	years	unknown	Daily	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	yes	yes	Within the past year	no_data	American Gut Project	68	unknown	Contact...	unknown	unknown	no_data	unknown	True	72872	Indoors	no_data	5/13/14	no	I use deoderant	unknown	male	Less than 25%	25	no_data	unknown	no	no	unknown	no_data	no_data	Never	138	unknown	Daily	MA	True	no_data	UBERON:feces	right	Tomato	no_data	no	no	ENVO:human-associated habitat	fish oil + D3, B-C complex, saw palmetto	11003672	7:30 AM	no	More than one year ago	no_data	unknown	5-6 hours	15284	y	Vegetarian but eat seafood	no_data	unknown	no_data	no	173	unknown	I do not have IBD	no_data	0	no_data	9606	no_data	no_data	unknown	completed	11 to 20	unknown	350	unknown	no_data	no_data	2014-05-13 07:30:00	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	no	no_data	unknown	no	no_data	no	20	no_data	no_data	unknown	no_data	unknown	Remained stable	no_data	Wheat	I do not have diabetes	unknown	no	Never	no_data	no	unknown	no_data	no	42.4	unknown	yes	yes	None
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BLANK.51.11D.fixed882	no_data	no_data	unknown	unknown	unknown	y	no_data	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	no_data	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	1629.7	unknown	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	unknown	no_data	BLANK.51.11D	ERC000011	unknown	no_data	no_data	-105.3	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	unknown	no_data	Control	unknown	unknown	no_data	unknown	no_data	no_data	unknown	no_data	unknown	no_data	GAZ:United States of America	unknown	unknown	unclassified metagenome	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	unknown	unknown	ENVO:aquatic biome	no_data	unknown	unknown	unknown	no_data	UCSD	unknown	no_data	unknown	unknown	unknown	years	unknown	unknown	Control	unknown	unknown	ENVO:sterile water	unknown	unknown	0.0	unknown	unknown	unknown	no_data	American Gut Project	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	unknown	True	no_data	unknown	no_data	8/21/14	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	no_data	unknown	unknown	unknown	unknown	CO	True	no_data	unknown	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	ENVO:water	unknown	no_data	unknown	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	BLANK.51.11D	y	unknown	no_data	unknown	no_data	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	0	no_data	408169	no_data	no_data	unknown	completed	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	no_data	2014-08-21 12:00:00	unknown	no_data	no_data	no_data	unknown	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	no_data	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	unknown	40.0	unknown	unknown	unknown	Description
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000011047.1257166	no_data	no_data	40	no_data	no_data	y	no_data	Housing...	83.0	72.0	no_data	1244905	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	no	no_data	47.9	Never	45	no	no_data	USA	100	Rarely (few times/month)	145049333	2234:3407108945	ERC000011	yes	000011047	311169B	-122.1	no	no_data	11047	no_data	no_data	AG38	no	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	50	PS13J2	no_data	no_data	Stool	City	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	In the past 6 months	no	no	26.62248521	ENVO:urban biome	E8	Daily	no_data	No	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	yes	years	no_data	Daily	human	no	yes	ENVO:feces	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	no	Within the past 6 months	no_data	American Gut Project	65	no_data	Contact...	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	20877	Outdoors	no_data	1/25/14	no	I do not use deoderant or antiperspirant	no_data	female	Less than 25%	15	no_data	no_data	no	no	no_data	no_data	.1,g	Never	160	no_data	Daily	CA	no_data	no_data	UBERON:feces	right	lettace	RNBC2791	no	no	ENVO:human-associated habitat	fish oil	3152427	11:00 AM	yes	More than one year ago	no_data	no_data	8 or more hours	11047	y	Omnivore	no_data	no_data	no_data	yes	165.0	no_data	I do not have IBD	409185Z	0	RIKE	9606	no_data	408170	no_data	no_data	11 to 20	no_data	21	no_data	EL	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	no	HOWE	no_data	no	4	no	50	no_data	311318B	no_data	no_data	no_data	Remained stable	22114	whole wheat bread	I do not have diabetes	no_data	no	Regularly (3-5 times/week)	no_data	no	no_data	no_data	yes	37.4	no_data	yes	no	American Gut Project Stool sample
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BLANK.2.11A.fixed600	TTACCTTACACC	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	unknown	unknown	unknown	y	8/21/14	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	BLANK.2.11A	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	1624.1	unknown	unknown	unknown	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	unknown	unknown	unknown	148025847	BLANK.2.11A	no_data	unknown	no_data	311169B	-105.3	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	Diet_Int_2	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	American_Gut_round_13	unknown	PS14F4	no_data	unknown	no_data	unknown	None	GAZ:United States of America	unknown	unknown	unclassified metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	unknown	unknown	unknown	unknown	ENVO:aquatic biome	A11	unknown	unknown	unknown	CCME	CCME	unknown	GT	unknown	unknown	unknown	years	unknown	unknown	blank	unknown	unknown	ENVO:sterile water	unknown	unknown	0.0	unknown	unknown	unknown	V4	American Gut Project	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	unknown	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	8/21/14	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	16S rRNA	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	.1,g	unknown	unknown	unknown	unknown	CO	True	CCME	unknown	unknown	unknown	RNBC9352	unknown	unknown	ENVO:water	unknown	no_data	12:00 PM	unknown	unknown	EMP	unknown	unknown	BLANK.2.11A	y	unknown	CCME	unknown	CCME	unknown	unknown	unknown	unknown	3111426B	0	JERE	408169	MiSeq	408169	unknown	completed	unknown	unknown	unknown	unknown	JG	AG13	2014-08-21 12:00:00	unknown	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	unknown	unknown	unknown	HOWE	unknown	unknown	5	unknown	unknown	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	unknown	71514	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	unknown	unknown	no_data	unknown	40.0	unknown	unknown	unknown	American Gut Project Stool sample
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000016764.fixed517	ACCTTGACAAGA	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	62.0	yes	unknown	y	8/21/14	Housing...	33.0	77.0	unknown	no_data	16764	no	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	1619.8	Rarely (few times/month)	13.0	yes	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	USA	100	Daily	148025847	1275797751	no_data	no	no_data	311172B	-105.2	no	unknown	no_data	unknown	unknown	Knight_Cleanse_1	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	50.0	PS14F4	no_data	unknown	no_data	City	None	GAZ:United States of America	unknown	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	Not in the last year	no	no	28.28639053	ENVO:urban biome	D4	Daily	unknown	No	CCME	CCME	yes	GT	Mother, Father	unknown	unknown	years	unknown	Regularly (3-5 times/week)	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	no	More than one year ago	V4	American Gut Project	65.0	unknown	Contact...	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	Both	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	5/12/14	no	I use an antiperspirant	unknown	female	Less than 25%	25.0	16S rRNA	unknown	no	no	unknown	no_data	.1,g	Never	170.0	unknown	Regularly (3-5 times/week)	CO	True	CCME	UBERON:feces	left	cauliflower	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	7:20 AM	no	More than one year ago	EMP	unknown	7-8 hours	16764	y	Omnivore	CCME	unknown	CCME	no	165.0	unknown	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	11 to 20	unknown	64.0	unknown	EZL	AG13	2014-05-12 07:20:00	no	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	Caucasian	Contact..., Housing...	no	NEWE	unknown	no	7	no	50.0	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Remained stable	71514	maple syrup	I do not have diabetes	unknown	no	Rarely (few times/month)	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	no	40.0	unknown	yes	no	American Gut Project Stool sample
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000016490.fixed117	no_data	no_data	unknown	yes	unknown	y	no_data	Housing...	28	unknown	unknown	no_data	no_data	no	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	8.1	Occasionally (1-2 times/week)	unknown	not_sure	no_data	USA	0	Never	no_data	3604297628	ERC000011	no	no_data	no_data	-71.1	no	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	no	unknown	no_data	UBERON:feces	no_data	Stool	unknown	unknown	no_data	unknown	no_data	no_data	unknown	no_data	City	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	no_data	In the past 6 months	no	no	unknown	ENVO:urban biome	no_data	Daily	unknown	unknown	no_data	CCME	no	no_data	unknown	unknown	yes	years	unknown	Daily	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	Eczema	0.0	unknown	yes	Within the past year	no_data	American Gut Project	unknown	unknown	Contact...	unknown	unknown	no_data	unknown	True	27353	Outdoors	no_data	4/30/14	no	Not sure, but I use some form of deoderant/antiperspirant	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	unknown	no	yes	unknown	no_data	no_data	Never	unknown	unknown	Regularly (3-5 times/week)	MA	True	no_data	UBERON:feces	right	unknown	no_data	no	no	ENVO:human-associated habitat	Vitamin D3	4130303	5:40 PM	no	More than one year ago	no_data	unknown	6-7 hours	16490	y	Vegetarian but eat seafood	no_data	unknown	no_data	no	unknown	unknown	I do not have IBD	no_data	0	no_data	9606	no_data	no_data	unknown	completed	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	no_data	2014-04-30 17:40:00	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	yes	no_data	yes	no	no_data	no	unknown	no_data	no_data	unknown	no_data	unknown	Remained stable	no_data	unknown	I do not have diabetes	unknown	yes	Rarely (few times/month)	no_data	no	unknown	no_data	no	42.4	unknown	yes	yes	None
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000006863.1131589	no_data	no_data	38	no_data	no_data	n	no_data	Housing...	14.0	54.0	no_data	1123477	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	no	no_data	no_data	Never	28	no	no_data	USA	100	Never	145032369	2037:3006231654	ERC000011	yes	000006863	311169B	-118.4	yes	no_data	no_data	no_data	no_data	Fecal24	no	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	50	13131155	6863	no_data	Stool	Filtered	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	Not in the last year	no	no	18.79260414	ENVO:human-associated habitat	G5	Daily	no_data	no_data	no_data	no_data	yes	no_data	Father, Mother	no_data	yes	years	no_data	Occasionally (1-2 times/week)	human	no	no_data	ENVO:feces	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	yes	Never	no_data	American Gut Project	67	no_data	Contact...	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	35242	Indoors	no_data	9/3/13	no	I do not use deoderant or antiperspirant	no_data	no_data	Less than 25%	34	no_data	no_data	no	yes	no_data	Fecal24_6863_G5	0.1,g	Never	120	no_data	Never	CA	no_data	no_data	UBERON:feces	right	spinach	RNBC2791.091181	no	no	ENVO:human-associated habitat	no_data	5321542	3:30 PM	no	More than one year ago	no_data	no_data	8 or more hours	6863	n	Omnivore	no_data	no_data	no_data	yes	170.0	no_data	I do not have IBD	311426B	0	RikE	9606	no_data	408170	no_data	no_data	6 to 10	no_data	no_data	no_data	JG	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	yes	HOWE	no_data	no	8	no	50	MiSeq 1	311318B	no_data	no_data	no_data	Remained stable	52813	rice	I do not have diabetes	no_data	no	Rarely (few times/month)	no_data	no	no_data	no_data	no	34.1	no_data	no	no_data	American Gut Project Stool sample
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BLANK.F.8.1210934	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	n	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	1202378	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	1624.1	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	2186:unknown	ERC000011	no_data	BLANK.F.8	no_data	-105.3	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	control	no_data	no_data	GAZ:United States of America	no_data	no_data	unclassified metagenome	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	ENVO:aquatic biome	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	ENVO:sterile water	no_data	no_data	0.0	no_data	no_data	no_data	no_data	American Gut Project	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	3497	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	.1,g	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	ENVO:water	no_data	528047	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	BLANK.F.8	y	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	0	no_data	no_data	no_data	408169	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	40.0	no_data	no_data	no_data	Round_7_control
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000015259.fixed344	GTTCCTCCATTA	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	60.0	unknown	unknown	y	8/21/14	Housing...	56.0	75.0	unknown	no_data	15259	yes	UBERON:feces	unknown	unknown	yes	unknown	40.2	Rarely (few times/month)	20.0	yes	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	United Kingdom	100	Never	148025847	337650061	no_data	no	no_data	311169B	-0.1	no	unknown	no_data	unknown	unknown	Diet_Int_1	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	95.0	PS14F4	no_data	unknown	no_data	City	None	GAZ:United Kingdom	In the past year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	In the past 6 months	no	no	23.67244898	ENVO:urban biome	G10	Daily	unknown	unknown	CCME	CCME	no	GT	unknown	unknown	no	years	unknown	Daily	human	no	yes	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	yes	Within the past month	V4	American Gut Project	70.0	sinusitis	Contact...	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	Outdoors	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	7/2/14	no	Not sure, but I use some form of deoderant/antiperspirant	unknown	male	Less than 25%	20.0	16S rRNA	unknown	no	no	unknown	no_data	.1,g	Never	165.0	unknown	Regularly (3-5 times/week)	LONDON, CITY OF	True	CCME	UBERON:feces	left	unknown	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	7:00 AM	no	More than one year ago	EMP	unknown	7-8 hours	15259	y	Vegetarian but eat seafood	CCME	unknown	CCME	no	180.0	ciprox	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	11 to 20	unknown	unknown	unknown	JG	AG13	2014-07-02 07:00:00	no	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	Caucasian	Contact..., Housing...	no	HOWE	unknown	no	4	no	5.0	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Remained stable	71514	unknown	I do not have diabetes	unknown	no	Rarely (few times/month)	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	no	51.6	unknown	yes	no	American Gut Project Stool sample
000005915.1053722	no_data	no_data	16	no_data	no_data	n	no_data	no_data	42.0	73.0	no_data	1046046	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no	no_data	no_data	Daily	43	no	no_data	USA	100	Daily	no_data	2006:71714702	ERC000011	yes	000005915	no_data	-71.1	no	no_data	no_data	no_data	no_data	AG14r	no_data	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	90	no_data	no_data	no_data	Stool	Well	no_data	GAZ:United States of America	In the past year	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	In the past 6 months	unknown	no_data	27.12165680473372781065088757396449704139	ENVO:human-associated habitat	B9	Daily	no_data	No	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	yes	years	spray	Occasionally (1-2 times/week)	human	no_data	no_data	ENVO:feces	no_data	I do not have a skin condition	0.0	yes	yes	More than one year ago	no_data	American Gut Project	65	UTI	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	44824	Indoors	no_data	06/27/2013	no_data	I use deoderant	no_data	female	Less than 25%	41	no_data	no_data	no	yes	no_data	no_data	.1,g	Never	163	no_data	Never	NH	no_data	no_data	UBERON:feces	right	broccoli	no_data	yes	no_data	ENVO:human-associated habitat	Probiotic	6768424	10:45 AM	no	More than one year ago	no_data	no_data	7-8 hours	000005915	n	Omnivore but no red meat	no_data	Only eating meat, rice and some veggies due to IBD	no_data	yes	165.0	amoxicillin	no_data	no_data	0	no_data	9606	no_data	408170	no_data	no_data	Less than 5	no_data	15	no_data	no_data	no_data	no_data	yes	no_data	no_data	no_data	Caucasian	no_data	no	no_data	no_data	no	4	yes	10	MiSeq1	no_data	no_data	no_data	no_data	Decreased more than 10 pounds	no_data	brown rice	I do not have diabetes	no_data	no	Rarely (few times/month)	no_data	no	no_data	no_data	no	43.3	no_data	yes	no	American Gut Project Stool sample
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000009228.1130183	no_data	no_data	36	yes	no_data	n	no_data	no_data	58.0	54.0	no_data	1121713	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	no	no_data	no_data	Daily	18	no	no_data	USA	100	Never	145041781	2065:2795409061	ERC000011	yes	000009228	311172B	-105.2	yes	no_data	no_data	no_data	no_data	Fecal23	no	eggs, dairy, soy	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	85	13131155	no_data	no_data	Stool	Filtered	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	no_data	human gut metagenome	yes	no_data	no_data	In the past 6 months	no_data	no	18.39597751	ENVO:human-associated habitat	D1	Daily	no_data	No	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	yes	years	no_data	Regularly (3-5 times/week)	human	no	no_data	ENVO:feces	no_data	Eczema	0.0	yes	no	Within the past year	no_data	American Gut Project	68	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	22939	Both	no_data	8/8/13	no	I do not use deoderant or antiperspirant	no_data	female	Less than 25%	46	no_data	no_data	no	no	no_data	Fecal23_9228_D1	.1,g	Never	121	no_data	Occasionally (1-2 times/week)	CO	no_data	no_data	UBERON:feces	right	Leafy greens	RNBC2791.100813	no	no	ENVO:human-associated habitat	Fish oil, Vit. D, Probiotics, Green tea extract, Curcumin, Triphala,Calcium-D-glucarate, DIM, B vits./Folate	3456955	9:30 AM	no	More than one year ago	no_data	no_data	8 or more hours	9228	y	Omnivore	no_data	no_data	no_data	yes	173.0	no_data	I do not have IBD	110705B	0	RikE	9606	no_data	408170	no_data	no_data	21 to 30	no_data	360	no_data	JG	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	no_data	no	HowE	no_data	no	7	no	15	no_data	311313B	no_data	no_data	yes	Remained stable	101013	Beans	I do not have diabetes	no_data	no	Never	no_data	no	no_data	no_data	no	39.7	yes	yes	yes	American Gut Project Stool sample
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BLANK.12F.fixed592	TACCTGTGTCTT	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	unknown	unknown	unknown	y	8/21/14	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	BLANK.12F	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	1624.1	unknown	unknown	unknown	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	unknown	unknown	unknown	148025847	BLANK.12F	no_data	unknown	no_data	311172B	-105.3	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	Knight_Cleanse_1	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	American_Gut_round_13	unknown	PS14F4	no_data	unknown	no_data	unknown	None	GAZ:United States of America	unknown	unknown	unclassified metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	unknown	unknown	unknown	unknown	ENVO:aquatic biome	F12	unknown	unknown	unknown	CCME	CCME	unknown	GT	unknown	unknown	unknown	years	unknown	unknown	blank	unknown	unknown	ENVO:sterile water	unknown	unknown	0.0	unknown	unknown	unknown	V4	American Gut Project	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	unknown	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	8/21/14	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	16S rRNA	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	.1,g	unknown	unknown	unknown	unknown	CO	True	CCME	unknown	unknown	unknown	RNBC9352	unknown	unknown	ENVO:water	unknown	no_data	12:00 PM	unknown	unknown	EMP	unknown	unknown	BLANK.12F	y	unknown	CCME	unknown	CCME	unknown	unknown	unknown	unknown	3111426B	0	JERE	408169	MiSeq	408169	unknown	completed	unknown	unknown	unknown	unknown	EZL	AG13	2014-08-21 12:00:00	unknown	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	unknown	unknown	unknown	NEWE	unknown	unknown	7	unknown	unknown	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	unknown	71514	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	unknown	unknown	no_data	unknown	40.0	unknown	unknown	unknown	American Gut Project Stool sample
000008976.1212976	no_data	no_data	34	no_data	no_data	n	no_data	Indoor	34.0	62.0	no_data	1204579	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	no	no_data	97.7	Daily	30	no	no_data	USA	100	Never	no_data	2191:2444917028	ERC000011	no	000008976	no_data	-81.0	no	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	58	no_data	8976	no_data	Stool	City	no_data	GAZ:United States of America	In the past year	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	Not in the last year	no	no	23.68505859	ENVO:urban biome	no_data	Daily	no_data	No	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	yes	years	no_data	Regularly (3-5 times/week)	human	no	yes	ENVO:feces	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	no	More than one year ago	no_data	American Gut Project	64	Bronchitis	Little	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	17315	Both	no_data	9/26/13	no	I use deodorant	no_data	female	Less than 25%	36	no_data	no_data	no	no	no_data	no_data	.1,g	Never	138	no_data	Occasionally (1-2 times/week)	SC	no_data	no_data	UBERON:feces	left	zucchini	no_data	yes	no	ENVO:human-associated habitat	Antronex, kelp tablets	2614565	6:35 AM	no	More than one year ago	no_data	no_data	7-8 hours	8976	y	Omnivore	no_data	no grains	no_data	no	163.0	Azithromycin Dihydrate (250mg)	I do not have IBD	no_data	0	no_data	9606	MiSeq	408170	no_data	no_data	21 to 30	no_data	213	no_data	no_data	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Hispanic	Fish, Little, Indoor	no	no_data	no_data	no	no_data	no	42	MiSeq1	no_data	no_data	no_data	no_data	Remained stable	no_data	plantain	I do not have diabetes	no_data	no	Rarely (few times/month)	no_data	no	no_data	no_data	no	34.0	no_data	yes	yes	American Gut Project Stool sample
Blank18.F6.1131727	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	n	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	1123197	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	145032369	2037:unknown	ERC000011	no_data	Blank18.F6	311172B	107.3	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	Oral18	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	12411155	Blank18.F6	no_data	control	no_data	no_data	GAZ:United States of America	no_data	no_data	unclassified metagenome	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	ENVO:aquatic biome	F6	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	years	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	ENVO:sterile water	no_data	no_data	0.0	no_data	no_data	no_data	no_data	American Gut Project	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	1131	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	Oral18_Blank18.F6_F6	0.1,g	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	RNBC2791.091074	no_data	no_data	ENVO:water	no_data	170781	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	Blank18.F6	n	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	311426B	0	RikE	408169	no_data	408169	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	MM	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	NEWE	no_data	no_data	7	no_data	no_data	MiSeq 1	311318B	no_data	no_data	no_data	no_data	52813	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	40.0	no_data	no_data	no_data	American Gut Project Stool sample
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BLANK.2.10F.fixed598	CTCATCATGTTC	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	unknown	unknown	unknown	y	8/21/14	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	BLANK.2.10F	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	1624.1	unknown	unknown	unknown	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	unknown	unknown	unknown	148025847	BLANK.2.10F	no_data	unknown	no_data	311169B	-105.3	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	Diet_Int_2	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	American_Gut_round_13	unknown	PS14F4	no_data	unknown	no_data	unknown	None	GAZ:United States of America	unknown	unknown	unclassified metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	unknown	unknown	unknown	unknown	ENVO:aquatic biome	F10	unknown	unknown	unknown	CCME	CCME	unknown	GT	unknown	unknown	unknown	years	unknown	unknown	blank	unknown	unknown	ENVO:sterile water	unknown	unknown	0.0	unknown	unknown	unknown	V4	American Gut Project	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	unknown	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	8/21/14	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	16S rRNA	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	.1,g	unknown	unknown	unknown	unknown	CO	True	CCME	unknown	unknown	unknown	RNBC9352	unknown	unknown	ENVO:water	unknown	no_data	12:00 PM	unknown	unknown	EMP	unknown	unknown	BLANK.2.10F	y	unknown	CCME	unknown	CCME	unknown	unknown	unknown	unknown	3111426B	0	JERE	408169	MiSeq	408169	unknown	completed	unknown	unknown	unknown	unknown	JG	AG13	2014-08-21 12:00:00	unknown	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	unknown	unknown	unknown	HOWE	unknown	unknown	5	unknown	unknown	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	unknown	71514	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	unknown	unknown	no_data	unknown	40.0	unknown	unknown	unknown	American Gut Project Stool sample
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BLANK.1.1C.fixed585	ATAATTGCCGAG	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	unknown	unknown	unknown	y	8/21/14	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	BLANK.1.1C	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	1624.1	unknown	unknown	unknown	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	unknown	unknown	unknown	148025847	BLANK.1.1C	no_data	unknown	no_data	311169B	-105.3	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	Diet_Int_1	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	American_Gut_round_13	unknown	PS14F4	no_data	unknown	no_data	unknown	None	GAZ:United States of America	unknown	unknown	unclassified metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	unknown	unknown	unknown	unknown	ENVO:aquatic biome	C1	unknown	unknown	unknown	CCME	CCME	unknown	GT	unknown	unknown	unknown	years	unknown	unknown	blank	unknown	unknown	ENVO:sterile water	unknown	unknown	0.0	unknown	unknown	unknown	V4	American Gut Project	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	unknown	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	8/21/14	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	16S rRNA	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	.1,g	unknown	unknown	unknown	unknown	CO	True	CCME	unknown	unknown	unknown	RNBC9352	unknown	unknown	ENVO:water	unknown	no_data	12:00 PM	unknown	unknown	EMP	unknown	unknown	BLANK.1.1C	y	unknown	CCME	unknown	CCME	unknown	unknown	unknown	unknown	3111426B	0	JERE	408169	MiSeq	408169	unknown	completed	unknown	unknown	unknown	unknown	JG	AG13	2014-08-21 12:00:00	unknown	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	unknown	unknown	unknown	HOWE	unknown	unknown	4	unknown	unknown	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	unknown	71514	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	unknown	unknown	no_data	unknown	40.0	unknown	unknown	unknown	American Gut Project Stool sample
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000013077.1257345	no_data	no_data	48	no_data	no_data	y	no_data	Housing...	6.0	25.0	no_data	1244880	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	no	no_data	6.7	Rarely (few times/month)	13	yes	no_data	USA	100	Never	145049333	2234:1932170223	ERC000011	no	000013077	311172B	-76.1	no	no_data	13077	no_data	no_data	AG39	no	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	10	PS14A22	no_data	no_data	Stool	Filtered	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	Not in the last year	no	no	17.5033952	ENVO:urban biome	C1	Daily	no_data	no_data	no_data	no_data	yes	no_data	father, sister	no_data	yes	years	no_data	Daily	human	no	no_data	ENVO:feces	no_data	Eczema	0.0	no_data	yes	no_data	no_data	American Gut Project	47	no_data	Contact...	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	39192	no_data	no_data	1/20/14	no	I do not use deoderant or antiperspirant	no_data	male	25 to 50%	39	no_data	no_data	no	yes	no_data	no_data	.1,g	Never	55	no_data	Never	VA	no_data	no_data	UBERON:feces	right	broccoli	RNBC2791	no	no	ENVO:human-associated habitat	probiotics, vitamin d3	5917992	11:00 AM	no	More than one year ago	no_data	no_data	8 or more hours	13077	y	Omnivore	no_data	no_data	no_data	no	119.0	no_data	I do not have IBD	111569B	0	JERE	9606	no_data	408170	no_data	no_data	Less than 5	no_data	18	no_data	GG	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	no	NEWE	yes	no	9	no	90	no_data	311426B	no_data	no_data	no_data	Remained stable	101013	gluten free bread	I do not have diabetes	no_data	no	Never	no_data	no	no_data	no_data	no	36.9	no_data	no_data	no	American Gut Project Stool sample
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000015257.fixed342	CTGTGTCCATGG	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	60.0	unknown	unknown	y	8/21/14	Housing...	56.0	75.0	unknown	no_data	15257	yes	UBERON:feces	unknown	unknown	yes	unknown	40.2	Rarely (few times/month)	20.0	yes	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	United Kingdom	100	Never	148025847	337650061	no_data	no	no_data	311169B	-0.1	no	unknown	no_data	unknown	unknown	Diet_Int_1	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	95.0	PS14F4	no_data	unknown	no_data	City	None	GAZ:United Kingdom	In the past year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	In the past 6 months	no	no	23.67244898	ENVO:urban biome	D11	Daily	unknown	unknown	CCME	CCME	no	GT	unknown	unknown	no	years	unknown	Daily	human	no	yes	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	yes	Within the past month	V4	American Gut Project	70.0	sinusitis	Contact...	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	Outdoors	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	7/1/14	no	Not sure, but I use some form of deoderant/antiperspirant	unknown	male	Less than 25%	20.0	16S rRNA	unknown	no	no	unknown	no_data	.1,g	Never	165.0	unknown	Regularly (3-5 times/week)	LONDON, CITY OF	True	CCME	UBERON:feces	left	unknown	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	8:00 AM	no	More than one year ago	EMP	unknown	7-8 hours	15257	y	Vegetarian but eat seafood	CCME	unknown	CCME	no	180.0	ciprox	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	11 to 20	unknown	unknown	unknown	JG	AG13	2014-07-01 08:00:00	no	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	Caucasian	Contact..., Housing...	no	HOWE	unknown	no	4	no	5.0	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Remained stable	71514	unknown	I do not have diabetes	unknown	no	Rarely (few times/month)	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	no	51.6	unknown	yes	no	American Gut Project Stool sample
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000005065.1053744	no_data	no_data	48.5	no_data	no_data	n	no_data	no_data	59.0	89.0	no_data	1046042	no_data	no_data	UBERON:hand	no_data	no_data	yes	no_data	no_data	Rarely (few times/month)	15.3	no	no_data	Hungary	100	Never	no_data	2006:2542250235	ERC000011	no	000005065	no_data	-73.1	no	no_data	no_data	no_data	no_data	AG13	no_data	no_data	no_data	UBERON:sebum	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	31.2	no_data	no_data	no_data	Right hand	Well	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	no_data	human skin metagenome	no_data	no_data	no_data	Not in the last year	no	no	31.0077968367119625751837825796391178436	ENVO:human-associated habitat	E12	Daily	no_data	no_data	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	no	years	no_data	Occasionally (1-2 times/week)	human	no_data	no_data	ENVO:sebum	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	no	More than one year ago	no_data	American Gut Project	67	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	44808	Depends on the season	no_data	05/26/2013	no_data	I do not use deoderant or antiperspirant	no_data	male	51 to 75%	36.2	no_data	no_data	no	yes	no_data	no_data	.1,g	Never	198	no_data	Never	CT	no_data	no_data	UBERON:skin	right	Tomato	no_data	no	no_data	ENVO:human-associated habitat	no_data	6766008	01:40 PM	no	More than one year ago	no_data	no_data	6-7 hours	000005065	n	Omnivore	no_data	no_data	no_data	no	172.0	no_data	I do not have IBD	no_data	0	no_data	9606	no_data	539655	no_data	no_data	11 to 20	no_data	108.5	no_data	no_data	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	no_data	no	no_data	no_data	no	3	no	68.8	MiSeq1	no_data	no_data	no_data	no_data	Remained stable	no_data	Potato	I do not have diabetes	no_data	no	Rarely (few times/month)	no_data	no	no_data	no_data	no	41.4	no_data	no	no	American Gut Project Right hand sample
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BLANK.57.11F.fixed634	GCCTTACGATAG	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	unknown	unknown	unknown	y	9/18/14	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	BLANK.57.11F	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	1624.1	unknown	unknown	unknown	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	unknown	unknown	unknown	148025847	BLANK.57.11F	no_data	unknown	no_data	31172B	-105.3	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	AG_57	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	American_Gut_round_13	unknown	PS14F4	no_data	unknown	no_data	unknown	None	GAZ:United States of America	unknown	unknown	unclassified metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	unknown	unknown	unknown	unknown	ENVO:aquatic biome	F11	unknown	unknown	unknown	CCME	CCME	unknown	GT	unknown	unknown	unknown	years	unknown	unknown	blank	unknown	unknown	ENVO:sterile water	unknown	unknown	0.0	unknown	unknown	unknown	V4	American Gut Project	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	unknown	140918_M01918_0133_000000000-A7FTM	8/21/14	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	16S rRNA	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	.1,g	unknown	unknown	unknown	unknown	CO	True	CCME	unknown	unknown	unknown	RNBC9352	unknown	unknown	ENVO:water	unknown	no_data	12:00 PM	unknown	unknown	EMP	unknown	unknown	BLANK.57.11F	y	unknown	CCME	unknown	CCME	unknown	unknown	unknown	unknown	3111426B	0	JERE	408169	MiSeq	408169	unknown	completed	unknown	unknown	unknown	unknown	JG	AG13	2014-08-21 12:00:00	unknown	plate57	no_data	Illumina	unknown	unknown	unknown	NEWE	unknown	unknown	7	unknown	unknown	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	unknown	71514	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	unknown	unknown	no_data	unknown	40.0	unknown	unknown	unknown	American Gut Project Stool sample
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000016222.fixed375	GACTGACTCGTC	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	unknown	unknown	unknown	y	8/21/14	Indoor	25.0	55.0	unknown	no_data	16222	no	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	10.1	Rarely (few times/month)	unknown	no	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	United Kingdom	0	Never	148025847	3020496105	no_data	no	no_data	311169B	-0.1	no	unknown	no_data	unknown	unknown	Diet_Int_1	yes	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	unknown	PS14F4	no_data	unknown	no_data	City	None	GAZ:United Kingdom	In the past year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	Not in the last year	no	no	17.86662466	ENVO:urban biome	B4	Daily	unknown	unknown	CCME	CCME	no	GT	unknown	unknown	no	years	unknown	Never	human	no	yes	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	no	Within the past 3 months	V4	American Gut Project	69.0	Infected wisdom tooth	Extensive	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	None of the above	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	5/25/14	no	I do not use deoderant or antiperspirant	unknown	male	unknown	unknown	16S rRNA	unknown	no	no	unknown	no_data	.1,g	Daily	121.0	unknown	Regularly (3-5 times/week)	LONDON	True	CCME	UBERON:feces	right	unknown	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	9:00 PM	no	Within the past year	EMP	unknown	6-7 hours	16222	y	Omnivore	CCME	unknown	CCME	no	178.0	Amoxicillin	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	unknown	unknown	unknown	unknown	JG	AG13	2014-05-25 21:00:00	no	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	Caucasian	Cat, Extensive, Indoor	no	HOWE	unknown	no	4	no	unknown	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Remained stable	71514	unknown	I do not have diabetes	unknown	no	Never	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	yes	51.5	unknown	yes	no	American Gut Project Stool sample
000003535.1053768	no_data	no_data	60	no_data	no_data	n	no_data	no_data	44.0	46.0	no_data	1046258	no_data	no_data	UBERON:hand	no_data	no_data	no	no_data	no_data	Regularly (3-5 times/week)	20	no	no_data	USA	100	Rarely (few times/month)	no_data	2006:4151022428	ERC000011	no	000003535	no_data	-74.0	no	no_data	no_data	no_data	no_data	AG13	no_data	no_data	no_data	UBERON:sebum	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	30	no_data	no_data	no_data	Left hand	City	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	no_data	human skin metagenome	no_data	no_data	no_data	In the past year	unknown	no	20.1136111111111111111111111111111111111	ENVO:human-associated habitat	A4	Daily	no_data	No	no_data	no_data	yes	no_data	husband	no_data	no	years	no_data	Regularly (3-5 times/week)	human	no_data	no_data	ENVO:sebum	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	no	Within the past 6 months	no_data	American Gut Project	60	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	58553	Indoors	no_data	04/14/2013	no_data	I do not use deoderant or antiperspirant	no_data	female	Less than 25%	20	no_data	no_data	no	no	no_data	no_data	.1,g	Never	103	no_data	Never	NY	no_data	no_data	UBERON:skin	right	asparagus	no_data	no	no_data	ENVO:human-associated habitat	no_data	8841503	12:30 PM	no	More than one year ago	no_data	no_data	5-6 hours	000003535	n	Omnivore	no_data	no_data	no_data	no_data	152.0	no_data	I do not have IBD	no_data	0	no_data	9606	no_data	539655	no_data	no_data	11 to 20	no_data	195	no_data	no_data	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Asian or Pacific Islander	no_data	yes	no_data	no_data	no	3	no	70	MiSeq1	no_data	no_data	no_data	no_data	Remained stable	no_data	bread	I do not have diabetes	no_data	no	Never	no_data	no	no_data	no_data	no	40.7	no_data	yes	no	American Gut Project Left hand sample
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000016279.fixed419	CTAGCTATGGAC	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	60.0	unknown	unknown	y	8/21/14	Housing...	56.0	75.0	unknown	no_data	16279	yes	UBERON:feces	unknown	unknown	yes	unknown	40.2	Rarely (few times/month)	20.0	yes	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	United Kingdom	100	Never	148025847	337650061	no_data	no	no_data	311169B	-0.1	no	unknown	no_data	unknown	unknown	Diet_Int_1	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	95.0	PS14F4	no_data	unknown	no_data	City	None	GAZ:United Kingdom	In the past year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	In the past 6 months	no	no	23.67244898	ENVO:urban biome	E12	Daily	unknown	unknown	CCME	CCME	no	GT	unknown	unknown	no	years	unknown	Daily	human	no	yes	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	yes	Within the past month	V4	American Gut Project	70.0	sinusitis	Contact...	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	Outdoors	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	4/26/14	no	Not sure, but I use some form of deoderant/antiperspirant	unknown	male	Less than 25%	20.0	16S rRNA	unknown	no	no	unknown	no_data	.1,g	Never	165.0	unknown	Regularly (3-5 times/week)	LONDON, CITY OF	True	CCME	UBERON:feces	left	unknown	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	10:00 AM	no	More than one year ago	EMP	unknown	7-8 hours	16279	y	Vegetarian but eat seafood	CCME	unknown	CCME	no	180.0	ciprox	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	11 to 20	unknown	unknown	unknown	JG	AG13	2014-04-26 10:00:00	no	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	Caucasian	Contact..., Housing...	no	HOWE	unknown	no	4	no	5.0	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Remained stable	71514	unknown	I do not have diabetes	unknown	no	Rarely (few times/month)	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	no	51.6	unknown	yes	no	American Gut Project Stool sample
Blank21.C9.1130417	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	n	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	1121637	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	1634.1	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	145032369	2065:unknown	ERC000011	no_data	Blank21.C9	311172B	-105.3	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	Fecal21	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	13131155	no_data	no_data	control	no_data	no_data	GAZ:United States of America	no_data	no_data	unclassified metagenome	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	ENVO:aquatic biome	C9	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	ENVO:sterile water	no_data	no_data	0.0	no_data	no_data	no_data	no_data	American Gut Project	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	359	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	Fecal21_Blank21.C9_C9	.1,g	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	RNBC2791.100813	no_data	no_data	ENVO:water	no_data	52088	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	Blank21.C9	y	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	110705B	0	RikE	408169	no_data	408169	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	GH	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	NewE	no_data	no_data	5	no_data	no_data	no_data	311313B	no_data	no_data	no_data	no_data	52813	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	40.0	no_data	no_data	no_data	Extraction blank
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000016763.fixed516	AAGCAGATTGTC	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	30.0	unknown	unknown	y	8/21/14	Housing...	22.0	83.0	unknown	no_data	16763	no	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	1664.9	Rarely (few times/month)	30.0	yes	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	USA	100	Never	148025847	2334514222	no_data	no	no_data	311172B	-105.2	yes	unknown	no_data	no	unknown	Knight_Cleanse_1	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	55.0	PS14F4	no_data	unknown	no_data	City	None	GAZ:United States of America	Not in the last year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	Not in the last year	no	no	22.51644737	ENVO:urban biome	B6	Daily	unknown	unknown	CCME	CCME	no	GT	unknown	unknown	no	years	unknown	Regularly (3-5 times/week)	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	no	Within the past 6 months	V4	American Gut Project	76.0	unknown	Contact...	unknown	Three	None	unknown	True	no_data	Both	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	6/10/14	no	I use deoderant	unknown	male	25 to 50%	40.0	16S rRNA	unknown	yes	yes	unknown	no_data	.1,g	Rarely (few times/month)	185.0	unknown	Regularly (3-5 times/week)	CO	True	CCME	UBERON:feces	left	kale	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	8:30 AM	no	More than one year ago	EMP	yes	6-7 hours	16763	y	Omnivore	CCME	unknown	CCME	no	193.0	unknown	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	11 to 20	unknown	280.0	unknown	EZL	AG13	2014-06-10 08:30:00	unknown	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	Caucasian	Contact..., Housing...	no	NEWE	unknown	no	7	yes	45.0	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Remained stable	71514	bread	I do not have diabetes	unknown	no	Rarely (few times/month)	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	unknown	40.0	unknown	no	no	American Gut Project Stool sample
000002820.1053783	no_data	no_data	45	no_data	no_data	n	no_data	no_data	67.0	74.0	no_data	1046219	no_data	no_data	UBERON:tongue	no_data	no_data	yes	no_data	no_data	Daily	22	no	no_data	USA	100	Never	no_data	2006:114496691	ERC000011	no	000002820	no_data	-124.3	no	no_data	no_data	no_data	no_data	AG12	no_data	no_data	no_data	UBERON:saliva	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	50	no_data	no_data	no_data	Mouth	Well	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	no_data	human oral metagenome	no_data	no_data	no_data	In the past 6 months	no	no	26.62878787878787878787878787878787878789	ENVO:human-associated habitat	F9	Daily	no_data	no_data	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	no	years	no_data	Daily	human	no_data	no_data	ENVO:saliva	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	yes	More than one year ago	no_data	American Gut Project	66	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	41765	Both	no_data	04/04/2013	no_data	I do not use deoderant or antiperspirant	no_data	male	Less than 25%	33	no_data	no_data	no	yes	no_data	no_data	.1,g	Never	165	no_data	Daily	CA	no_data	no_data	UBERON:oral cavity	right	leafy greens	no_data	no	no_data	ENVO:human-associated habitat	no_data	6306515	12:05 PM	no	More than one year ago	no_data	no_data	7-8 hours	000002820	n	Vegetarian but eat seafood	no_data	no_data	no_data	no	168.0	no_data	I do not have IBD	no_data	0	no_data	9606	no_data	447426	no_data	no_data	11 to 20	no_data	350	no_data	no_data	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	no_data	no	no_data	yes	no	2	no	50	MiSeq1	no_data	no_data	no_data	no_data	Remained stable	no_data	whole grains	I do not have diabetes	no_data	no	Never	no_data	no	no_data	no_data	no	40.5	no_data	yes	yes	American Gut Project Mouth sample
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000014563.fixed646	no_data	no_data	unknown	unknown	unknown	y	no_data	Indoor	35	57	unknown	no_data	no_data	no	UBERON:feces	Stress	unknown	no	Other	112.6	Regularly (3-5 times/week)	unknown	no	no_data	USA	0	Daily	no_data	987657397	ERC000011	no	no_data	no_data	-76.3	yes	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	no	unknown	no_data	UBERON:feces	no_data	Stool	Monthly	no	no_data	40	no_data	no_data	yes	no_data	Bottled	no_data	GAZ:United States of America	In the past 6 months	yes	human gut metagenome	unknown	unknown	no_data	In the past year	no	yes	21.62548828	ENVO:urban biome	no_data	Daily	Excedrin or Aleve	No	no_data	CCME	no	no_data	unknown	unknown	yes	years	unknown	Occasionally (1-2 times/week)	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	Eczema	0.0	unknown	yes	Within the past 6 months	no_data	American Gut Project	64	SIBO	Extensive	unknown	unknown	no_data	unknown	y	no_data	Indoors	no_data	7/19/14	no	I use an antiperspirant	unknown	female	25 to 50%	unknown	no_data	unknown	no	no	unknown	no_data	no_data	Never	126	unknown	Rarely (few times/month)	NEW YORK	y	no_data	UBERON:feces	right	Lettuce/Leafy Greens	no_data	yes	no	ENVO:human-associated habitat	Herbal Tea: peppermint, fennel, licorice, lemon balm, ginger, B Complex, Lutein, Omega 3	no_data	8:35 AM	no	More than one year ago	no_data	unknown	6-7 hours	000014563	y	Omnivore but no red meat	no_data	Low FODMAP	no_data	no	163	Riflaximin	I do not have IBD	no_data	0	no_data	9606	no_data	no_data	unknown	completed	Less than 5	yes	unknown	unknown	no_data	no_data	7/19/14 0:00	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	dog, Extensive, Indoor	yes	no_data	unknown	no	no_data	no	60	no_data	no_data	Hormones	no_data	unknown	Decreased more than 10 pounds	no_data	Brown Rice Bread	I do not have diabetes	unknown	no	Never	no_data	no	unknown	no_data	no	43.2	unknown	yes	yes	Description
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000017287.fixed543	AACCATGCCAAC	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	68.0	unknown	unknown	y	9/18/14	Indoor	3.0	17.0	unknown	no_data	17287	no	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	32.7	Rarely (few times/month)	17.0	yes	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	USA	99	Never	148025847	696051083	no_data	no	no_data	31172B	-76.9	yes	unknown	no_data	unknown	unknown	AG_57	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	70.0	PS14F4	no_data	unknown	no_data	Filtered	None	GAZ:United States of America	Not in the last year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	In the past year	no	no	21.80734694	ENVO:urban biome	D7	Regularly (3-5 times/week)	unknown	unknown	CCME	CCME	yes	GT	Mother	unknown	no	years	unknown	Regularly (3-5 times/week)	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	no	Never	V4	American Gut Project	35.0	unknown	Extensive	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	Outdoors	140918_M01918_0133_000000000-A7FTM	8/14/14	no	I do not use deoderant or antiperspirant	unknown	male	51 to 75%	14.0	16S rRNA	unknown	no	no	unknown	no_data	.1,g	Never	38.0	unknown	Never	MD	True	CCME	UBERON:feces	right	peas	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	7:40 PM	no	More than one year ago	EMP	unknown	8 or more hours	17287	y	Omnivore	CCME	unknown	CCME	yes	89.0	unknown	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	6 to 10	unknown	101.9	unknown	JG	AG13	2014-08-14 19:40:00	no	plate57	no_data	Illumina	African American	Dog, Extensive, Indoor	no	NEWE	unknown	no	7	no	30.0	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Remained stable	71514	rice	I do not have diabetes	unknown	no	Rarely (few times/month)	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	no	39.0	unknown	no	no	American Gut Project Stool sample
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000010981.1210735	no_data	no_data	60	no_data	no_data	n	no_data	Housing...	41.0	52.0	no_data	1202457	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	no	no_data	32.3	Regularly (3-5 times/week)	20	no	no_data	Canada	100	Daily	145042558	2186:4007956351	ERC000011	no	000010981	311169B	-122.4	no	no_data	no_data	no_data	no_data	AG_Plate36	no	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	85	PS13J2	no_data	no_data	Stool	City	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	Not in the last year	no	no	20.36911061	ENVO:urban biome	E2	Daily	no_data	No	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	yes	years	no_data	Daily	human	no	yes	ENVO:feces	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	yes	Within the past month	no_data	American Gut Project	63	no_data	Contact...	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	16786	Indoors	no_data	1/7/14	no	I use deoderant	no_data	female	Less than 25%	20	no_data	no_data	no	yes	no_data	no_data	.1,g	Never	115	no_data	Occasionally (1-2 times/week)	CA	no_data	no_data	UBERON:feces	right	carrots, cabbage, lettuce	RNBC2791	no	no	ENVO:human-associated habitat	iron, potassium, probiotic	2534686	6:00 AM	no	More than one year ago	no_data	no_data	6-7 hours	10981	y	Omnivore	no_data	no_data	no_data	no	160.0	no_data	I do not have IBD	311313B	0	ROBE	9606	no_data	408170	no_data	no_data	11 to 20	no_data	350	no_data	GG	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	no	HOWE	no_data	no	10	no	15	no_data	111075B	no_data	no_data	no_data	Remained stable	101013	rice, bran	I do not have diabetes	no_data	no	Rarely (few times/month)	no_data	no	no_data	no_data	no	37.7	no_data	yes	yes	American Gut Project Stool sample
000006824.fixed35	no_data	no_data	57	unknown	unknown	y	no_data	Housing...	79	66	unknown	no_data	no_data	yes	UBERON:skin	unknown	unknown	no	unknown	33.3	Daily	12	no	no_data	Germany	100	Daily	no_data	1005005301	ERC000011	no	no_data	no_data	-74.7	no	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	no	unknown	no_data	UBERON:sebum	no_data	Forehead	unknown	unknown	no_data	85	no_data	no_data	unknown	no_data	Bottled	no_data	GAZ:United States of America	In the past week	unknown	human skin metagenome	unknown	unknown	no_data	Not in the last year	no	no	26.70083247	ENVO:urban biome	no_data	Daily	unknown	No	no_data	CCME	yes	no_data	daughter	unknown	yes	years	unknown	Occasionally (1-2 times/week)	human	no	unknown	ENVO:sebum	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	yes	More than one year ago	no_data	American Gut Project	62	Bladder infection	Contact...	unknown	unknown	no_data	unknown	True	24317	Outdoors	no_data	9/29/13	no	I use deoderant	unknown	female	Less than 25%	31	no_data	unknown	no	no	unknown	no_data	no_data	Never	146	unknown	Occasionally (1-2 times/week)	NJ	True	no_data	UBERON:skin	right	Kale	no_data	unknown	no	ENVO:human-associated habitat	L-Glutamine, Spirulina, Wheatgrass, Procera, Calcium/Magnesium	3671867	11:45 AM	yes	More than one year ago	no_data	unknown	5-6 hours	6824	y	Omnivore	no_data	unknown	no_data	no	157	Cipro	I do not have IBD	no_data	0	no_data	9606	no_data	no_data	unknown	completed	11 to 20	unknown	25	unknown	no_data	no_data	2013-09-29 11:45:00	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	yes	no_data	unknown	no	no_data	no	15	no_data	no_data	unknown	no_data	unknown	Remained stable	no_data	Quinoa	I do not have diabetes	unknown	no	Never	no_data	no	unknown	no_data	no	40.6	unknown	yes	no	None
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000009038.1259677	no_data	no_data	55	no_data	no_data	y	no_data	Indoor	66.0	79.0	no_data	1247362	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	no	no_data	747.7	Daily	22	no	no_data	USA	100	Never	145049333	2246:3710664005	ERC000011	no	000009038	108379Z	-110.9	yes	no_data	no_data	no_data	no_data	AG_45	no	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	44	BP1214A22	no_data	no_data	Stool	Filtered	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	Not in the last year	no	no	23.73167438	ENVO:urban biome	A5	Daily	no_data	no_data	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	yes	years	no_data	Regularly (3-5 times/week)	human	no	yes	ENVO:feces	no_data	Psoriasis	0.0	no_data	yes	More than one year ago	no_data	American Gut Project	72	no_data	Moderate	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	5	no_data	no_data	10/11/13	no	I use deoderant	no_data	male	Less than 25%	23	no_data	no_data	no	no	no_data	no_data	.1,g	Never	175	no_data	Rarely (few times/month)	AZ	no_data	no_data	UBERON:feces	right	green beans (?)	RNBC3083	yes	no	ENVO:human-associated habitat	chyzme, vit c, vit A/D, probiotics, tumeric	755	7:30 AM	no	More than one year ago	no_data	no_data	7-8 hours	9038	y	Omnivore but no red meat	no_data	low wheat, no cow dairy, no beef no pork	no_data	no	183.0	no_data	Ulcerative colitis	111075B	0	ROBE	9606	no_data	408170	no_data	no_data	11 to 20	no_data	140	no_data	JG	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	dog, Moderate, Indoor	no	HOWE	no_data	no	4	no	56	no_data	311313B	no_data	no_data	no_data	Remained stable	101013	gluten free cereal	I do not have diabetes	no_data	no	Rarely (few times/month)	no_data	no	no_data	round9	no	32.3	no_data	yes	no	American Gut Project Stool sample
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000016227.fixed379	ACCTGGGAATAT	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	unknown	unknown	unknown	y	8/21/14	Housing...	unknown	unknown	unknown	no_data	16227	no	UBERON:feces	unknown	unknown	unknown	unknown	15.5	unknown	unknown	unknown	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	Afghanistan	0	unknown	148025847	1891536758	no_data	unknown	no_data	311169B	-0.2	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	Diet_Int_1	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	unknown	PS14F4	no_data	unknown	no_data	unknown	None	GAZ:United Kingdom	unknown	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	unknown	no	unknown	unknown	ENVO:urban biome	F2	unknown	unknown	unknown	CCME	CCME	unknown	GT	unknown	unknown	unknown	years	unknown	unknown	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	unknown	0.0	unknown	unknown	unknown	V4	American Gut Project	unknown	unknown	Contact...	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	unknown	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	6/14/14	no	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	16S rRNA	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	.1,g	unknown	unknown	unknown	unknown	LONDON	True	CCME	UBERON:feces	unknown	unknown	RNBC9352	unknown	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	7:45 AM	unknown	unknown	EMP	unknown	unknown	16227	y	unknown	CCME	unknown	CCME	unknown	unknown	unknown	unknown	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	unknown	unknown	unknown	unknown	JG	AG13	2014-06-14 07:45:00	unknown	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	unknown	Contact..., Housing...	unknown	HOWE	unknown	unknown	4	unknown	unknown	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	unknown	71514	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	unknown	unknown	no_data	unknown	51.4	unknown	unknown	unknown	American Gut Project Stool sample
000016233.fixed384	GATCCTCATGCG	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	unknown	unknown	unknown	y	8/21/14	Indoor	25.0	55.0	unknown	no_data	16233	no	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	10.1	Rarely (few times/month)	unknown	no	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	United Kingdom	0	Never	148025847	3020496105	no_data	no	no_data	311169B	-0.1	no	unknown	no_data	unknown	unknown	Diet_Int_1	yes	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	unknown	PS14F4	no_data	unknown	no_data	City	None	GAZ:United Kingdom	In the past year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	Not in the last year	no	no	17.86662466	ENVO:urban biome	A4	Daily	unknown	unknown	CCME	CCME	no	GT	unknown	unknown	no	years	unknown	Never	human	no	yes	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	no	Within the past 3 months	V4	American Gut Project	69.0	Infected wisdom tooth	Extensive	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	None of the above	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	6/4/14	no	I do not use deoderant or antiperspirant	unknown	male	unknown	unknown	16S rRNA	unknown	no	no	unknown	no_data	.1,g	Daily	121.0	unknown	Regularly (3-5 times/week)	LONDON	True	CCME	UBERON:feces	right	unknown	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	7:50 AM	no	Within the past year	EMP	unknown	6-7 hours	16233	y	Omnivore	CCME	unknown	CCME	no	178.0	Amoxicillin	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	unknown	unknown	unknown	unknown	JG	AG13	2014-06-04 07:50:00	no	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	Caucasian	Cat, Extensive, Indoor	no	HOWE	unknown	no	4	no	unknown	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Remained stable	71514	unknown	I do not have diabetes	unknown	no	Never	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	yes	51.5	unknown	yes	no	American Gut Project Stool sample
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000016771.fixed524	TAGGCTCGTGCT	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	62.0	yes	unknown	y	8/21/14	Housing...	33.0	77.0	unknown	no_data	16771	no	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	1619.8	Rarely (few times/month)	13.0	yes	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	USA	100	Daily	148025847	1275797751	no_data	no	no_data	311172B	-105.2	no	unknown	no_data	unknown	unknown	Knight_Cleanse_1	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	50.0	PS14F4	no_data	unknown	no_data	City	None	GAZ:United States of America	unknown	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	Not in the last year	no	no	28.28639053	ENVO:urban biome	F3	Daily	unknown	No	CCME	CCME	yes	GT	Mother, Father	unknown	unknown	years	unknown	Regularly (3-5 times/week)	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	no	More than one year ago	V4	American Gut Project	65.0	unknown	Contact...	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	Both	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	5/21/14	no	I use an antiperspirant	unknown	female	Less than 25%	25.0	16S rRNA	unknown	no	no	unknown	no_data	.1,g	Never	170.0	unknown	Regularly (3-5 times/week)	CO	True	CCME	UBERON:feces	left	cauliflower	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	5:50 AM	no	More than one year ago	EMP	unknown	7-8 hours	16771	y	Omnivore	CCME	unknown	CCME	no	165.0	unknown	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	11 to 20	unknown	64.0	unknown	EZL	AG13	2014-05-21 05:50:00	no	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	Caucasian	Contact..., Housing...	no	NEWE	unknown	no	7	no	50.0	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Remained stable	71514	maple syrup	I do not have diabetes	unknown	no	Rarely (few times/month)	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	no	40.0	unknown	yes	no	American Gut Project Stool sample
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000015190.fixed335	ATACGCATCAAG	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	unknown	unknown	unknown	y	9/18/14	Housing...	26.0	74.0	unknown	no_data	15190	no	UBERON:feces	Lack of sleep	Depression	no	Stress	229.0	Daily	unknown	no	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	USA	0	Never	148025847	1694519516	no_data	no	no_data	31172B	-80.0	no	yes	no_data	no	unknown	AG_57	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	Monthly	yes	American_Gut_round_13	unknown	PS14F4	no_data	yes	no_data	Filtered	None	GAZ:United States of America	Not in the last year	yes	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	In the past year	no	yes	unknown	ENVO:urban biome	A4	Daily	Imitrex; Excedrin Migraine	unknown	CCME	CCME	no	GT	unknown	unknown	yes	years	unknown	Occasionally (1-2 times/week)	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	yes	yes	More than one year ago	V4	American Gut Project	unknown	unknown	Contact...	unknown	One	None	unknown	True	no_data	Depends on the season	140918_M01918_0133_000000000-A7FTM	5/1/14	no	I use an antiperspirant	unknown	male	unknown	unknown	16S rRNA	unknown	yes	yes	yes	no_data	.1,g	Rarely (few times/month)	165.0	unknown	Daily	PA	True	CCME	UBERON:feces	left	unknown	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	Vit B Complex w/C; Vit D	no_data	10:20 AM	no	More than one year ago	EMP	no	6-7 hours	15190	y	Omnivore	CCME	unknown	CCME	no	unknown	unknown	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	unknown	yes	unknown	unknown	JG	AG13	2014-05-01 10:20:00	yes	plate57	no_data	Illumina	Caucasian	Contact..., Housing...	no	NEWE	unknown	no	7	yes	unknown	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Remained stable	71514	unknown	I do not have diabetes	unknown	no	Never	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	no	40.4	unknown	no	yes	American Gut Project Stool sample
000006634.1131683	no_data	no_data	48	no_data	no_data	n	no_data	no_data	26.0	80.0	no_data	1123181	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	no	no_data	no_data	Daily	19	no	no_data	USA	100	Never	145032369	2037:2534239497	ERC000011	no	000006634	311172B	-74.0	no	no_data	no_data	no_data	no_data	Fecal19	no	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	22	12411155	6634	no_data	Stool	City	no_data	GAZ:United States of America	In the past month	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	In the past year	no	no	no_data	ENVO:human-associated habitat	B6	Daily	no_data	no_data	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	yes	years	no_data	Daily	human	no	no_data	ENVO:feces	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	no	Within the past year	no_data	American Gut Project	no_data	wound	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	19691	Both	no_data	7/3/13	no	Not sure, but I use some form of deoderant/antiperspirant	no_data	male	Less than 25%	33	no_data	no_data	no	no	no_data	Fecal19_6634_B6	0.1,g	Never	178	no_data	Occasionally (1-2 times/week)	NY	no_data	no_data	UBERON:feces	right	Peppers	RNBC2791.091218	no	no	ENVO:human-associated habitat	biotin, probiotic	2973341	8:35 AM	yes	Within the past year	no_data	no_data	6-7 hours	6634	n	Omnivore	no_data	no_data	no_data	no	no_data	cephalexin	I do not have IBD	311426B	0	RikE	9606	no_data	408170	no_data	no_data	11 to 20	no_data	119	no_data	MM	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	no_data	no	NEWE	no_data	no	9	yes	78	MiSeq 1	311318B	no_data	no_data	no_data	Remained stable	52813	Ice cream	I do not have diabetes	no_data	no	Rarely (few times/month)	no_data	no	no_data	no_data	no	40.8	no_data	yes	no	American Gut Project Stool sample
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BLANK.12G.fixed593	CTATCCAAGTGG	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	unknown	unknown	unknown	y	8/21/14	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	BLANK.12G	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	1624.1	unknown	unknown	unknown	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	unknown	unknown	unknown	148025847	BLANK.12G	no_data	unknown	no_data	311172B	-105.3	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	Knight_Cleanse_1	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	American_Gut_round_13	unknown	PS14F4	no_data	unknown	no_data	unknown	None	GAZ:United States of America	unknown	unknown	unclassified metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	unknown	unknown	unknown	unknown	ENVO:aquatic biome	G12	unknown	unknown	unknown	CCME	CCME	unknown	GT	unknown	unknown	unknown	years	unknown	unknown	blank	unknown	unknown	ENVO:sterile water	unknown	unknown	0.0	unknown	unknown	unknown	V4	American Gut Project	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	unknown	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	8/21/14	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	16S rRNA	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	.1,g	unknown	unknown	unknown	unknown	CO	True	CCME	unknown	unknown	unknown	RNBC9352	unknown	unknown	ENVO:water	unknown	no_data	12:00 PM	unknown	unknown	EMP	unknown	unknown	BLANK.12G	y	unknown	CCME	unknown	CCME	unknown	unknown	unknown	unknown	3111426B	0	JERE	408169	MiSeq	408169	unknown	completed	unknown	unknown	unknown	unknown	EZL	AG13	2014-08-21 12:00:00	unknown	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	unknown	unknown	unknown	NEWE	unknown	unknown	7	unknown	unknown	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	unknown	71514	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	unknown	unknown	no_data	unknown	40.0	unknown	unknown	unknown	American Gut Project Stool sample
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000009621.1130016	no_data	no_data	33	yes	no_data	n	no_data	Indoor, Outdoor	43.0	57.0	no_data	1121893	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	no	no_data	no_data	Daily	19	no	no_data	USA	100	Daily	145041781	2065:864983084	ERC000011	no	000009621	311172B	-75.3	yes	no_data	no_data	no_data	no_data	Fecal27	no	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	20	13131155	no_data	no_data	Stool	Bottled	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	Not in the last year	no	no	22.49458302	ENVO:human-associated habitat	C1	Daily	no_data	No	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	yes	years	no_data	Regularly (3-5 times/week)	human	no	no_data	ENVO:feces	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	yes	Within the past 6 months	no_data	American Gut Project	63	no_data	Extensive, Extensive	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	20414	Both	no_data	9/16/13	no	I use an antiperspirant	no_data	female	Less than 25%	48	no_data	no_data	no	no	no_data	Fecal27_9621_C1	.1,g	Never	127	no_data	Occasionally (1-2 times/week)	PA	no_data	no_data	UBERON:feces	right	romaine lettuce	RNBC2791.100813	yes	no	ENVO:human-associated habitat	rhodiola, vitamin d, magnesium citrate, fermented cod liver oil	3076186	7:40 AM	no	More than one year ago	no_data	no_data	7-8 hours	9621	y	Omnivore	no_data	mostly Paleo diet	no_data	no	160.0	no_data	I do not have IBD	311426B	0	RobE	9606	no_data	408170	no_data	no_data	11 to 20	no_data	169	no_data	JG	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	dog, cat, Extensive, Extensive, Indoor, Outdoor	no	HowE	no_data	no	10	no	80	no_data	110569B	no_data	no_data	no_data	Remained stable	101013	fruit (bananas/apples)	I do not have diabetes	no_data	no	Rarely (few times/month)	no_data	no	no_data	no_data	yes	40.4	no_data	yes	yes	American Gut Project Stool sample
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Blank18.B6.1131874	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	n	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	1123279	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	145032369	2037:unknown	ERC000011	no_data	Blank18.B6	311172B	107.3	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	Oral18	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	12411155	Blank18.B6	no_data	control	no_data	no_data	GAZ:United States of America	no_data	no_data	unclassified metagenome	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	ENVO:aquatic biome	B6	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	years	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	ENVO:sterile water	no_data	no_data	0.0	no_data	no_data	no_data	no_data	American Gut Project	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	510	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	Oral18_Blank18.B6_B6	0.1,g	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	RNBC2791.091026	no_data	no_data	ENVO:water	no_data	77010	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	Blank18.B6	n	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	311426B	0	RikE	408169	no_data	408169	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	MM	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	NEWE	no_data	no_data	7	no_data	no_data	MiSeq 1	311318B	no_data	no_data	no_data	no_data	52813	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	40.0	no_data	no_data	no_data	American Gut Project Stool sample
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000015623.fixed351	TCTGGAACGGTT	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	40.0	unknown	unknown	y	9/18/14	Indoor	60.0	68.0	unknown	no_data	15623	yes	UBERON:feces	unknown	unknown	yes	unknown	-0.0	Regularly (3-5 times/week)	40.0	no	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	Peru	100	Never	148025847	2095980222	no_data	no	no_data	31172B	-97.3	yes	unknown	no_data	unknown	no	AG_57	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	10.0	PS14F4	no_data	unknown	no_data	City	None	GAZ:United States of America	In the past month	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	In the past 6 months	no	no	24.95857988	ENVO:urban biome	G9	Daily	unknown	unknown	CCME	CCME	not_sure	GT	unknown	unknown	no	years	unknown	Regularly (3-5 times/week)	human	no	yes	ENVO:feces	Greek/hispanic	I do not have a skin condition	0.0	unknown	yes	Within the past 3 months	V4	American Gut Project	65.0	Diverticulitis	Extensive	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	Outdoors	140918_M01918_0133_000000000-A7FTM	8/21/14	yes	I use deoderant	unknown	male	25 to 50%	20.0	16S rRNA	unknown	no	yes	unknown	no_data	.1,g	Rarely (few times/month)	150.0	unknown	Occasionally (1-2 times/week)	TX-TEXAS	True	CCME	UBERON:feces	right	leafy greens	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	6:00 AM	no	More than one year ago	EMP	unknown	6-7 hours	15623	y	Omnivore	CCME	unknown	CCME	no	167.0	Cipro, Flagyl	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	8/1/14	completed	Less than 5	unknown	5.0	unknown	JG	AG13	2014-08-21 06:00:00	no	plate57	no_data	Illumina	Other	Extensive, Indoor	no	NEWE	unknown	no	7	no	90.0	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Decreased more than 10 pounds	71514	bread	Type II	unknown	no	Rarely (few times/month)	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	no	27.6	unknown	no	yes	American Gut Project Stool sample
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000016247.fixed393	GTCATGCTCCAG	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	unknown	unknown	unknown	y	8/21/14	Housing...	unknown	unknown	unknown	no_data	16247	no	UBERON:feces	unknown	unknown	unknown	unknown	40.2	unknown	unknown	unknown	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	Afghanistan	0	unknown	148025847	101178954	no_data	unknown	no_data	311169B	-0.1	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	Diet_Int_2	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	unknown	PS14F4	no_data	unknown	no_data	unknown	None	GAZ:United Kingdom	unknown	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	unknown	no	unknown	unknown	ENVO:urban biome	A6	unknown	unknown	unknown	CCME	CCME	unknown	GT	unknown	unknown	unknown	years	unknown	unknown	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	unknown	0.0	unknown	unknown	unknown	V4	American Gut Project	unknown	unknown	Contact...	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	unknown	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	6/3/14	no	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	16S rRNA	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	.1,g	unknown	unknown	unknown	unknown	LONDON	True	CCME	UBERON:feces	unknown	unknown	RNBC9352	unknown	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	10:00 AM	unknown	unknown	EMP	unknown	unknown	16247	y	unknown	CCME	unknown	CCME	unknown	unknown	unknown	unknown	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	unknown	unknown	unknown	unknown	JG	AG13	2014-06-03 10:00:00	unknown	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	unknown	Contact..., Housing...	unknown	HOWE	unknown	unknown	5	unknown	unknown	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	unknown	71514	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	unknown	unknown	no_data	unknown	51.6	unknown	unknown	unknown	American Gut Project Stool sample
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000016236.fixed387	TTGGGCCACATA	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	unknown	unknown	unknown	y	8/21/14	Housing...	23.0	68.0	unknown	no_data	16236	no	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	8.5	Rarely (few times/month)	unknown	no	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	United Kingdom	0	Never	148025847	279704143	no_data	no	no_data	311169B	-0.0	no	unknown	no_data	unknown	unknown	Diet_Int_1	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	unknown	PS14F4	no_data	unknown	no_data	City	None	GAZ:United Kingdom	Not in the last year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	Not in the last year	no	no	21.52040816	ENVO:urban biome	G4	Daily	unknown	unknown	CCME	CCME	no	GT	unknown	unknown	no	years	unknown	Occasionally (1-2 times/week)	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	no	Within the past 3 months	V4	American Gut Project	70.0	unknown	Contact...	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	Outdoors	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	5/29/14	no	I use deoderant	unknown	male	unknown	unknown	16S rRNA	unknown	no	no	unknown	no_data	.1,g	Never	150.0	unknown	Regularly (3-5 times/week)	ROTHERHITHE	True	CCME	UBERON:feces	left	unknown	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	1:45 PM	no	Within the past year	EMP	unknown	7-8 hours	16236	y	Omnivore	CCME	unknown	CCME	no	179.0	unknown	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	unknown	unknown	unknown	unknown	JG	AG13	2014-05-29 13:45:00	no	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	Caucasian	Contact..., Housing...	no	HOWE	unknown	no	4	no	unknown	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Remained stable	71514	unknown	I do not have diabetes	unknown	no	Rarely (few times/month)	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	no	51.5	unknown	no	no	American Gut Project Stool sample
000009020.1257157	no_data	no_data	27	no_data	no_data	y	no_data	Housing...	35.0	68.0	no_data	1245261	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	no	no_data	19.5	Rarely (few times/month)	28	no	no_data	USA	100	Rarely (few times/month)	145049333	2234:2930817218	ERC000011	yes	000009020	311172B	-118.0	no	no_data	9020	no_data	no_data	AG39	no	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	90	PS14A22	no_data	no_data	Stool	Filtered	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	Not in the last year	no	no	22.8049308	ENVO:urban biome	C2	Daily	no_data	No	no_data	no_data	yes	no_data	Boyfriend	no_data	yes	years	no_data	Regularly (3-5 times/week)	human	no	no_data	ENVO:feces	no_data	I do not have a skin condition	0.0	yes	no	Within the past 3 months	no_data	American Gut Project	68	no_data	Contact...	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	13430	Depends on the season	no_data	1/26/14	no	I do not use deoderant or antiperspirant	no_data	female	Less than 25%	45	no_data	no_data	no	no	no_data	no_data	.1,g	Never	150	no_data	Rarely (few times/month)	CA	no_data	no_data	UBERON:feces	right	Leafy greens	RNBC2791	yes	no	ENVO:human-associated habitat	FemGuard+ Balance (herbs to balance hormones), Vitamin C, MSM, Desiccated porcine thyroid, Desiccated bovine adrenal cortex	2027930	8:30 AM	no	More than one year ago	no_data	no_data	8 or more hours	9020	y	Omnivore	no_data	Avoid GMOs, Avoid soy, Avoid vegetable oils	no_data	no	173.0	no_data	I do not have IBD	111569B	0	JERE	9606	no_data	408170	no_data	no_data	More than 30	no_data	80	no_data	GG	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	no	NEWE	yes	no	9	no	10	no_data	311426B	no_data	no_data	no_data	Remained stable	101013	Fruit	I do not have diabetes	no_data	no	Never	no_data	no	no_data	no_data	no	33.8	no_data	yes	yes	American Gut Project Stool sample
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000016730.fixed487	ACTACCTCTTCA	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	53.0	unknown	unknown	y	8/21/14	Housing...	26.0	72.0	unknown	no_data	16730	no	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	1661.8	Rarely (few times/month)	21.0	no	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	Spain	100	Never	148025847	2542392039	no_data	no	no_data	311172B	-105.3	no	unknown	no_data	unknown	unknown	Knight_Cleanse_1	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	40.0	PS14F4	no_data	unknown	no_data	City	None	GAZ:United States of America	Not in the last year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	Not in the last year	no	no	22.17357667	ENVO:urban biome	D9	Daily	unknown	unknown	CCME	CCME	no	GT	unknown	unknown	no	years	unknown	Occasionally (1-2 times/week)	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	no	Within the past 6 months	V4	American Gut Project	71.0	unknown	Contact...	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	Outdoors	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	5/30/14	no	I use an antiperspirant	unknown	male	25 to 50%	26.0	16S rRNA	unknown	no	no	unknown	no_data	.1,g	Never	159.0	unknown	Rarely (few times/month)	COLORADO	True	CCME	UBERON:feces	right	Onion	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	9:45 AM	no	More than one year ago	EMP	unknown	6-7 hours	16730	y	Omnivore	CCME	unknown	CCME	no	181.0	unknown	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	11 to 20	unknown	125.0	unknown	EZL	AG13	2014-05-30 09:45:00	no	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	Hispanic	Contact..., Housing...	no	NEWE	unknown	no	7	no	60.0	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Remained stable	71514	granola	I do not have diabetes	unknown	no	Never	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	no	40.1	unknown	yes	no	American Gut Project Stool sample
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000012112.fixed295	AGCTTCGACAGT	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	15.0	unknown	unknown	y	9/18/14	Housing...	50.0	95.0	unknown	no_data	12112	no	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	6.8	Occasionally (1-2 times/week)	45.0	no	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	USA	100	Occasionally (1-2 times/week)	148025847	970877533	no_data	yes	no_data	31172B	-123.9	yes	unknown	no_data	unknown	unknown	AG_57	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	10.0	PS14F4	no_data	unknown	no_data	City	None	GAZ:United States of America	Not in the last year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	Not in the last year	no	no	56.75893887	ENVO:urban biome	A3	Daily	unknown	No	CCME	CCME	no	GT	unknown	unknown	yes	years	unknown	Rarely (few times/month)	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	yes	yes	More than one year ago	V4	American Gut Project	51.0	unknown	Contact...	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	Both	140918_M01918_0133_000000000-A7FTM	8/4/14	no	I do not use deoderant or antiperspirant	unknown	female	51 to 75%	40.0	16S rRNA	unknown	no	yes	unknown	no_data	.1,g	Never	210.0	unknown	Rarely (few times/month)	OR	True	CCME	UBERON:feces	right	Lettuces	RNBC9352	yes	no	ENVO:human-associated habitat	DRibose, Acetyl L Carnitine, Glutathione Reduced, Superfood 100	no_data	9:00 AM	no	More than one year ago	EMP	unknown	Less than 5 hours	12112	y	Omnivore	CCME	Sensitive to garlic, eggs, gluten, shellfish (I distill my tap water)	CCME	no	132.0	unknown	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	21 to 30	unknown	120.0	unknown	JG	AG13	2014-08-04 09:00:00	no	plate57	no_data	Illumina	Caucasian	Contact..., Housing...	yes	NEWE	unknown	no	7	unknown	90.0	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Increased more than 10 pounds	71514	Jasmine Rice	I do not have diabetes	unknown	no	Never	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	yes	45.6	unknown	yes	yes	American Gut Project Stool sample
000006111.1210671	no_data	no_data	43	no_data	no_data	n	no_data	no_data	42.0	56.0	no_data	1202264	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	no	no_data	37.8	Daily	14	no	no_data	USA	97	Daily	145042558	2186:2066081726	ERC000011	no	000006111	311172B	-77.0	no	no_data	no_data	no_data	no_data	AG_Plate32	no	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	50	PS13G10	no_data	no_data	Stool	Filtered	no_data	GAZ:United States of America	In the past 6 months	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	Not in the last year	no_data	no	22.14033762	ENVO:urban biome	A5	Daily	no_data	I take the pill	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	yes	years	no_data	Occasionally (1-2 times/week)	human	no	yes	ENVO:feces	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	no	Within the past 6 months	no_data	American Gut Project	63	sinus infection	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	13209	Outdoors	no_data	7/19/13	no	I use an antiperspirant	no_data	female	Less than 25%	40	no_data	no_data	no	yes	no_data	no_data	.1,g	Never	125	no_data	Occasionally (1-2 times/week)	DC	no_data	no_data	UBERON:feces	left	corn	RNBC2791	no	no	ENVO:human-associated habitat	oil of primrose, Wild Alaskan Salmon Oil, Total Omega 3, EPA, DHA, Boron, Horse Tail Extract, Coenzyme Q10, L-Carnitine L- Tartrate, Alpha Lipoic Acid, Tocetrienols Complex, oil of borage seed, Natural Astaxanthin Complex As AstaREAL, black current seed oil, flaxseed oil, rosemary extract, DMAE, Grape Seed Extract, Pycnogenol Maritime Pine Bark Extract, Ascorbyl Palmitate	1994559	6:00 AM	no	More than one year ago	no_data	no_data	7-8 hours	6111	y	Omnivore	no_data	no_data	no_data	no	160.0	azithromycin	I do not have IBD	311426B	0	JERE	9606	no_data	408170	no_data	no_data	Less than 5	no_data	115.5	no_data	EZL	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Asian or Pacific Islander	no_data	yes	NEWE	no_data	no	7	no	50	no_data	111569B	no_data	no_data	no_data	Remained stable	101013	pasta	I do not have diabetes	no_data	no	Never	no_data	no_data	no_data	no_data	no	38.9	no_data	yes	yes	American Gut Project Stool sample
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BLANK.1F.fixed121	no_data	no_data	unknown	unknown	unknown	y	no_data	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	no_data	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	1624.1	unknown	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	unknown	no_data	BLANK.1F	ERC000011	unknown	no_data	no_data	-105.3	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	unknown	no_data	control	unknown	unknown	no_data	unknown	no_data	no_data	unknown	no_data	unknown	no_data	GAZ:United States of America	unknown	unknown	unclassified metagenome	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	unknown	unknown	ENVO:aquatic biome	no_data	unknown	unknown	unknown	no_data	CCME	unknown	no_data	unknown	unknown	unknown	years	unknown	unknown	control	unknown	unknown	ENVO:sterile water	unknown	unknown	0.0	unknown	unknown	unknown	no_data	American Gut Project	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	unknown	True	10415	unknown	no_data	5/14/14	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	no_data	unknown	unknown	unknown	unknown	CO	True	no_data	unknown	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	ENVO:water	unknown	1572665	12:00 PM	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	BLANK.1F	y	unknown	no_data	unknown	no_data	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	0	no_data	408169	no_data	no_data	unknown	completed	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	no_data	2014-05-14 12:00:00	unknown	no_data	no_data	no_data	unknown	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	no_data	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	unknown	40.0	unknown	unknown	unknown	None
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000016231.fixed382	GCATTACTGGAC	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	unknown	unknown	unknown	y	8/21/14	Indoor	25.0	55.0	unknown	no_data	16231	no	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	10.1	Rarely (few times/month)	unknown	no	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	United Kingdom	0	Never	148025847	3020496105	no_data	no	no_data	311169B	-0.1	no	unknown	no_data	unknown	unknown	Diet_Int_1	yes	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	unknown	PS14F4	no_data	unknown	no_data	City	None	GAZ:United Kingdom	In the past year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	Not in the last year	no	no	17.86662466	ENVO:urban biome	G3	Daily	unknown	unknown	CCME	CCME	no	GT	unknown	unknown	no	years	unknown	Never	human	no	yes	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	no	Within the past 3 months	V4	American Gut Project	69.0	Infected wisdom tooth	Extensive	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	None of the above	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	5/29/14	no	I do not use deoderant or antiperspirant	unknown	male	unknown	unknown	16S rRNA	unknown	no	no	unknown	no_data	.1,g	Daily	121.0	unknown	Regularly (3-5 times/week)	LONDON	True	CCME	UBERON:feces	right	unknown	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	1:00 PM	no	Within the past year	EMP	unknown	6-7 hours	16231	y	Omnivore	CCME	unknown	CCME	no	178.0	Amoxicillin	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	unknown	unknown	unknown	unknown	JG	AG13	2014-05-29 13:00:00	no	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	Caucasian	Cat, Extensive, Indoor	no	HOWE	unknown	no	4	no	unknown	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Remained stable	71514	unknown	I do not have diabetes	unknown	no	Never	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	yes	51.5	unknown	yes	no	American Gut Project Stool sample
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000014280.fixed750	no_data	no_data	55	unknown	unknown	y	no_data	Housing...	22	56	unknown	no_data	no_data	no	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	88.6	Occasionally (1-2 times/week)	25	no	no_data	USA	100	Rarely (few times/month)	no_data	1959542465	ERC000011	yes	no_data	no_data	-77.0	yes	unknown	no_data	no	unknown	no_data	no	unknown	no_data	UBERON:feces	no_data	Stool	unknown	unknown	no_data	60	no_data	no_data	unknown	no_data	City	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	no_data	In the past year	no	unknown	21.45385742	ENVO:urban biome	no_data	Daily	unknown	I use the NuvaRing	no_data	CCME	yes	no_data	father, mother	unknown	yes	years	unknown	Daily	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	Eczema	0.0	unknown	yes	More than one year ago	no_data	American Gut Project	64	unknown	Contact...	unknown	One	no_data	unknown	y	no_data	Outdoors	no_data	6/8/14	no	I do not use deoderant or antiperspirant	unknown	female	Less than 25%	20	no_data	unknown	yes	no	unknown	no_data	no_data	Never	125	unknown	Regularly (3-5 times/week)	MD	y	no_data	UBERON:feces	right	greens	no_data	no	no	ENVO:human-associated habitat	vsl #3	no_data	11:00 AM	no	More than one year ago	no_data	no	8 or more hours	000014280	y	Omnivore	no_data	unknown	no_data	yes	163	unknown	I do not have IBD	no_data	0	no_data	9606	no_data	no_data	unknown	completed	11 to 20	unknown	140	unknown	no_data	no_data	6/8/14 0:00	yes	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	no	no_data	unknown	no	no_data	no	40	no_data	no_data	unknown	no_data	unknown	Remained stable	no_data	beans	I do not have diabetes	unknown	no	Rarely (few times/month)	no_data	no	unknown	no_data	yes	39.0	unknown	no	no	Description
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000010758.fixed286	CTGTAAAGGTTG	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	54.0	yes	unknown	y	9/18/14	Indoor, Indoor	72.0	83.0	unknown	no_data	10758	no	UBERON:feces	unknown	unknown	yes	unknown	158.5	Daily	15.0	no	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	USA	100	Never	148025847	2384439172	no_data	no	no_data	31172B	-90.3	yes	unknown	no_data	unknown	unknown	AG_57	no	Tamarind spice	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	40.0	PS14F4	no_data	unknown	no_data	City	None	GAZ:United States of America	In the past week	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	Not in the last year	no	no	unknown	ENVO:urban biome	A9	Daily	unknown	unknown	CCME	CCME	yes	GT	Spouse	unknown	yes	years	unknown	Regularly (3-5 times/week)	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	yes	More than one year ago	V4	American Gut Project	unknown	dental appointment/knee reoplacements	Extensive, Extensive	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	Both	140918_M01918_0133_000000000-A7FTM	8/11/14	no	Not sure, but I use some form of deoderant/antiperspirant	unknown	male	25 to 50%	31.0	16S rRNA	unknown	no	no	unknown	no_data	.1,g	Never	184.0	unknown	Daily	MO	True	CCME	UBERON:feces	right	tomato	RNBC9352	unknown	no	ENVO:human-associated habitat	COQ10, Vitamin D	no_data	8:00 AM	no	More than one year ago	EMP	unknown	7-8 hours	10758	y	Omnivore	CCME	unknown	CCME	no	unknown	amoxycillan	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	6 to 10	unknown	70.0	unknown	JG	AG13	2014-08-11 08:00:00	yes	plate57	no_data	Illumina	Caucasian	cats, dog, Extensive, Extensive, Indoor, Indoor	no	NEWE	unknown	no	7	no	60.0	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	yes	Remained stable	71514	pasta	I do not have diabetes	unknown	no	Rarely (few times/month)	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	yes	38.6	unknown	no	yes	American Gut Project Stool sample
000001712.fixed20	no_data	no_data	45.4	unknown	unknown	y	no_data	unknown	65	66	unknown	no_data	no_data	no	UBERON:feces	Medications; horomones	unknown	no	unknown	6.1	Daily	23.8	no	no_data	USA	96	Regularly (3-5 times/week)	no_data	764076167	ERC000011	no	no_data	no_data	-121.7	no	yes	no_data	unknown	unknown	no_data	no	unknown	no_data	UBERON:feces	no_data	Stool	Weekly	yes	no_data	39.2	no_data	no_data	unknown	no_data	Well	no_data	GAZ:United States of America	In the past 6 months	unknown	human gut metagenome	unknown	yes	no_data	Not in the last year	unknown	yes	24.45940828	ENVO:urban biome	no_data	unknown	sumatryptan	unknown	no_data	CCME	no	no_data	unknown	unknown	yes	years	unknown	Rarely (few times/month)	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	yes	unknown	no_data	American Gut Project	65	tooth	unknown	unknown	unknown	no_data	unknown	True	18247	unknown	no_data	6/2/13	no	I use an antiperspirant	unknown	female	Less than 25%	26.9	no_data	unknown	no	yes	yes	no_data	no_data	Never	147	unknown	Rarely (few times/month)	CA	True	no_data	UBERON:feces	right	lettuce	no_data	no	no	ENVO:human-associated habitat	D3, calcium, glucosamine and chondroitan, fish oil	2755297	8:30 AM	no	More than one year ago	no_data	unknown	7-8 hours	1712	y	Omnivore	no_data	unknown	no_data	no	165	amoxicillan	I do not have IBD	no_data	0	no_data	9606	no_data	no_data	unknown	completed	11 to 20	yes	146	unknown	no_data	no_data	2013-06-02 08:30:00	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	unknown	yes	no_data	yes	no	no_data	no	60.8	no_data	no_data	unknown	no_data	unknown	Remained stable	no_data	bread	I do not have diabetes	unknown	no	Never	no_data	no	unknown	no_data	yes	38.0	unknown	yes	yes	None
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000012963.1210657	no_data	no_data	40	no_data	no_data	n	no_data	Indoor	21.0	68.0	no_data	1202397	no_data	yes	UBERON:feces	Lack of sleep	Other	no	Stress	376.7	Regularly (3-5 times/week)	30	no	no_data	USA	100	Daily	145042558	2186:542209966	ERC000011	no	000012963	311169B	-121.1	no	no_data	no_data	no	no_data	AG_Plate35	no	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	A few times a year	yes	no_data	40	PS13J2	no_data	no_data	Stool	City	no_data	GAZ:United States of America	In the past year	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	Not in the last year	no	yes	24.20798898	ENVO:urban biome	B7	Daily	Imitrex	No	no_data	no_data	yes	no_data	Father, Sister	no_data	yes	years	no_data	Rarely (few times/month)	human	no	no_data	ENVO:feces	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	no	Within the past 6 months	no_data	American Gut Project	66	Repiratory infection	Extensive	no_data	One	no_data	no_data	no_data	22300	Outdoors	no_data	12/26/13	no	Not sure, but I use some form of deoderant/antiperspirant	no_data	female	25 to 50%	30	no_data	no_data	yes	yes	no_data	no_data	.1,g	Never	150	no_data	Rarely (few times/month)	CA	no_data	no_data	UBERON:feces	right	Spinach	RNBC2791	yes	no	ENVO:human-associated habitat	Fish oil	3367300	9:05 AM	no	More than one year ago	no_data	no	6-7 hours	12963	y	Omnivore	no_data	I try to avoid grains	no_data	no	168.0	Cipro	I do not have IBD	311313B	0	ROBE	9606	no_data	408170	no_data	no_data	6 to 10	yes	200	no_data	EL	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Cat, Extensive, Indoor	yes	HOWE	no_data	no	9	no	60	no_data	111075B	no_data	no_data	no_data	Remained stable	101013	Vegetables	I do not have diabetes	no_data	no	Rarely (few times/month)	no_data	no	no_data	no_data	yes	38.9	no_data	no	no	American Gut Project Stool sample
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000013047.1257495	no_data	no_data	53	no_data	no_data	y	no_data	Housing...	69.0	83.0	no_data	1245234	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	no	no_data	1729.5	Daily	14	no	no_data	USA	100	Never	145049333	2234:891249431	ERC000011	no	000013047	311169B	-105.2	no	no_data	13047	no_data	no_data	AG37	no	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	35	PS13J2	no_data	no_data	Stool	City	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	In the past 6 months	no	no	25.79944455	ENVO:urban biome	D2	Daily	no_data	no_data	no_data	no_data	yes	no_data	wife	no_data	yes	years	no_data	Regularly (3-5 times/week)	human	no	yes	ENVO:feces	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	yes	Within the past 3 months	no_data	American Gut Project	71	no_data	Contact...	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	17902	Indoors	no_data	1/10/14	no	I do not use deoderant or antiperspirant	no_data	male	25 to 50%	33	no_data	no_data	no	yes	no_data	no_data	.1,g	Never	185	no_data	Rarely (few times/month)	CO	no_data	no_data	UBERON:feces	right	cabbage	RNBC2791	no	no	ENVO:human-associated habitat	no_data	2703202	11:50 AM	no	More than one year ago	no_data	no_data	7-8 hours	13047	y	Vegetarian	no_data	no_data	no_data	no	180.0	no_data	I do not have IBD	409185Z	0	RIKE	9606	no_data	408170	no_data	no_data	21 to 30	no_data	204	no_data	JG	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	yes	HOWE	no_data	no	3	no	65	no_data	311318B	no_data	no_data	no_data	Remained stable	22114	sugar	I do not have diabetes	no_data	no	Never	no_data	no	no_data	no_data	no	39.8	no_data	yes	no	American Gut Project Stool sample
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000018311.fixed579	TTGTATGACAGG	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	40.0	unknown	unknown	y	9/18/14	Housing...	49.0	51.0	unknown	no_data	18311	yes	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	8.6	Occasionally (1-2 times/week)	40.0	no	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	USA	100	Daily	148025847	1636456471	no_data	no	no_data	31172B	-70.8	no	unknown	no_data	unknown	unknown	AG_57	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	60.0	PS14F4	no_data	unknown	no_data	Well	None	GAZ:United States of America	In the past 6 months	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	In the past year	no	no	20.84859521	ENVO:urban biome	D12	Daily	unknown	unknown	CCME	CCME	no	GT	unknown	unknown	yes	years	spray	Regularly (3-5 times/week)	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	yes	Never	V4	American Gut Project	62.0	Urinary tract infection	Contact...	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	Depends on the season	140918_M01918_0133_000000000-A7FTM	8/28/14	no	I use an antiperspirant	unknown	unknown	Less than 25%	20.0	16S rRNA	unknown	no	yes	unknown	no_data	.1,g	Never	114.0	unknown	Rarely (few times/month)	MAINE	True	CCME	UBERON:feces	right	beets	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	ginger tea, mint tea, green tea, Lutein	no_data	9:20 AM	no	More than one year ago	EMP	unknown	7-8 hours	18311	y	Omnivore	CCME	unknown	CCME	no	157.0	Ciprofloxacin 250mg, Ciprofloxacin 500 mg	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	6 to 10	unknown	unknown	unknown	JG	AG13	2014-08-28 09:20:00	no	plate57	no_data	Illumina	Caucasian	Contact..., Housing...	yes	NEWE	unknown	no	7	no	40.0	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Remained stable	71514	Whole grain bread	I do not have diabetes	unknown	no	Never	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	no	43.2	unknown	yes	unknown	American Gut Project Stool sample
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000002567.1130387	no_data	no_data	50	no_data	no_data	n	no_data	Housing...	28.0	50.0	no_data	1121880	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	no	no_data	no_data	Never	20	no	no_data	USA	100	Regularly (3-5 times/week)	145041781	2065:2393650856	ERC000011	no	000002567	311172B	-105.0	yes	no_data	no_data	no_data	no_data	Fecal23	no	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	70	13131155	no_data	no_data	Stool	Filtered	no_data	GAZ:United States of America	In the past 6 months	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	Not in the last year	no	no	18.63573964	ENVO:human-associated habitat	D9	Daily	no_data	I use the NuvaRing	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	yes	years	spray	Daily	human	no	yes	ENVO:feces	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	no	More than one year ago	no_data	American Gut Project	65	vaginal cyst	Contact...	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	11732	Both	no_data	8/22/13	no	Not sure, but I use some form of deoderant/antiperspirant	no_data	female	25 to 50%	30	no_data	no_data	no	no	no_data	Fecal23_2567_D9	.1,g	Rarely (few times/month)	112	no_data	Occasionally (1-2 times/week)	CO	no_data	no_data	UBERON:feces	right	onions or lettuce	RNBC2791.100813	no	no	ENVO:human-associated habitat	probiotics, magnesium, b12 complex	1758620	7:00 AM	no	More than one year ago	no_data	no_data	7-8 hours	2567	y	Omnivore	no_data	no_data	no_data	no	165.0	Cephalexin	I do not have IBD	110705B	0	RikE	9606	no_data	408170	no_data	no_data	11 to 20	no_data	103	no_data	JG	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	no	HowE	no_data	no	7	yes	30	no_data	311313B	no_data	no_data	no_data	Remained stable	101013	bread	I do not have diabetes	no_data	no	Never	no_data	no	no_data	no_data	no	39.8	no_data	yes	no	American Gut Project Stool sample
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000013446.1257288	no_data	no_data	45	yes	no_data	y	no_data	Housing...	64.0	61.0	no_data	1245144	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	yes	no_data	52.2	Daily	17	not_sure	no_data	USA	97	Rarely (few times/month)	145049333	2234:452483204	ERC000011	no	000013446	311169B	-76.9	no	no_data	13446	no_data	no_data	AG38	no	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	75	PS13J2	no_data	no_data	Stool	City	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	In the past 6 months	no	no	19.93383743	ENVO:urban biome	C7	Daily	no_data	no_data	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	yes	years	no_data	Daily	human	no	no_data	ENVO:feces	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	yes	More than one year ago	no_data	American Gut Project	69	no_data	Contact...	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	2	Indoors	no_data	1/20/14	no	I use deoderant	no_data	male	51 to 75%	35	no_data	no_data	no_data	no	no_data	no_data	.1,g	Never	135	no_data	Daily	no_data	no_data	no_data	UBERON:feces	right	leafy greens	RNBC2791	no	no	ENVO:human-associated habitat	lecithin, brewers yeast, fish oil	302	10:35 PM	no	More than one year ago	no_data	no_data	5-6 hours	13446	y	Omnivore	no_data	no_data	no_data	no	175.0	no_data	I do not have IBD	409185Z	0	RIKE	9606	no_data	408170	no_data	no_data	11 to 20	no_data	17.8	no_data	EL	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	yes	HOWE	no_data	no	4	no	25	no_data	311318B	no_data	no_data	no_data	Remained stable	22114	pasta	I do not have diabetes	no_data	no	Never	no_data	no	no_data	no_data	no	38.9	no_data	yes	yes	American Gut Project Stool sample
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000012092.1257275	no_data	no_data	55	no_data	no_data	y	no_data	Housing...	56.0	61.0	no_data	1244974	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	no	no_data	29.5	Daily	30	no	no_data	USA	100	Never	145049333	2234:1960675040	ERC000011	yes	000012092	311169B	-122.9	no	no_data	12092	no_data	no_data	AG38	no	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	25	PS13J2	no_data	no_data	Stool	City	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	In the past month	no	no	19.36836735	ENVO:urban biome	D7	Daily	no_data	no_data	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	yes	years	no_data	Regularly (3-5 times/week)	human	no	no_data	ENVO:feces	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	no	Within the past month	no_data	American Gut Project	70	no_data	Contact...	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	29467	Outdoors	no_data	1/24/14	no	I do not use deoderant or antiperspirant	no_data	male	25 to 50%	15	no_data	no_data	no	yes	no_data	no_data	.1,g	Never	135	no_data	Daily	WA	no_data	no_data	UBERON:feces	right	Brassicaceae	RNBC2791	no	no	ENVO:human-associated habitat	CoQ10, Nattokinase, Rhodiola	4449517	9:00 AM	no	More than one year ago	no_data	no_data	8 or more hours	12092	y	Omnivore	no_data	no_data	no_data	yes	178.0	no_data	I do not have IBD	409185Z	0	RIKE	9606	no_data	408170	no_data	no_data	11 to 20	no_data	140	no_data	EL	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	no	HOWE	yes	no	4	no	75	no_data	311318B	no_data	no_data	no_data	Remained stable	22114	rice	I do not have diabetes	no_data	no	Rarely (few times/month)	no_data	no	no_data	no_data	no	47.0	no_data	yes	yes	American Gut Project Stool sample
000015151.fixed208	no_data	no_data	30	unknown	unknown	y	no_data	Housing...	24	92	unknown	no_data	no_data	no	UBERON:hand	unknown	unknown	no	unknown	26.8	Occasionally (1-2 times/week)	30	no	no_data	USA	100	Never	no_data	11208823	ERC000011	no	no_data	no_data	-71.3	no	unknown	no_data	no	unknown	no_data	no	unknown	no_data	UBERON:sebum	no_data	Left hand	unknown	unknown	no_data	80	no_data	no_data	unknown	no_data	Filtered	no_data	GAZ:United States of America	In the past year	unknown	human skin metagenome	unknown	unknown	no_data	Not in the last year	no	no	27.04353537	ENVO:urban biome	no_data	Regularly (3-5 times/week)	unknown	unknown	no_data	CCME	yes	no_data	Father	unknown	yes	years	unknown	Regularly (3-5 times/week)	human	no	yes	ENVO:sebum	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	no	More than one year ago	no_data	American Gut Project	73	Cellulitis	Contact...	unknown	More than three	no_data	unknown	True	8270	Depends on the season	no_data	4/30/14	no	I do not use deoderant or antiperspirant	unknown	male	Less than 25%	40	no_data	unknown	yes	no	unknown	no_data	no_data	Never	205	unknown	Rarely (few times/month)	MASSACHUSETTS	True	no_data	UBERON:skin	right	Greens (Kale, spinach, arugula, baby lettuce)	no_data	yes	no	ENVO:human-associated habitat	Magnesium Citrate, Vitamin D, Vitamin B complex, Zinc picolinate, Inflavanoid	1248770	5:25 PM	no	More than one year ago	no_data	yes	7-8 hours	15151	y	Omnivore	no_data	No grains, No refined sugar, Low starch	no_data	no	185	Cefadroxil	I do not have IBD	no_data	0	no_data	9606	no_data	no_data	unknown	completed	11 to 20	unknown	280	unknown	no_data	no_data	2014-04-30 17:25:00	yes	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	no	no_data	unknown	no	no_data	no	20	no_data	no_data	unknown	no_data	unknown	Remained stable	no_data	Apples	I do not have diabetes	unknown	no	Never	no_data	no	unknown	no_data	no	42.4	unknown	yes	no	None
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BLANK.G.3.1257090	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	y	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	1244967	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	1624.1	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	145049333	2234:unknown	ERC000011	no_data	BLANK.G.3	311172B	-105.3	no_data	no_data	BLANK.G.3	no_data	no_data	AG39	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	PS14A22	no_data	no_data	control	no_data	no_data	GAZ:United States of America	no_data	no_data	unclassified metagenome	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	ENVO:aquatic biome	G3	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	years	no_data	no_data	control	no_data	no_data	ENVO:sterile water	no_data	no_data	0.0	no_data	no_data	no_data	no_data	American Gut Project	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	4004	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	.1,g	no_data	no_data	no_data	no_data	CO	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	RNBC2791	no_data	no_data	ENVO:water	no_data	604604	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	BLANK.G.3	y	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	111569B	0	JERE	408169	no_data	408169	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	GG	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	NEWE	no_data	no_data	9	no_data	no_data	no_data	311426B	no_data	no_data	no_data	no_data	101013	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	40.0	no_data	no_data	no_data	American Gut Project blank
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Blank27.F3.1130453	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	n	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	1121934	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	1683.1	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	145041781	2065:unknown	ERC000011	no_data	Blank27.F3	311172B	-105.3	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	Fecal27	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	13131155	no_data	no_data	control	no_data	no_data	GAZ:United States of America	no_data	no_data	unclassified metagenome	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	ENVO:aquatic biome	F3	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	ENVO:sterile water	no_data	no_data	0.0	no_data	no_data	no_data	no_data	American Gut Project	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	4240	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	Fecal27_Blank27.F3_F3	.1,g	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	RNBC2791.100813	no_data	no_data	ENVO:water	no_data	638196	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	Blank27.F3	y	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	311426B	0	RobE	408169	no_data	408169	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	JG	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	HowE	no_data	no_data	10	no_data	no_data	no_data	110569B	no_data	no_data	no_data	no_data	101013	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	40.0	no_data	no_data	no_data	Extraction blank
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000002335.fixed826	no_data	no_data	27	yes	unknown	y	no_data	Indoor	55	52	unknown	no_data	no_data	no	UBERON:tongue	Lack of sleep	Depression	no	Foods; other	327.4	Daily	22	no	no_data	USA	100	Daily	no_data	2283135378	ERC000011	yes	no_data	no_data	-92.5	no	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	no	turkey, pork, eggs, moderate & high level fructose fruits & veggies, too numerous to list here	no_data	UBERON:saliva	no_data	Mouth	Weekly	no	no_data	31	no_data	no_data	yes	no_data	Filtered	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	yes	human oral metagenome	yes	yes	no_data	Not in the last year	no	yes	20.36911060720584530108339632149155958678	ENVO:urban biome	no_data	Daily	unknown	No	no_data	UCSD	yes	no_data	grandson	unknown	yes	years	unknown	Rarely (few times/month)	human	no	unknown	ENVO:saliva	unknown	Eczema	0.0	yes	no	More than one year ago	no_data	American Gut Project	63	unknown	Little	yes	unknown	no_data	unknown	True	no_data	Both	no_data	01/24/2014	no	I use deoderant	yes	female	51 to 75%	51	no_data	unknown	no	no	unknown	no_data	no_data	Never	115	bed	Never	WI	True	no_data	UBERON:oral cavity	right	tomatoe	no_data	yes	no	ENVO:human-associated habitat	Homemade Kombucha Tea, 1 cup daily, 2 Kelp tablets, Betaine HCL by Integrative, 1 capsule ea meal, Calcium 1000 Magnesium 500, 4 capsules daily, Vitamin D3 6000 IU, Coenzyme B-Complex, 1 tab	no_data	11:00 AM	no	More than one year ago	no_data	unknown	6-7 hours	000002335	y	Omnivore	no_data	FODMAPS (low fructose),PALEO, Gluten & Dairy Free	no_data	yes	160	unknown	Ulcerative colitis	no_data	0	no_data	9606	no_data	no_data	unknown	completed	21 to 30	no	214	unknown	no_data	no_data	2014-01-24 11:00:00	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	cat, Little, Indoor	yes	no_data	unknown	no	no_data	no	69	no_data	no_data	unknown	no_data	yes	Remained stable	no_data	banana	I do not have diabetes	unknown	yes	Never	no_data	no	unknown	no_data	yes	44.7	unknown	yes	yes	Description
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000015874.fixed803	no_data	no_data	unknown	unknown	unknown	y	no_data	Confined	29	53	unknown	no_data	no_data	no	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	43.8	Rarely (few times/month)	unknown	no	no_data	USA	85	Daily	no_data	3797121278	ERC000011	no	no_data	no_data	-73.9	no	unknown	no_data	no	unknown	no_data	no	unknown	no_data	UBERON:feces	no_data	Stool	unknown	unknown	no_data	75	no_data	no_data	unknown	no_data	City	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	no_data	Not in the last year	no	no	19.63408284	ENVO:urban biome	no_data	Daily	unknown	No	no_data	CCME	no	no_data	unknown	unknown	yes	years	unknown	Occasionally (1-2 times/week)	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	yes	no	Within the past year	no_data	American Gut Project	65	unknown	Little	unknown	Two	no_data	unknown	y	no_data	Outdoors	no_data	7/29/14	no	I do not use deoderant or antiperspirant	unknown	female	25 to 50%	unknown	no_data	unknown	yes	no	unknown	no_data	no_data	Rarely (few times/month)	118	unknown	Regularly (3-5 times/week)	NY	y	no_data	UBERON:feces	right	leafy greens	no_data	no	no	ENVO:human-associated habitat	probiotics- acidopholis (irregularly) , B vitamins (irregularly), st john's wort (rarely)	no_data	12:51 PM	no	Within the past month	no_data	no	5-6 hours	000015874	y	Vegetarian but eat seafood	no_data	unknown	no_data	no	165	unknown	I do not have IBD	no_data	0	no_data	9606	no_data	no_data	unknown	completed	11 to 20	unknown	13	unknown	no_data	no_data	7/29/14 0:00	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	harvester ants (for art practice), Little, Confined	no	no_data	unknown	no	no_data	no	25	no_data	no_data	unknown	no_data	unknown	Remained stable	no_data	bread	I do not have diabetes	unknown	no	Rarely (few times/month)	no_data	no	unknown	no_data	no	40.9	unknown	yes	yes	Description
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BLANK.A.12.1210937	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	n	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	1202259	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	1624.1	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	2186:unknown	ERC000011	no_data	BLANK.A.12	no_data	-105.3	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	control	no_data	no_data	GAZ:United States of America	no_data	no_data	unclassified metagenome	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	ENVO:aquatic biome	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	ENVO:sterile water	no_data	no_data	0.0	no_data	no_data	no_data	no_data	American Gut Project	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	5700	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	.1,g	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	ENVO:water	no_data	860700	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	BLANK.A.12	y	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	0	no_data	no_data	no_data	408169	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	40.0	no_data	no_data	no_data	Round_7_control
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000014212.1259686	no_data	no_data	47	no_data	no_data	y	no_data	Housing...	59.0	53.0	no_data	1247371	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	no	no_data	3.8	Regularly (3-5 times/week)	24	no	no_data	USA	100	Occasionally (1-2 times/week)	145049333	2246:1177232625	ERC000011	yes	000014212	108379Z	-80.3	no	no_data	no_data	no_data	no_data	AG_31	no	white potatoes, corn	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	99	BP1214A22	no_data	no_data	Stool	City	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	Not in the last year	no	no	23.04277778	ENVO:urban biome	B9	Daily	no_data	No	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	yes	years	no_data	Regularly (3-5 times/week)	human	no	no_data	ENVO:feces	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	yes	More than one year ago	no_data	American Gut Project	60	no_data	Contact...	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	21824	Outdoors	no_data	3/28/14	no	I use an antiperspirant	no_data	female	Less than 25%	29	no_data	no_data	no	no	no_data	no_data	.1,g	Never	118	no_data	Never	FLORIDA	no_data	no_data	UBERON:feces	right	cauliflower	RNBC3195	yes	no	ENVO:human-associated habitat	A&D (25,000; 1,000), Magnesium 1600 mg x2 + 1200 mg, Mega Chromium Picolinate; 500 mg x2, Acetyl L Carnitine 250 mg, NattoKinase x2, Ossopan 1100 MCHC; 600 mg x2, Pantothenic Acid; 1000 mg x2, PanXyme  pH x3, Phosphatidylserine, Q-Sorb 100 mg x2, Selenium; 200 mcg, Curcumin 95; 500 mg, Strontium Bone Maker 680 mg, Two per day x2, Zinc Glycinate; 20 mg, Adrene Vive or Adren-All, Super Aloe 450; 450 mg, Ultra Jarro-Dophilus 50 billion OR, ProbioMax DF 100 billion, Melatonin, Alpha Lipoic Acid 600 mg, B-6 100 mg x 2, DHEA; 10 mg, B-12 2000 mg, Bee Propolis Brazilian Green 100 mg, Cod Liver Oil, Coenzyme B-Complex, DioVasc; 500 mg x2, Vitamin E mixed tocopherals; 2000 iu, EPA Nordic Naturals, Ester C; 1000 mg x4, Estro Balance w/DIM, Glucosamine, MSM & Chondrotin x2	3295221	7:07 AM	no	More than one year ago	no_data	no_data	7-8 hours	14212	y	Vegan	no_data	vegan (xcept cod liver oil & cream in coffee)	no_data	no	152.0	no_data	I do not have IBD	311426B	0	JERE	9606	no_data	408170	no_data	no_data	21 to 30	no_data	223.1	no_data	JG	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	yes	HOWE	yes	no	5	no	1	no_data	111569B	no_data	no_data	yes	Decreased more than 10 pounds	101013	sweet potato	I do not have diabetes	no_data	no	Never	no_data	no	no_data	round9	no	26.3	no_data	no	yes	American Gut Project Stool sample
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000004039.1075833	no_data	no_data	60	no_data	no_data	n	no_data	no_data	68.0	70.0	no_data	1068602	4039	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	yes	no_data	no_data	Daily	15	no	no_data	USA	100	Never	no_data	1925:964451839	ERC000011	no	000004039	no_data	-122.6	no	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	100	no_data	no_data	no_data	Stool	City	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	no_data	no	no	19.37155555555555555555555555555555555559	ENVO:human-associated habitat	E3	Daily	no_data	no_data	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	yes	years	no_data	Regularly (3-5 times/week)	human	no_data	no_data	ENVO:feces	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	yes	More than one year ago	no_data	American Gut Project	75	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	25374	Indoors	no_data	04/14/2013	no_data	I use deoderant	no_data	male	Less than 25%	25	no_data	no_data	no	no	no_data	no_data	0.1, gram	Never	155	no_data	Never	OR	no_data	no_data	UBERON:feces	right	blueberries	no_data	no	no_data	ENVO:human-associated habitat	Vit D, Omega-3	3821142	08:45 AM	no	More than one year ago	no_data	no_data	7-8 hours	000004039	n	Vegetarian	no_data	no_data	no_data	no	191.0	no_data	no_data	no_data	0	no_data	9606	no_data	408170	no_data	no_data	21 to 30	no_data	275	no_data	no_data	no_data	no_data	no	no_data	AGFecal5	no_data	Caucasian	no_data	yes	no_data	no_data	no	10	no	0	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	Remained stable	no_data	bread	I do not have diabetes	no_data	no	Never	no_data	no	no_data	no_data	yes	45.5	no_data	no	no	American Gut Project Stool sample
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000016287.fixed427	CTCTTCTGATCA	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	unknown	unknown	unknown	y	8/21/14	Housing...	23.0	68.0	unknown	no_data	16287	no	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	8.5	Rarely (few times/month)	unknown	no	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	United Kingdom	0	Never	148025847	279704143	no_data	no	no_data	311169B	-0.0	no	unknown	no_data	unknown	unknown	Diet_Int_1	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	unknown	PS14F4	no_data	unknown	no_data	City	None	GAZ:United Kingdom	Not in the last year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	Not in the last year	no	no	21.52040816	ENVO:urban biome	C5	Daily	unknown	unknown	CCME	CCME	no	GT	unknown	unknown	no	years	unknown	Occasionally (1-2 times/week)	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	no	Within the past 3 months	V4	American Gut Project	70.0	unknown	Contact...	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	Outdoors	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	6/7/14	no	I use deoderant	unknown	male	unknown	unknown	16S rRNA	unknown	no	no	unknown	no_data	.1,g	Never	150.0	unknown	Regularly (3-5 times/week)	ROTHERHITHE	True	CCME	UBERON:feces	left	unknown	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	11:25 AM	no	Within the past year	EMP	unknown	7-8 hours	16287	y	Omnivore	CCME	unknown	CCME	no	179.0	unknown	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	unknown	unknown	unknown	unknown	JG	AG13	2014-06-07 11:25:00	no	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	Caucasian	Contact..., Housing...	no	HOWE	unknown	no	4	no	unknown	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Remained stable	71514	unknown	I do not have diabetes	unknown	no	Rarely (few times/month)	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	no	51.5	unknown	no	no	American Gut Project Stool sample
BLANK.C.1.1257453	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	y	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	1245115	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	1624.1	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	145049333	2234:unknown	ERC000011	no_data	BLANK.C.1	311169B	-105.3	no_data	no_data	BLANK.C.1	no_data	no_data	AG37	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	PS13J2	no_data	no_data	control	no_data	no_data	GAZ:United States of America	no_data	no_data	unclassified metagenome	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	ENVO:aquatic biome	C1	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	years	no_data	no_data	control	no_data	no_data	ENVO:sterile water	no_data	no_data	0.0	no_data	no_data	no_data	no_data	American Gut Project	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	232	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	.1,g	no_data	no_data	no_data	no_data	CO	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	RNBC2791	no_data	no_data	ENVO:water	no_data	35032	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	BLANK.C.1	y	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	409185Z	0	RIKE	408169	no_data	408169	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	JG	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	HOWE	no_data	no_data	3	no_data	no_data	no_data	311318B	no_data	no_data	no_data	no_data	22114	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	40.0	no_data	no_data	no_data	American Gut Project blank
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000009004.1130263	no_data	no_data	25	yes	no_data	n	no_data	Indoor	42.0	70.0	no_data	1121835	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	yes	no_data	no_data	Rarely (few times/month)	22	no	no_data	USA	96	Rarely (few times/month)	145041781	2065:3508662229	ERC000011	no	000009004	311172B	-122.7	no	no_data	no_data	no_data	no_data	Fecal23	no	pennicilin, septra, sulfa drugs, strawberries. I have had some allergy test come over the years showing that I have allergy at times to these foods, but other times not: turkey, lettuce, msg, almonds, egg, wheat, mushroom, pineapple, kidney beans	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	20	13131155	no_data	no_data	Stool	Filtered	no_data	GAZ:United States of America	In the past 6 months	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	Not in the last year	no	no	no_data	ENVO:human-associated habitat	A7	Daily	no_data	No	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	yes	years	no_data	Occasionally (1-2 times/week)	human	no	no_data	ENVO:feces	no_data	Psoriasis	0.0	no_data	yes	More than one year ago	no_data	American Gut Project	no_data	no_data	Extensive	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	27244	Both	no_data	8/17/13	no	I use deoderant	no_data	female	Less than 25%	49	no_data	no_data	no	no	no_data	Fecal23_9004_A7	.1,g	Never	155	bed	Occasionally (1-2 times/week)	OR	no_data	no_data	UBERON:feces	right	spinach and kale	RNBC2791.100813	yes	no	ENVO:human-associated habitat	Multivitamin, Vitamin D 6000 iu per day, Vit A 50 iu per day, Probiotic blend lacto and bifidus 100,000 cfus per day, Magnesium gel - lotion on skin, Magnesium 100 mg per day	4104863	8:00 AM	no	More than one year ago	no_data	no_data	7-8 hours	9004	y	Omnivore	no_data	Specific Carbohydrate Diet to manage ulcerative colitis (but as of late I have fallen off the wagon a bit) - it's only been about seven to eight days total over a five year period of strict adherance - it hjust so happens that there are several of those daywere during the time of the food journal. otherwise, very strict adherence.	no_data	no	no_data	Clarithromyacin 150 mg 3x a day for about a week in late May, early June and Clindomyacin 300 mg 4x a day for about 35 days to manage a gum infection post surgery. Last take 7/12/13	Crohn's disease	110705B	0	RikE	9606	no_data	408170	no_data	no_data	11 to 20	no_data	151	no_data	JG	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	cats, Extensive, Indoor	yes	HowE	no_data	no	7	no	80	no_data	311313B	no_data	no_data	no_data	Increased more than 10 pounds	101013	carrots, grapes, raisins	I do not have diabetes	no_data	no	Rarely (few times/month)	no_data	no	no_data	no_data	yes	45.5	no_data	yes	no	American Gut Project Stool sample
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BLANK103.1259712	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	y	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	1247406	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	1624.1	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	145049333	2246:unknown	ERC000011	no_data	BLANK103	108379Z	-105.3	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	AG_31	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	BP1214A22	no_data	no_data	control	no_data	no_data	GAZ:United States of America	no_data	no_data	unclassified metagenome	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	ENVO:aquatic biome	E9	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	years	no_data	no_data	unclassified	no_data	no_data	ENVO:sterile water	no_data	no_data	0.0	no_data	no_data	no_data	no_data	American Gut Project	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	11278	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	.1,g	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	RNBC3231	no_data	no_data	ENVO:water	no_data	1702933	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	BLANK103	y	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	311426B	0	JERE	408169	no_data	408169	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	JG	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	HOWE	no_data	no_data	5	no_data	no_data	no_data	111569B	no_data	no_data	no_data	no_data	101013	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	round9	no_data	40.0	no_data	no_data	no_data	American Gut Project control
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000014900.fixed6	no_data	no_data	62	unknown	unknown	y	no_data	Housing...	68	83	unknown	no_data	no_data	no	UBERON:feces	unknown	unknown	yes	unknown	21.9	Daily	20	no	no_data	USA	100	Occasionally (1-2 times/week)	no_data	1198218623	ERC000011	no	no_data	no_data	-117.3	no	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	no	unknown	no_data	UBERON:feces	no_data	Stool	unknown	unknown	no_data	15	no_data	no_data	unknown	no_data	City	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	no_data	In the past 6 months	no	no	25.08777006	ENVO:urban biome	no_data	Daily	unknown	unknown	no_data	CCME	no	no_data	unknown	unknown	yes	years	unknown	Regularly (3-5 times/week)	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	yes	Within the past 6 months	no_data	American Gut Project	72	unknown	Contact...	unknown	unknown	no_data	unknown	True	17	Both	no_data	3/31/14	no	I do not use deoderant or antiperspirant	unknown	male	25 to 50%	18	no_data	unknown	no	yes	unknown	no_data	no_data	Never	185	unknown	Rarely (few times/month)	CA	True	no_data	UBERON:feces	right	broccoli	no_data	no	no	ENVO:human-associated habitat	Vit D	2567	8:00 AM	no	More than one year ago	no_data	unknown	6-7 hours	14900	y	Omnivore	no_data	unknown	no_data	no	183	unknown	I do not have IBD	no_data	0	no_data	9606	no_data	no_data	unknown	completed	6 to 10	unknown	68	unknown	no_data	no_data	2014-03-31 08:00:00	yes	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	no	no_data	unknown	no	no_data	no	85	no_data	no_data	unknown	no_data	unknown	Remained stable	no_data	whole wheat bread	I do not have diabetes	unknown	no	Rarely (few times/month)	no_data	no	unknown	no_data	yes	33.0	unknown	no	yes	None
BLANK.2.7F.fixed616	CGCTTAGTGCTG	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	unknown	unknown	unknown	y	8/21/14	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	BLANK.2.7F	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	1624.1	unknown	unknown	unknown	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	unknown	unknown	unknown	148025847	BLANK.2.7F	no_data	unknown	no_data	311169B	-105.3	unknown	unknown	no_data	unknown	unknown	Diet_Int_2	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	American_Gut_round_13	unknown	PS14F4	no_data	unknown	no_data	unknown	None	GAZ:United States of America	unknown	unknown	unclassified metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	unknown	unknown	unknown	unknown	ENVO:aquatic biome	F7	unknown	unknown	unknown	CCME	CCME	unknown	GT	unknown	unknown	unknown	years	unknown	unknown	blank	unknown	unknown	ENVO:sterile water	unknown	unknown	0.0	unknown	unknown	unknown	V4	American Gut Project	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	unknown	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	8/21/14	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	16S rRNA	unknown	unknown	unknown	unknown	no_data	.1,g	unknown	unknown	unknown	unknown	CO	True	CCME	unknown	unknown	unknown	RNBC9352	unknown	unknown	ENVO:water	unknown	no_data	12:00 PM	unknown	unknown	EMP	unknown	unknown	BLANK.2.7F	y	unknown	CCME	unknown	CCME	unknown	unknown	unknown	unknown	3111426B	0	JERE	408169	MiSeq	408169	unknown	completed	unknown	unknown	unknown	unknown	JG	AG13	2014-08-21 12:00:00	unknown	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	unknown	unknown	unknown	HOWE	unknown	unknown	5	unknown	unknown	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	unknown	71514	unknown	unknown	unknown	unknown	unknown	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	unknown	unknown	no_data	unknown	40.0	unknown	unknown	unknown	American Gut Project Stool sample
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000015188.fixed1026	no_data	no_data	unknown	unknown	unknown	y	no_data	Housing...	26	74	unknown	no_data	no_data	no	UBERON:skin	Lack of sleep	Depression	no	Stress	229.0	Daily	unknown	no	no_data	USA	0	Never	no_data	1694519516	ERC000011	no	no_data	no_data	-80.0	no	yes	no_data	no	unknown	no_data	no	unknown	no_data	UBERON:sebum	no_data	Forehead	Monthly	yes	no_data	unknown	no_data	no_data	yes	no_data	Filtered	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	yes	human skin metagenome	unknown	unknown	no_data	In the past year	no	yes	unknown	ENVO:urban biome	no_data	Daily	Imitrex; Excedrin Migraine	unknown	no_data	UCSD	no	no_data	unknown	unknown	yes	years	unknown	Occasionally (1-2 times/week)	human	no	unknown	ENVO:sebum	unknown	I do not have a skin condition	0.0	yes	yes	More than one year ago	no_data	American Gut Project	unknown	unknown	Contact...	unknown	One	no_data	unknown	True	no_data	Depends on the season	no_data	05/01/2014	no	I use an antiperspirant	unknown	male	unknown	unknown	no_data	unknown	yes	yes	yes	no_data	no_data	Rarely (few times/month)	165	unknown	Daily	PA	True	no_data	UBERON:skin	left	unknown	no_data	no	no	ENVO:human-associated habitat	Vit B Complex w/C; Vit D	no_data	10:20 PM	no	More than one year ago	no_data	no	6-7 hours	000015188	y	Omnivore	no_data	unknown	no_data	no	unknown	unknown	I do not have IBD	no_data	0	no_data	9606	no_data	no_data	unknown	completed	unknown	yes	unknown	unknown	no_data	no_data	2014-05-01 10:20:00	yes	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	no	no_data	unknown	no	no_data	yes	unknown	no_data	no_data	unknown	no_data	unknown	Remained stable	no_data	unknown	I do not have diabetes	unknown	no	Never	no_data	no	unknown	no_data	no	40.4	unknown	no	yes	Description
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000013336.fixed174	no_data	no_data	58	unknown	unknown	y	no_data	Housing...	63	86	unknown	no_data	no_data	no	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	86.9	Occasionally (1-2 times/week)	12	no	no_data	USA	97	Daily	no_data	1989866504	ERC000011	no	no_data	no_data	-77.3	yes	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	no	unknown	no_data	UBERON:feces	no_data	Stool	unknown	unknown	no_data	100	no_data	no_data	unknown	no_data	Filtered	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	no_data	In the past 6 months	no	no	34.74765869	ENVO:urban biome	no_data	Daily	unknown	No	no_data	CCME	no	no_data	unknown	unknown	no	years	unknown	Occasionally (1-2 times/week)	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	yes	yes	Within the past 3 months	no_data	American Gut Project	62	unknown	Contact...	unknown	unknown	no_data	unknown	True	64997	Indoors	no_data	3/25/14	no	I use deoderant	unknown	female	Less than 25%	27	no_data	unknown	no	yes	unknown	no_data	no_data	Never	190	unknown	Regularly (3-5 times/week)	VA	True	no_data	UBERON:feces	right	Beans	no_data	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	9814547	1:10 PM	no	More than one year ago	no_data	unknown	7-8 hours	13336	y	Vegan	no_data	unknown	no_data	yes	157	unknown	I do not have IBD	no_data	0	no_data	9606	no_data	no_data	unknown	completed	11 to 20	unknown	28	unknown	no_data	no_data	2014-03-25 13:10:00	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	no	no_data	yes	no	no_data	no	0	no_data	no_data	unknown	no_data	unknown	Remained stable	no_data	Bananas (and other fruits)	I do not have diabetes	unknown	yes	Never	no_data	no	unknown	no_data	no	38.9	unknown	yes	yes	None
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000018390.fixed581	TCTTCAACTACC	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	25.0	unknown	unknown	y	9/18/14	Housing...	37.0	70.0	unknown	no_data	18390	no	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	361.2	Daily	8.0	no	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	USA	100	Never	148025847	1914773423	no_data	yes	no_data	31172B	-122.6	no	unknown	no_data	unknown	unknown	AG_57	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	20.0	PS14F4	no_data	unknown	no_data	City	None	GAZ:United States of America	Not in the last year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	In the past year	no	no	21.61575084	ENVO:urban biome	C12	Daily	unknown	unknown	CCME	CCME	no	GT	unknown	unknown	yes	years	unknown	Occasionally (1-2 times/week)	human	no	yes	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	no	Within the past 3 months	V4	American Gut Project	71.0	unknown	Contact...	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	Both	140918_M01918_0133_000000000-A7FTM	8/28/14	no	I use an antiperspirant	unknown	male	Less than 25%	67.0	16S rRNA	unknown	no	no	unknown	no_data	.1,g	Never	155.0	unknown	Regularly (3-5 times/week)	CA	True	CCME	UBERON:feces	right	greens	RNBC9352	yes	no	ENVO:human-associated habitat	magnesium, vitamin c, rhodiola, curcumin	no_data	1:37 PM	no	More than one year ago	EMP	unknown	7-8 hours	18390	y	Omnivore	CCME	generally avoid wheat, eat some other grains mainly rice	CCME	no	180.0	unknown	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	21 to 30	unknown	210.0	unknown	JG	AG13	2014-08-28 13:37:00	no	plate57	no_data	Illumina	Caucasian	Contact..., Housing...	yes	NEWE	unknown	no	7	no	80.0	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Remained stable	71514	rice	I do not have diabetes	unknown	no	Never	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	unknown	38.5	unknown	no	yes	American Gut Project Stool sample
000007729.1131778	no_data	no_data	33	no_data	no_data	n	no_data	Housing...	39.0	77.0	no_data	1123124	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	no	no_data	no_data	Regularly (3-5 times/week)	33	no	no_data	USA	100	Never	145032369	2037:3451598628	ERC000011	no	000007729	311169B	-121.1	no	no_data	no_data	no_data	no_data	Fecal24	no	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	50	13131155	7729	no_data	Stool	City	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	Not in the last year	no	no	21.24622222	ENVO:human-associated habitat	A4	Daily	no_data	no_data	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	no	years	no_data	Occasionally (1-2 times/week)	human	no	no_data	ENVO:feces	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	no	Within the past month	no_data	American Gut Project	75	no_data	Contact...	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	23064	Outdoors	no_data	8/30/13	no	I use deoderant	no_data	no_data	Less than 25%	34	no_data	no_data	no	no	no_data	Fecal24_7729_A4	0.1,g	Rarely (few times/month)	170	no_data	Occasionally (1-2 times/week)	WA	no_data	no_data	UBERON:feces	right	zuchinni	RNBC2791.091108	no_data	no	ENVO:human-associated habitat	no_data	3482664	2:10 PM	no	More than one year ago	no_data	no_data	7-8 hours	7729	n	Omnivore	no_data	no_data	no_data	no	191.0	no_data	I do not have IBD	311426B	0	RikE	9606	no_data	408170	no_data	no_data	11 to 20	no_data	245	no_data	JG	no_data	no_data	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	no	HOWE	yes	no	8	no	50	MiSeq 1	311318B	no_data	no_data	no_data	Remained stable	52813	bread	I do not have diabetes	no_data	no	Rarely (few times/month)	no_data	no	no_data	no_data	no	45.8	no_data	no	no	American Gut Project Stool sample
000007831.fixed1070	no_data	no_data	46	unknown	unknown	y	no_data	Housing...	36	51	unknown	no_data	no_data	no	UBERON:skin	unknown	unknown	no	unknown	101.9	Never	15	no	no_data	Belgium	91	Daily	no_data	1833989590	ERC000011	no	no_data	no_data	4.4	no	unknown	no_data	unknown	unknown	no_data	no	unknown	no_data	UBERON:sebum	no_data	Forehead	unknown	unknown	no_data	15	no_data	no_data	unknown	no_data	Filtered	no_data	GAZ:Belgium	Not in the last year	unknown	human skin metagenome	unknown	unknown	no_data	Not in the last year	no	no	18.07529843893480257116620752984389348026	ENVO:urban biome	no_data	Daily	unknown	I take the pill	no_data	UCSD	yes	no_data	Husband, Daughter, Daughter	unknown	no	years	unknown	Never	human	no	yes	ENVO:sebum	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	no	Within the past month	no_data	American Gut Project	66	unknown	Contact...	unknown	unknown	no_data	unknown	True	no_data	None of the above	no_data	08/22/2013	no	Not sure, but I use some form of deoderant/antiperspirant	unknown	female	Less than 25%	30	no_data	unknown	no	no	unknown	no_data	no_data	Never	112	unknown	Regularly (3-5 times/week)	unknown	True	no_data	UBERON:skin	right	Tomatoes	no_data	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	07:30 PM	no	More than one year ago	no_data	unknown	7-8 hours	000007831	y	Omnivore	no_data	unknown	no_data	no	169	unknown	I do not have IBD	no_data	0	no_data	9606	no_data	no_data	unknown	completed	Less than 5	unknown	106	unknown	no_data	no_data	2013-08-22 07:30:00	no	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	no	no_data	unknown	no	no_data	no	85	no_data	no_data	unknown	no_data	unknown	Remained stable	no_data	Pasta, fruits	I do not have diabetes	unknown	no	Never	no_data	no	unknown	no_data	no	50.8	unknown	yes	no	Description
000016765.fixed518	ATACGCATCAAG	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	62.0	yes	unknown	y	8/21/14	Housing...	33.0	77.0	unknown	no_data	16765	no	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	1619.8	Rarely (few times/month)	13.0	yes	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	USA	100	Daily	148025847	1275797751	no_data	no	no_data	311172B	-105.2	no	unknown	no_data	unknown	unknown	Knight_Cleanse_1	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	50.0	PS14F4	no_data	unknown	no_data	City	None	GAZ:United States of America	unknown	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	Not in the last year	no	no	28.28639053	ENVO:urban biome	A4	Daily	unknown	No	CCME	CCME	yes	GT	Mother, Father	unknown	unknown	years	unknown	Regularly (3-5 times/week)	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	no	More than one year ago	V4	American Gut Project	65.0	unknown	Contact...	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	Both	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	5/13/14	no	I use an antiperspirant	unknown	female	Less than 25%	25.0	16S rRNA	unknown	no	no	unknown	no_data	.1,g	Never	170.0	unknown	Regularly (3-5 times/week)	CO	True	CCME	UBERON:feces	left	cauliflower	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	6:40 AM	no	More than one year ago	EMP	unknown	7-8 hours	16765	y	Omnivore	CCME	unknown	CCME	no	165.0	unknown	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	11 to 20	unknown	64.0	unknown	EZL	AG13	2014-05-13 06:40:00	no	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	Caucasian	Contact..., Housing...	no	NEWE	unknown	no	7	no	50.0	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Remained stable	71514	maple syrup	I do not have diabetes	unknown	no	Rarely (few times/month)	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	no	40.0	unknown	yes	no	American Gut Project Stool sample
000015072.fixed317	TCATTCCACTCA	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	45.0	unknown	unknown	y	8/21/14	Housing...	35.0	69.0	unknown	no_data	15072	no	UBERON:feces	Stress	Other	no	Lack of sleep	34.4	Rarely (few times/month)	35.0	no	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	France	100	Rarely (few times/month)	148025847	2101822668	no_data	no	no_data	311169B	-0.1	no	unknown	no_data	no	unknown	Diet_Int_2	no	Sun	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	A few times a year	notsure	American_Gut_round_13	45.0	PS14F4	no_data	yes	no_data	City	None	GAZ:United Kingdom	In the past year	unknown	human gut metagenome	unknown	yes	sequencing by synthesis	Not in the last year	no	yes	24.53076217	ENVO:urban biome	H1	Daily	unknown	unknown	CCME	CCME	no	GT	unknown	unknown	no	years	unknown	Occasionally (1-2 times/week)	human	no	yes	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	no	Within the past year	V4	American Gut Project	66.0	unknown	Moderate	unknown	Two	None	yes	True	no_data	Outdoors	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	7/4/14	no	Not sure, but I use some form of deoderant/antiperspirant	unknown	unknown	51 to 75%	20.0	16S rRNA	unknown	yes	yes	unknown	no_data	.1,g	Never	152.0	unknown	Rarely (few times/month)	CAMDEN TOWN	True	CCME	UBERON:feces	right	lettuce	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	9:00 PM	yes	More than one year ago	EMP	no	7-8 hours	15072	y	Omnivore	CCME	unknown	CCME	no	170.0	unknown	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	11 to 20	no	unknown	PC or TV screen	JG	AG13	2014-07-04 21:00:00	yes	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	Caucasian	1, Moderate, Housing...	no	HOWE	unknown	no	5	no	55.0	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	yes	Remained stable	71514	bread	I do not have diabetes	unknown	no	Rarely (few times/month)	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	yes	51.5	unknown	yes	yes	American Gut Project Stool sample
000015098.fixed323	TAATGGTCGTAG	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	40.0	unknown	unknown	y	8/21/14	Confined	26.0	52.0	unknown	no_data	15098	no	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	21.1	Never	25.0	no	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	United Kingdom	100	Never	148025847	3658555813	no_data	no	no_data	311169B	0.0	no	unknown	no_data	unknown	unknown	Diet_Int_2	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	40.0	PS14F4	no_data	unknown	no_data	City	None	GAZ:United Kingdom	Not in the last year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	Not in the last year	no	no	18.96852071	ENVO:urban biome	E2	Daily	unknown	No	CCME	CCME	no	GT	unknown	unknown	no	years	unknown	Rarely (few times/month)	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	no	Within the past year	V4	American Gut Project	65.0	unknown	Little	unknown	unknown	None	unknown	True	no_data	Outdoors	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	7/8/14	no	I use deoderant	unknown	female	51 to 75%	35.0	16S rRNA	unknown	no	yes	unknown	no_data	.1,g	Never	114.0	unknown	Occasionally (1-2 times/week)	GREATER LONDON	True	CCME	UBERON:feces	right	Potato	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	1:09 PM	no	More than one year ago	EMP	unknown	8 or more hours	15098	y	Omnivore	CCME	unknown	CCME	no	167.0	unknown	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	Less than 5	unknown	95.0	unknown	JG	AG13	2014-07-08 13:09:00	yes	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	Caucasian	Snake, Little, Confined	no	HOWE	unknown	no	5	no	60.0	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Remained stable	71514	Soft drinks	I do not have diabetes	unknown	no	Never	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	no	51.6	unknown	yes	no	American Gut Project Stool sample
000013827.1261620	no_data	no_data	35	no_data	yes	y	no_data	Housing...	10.0	32.0	no_data	1249751	no_data	no	UBERON:feces	no_data	no_data	no	no_data	11.1	Rarely (few times/month)	20	no	no_data	USA	100	Never	148014030	2254:3295836809	ERC000011	no	000013827	311172B	-122.7	no	no_data	13827	no_data	no_data	AG_40	no	no_data	no_data	UBERON:feces	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	36	PS14C110	no_data	no_data	Stool	City	no_data	GAZ:United States of America	Not in the last year	no_data	human gut metagenome	no_data	no_data	no_data	Not in the last year	no	no	16.50016529	ENVO:urban biome	A5	Daily	no_data	no_data	no_data	no_data	yes	no_data	parent, parent	no_data	yes	years	no_data	Daily	human	no	no_data	ENVO:feces	no_data	I do not have a skin condition	0.0	no_data	no	More than one year ago	no_data	American Gut Project	55	no_data	Contact...	no_data	no_data	no_data	no_data	no_data	39298	Outdoors	no_data	2/10/14	no	I do not use deoderant or antiperspirant	no_data	male	25 to 50%	45	no_data	no_data	no	no	no_data	no_data	0.1, gram	Never	71	no_data	Never	OR	no_data	no_data	UBERON:feces	right	Leafy Greens	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	Mega EPA Omega 3, Vitamin K2, Vitamin D, Fermented Cod Liver Oil	5933998	6:40 PM	no	More than one year ago	no_data	no_data	8 or more hours	13827	y	Omnivore	no_data	no_data	no_data	no	140.0	no_data	I do not have IBD	111075B	0	ROBE	9606	no_data	408170	no_data	no_data	21 to 30	no_data	85	no_data	GG	no_data	no_data	yes	no_data	no_data	no_data	Caucasian	Contact..., Housing...	no	NEWE	yes	no	10	no	64	no_data	311313B	no_data	no_data	no_data	Remained stable	22114	Starch	I do not have diabetes	no_data	no	Never	no_data	no	no_data	no_data	no	45.6	no_data	yes	no	American Gut Project Stool sample
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000016755.fixed509	CCGAAGATTCTG	GTGCCAGCMGCCGCGGTAA	30.0	unknown	unknown	y	8/21/14	Housing...	22.0	83.0	unknown	no_data	16755	no	UBERON:feces	unknown	unknown	no	unknown	1664.9	Rarely (few times/month)	30.0	yes	FWD:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; REV:GGACTACHVGGGTWTCTAAT	USA	100	Never	148025847	2334514222	no_data	no	no_data	311172B	-105.2	yes	unknown	no_data	no	unknown	Knight_Cleanse_1	no	unknown	unknown	UBERON:feces	unknown	Stool	unknown	unknown	American_Gut_round_13	55.0	PS14F4	no_data	unknown	no_data	City	None	GAZ:United States of America	Not in the last year	unknown	human gut metagenome	unknown	unknown	sequencing by synthesis	Not in the last year	no	no	22.51644737	ENVO:urban biome	H5	Daily	unknown	unknown	CCME	CCME	no	GT	unknown	unknown	no	years	unknown	Regularly (3-5 times/week)	human	no	unknown	ENVO:feces	unknown	I do not have a skin condition	0.0	unknown	no	Within the past 6 months	V4	American Gut Project	76.0	unknown	Contact...	unknown	Three	None	unknown	True	no_data	Both	140821_M01918_0129_000000000-A7FMN	6/7/14	no	I use deoderant	unknown	male	25 to 50%	40.0	16S rRNA	unknown	yes	yes	unknown	no_data	.1,g	Rarely (few times/month)	185.0	unknown	Regularly (3-5 times/week)	CO	True	CCME	UBERON:feces	left	kale	RNBC9352	no	no	ENVO:human-associated habitat	unknown	no_data	11:00 AM	no	More than one year ago	EMP	yes	6-7 hours	16755	y	Omnivore	CCME	unknown	CCME	no	193.0	unknown	I do not have IBD	3111426B	0	JERE	9606	MiSeq	408170	unknown	completed	11 to 20	unknown	280.0	unknown	EZL	AG13	2014-06-07 11:00:00	unknown	Undetermined_S0_L001_	no_data	Illumina	Caucasian	Contact..., Housing...	no	NEWE	unknown	no	7	yes	45.0	no_data	111569B	unknown	samples from AGP round 13 and plate 57	unknown	Remained stable	71514	bread	I do not have diabetes	unknown	no	Rarely (few times/month)	This analysis was done as in Caporaso et al 2011 Genome research. The PCR primers F515 and R806 were developed against the V4 region of the 16S rRNA, both bacteria and archaea, which we determined would yield optimal community clustering with reads of this length The reverse PCR primer is barcoded with a 12-base error-correcting Golay code to facilitate multiplexing of up to 1,500 samples per lane, and both PCR primers contain sequencer adapter regions.	no	unknown	no_data	unknown	40.0	unknown	no	no	American Gut Project Stool sample
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