all_datasets = ( 'Dataset1', 'Dataset2', 'Dataset3', 'Dataset4', 'Dataset5', 'Dataset6', 'Dataset7', 'Dataset8', ) datasets_with_adj = ( 'Dataset1', 'Dataset2', 'Dataset3', 'Dataset4', 'Dataset5', 'Dataset6', 'Dataset8', ) timepoint = { 'Dataset1': 0, 'Dataset2': 5, 'Dataset3': 8, 'Dataset4': 16, 'Dataset5': 23, 'Dataset6': 27, 'Dataset7': 50, 'Dataset8': 50, } stage = { 'Dataset1': 'L1', 'Dataset2': 'L1', 'Dataset3': 'L1', 'Dataset4': 'L1', 'Dataset5': 'L2', 'Dataset6': 'L3', 'Dataset7': 'Adult', 'Dataset8': 'Adult', 'white_l4': 'L4', 'white_adult': 'Adult', } # Dataset 6 coordinates need to be scaled due to shrinkage. upscale_l3 = 1.1