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  "id": "https://vre.eucanshare.bsc.es/tool-schema",
  "$schema": "http://json-schema.org/draft-04/schema#",
  "type": "object",
  "title": "Tool definition schema - I/O",
  "description": "Specification of inputs, outputs and arguments for a openVRE Tool",
  "properties": {
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                "null",
                "AMB",
                "ANN",
                "BAI",
                "BAM",
                "BB",
                "BED",
                "BEDGRAPH",
                "BT2",
                "BW",
                "BWT",
                "CPT",
                "CSV",
                "DCD",
                "FASTA",
                "FASTQ",
                "GEM",
                "GFF",
                "GFF3",
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                "IDX",
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                "MDCRD",
                "NETCDF",
                "NIFTI",
                "DICOM",
                "BIM",
                "FAM",
                "FRQ",
                "RAW",
                "NOSEX",
                "PAC",
                "PARMTOP",
                "PDB",
                "PDF",
                "PICKLE",
                "PNG",
                "RDATA",
                "RST",
                "SA",
                "TAR",
                "TBI",
                "TIFF",
                "TOP",
                "TPR",
                "TSV",
                "TXT",
                "VCF",
                "WIG",
                "XLSX",
                "XTC"
              ]
            }
          },
          "data_type": {
            "type": "array",
            "items": {
              "type": "string",
              "enum": [
                "tool_statistics",
                "dna_sequence",
                "data_atac_seq",
                "data_rna_seq",
                "sequence_rna",
                "data_chic",
                "configuration_file",
                "sequence_annotation",
                "bioimage",
                "image_mask",
                "deep_learning_model",
                "parameter_file",
                "report",
                "extended_MAP_file",
                "sample_information_file",
                "allele_frequency_report",
                "component_file",
                "machine_learning_features",
                "expression_matrix",
                "annotations",
                "group_definitions",
                "covariate_matrix",
                "differential_matrix",
                "study_data",
                "study_meta_data"
              ]
            }
          },
          "required": {
            "type": "boolean",
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          },
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            "type": "boolean",
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        },
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          "name",
          "description",
          "file_type",
          "data_type",
          "required",
          "allow_multiple"
        ]
      }
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        "type": "object",
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              "enum_multiple",
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            ]
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                "AMB",
                "ANN",
                "BAI",
                "BAM",
                "BB",
                "BED",
                "BEDGRAPH",
                "BT2",
                "BW",
                "BWT",
                "CPT",
                "CSV",
                "DCD",
                "FASTA",
                "FASTQ",
                "GEM",
                "GFF",
                "GFF3",
                "GTF",
                "HDF5",
                "HTML",
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                "LIF",
                "MDCRD",
                "NETCDF",
                "NIFTI",
                "DICOM",
                "BIM",
                "FAM",
                "FRQ",
                "RAW",
                "NOSEX",
                "PAC",
                "PARMTOP",
                "PDB",
                "PDF",
                "PICKLE",
                "PNG",
                "RDATA",
                "RST",
                "SA",
                "TAR",
                "TBI",
                "TIFF",
                "TOP",
                "TPR",
                "TSV",
                "TXT",
                "VCF",
                "WIG",
                  "XLSX",
                "XTC"
              ]
            }
          },
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                "parameter_file",
                "report",
                "extended_MAP_file",
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                "allele_frequency_report",
		"genome_annotation",
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                "expression_matrix",
                "annotations",
                "group_definitions",
                "covariate_matrix",
                "differential_matrix",
                "study_data",
                "study_meta_data"
              ]
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        ]
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              "enum_multiple",
              "boolean",
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            ]
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                "type": "array"
              },
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              }
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            "required": [
              "name"
            ],
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          },
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            "type": "integer"
          },
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          },
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            "type": "boolean",
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          }
        },
        "additionalProperties": false,
        "required": [
          "name",
          "description",
          "type"
        ]
      }
    },
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      "type": "array",
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            "type": "string"
          },
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            "type": "boolean",
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          },
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            "type": "boolean",
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          },
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            "type": "object",
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                  "null",
                  "AMB",
                  "ANN",
                  "BAI",
                  "BAM",
                  "BB",
                  "BED",
                  "BEDGRAPH",
                  "BT2",
                  "BW",
                  "BWT",
                  "CPT",
                  "CSV",
                  "DCD",
                  "FASTA",
                  "FASTQ",
                  "GEM",
                  "GFF",
                  "GFF3",
                  "GTF",
                  "HDF5",
                  "HTML",
                  "IDX",
                  "JSON",
                  "LIF",
                  "MDCRD",
                  "NETCDF",
                  "NIFTI",
                  "DICOM",
                  "BIM",
                  "FAM",
                  "FRQ",
                  "RAW",
                  "NOSEX",
                  "PAC",
                  "PARMTOP",
                  "PDB",
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                  "PICKLE",
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