@HD VN:1.6 SO:coordinate @SQ SN:chr1 LN:248956422 @SQ SN:chr2 LN:242193529 @PG ID:bwa PN:bwa VN:0.7.17-r1188 READ001 99 chr1 10000 60 75M = 10150 225 ACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACG FFFFF:FFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFF,FFFFFFFFFFFFFFF,FF:F:F NM:i:0 MD:Z:75 AS:i:75 XS:i:0 READ001 147 chr1 10150 60 75M = 10000 -225 TGCATGCATGCATGCATGCATGCATGCATGCATGCATGCATGCATGCATGCATGCATGCATGCATGCATGCATGC FFFFFFFFFFFF,FFFFFFFFFFFFFFFFF:FFFFFFFFFFFF:FFFFFFFFFFFF,FFFFFFF:FFFFFFFFFF NM:i:0 MD:Z:75 AS:i:75 XS:i:0 READ002 0 chr1 15000 60 70M5S * 0 0 GGTTAAGGTTAAGGTTAAGGTTAAGGTTAAGGTTAAGGTTAAGGTTAAGGTTAAGGTTAAGGTTAAGGTTAAGGT FFFFFFFFF:F;FFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFF,FFFFFFFFFFFF:FFFFFFFFFFFFFFFFFFFFF,F NM:i:1 MD:Z:70 AS:i:65 XS:i:0 READ003 16 chr2 50000 40 3S72M * 0 0 GACCCCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCG FFFFFF:FFFFFFFFFF:FFFFFFFFFFFFFF:FFFFFFFFFFFFFF,FFFFFFFFFFFFFFFFFF,FFFFFFFF NM:i:2 MD:Z:40A30G1 AS:i:62 XS:i:30 READ004 4 * 0 0 * * 0 0 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN FFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFF:FFFFFFFFFFF:FFFFFFFFFFFFF,FFFFFFFFF,,FFFFFFF NM:i:0 MD:Z:75 AS:i:0 XS:i:0