clade	gene	site	alt

19A	nuc	8782	C
19A	nuc	14408	C

19B	nuc	8782	T
19B	nuc	28144	C

20A	clade	19A
20A	nuc	14408	T
20A	nuc	23403	G

20B	clade	20A
20B	nuc	28881	A
20B	nuc	28882	A

20C	clade	20A
20C	nuc	1059	T
20C	nuc	25563	T

20D	clade	20B
20D	nuc	4002	T
20D	nuc	10097	A
20D	nuc	13536	T
20D	nuc	23731	T

20E	clade	20A
20E	nuc	22227	T
20E	nuc	28932	T
20E	nuc	29645	T

20F	clade	20B
20F	nuc	1163	T
20F	nuc	7540	C
20F	nuc	16647	T
20F	nuc	18555	T
20F	nuc	22992	A
20F	nuc	23401	A

20G	clade	20C
20G	nuc	10319	T
20G	nuc	18424	G
20G	nuc	25907	T
20G	nuc	27964	T
20G	nuc	28472	T
20G	nuc	28869	T

20H	clade	20C
20H	nuc	23012	A
20H	nuc	23063	T
20H	nuc	23403	G
20H	nuc	26456	T

20I	clade	20B
20I	nuc	14676	T
20I	nuc	15279	T
20I	nuc	23063	T

20J	clade	20B
20J	nuc	733	C
20J	nuc	2749	T
20J	nuc	3828	T
20J	nuc	5648	C
20J	nuc	12778	T
20J	nuc	13860	T

21A	clade	20A
21A	nuc	21618	G
21A	nuc	26767	C
21A	nuc	28461	G

21B	clade	20A
21B	nuc	17523	T
21B	nuc	22917	G
21B	nuc	23012	C
21B	nuc	27638	C
21B	nuc	28881	T
21B	nuc	29402	T

21C	clade	20C
21C	nuc	17014	T
21C	nuc	21600	T
21C	nuc	22018	T
21C	nuc	22917	G

21D	clade	20A
21D	nuc	14407	T
21D	nuc	20724	G
21D	nuc	23593	C
21D	nuc	24224	C
21D	nuc	24748	T

21E	clade	20B
21E	nuc	12049	T
21E	nuc	23341	C
21E	nuc	23604	A
21E	nuc	24187	A
21E	nuc	24836	A

21F	clade	20C
21F	nuc	16500	C
21F	nuc	20262	G
21F	nuc	21575	T
21F	nuc	22320	G

21G	clade	20D
21G	nuc	21786	T
21G	nuc	21789	T
21G	nuc	22917	A
21G	nuc	23031	C

21H	clade	20A
21H	nuc	3428	G
21H	nuc	4878	T
21H	nuc	11451	G
21H	nuc	13057	T
21H	nuc	17491	T
21H	nuc	27925	A

21I	clade	21A
21I	nuc	5184	T
21I	nuc	9891	T
21I	nuc	22227	T

21J	clade	21A
21J	nuc	11332	G
21J	nuc	19220	T

21K	clade	21M
21K	nuc	15240	T
21K	nuc	23202	A
21K	nuc	23525	T
21K	nuc	27259	C

21L	clade	21M
21L	nuc	21618	T
21L	nuc	22775	A

21M	clade	20B
21M	nuc	18163	G
21M	nuc	23599	G

22A	clade	21L
22A	nuc	12160	A
22A	nuc	9866	C
22A	nuc	28724	T

22B	clade	21L
22B	nuc	12160	A
22B	nuc	9866	C
22B	nuc	27259	A

22C	clade	21L
22C	nuc	22917	A
22C	nuc	23673	T

22D	clade	21L
22D	nuc	3796	T
22D	nuc	26275	G

22E	clade	22B
22E	nuc	14257	C
22E	nuc	16935	A
22E	nuc	28312	T
22E	nuc	22942	A

22F	clade	21L
22F	nuc	15461	A
22F	nuc	17859	C
22F	nuc	23019	C
22F	nuc	26275	G

23A	clade	22F
23A	nuc	22317	T
23A	nuc	23018	C
23A	nuc	27915	T

23B	clade	22F
23B	nuc	12730	A
23B	nuc	14856	G
23B	nuc	18703	T
23B	nuc	28447	G

23C	clade	22D
23C	nuc	3857	A
23C	nuc	20741	G
23C	nuc	22599	C
23C	nuc	22917	G
23C	nuc	22893	C
23C	nuc	23019	C

23D	clade	22F
23D	nuc	5720	A
23D	nuc	12789	T
23D	nuc	28297	C

23E	clade	22F
23E	nuc	4234	T
23E	nuc	23123	T
23E	nuc	27431	T

23F	clade	23D
23F	nuc	2334	T
23F	nuc	9693	T
23F	nuc	21718	T
23F	nuc	22480	T
23F	nuc	22930	A

23G	clade	23A
23G	nuc	8737	C
23G	nuc	25045	G
23G	nuc	28005	T

23H	clade	23F
23H	nuc	13627	A
23H	nuc	22927	T

23I	clade	21L
23I	nuc	897	A
23I	nuc	15756	A
23I	nuc	28958	A

24A	clade	23I
24A	nuc	11727	A
24A	nuc	22926	C
24A	nuc	27810	C

24B	clade	24A
24B	nuc	7113	T
24B	nuc	17334	T
24B	nuc	22928	C
24B	nuc	24872	T