{ "All": { "Astrocyte": ["Aass", "Acaa2", "Acsl6", "Add3", "Adgrg1", "Adhfe1", "Adora2b", "AI464131", "Aldh6a1", "Amot", "Antxr1", "Aox1", "Appl2", "Axl", "Bcan", "Btbd17", "Cbs", "Cd38", "Clu", "Col4a5", "Cpq", "Crot", "Cspg5", "Cth", "Cyp2j6", "Cyp4f14", "Cyp4f15", "Cyr61", "Dennd4c", "Dtna", "Ednrb", "Egfr", "Elovl5", "Entpd2", "Ephx2", "Fads1", "Fads2", "Fermt2", "Fgd6", "Fgfrl1", "Fjx1", "Fkbp10", "Fmo1", "Fzd2", "Fzd4", "Gabrg1", "Glud1", "Gpld1", "Hacd2", "Il18", "Itga7", "Lamb2", "Lhx2", "Lmcd1", "Lpp", "Lrp4", "Msmo1", "Naaa", "Nat8f4", "Nrarp", "Oaf", "Oplah", "Papss2", "Pdgfc", "Pdgfrb", "Pdk4", "Pdzph1", "Phka1", "Phkg1", "Ppara", "Prdx6", "Prodh", "Ptpn13", "Pygb", "Retsat", "Rftn2", "Rlbp1", "Rnft1", "Rorb", "Sash1", "Serhl", "Slc12a4", "Slc38a3", "Slc41a1", "Smpd2", "Sorcs2", "Sox21", "Srebf1", "Suclg2", "Tfcp2l1", "Tnfrsf19", "Trps1", "Vcam1", "Vcl"], "Basket": ["Socs2"], "Bergmann": ["A2m", "Baalc", "Casp12", "Cd70", "Cdc42ep1", "Chil1", "Dao", "E2f5", "Evc", "Fam227b", "Gstt2", "Hist1h4i", "Htra3", "Mob3b", "Msx2", "Plce1", "Plscr1", "Pth1r", "Pxmp2", "Rarres2", "Rdh5", "Rhoc", "Rhoj", "Rras", "Tcf7l1", "Tmem30b", "Tmprss3", "Tprkb", "Vamp5", "Vegfc", "Wif1"], "BrainstemCholin": ["Fgf18"], "CerebGranule": ["Car4", "Cbln3", "Crtam", "Dleu2", "Eomes", "Mapk12", "Pax6", "Sptssb", "Tbata", "Trim62", "Uncx"], "DentateGranule": ["Dsg2", "Dsp", "Iigp1", "Npy5r", "Phf20l1", "Sema5a", "Stxbp6", "Tdo2"], "Dopaminergic": ["Slc6a3"], "Ependymal": ["Acvr2b", "Arid1a", "Aspm", "Ccnb2", "Ccr6", "Cd1d1", "Cdc20", "Cdca7", "Cdk1", "Cdt1", "Cenpe", "Cenpf", "Cep55", "D930015E06Rik", "Dbf4", "Dlx2", "Dna2", "Ect2", "Ezh2", "Igfbpl1", "Iqgap1", "Isg20", "Kif2c", "Mcm7", "Mis18bp1", "Mki67", "Nasp", "Ncaph", "Nusap1", "Rad54l", "Rnd3", "Rrm2", "Shcbp1", "Smc4", "Sox11", "Sox4", "Sp1", "Top2a", "Ube2c", "Uhrf1", "Vgll4", "Zcchc14", "Zfp704", "Zwilch"], "ForebrainCholin": ["Crabp1", "Lhx8", "Ptger2", "Slc5a7"], "GabaPV": ["Cox6a2"], "GabaReln": ["Gabrr1", "Gabrr2", "Lmo1", "Otx2", "Tal1", "Tnnt1"], "GabaRelnCalb": ["Nppc"], "GabaSSTReln": ["Gp5", "Grpr", "Kcnmb2", "Postn"], "GabaVIPReln": ["Col14a1", "Htr3a", "Npas1", "Vip", "Wnt5a"], "Gluta": ["Tshz2"], "Golgi": ["Actn3", "Ccnb1ip1", "Dapk2", "Flt4", "Rasgrp2", "Sgcg"], "Hypocretinergic": ["2010005H15Rik", "Avpr1a", "Cckar", "Crhr2", "Hcrt", "Hmx2", "Pcsk1", "Pdyn", "Rspo1", "Trhr"], "Microglia": ["1700017B05Rik", "2510039O18Rik", "Abhd15", "Adap2", "Akna", "Ankrd44", "Arhgap45", "Arrb2", "AW112010", "C3ar1", "Casp1", "Casp8", "Ccl6", "Cd300c2", "Cd34", "Cd37", "Cd52", "Cd68", "Cfh", "Cflar", "Chil3", "Clec5a", "Clic1", "Cln3", "Coro1a", "Crybb1", "Ctsa", "Ctsh", "Ctsz", "Cttnbp2nl", "Cyba", "Cysltr1", "Dapp1", "Dock2", "Ebi3", "Ehd4", "Entpd1", "Erap1", "F11r", "Fam91a1", "Fcgr1", "Fcrl1", "Fes", "Fkbp7", "Fyb", "Gcnt1", "Ggta1", "Gmfg", "Gmip", "Gpsm3", "Grn", "Gusb", "H2-Ab1", "H2-K1", "H2-Oa", "Hacd4", "Havcr2", "Hcls1", "Herpud1", "Hps4", "Ifngr1", "Igsf6", "Il13ra1", "Il21r", "Il6ra", "Il7r", "Irf5", "Irgm2", "Itgb2", "Junb", "Lag3", "Lgals9", "Ly96", "Lyn", "Map3k1", "Mlxipl", "Morc3", "Mrc1", "Msn", "Naip2", "Naip5", "Nrros", "Pag1", "Pald1", "Parp12", "Pdgfb", "Pf4", "Phyhd1", "Pla2g15", "Pla2g4a", "Plcg2", "Plekho1", "Pon3", "Ppp1r15a", "Pros1", "Ptbp3", "Ptgs1", "Rassf5", "Rbm39", "Rcsd1", "Rel", "Rin2", "Rrbp1", "Sash3", "Sgpl1", "Sh3glb1", "Siglecf", "Sipa1", "Skap2", "Slc11a1", "Slc7a7", "Snord22", "Spi1", "Sppl2a", "Srsf7", "Stab1", "Stat6", "Stt3a", "Tapbp", "Tbxas1", "Tcn2", "Tgfb1", "Tgif2", "Tlr1", "Tmc6", "Tob2", "Tor4a", "Tpst2", "Trim12a", "Trim34a", "Vwa5a"], "Microglia_activation": ["Asxl1", "Atp7a", "B4galt1", "Bach1", "Birc3", "Casp4", "Ccl12", "Ccl2", "Ccl9", "Ccr5", "Cd164", "Cd86", "Cebpb", "Cep152", "Chst7", "Csf2rb2", "Ctla2b", "Cxcl10", "Cxcl16", "Cxcl2", "Eif4ebp1", "Fcer1g", "Fcgr2b", "Frrs1", "Gas5", "Gpr84", "Hck", "Hfe", "Hlx", "Ier3", "Ifi30", "Ifi35", "Ifih1", "Igtp", "Il17ra", "Il1a", "Il4ra", "Il6", "Irf9", "Jmjd1c", "Lcp2", "Maff", "Map3k8", "Mlph", "Mlxip", "Ms4a6b", "Ms4a6c", "Ms4a6d", "Myd88", "Ncf1", "Ncf2", "Ncf4", "Nfkbia", "Nfkbie", "P2ry6", "Parp10", "Parp14", "Parp9", "Per1", "Plk3", "Pmaip1", "Ptbp1", "Rab20", "Rab3il1", "Rbm26", "Rela", "Relb", "Rhoh", "Ripk1", "Runx1", "Samsn1", "Serpine1", "Sertad1", "Sh2b2", "Slc15a3", "Smagp", "Snx18", "Spint1", "Syk", "Tap1", "Tgm2", "Tlr2", "Tlr6", "Tlr7", "Tmem173", "Tnf", "Tpp2", "Traf5", "Trim30a", "Tsc22d3", "Tspo", "Tubb6", "Vasp", "Vav1"], "Microglia_deactivation": ["Abcc3", "Adrb1", "Adrb2", "Aif1", "Ang", "Arap3", "Arhgap17", "Arhgap4", "Arhgap9", "Arhgdib", "Batf3", "Btk", "Calhm2", "Camp", "Capn3", "Cd177", "Cd2ap", "Cd300a", "Cd33", "Cd48", "Cd79b", "Cebpa", "Clcf1", "Clec4a2", "Clec7a", "Cmtm7", "Csf3r", "Ctc1", "Cyfip1", "Daglb", "Dhrs3", "Dock8", "Dok1", "Edem1", "Elf1", "Elk3", "Ets1", "Fam105a", "Fam111a", "Fgd2", "Fli1", "Fmnl3", "Gimap6", "Gna15", "H2-Aa", "H2-DMa", "Hhex", "Hpgds", "Hvcn1", "Ifitm6", "Il10ra", "Il10rb", "Inpp5d", "Klk8", "Lair1", "Lcn2", "Lgmn", "Lpxn", "Lrba", "Lrmp", "Lrrk1", "Ltf", "Lyl1", "Man2b1", "Mfng", "Mylip", "Myo1g", "Naalad2", "Naglu", "Parvg", "Pik3cg", "Pld1", "Pld4", "Psmb9", "Ptpn18", "Ptpn6", "Rasa4", "Rbl1", "Rcbtb2", "Samhd1", "Sesn1", "Slamf9", "Slc15a4", "Slc25a45", "Slc2a5", "Slc37a2", "Slc40a1", "Snx5", "Srpk3", "St3gal6", "Tcirg1", "Tec", "Tgfbi", "Tgif1", "Themis2", "Tifa", "Tlr4", "Tmcc3", "Tmem140", "Tnfrsf1b", "Trem2", "Trim47", "Uba7", "Unc93b1", "Vrk2"], "Noradrenergic": ["4930550L24Rik", "Asb4", "Calcr", "Dbh", "Gstm6", "Maoa", "Ovgp1", "Phox2a", "Slc6a2", "Stbd1", "Tm4sf1"], "Oligo": ["Anln", "Aspa", "D16Ertd472e", "Elovl7", "Fa2h", "Gamt", "Gjb1", "Grb14", "Hapln2", "Mag", "Mobp", "Mog", "Nkx6-2", "Olig2", "Plekhh1", "Pllp", "S1pr5", "Slain1", "Slc44a1", "Sox10", "Tmem98", "Tspan2"], "Purkinje": ["Atp2a3", "Casq2", "Col18a1", "Cox6b2", "Ebf1", "Ebf2", "Eps8l2", "Fam117a", "Gng13", "Homer3", "Icmt", "Inpp5a", "Krt25", "Lhx5", "Nrk", "Ppp1r17", "Ptpn2", "Ptprr", "Rhod", "Slc1a6", "Slc5a1", "Smpx", "Stac", "Sycp1", "Tuba8", "Washc2"], "Pyramidal Thy1 Amyg": ["Il1rapl2", "Mndal"], "Pyramidal Thy1 Hipp": [], "Pyramidal_Glt_25d2": ["Sox17", "Tsen15"], "Pyramidal_S100a10": ["Dkkl1", "Tnnc1"], "PyramidalCorticoThalam": ["Ephb6", "Rai14"], "Serotonergic": ["Cited1", "Crct1", "Fev", "H2-Q1", "Ptger3", "Slc22a3", "Slc6a4", "Trh"], "SpinalCordCholinergic": ["Elf5", "Gna14", "Hoxa9", "Hoxc8", "Mmp9", "Polr3g", "Wnk4"], "Spiny": ["Dmkn", "Foxo1", "Foxp1", "Gpr88", "Ido1", "Npas2", "Pde10a", "Pde1b", "Pde7b", "Rarb", "Rin1"], "ThalamusCholin": ["C130026I21Rik", "Chrna3", "Cxcl11", "Cytip", "Eno3", "Fzd7", "Galm", "Htr5b", "Irx2", "Irx5", "Map3k6", "Necab3", "Nppa", "Prkcq", "Sh3bgrl2", "Sostdc1", "Tcf7", "Tex15", "Tnfaip2", "Tyrp1", "Vav3", "Zic4"] }, "Amygdala": { "Astrocyte": ["Aass", "Abat", "Acaa2", "Acsbg1", "Acsl6", "Add3", "Adhfe1", "AI464131", "Aldh1l1", "Amot", "Antxr1", "Aox1", "Appl2", "Aqp4", "Atp1a2", "Axl", "Bcar3", "Btbd17", "Capn2", "Cbs", "Ccdc80", "Cd38", "Cd44", "Cldn10", "Clu", "Col4a5", "Cpq", "Cth", "Cyp2d22", "Cyp2j9", "Cyp4f14", "Cyp4f15", "Cyp7b1", "Cyr61", "Dclk1", "Ddhd1", "Dio2", "Dmd", "Dtna", "Egfr", "Elovl2", "Emp2", "Entpd2", "Ephx2", "Eva1a", "Ezr", "F3", "Fads2", "Fgd6", "Fgfr1", "Fgfr3", "Fjx1", "Fkbp10", "Fmo1", "Fxyd1", "Fzd2", "Gabrg1", "Gdf10", "Ghr", "Gjb6", "Gldc", "Gli2", "Glud1", "Gpld1", "Grin2c", "Hapln1", "Hbegf", "Hsd11b1", "Igdcc4", "Igfbp2", "Igfbp5", "Itga7", "Itih5", "Kcnk1", "Kcnn2", "Lamb2", "Lcat", "Lgi4", "Lhx2", "Lpp", "Lrig1", "Lrp4", "Mfge8", "Mlc1", "Mmp14", "Myo10", "Nat8f4", "Ncan", "Ndp", "Nhsl1", "Notch1", "Ntrk2", "Ntsr2", "Oaf", "Oplah", "Papss2", "Pax6", "Pdgfrb", "Pdk4", "Pdzph1", "Phka1", "Phkg1", "Pla2g7", "Pou3f4", "Ppara", "Ppic", "Ppp1r3c", "Prelp", "Prkd1", "Prodh", "Ptprz1", "Pygb", "Pygm", "S1pr1", "Scara3", "Scg3", "Sdc4", "Serhl", "Slc13a3", "Slc14a1", "Slc15a2", "Slc1a2", "Slc1a3", "Slc1a4", "Slc38a3", "Slc41a1", "Slc4a4", "Slc7a10", "Slco1c1", "Smpdl3a", "Sorcs2", "Sox9", "Spag1", "Sparcl1", "Srebf1", "Tenm3", "Tfcp2l1", "Timp3", "Tlcd1", "Tmem47", "Tmem51", "Tnfrsf19", "Tril", "Trps1", "Ttpa", "Vcam1", "Vcl", "Wnt7a", "Wwtr1"], "Gluta": ["Cadm3", "Cdh22", "Cntn6", "Coch", "Myh7", "Neurod1", "Pnck", "Susd2", "Tiam1", "Tshz2"], "Microglia": ["1700017B05Rik", "Abhd15", "Adap2", "Adgre1", "Akna", "Alas2", "Alox5ap", "Ankrd44", "Anxa3", "Arhgap39", "Arhgap45", "Arrb2", "AW112010", "B2m", "C1qc", "C3ar1", "Casp1", "Casp8", "Ccl3", "Ccl6", "Ccrl2", "Cd300c2", "Cd34", "Cd37", "Cd52", "Cd68", "Cfh", "Chil3", "Clec5a", "Clic1", "Crybb1", "Ctsh", "Ctss", "Cttnbp2nl", "Cyba", "Cysltr1", "D17H6S56E-5", "Dapp1", "Dnajb1", "Dock2", "Ehd4", "Emp3", "Entpd1", "F11r", "Fam91a1", "Fcgr1", "Fcrl1", "Fcrls", "Fermt3", "Fes", "Fyb", "Gcnt1", "Ggta1", "Gmfg", "Gmip", "Golm1", "Gpsm3", "Grn", "Gusb", "H2-Ab1", "H2-K1", "H2-Oa", "Havcr2", "Hcls1", "Herpud1", "Hk2", "Hp", "Ier2", "Ier5", "Ifngr1", "Igsf6", "Il13ra1", "Il21r", "Il6ra", "Il7r", "Irf5", "Irgm2", "Itgb2", "Junb", "Klf2", "Klf6", "Lag3", "Lcp1", "Lgals3", "Lgals9", "Ly86", "Ly96", "Lyn", "Map3k1", "Mef2a", "Mlxipl", "Mrc1", "Msn", "Myh9", "Myo1b", "Naip2", "Naip5", "Nckap1l", "Nrros", "Pald1", "Pdgfb", "Pf4", "Pla2g15", "Plcg2", "Plekho1", "Plxdc2", "Pon3", "Ppp1r15a", "Pros1", "Ptbp3", "Ptgr1", "Rassf5", "Rbm39", "Rcsd1", "Rel", "Rgs1", "Rgs19", "Rnase4", "Sash3", "Serinc3", "Sh3glb1", "Siglecf", "Sipa1", "Skap2", "Slc11a1", "Slc7a7", "Snord22", "Spata13", "Spi1", "Srsf7", "Stab1", "Stat6", "Stk26", "Tapbp", "Tbxas1", "Tcn2", "Tgfb1", "Tgfbr2", "Tlr1", "Tm6sf1", "Tmc6", "Tor4a", "Trim12a", "Trim34a", "Tyrobp", "Vsir", "Ythdc1", "Zfhx3", "Zfp869", "Zwint"], "Microglia_activation": ["Atp7a", "B4galt1", "Birc3", "C1qa", "C1qb", "Casp4", "Ccl12", "Ccl2", "Ccl4", "Ccl9", "Ccr5", "Cd14", "Cd53", "Cd83", "Cd86", "Cebpb", "Cep152", "Csf2rb2", "Ctla2b", "Cxcl10", "Cxcl16", "Cxcl2", "Egr2", "Fcer1g", "Fcgr2b", "Fcgr3", "Frrs1", "Gcnt2", "Gpr84", "Hck", "Hfe", "Hlx", "Icam1", "Ier3", "Ifi30", "Ifi35", "Ifih1", "Il1a", "Il1b", "Il4ra", "Il6", "Irf9", "Isg20", "Jmjd1c", "Lcp2", "Lrrfip1", "Maff", "Map3k8", "Mcl1", "Mlph", "Mrc2", "Ms4a6b", "Ms4a6d", "Myc", "Myd88", "Ncf1", "Ncf2", "Ncf4", "Nfkbia", "Nfkbie", "Nfkbiz", "Osbpl11", "P2ry6", "Parp10", "Parp14", "Plek", "Pmaip1", "Rab20", "Rab3il1", "Rcan1", "Rhoh", "Rnasel", "Rnf19b", "Rrad", "Runx1", "Samsn1", "Serpine1", "Sh2b2", "Sla", "Slc15a3", "Slc39a8", "Smagp", "Socs3", "Spint1", "Sqrdl", "Srgn", "Syk", "Tgm2", "Tlr2", "Tlr6", "Tlr7", "Tmem173", "Tnf", "Tnfaip2", "Tpp2", "Trim30a", "Tspo", "Tubb6", "Ucp2", "Vasp", "Vav1", "Zfp36"], "Microglia_deactivation": ["Abcc3", "Adcy7", "Adrb1", "Adrb2", "Afp", "Aif1", "Ang", "Anxa1", "Arap3", "Arhgap17", "Arhgap4", "Arhgap9", "Arhgdib", "Atf3", "Batf3", "Blnk", "Btk", "Camp", "Capn3", "Cd177", "Cd300a", "Cd33", "Cd48", "Cd79b", "Cebpa", "Cited2", "Clcf1", "Clec4a2", "Clec7a", "Cmtm6", "Cmtm7", "Csf1r", "Csf3r", "Ctc1", "Cx3cr1", "Cytip", "Daglb", "Dock8", "Ebf3", "Edem1", "Elk3", "Ets1", "Fam105a", "Fam111a", "Fgd2", "Fli1", "Fmnl3", "Fosb", "Gimap6", "Gna15", "Gpr34", "H2-Aa", "H2-DMa", "H2-M3", "Hexb", "Hhex", "Hpgd", "Hpgds", "Hps3", "Hspa1a", "Hvcn1", "Ifitm6", "Il10ra", "Il10rb", "Il16", "Inpp5d", "Irf8", "Kctd12", "Klk8", "Lair1", "Laptm5", "Lcn2", "Lgmn", "Lmo2", "Lpxn", "Lrba", "Lrmp", "Lrrk1", "Ltf", "Lyl1", "Lyz1", "Mafb", "Mcm3", "Mfng", "Mpeg1", "Mylip", "Myo1g", "Naalad2", "Nfam1", "Ngp", "Npnt", "Nrip1", "Olfml3", "P2ry12", "Parvg", "Pik3cg", "Pld1", "Pld4", "Plxdc1", "Pmepa1", "Pnrc1", "Psmb9", "Ptpn18", "Ptpn6", "Pycard", "Rasa4", "Rgs10", "Rgs2", "Rps6ka1", "S100a8", "S100a9", "Samhd1", "Scamp2", "Selplg", "Slamf9", "Slc16a6", "Slc25a37", "Slc2a5", "Slc35c2", "Slc37a2", "Slc40a1", "Snx20", "Snx5", "St3gal6", "Tcirg1", "Tec", "Tgfbi", "Tgfbr1", "Tgif1", "Themis2", "Tifa", "Tlr4", "Tmem119", "Tmem140", "Tnfrsf1b", "Tnfsf13b", "Trem2", "Trim47", "Uba7", "Unc93b1", "Vamp8", "Vrk2"], "Oligo": ["Adamts4", "Adssl1", "Anln", "Apod", "Aspa", "Chn2", "Cldn11", "Ddc", "Elovl7", "Fa2h", "Gal3st1", "Gamt", "Gjb1", "Gltp", "Grb14", "Hapln2", "Josd2", "Kazn", "Lims2", "Lpar1", "Lrrn1", "Mag", "Mal", "Mobp", "Mog", "Ndrg1", "Nkain1", "Nkx2-2", "Nkx6-2", "Olig2", "Pdlim2", "Plekhh1", "Pllp", "Pou3f1", "Ppp1r14a", "S1pr5", "Slain1", "Slc44a1", "Sox10", "Tmem163", "Tmem98", "Trim59", "Tspan2", "Ugt8a"], "Pyramidal Thy1 Amyg": ["AF357355", "Ar", "Calm1", "Cdh8", "Cdh9", "Cnih3", "Cntnap4", "Dgkg", "Etl4", "Fhl2", "Fxyd7", "Gabrb3", "Il1rapl2", "Mndal", "Pde1a", "Psrc1", "Rspo2", "Slc26a4", "Slit2", "Sstr2", "Tenm1"] }, "BasalForebrain": { "Astrocyte": ["Aass", "Acaa2", "Acsbg1", "Acsl6", "Add3", "Adhfe1", "Adora2b", "AI464131", "Aldh1a1", "Aldh1l1", "Aldh6a1", "Amot", "Antxr1", "Aox1", "Aqp4", "Atp1a2", "Atp1b2", "Axl", "Bhlhe40", "Btbd17", "Cbs", "Ccdc80", "Ccdc88a", "Ccnd2", "Cd38", "Cldn10", "Clu", "Col4a5", "Cth", "Cyp2d22", "Cyp2j9", "Cyp4f14", "Cyp4f15", "Cyp7b1", "Cyr61", "Dag1", "Dclk1", "Dio2", "Dkk3", "Dtna", "Egfr", "Elovl2", "Emp2", "Entpd2", "Ephx2", "Ezr", "F3", "Fads2", "Farp1", "Fgd6", "Fgfr3", "Fjx1", "Fkbp10", "Fmo1", "Fxyd1", "Fzd2", "Fzd4", "Gabrb1", "Gdf10", "Ghr", "Gjb2", "Gjb6", "Gldc", "Gli2", "Gpc4", "Gpld1", "Grin2c", "Hapln1", "Hsd11b1", "Igdcc4", "Igfbp2", "Igfbp5", "Itga7", "Itih5", "Kcnk1", "Kcnn2", "Lamb2", "Lcat", "Lgi4", "Lhx2", "Lpp", "Lrig1", "Lxn", "Mfge8", "Mlc1", "Myo10", "Nat8f4", "Ncan", "Nhsl1", "Notch1", "Ntsr2", "Oaf", "Papss2", "Pax6", "Pbxip1", "Pdgfrb", "Pdzph1", "Phka1", "Phkg1", "Pla2g7", "Pou3f4", "Ppara", "Ppic", "Ppp1r3c", "Prelp", "Prkd1", "Prodh", "Ptch1", "Ptprz1", "Pygb", "Pygm", "Rora", "Rorb", "S1pr1", "Sash1", "Scara3", "Scg3", "Sdc4", "Serhl", "Serpinh1", "Slc14a1", "Slc15a2", "Slc1a2", "Slc1a3", "Slc1a4", "Slc38a3", "Slc41a1", "Slc4a4", "Slc7a10", "Slco1c1", "Smpdl3a", "Sorcs2", "Sox5", "Sox9", "Sparcl1", "Tfcp2l1", "Tgfb2", "Timp3", "Tlcd1", "Tmem47", "Tnfrsf19", "Tril", "Trps1", "Ttpa", "Vcam1", "Vcl", "Vegfa", "Wnt7a", "Wwtr1", "Yap1"], "ForebrainCholin": ["1700037H04Rik", "Ache", "Actl6b", "AI506816", "Arhgdig", "Cartpt", "Cbln1", "Cda", "Cdh8", "Ceacam10", "Cend1", "Cgref1", "Chd3os", "Chga", "Crabp1", "Crabp2", "Cst6", "Cyb561", "Cygb", "Dbndd1", "Doc2b", "Ecel1", "Elavl2", "Fabp3", "Fkbp1b", "Flywch2", "Fxyd2", "Gabrg2", "Gal", "Gap43", "Gdnf", "Gpr83", "Gpx3", "Grb10", "Hrasls", "Isl1", "Kcnip4", "Klhdc8a", "Lhx6", "Lhx8", "Lin7b", "Lor", "Lrrc3b", "Lypd1", "Map4", "Mcub", "Mme", "Myh7", "Nrip3", "Ntng1", "Ntsr1", "Olfm3", "Pcbd1", "Pde1a", "Popdc3", "Ptger2", "Rab3b", "Rasd2", "Resp18", "Rhov", "Rph3a", "Rpp25", "S100a10", "S100a11", "Serpinb1b", "Sh3bgrl2", "Slc18a3", "Slc5a7", "Slc6a15", "Slc8a1", "Sln", "Sncg", "Socs2", "Spint2", "Stmn2", "Sult4a1", "Susd2", "Syngr3", "Syt1", "Syt4", "Tacr3", "Tesc", "Tfr2", "Th", "Tmsb10", "Trpc3", "Tubg2", "Usp29", "Ykt6", "Zic1"], "Microglia": ["1700017B05Rik", "Abhd15", "Adap2", "Adgre1", "Akna", "Alas2", "Alox5ap", "Ankrd44", "Anxa3", "Apobec1", "Arhgap45", "Arrb2", "AW112010", "B2m", "C1qc", "C3ar1", "Casp1", "Casp8", "Ccl3", "Ccl6", "Ccrl2", "Cd300c2", "Cd34", "Cd37", "Cd52", "Cd68", "Cfh", "Chil3", "Clec5a", "Clic1", "Col6a3", "Coro1a", "Crybb1", "Ctsh", "Ctss", "Ctsz", "Cttnbp2nl", "Cyba", "Cysltr1", "D17H6S56E-5", "Dapp1", "Dock2", "Ebi3", "Ehd4", "Emp3", "Entpd1", "F11r", "Fcgr1", "Fcrl1", "Fcrls", "Fermt3", "Fes", "Fyb", "Gcnt1", "Ggta1", "Gmfg", "Gmip", "Golm1", "Gpsm3", "Grn", "Gusb", "H2-Ab1", "H2-K1", "H2-Oa", "Hacd4", "Havcr2", "Hcls1", "Herpud1", "Hk2", "Hp", "Hps4", "Ier2", "Ier5", "Ifngr1", "Igsf6", "Il13ra1", "Il21r", "Il6ra", "Il7r", "Irf5", "Irgm2", "Itgb2", "Junb", "Klf2", "Klf6", "Lag3", "Lcp1", "Lgals9", "Ltc4s", "Ly86", "Ly96", "Lyn", "Mef2a", "Mlxipl", "Mrc1", "Msn", "Myh9", "Myo1b", "Myo7a", "Naip2", "Naip5", "Nckap1l", "Nrros", "Pald1", "Pdgfb", "Pf4", "Phxr1", "Phyhd1", "Pik3cd", "Pla2g15", "Plcg2", "Plekho1", "Plxdc2", "Pon3", "Ppp1r15a", "Prkab1", "Pros1", "Ptbp3", "Ptgr1", "Ptprc", "Rassf5", "Rbm39", "Rcsd1", "Rel", "Rgs1", "Rnase4", "Sash3", "Serinc3", "Siglecf", "Sipa1", "Skap2", "Slc11a1", "Slc7a7", "Snord22", "Spata13", "Spi1", "Srgap2", "Srsf7", "Stab1", "Stat6", "Stk26", "Tbxas1", "Tcn2", "Tgfb1", "Tgfbr2", "Tlr1", "Tm6sf1", "Tmc6", "Tor4a", "Trim12a", "Trim34a", "Trpv2", "Tyrobp", "Vsir", "Zfhx3"], "Microglia_activation": ["Asxl1", "B4galt1", "Birc3", "C1qa", "C1qb", "Casp4", "Ccl12", "Ccl2", "Ccl4", "Ccl9", "Ccnl1", "Ccr5", "Cd14", "Cd53", "Cd83", "Cd86", "Cebpb", "Cep152", "Csf2rb2", "Ctla2b", "Cxcl10", "Cxcl16", "Cxcl2", "Egr2", "Ets2", "Fcer1g", "Fcgr2b", "Fcgr3", "Frrs1", "Glipr1", "Gpr84", "Hck", "Hfe", "Hlx", "Icam1", "Ier3", "Ifi30", "Ifi35", "Il17ra", "Il1a", "Il1b", "Il4ra", "Il6", "Irf9", "Isg20", "Jmjd1c", "Klf10", "Lcp2", "Lrrfip1", "Map3k8", "Mcl1", "Mlph", "Mlxip", "Mrc2", "Ms4a6b", "Ms4a6c", "Ms4a6d", "Myd88", "Ncf1", "Ncf2", "Ncf4", "Nfkbia", "Nfkbie", "Nfkbiz", "P2ry6", "Parp10", "Parp14", "Parp9", "Per1", "Plaur", "Plek", "Pmaip1", "Rab20", "Rab3il1", "Rac2", "Rhoh", "Ripk1", "Rnasel", "Rnf19b", "Rrad", "Runx1", "Samsn1", "Serpine1", "Sertad1", "Sh2b2", "Sla", "Slc15a3", "Slc39a8", "Smagp", "Socs3", "Spint1", "Srgn", "Syk", "Tap1", "Tgm2", "Tlr2", "Tlr6", "Tlr7", "Tmem173", "Tnf", "Tnfaip2", "Tpp2", "Trim30a", "Tsc22d3", "Tubb6", "Ucp2", "Vav1", "Zfp36"], "Microglia_deactivation": ["2810474O19Rik", "Abcc3", "Adcy7", "Adrb2", "Afp", "Aif1", "Ang", "Anxa1", "Arap3", "Arhgap17", "Arhgap4", "Arhgap9", "Arhgdib", "Atf3", "Batf3", "Blnk", "Btk", "Calhm2", "Camp", "Capn3", "Cd177", "Cd300a", "Cd33", "Cd48", "Cd79b", "Cebpa", "Clcf1", "Clec4a2", "Clec7a", "Cmtm7", "Cmtm8", "Csf1r", "Csf3r", "Ctc1", "Cx3cr1", "Cytip", "Dock8", "Ebf3", "Edem1", "Elk3", "Ets1", "Fam105a", "Fam111a", "Fgd2", "Fli1", "Fmnl3", "Gimap6", "Gna15", "Gpr34", "H2-Aa", "H2-DMa", "H2-M3", "Hexb", "Hhex", "Hpgd", "Hpgds", "Hvcn1", "Ifitm6", "Il10ra", "Il10rb", "Il16", "Inpp5d", "Irf8", "Kctd12", "Klk8", "Lair1", "Laptm5", "Lcn2", "Lgmn", "Lmo2", "Lpxn", "Lrba", "Lrmp", "Lrrk1", "Lst1", "Ltf", "Lyl1", "Lyz1", "Mafb", "Man2b1", "Mef2c", "Mfng", "Mpeg1", "Mylip", "Myo1g", "Naalad2", "Naip6", "Nfam1", "Ngp", "Nrip1", "Olfml3", "P2ry12", "Parvg", "Pik3cg", "Plbd1", "Plcl2", "Pld4", "Plxdc1", "Psmb9", "Ptpn18", "Ptpn6", "Pycard", "Rasa4", "Rgl1", "Rgs2", "Rps6ka1", "S100a8", "S100a9", "Selplg", "Slamf9", "Slc16a6", "Slc25a37", "Slc25a45", "Slc2a5", "Slc37a2", "Slc40a1", "Slc7a8", "Snx5", "St3gal6", "Tcirg1", "Tec", "Tgfbi", "Tgfbr1", "Tgif1", "Themis2", "Tifa", "Tlr4", "Tmem119", "Tmem140", "Tnfrsf1b", "Tnfsf13b", "Trem2", "Trim47", "Uba7", "Unc93b1", "Vamp8", "Vrk2"], "Oligo": ["Adamts4", "Ank3", "Anln", "Apod", "Aspa", "C1ql3", "Cldn11", "Cryab", "Ctsk", "Ddc", "Efnb3", "Elovl7", "Fa2h", "Gal3st1", "Gamt", "Gjb1", "Grb14", "Gsn", "Hapln2", "Josd2", "Kazn", "Kcna1", "Larp6", "Lims2", "Lpar1", "Lrrn1", "Mag", "Mal", "Mbp", "Mcam", "Mobp", "Mog", "Ndrg1", "Ninj2", "Nkx2-2", "Nkx6-2", "Olig2", "Pdlim2", "Phldb1", "Plekhf1", "Plekhh1", "Pllp", "Plp1", "Pou3f1", "Ppp1r14a", "Rab33a", "S1pr5", "Sept4", "Sgk2", "Slain1", "Slc44a1", "Sox10", "Tmeff2", "Tmem163", "Tmem98", "Tnni1", "Trim59", "Tspan2", "Ugt8a"] }, "Brainstem": { "Astrocyte": ["Aass", "Acsbg1", "Acsl6", "Add3", "Adhfe1", "AI464131", "Aldh1l1", "Aldh6a1", "Amot", "Antxr1", "Aox1", "Appl2", "Axl", "Bcar3", "Btbd17", "Cbs", "Ccdc80", "Ccnd2", "Cd38", "Cd44", "Cldn10", "Col4a5", "Crot", "Cspg5", "Cth", "Cyp2d22", "Cyp2j9", "Cyp4f14", "Cyp4f15", "Cyp7b1", "Cyr61", "Dag1", "Dclk1", "Ddit4l", "Dtna", "Ednrb", "Egfr", "Elovl2", "Emp2", "Entpd2", "Ephx2", "Eva1a", "Ezr", "F3", "Fads2", "Fam181b", "Farp1", "Fgd6", "Fgfr3", "Fjx1", "Fkbp10", "Fmo1", "Fxyd1", "Fzd2", "Fzd4", "Gas1", "Gdf10", "Gjb6", "Gldc", "Gli2", "Grin2c", "Hapln1", "Hsd11b1", "Igfbp2", "Itih5", "Kcnk1", "Kcnn2", "Klf15", "Lcat", "Lgi4", "Lhx2", "Lmcd1", "Lpp", "Lrp4", "Mgst1", "Mmp14", "Naaa", "Nat8f4", "Ndp", "Ngef", "Nkain4", "Notch1", "Nrarp", "Ntrk2", "Ntsr2", "Oaf", "Oplah", "Papss2", "Pax6", "Pbxip1", "Pdlim5", "Pdzph1", "Phka1", "Phkg1", "Pla2g7", "Plpp3", "Ppara", "Ppic", "Ppp1r3c", "Prdx6", "Prelp", "Prkd1", "Prodh", "Ptprz1", "Pygm", "Rftn2", "Rorb", "Sash1", "Scara3", "Sdc4", "Serhl", "Serpinh1", "Slc12a4", "Slc14a1", "Slc15a2", "Slc1a3", "Slc38a3", "Slc41a1", "Slc4a4", "Slc7a10", "Slco1c1", "Smpd2", "Smpdl3a", "Sorcs2", "Sox21", "Sox5", "Sparcl1", "Suclg2", "Tfcp2l1", "Timp3", "Tlcd1", "Tnfrsf19", "Tril", "Trps1", "Ttpa", "Vcam1", "Vcl", "Vegfa", "Wnt7a", "Wwtr1"], "BrainstemCholin": ["2310030G06Rik", "Anxa2", "Cabp1", "Calcb", "Cd55", "Cela1", "Fxyd7", "Hebp2", "Hspb1", "Hspb8", "Ifitm10", "Irx3", "Isl1", "Kazald1", "Kcnj14", "Lgals1", "Medag", "Nts", "Patj", "Pcp4l1", "Pip5kl1", "Popdc3", "Prph", "Prss12", "Rspo2", "Sh3bgr", "Slc18a3", "Spp1", "Tesc", "Uts2"], "Dopaminergic": ["Cadps2", "Caprin1", "Nr4a2", "Ntn1", "Prkcg", "Scn2a", "Slc6a3", "Zim3"], "Microglia": ["1700017B05Rik", "Abhd15", "Adamts1", "Adap2", "Akna", "Alas2", "Alox5ap", "Ankrd44", "Anxa3", "Apobec1", "Arhgap45", "Arrb2", "AW112010", "B2m", "Btg2", "C1qc", "C3ar1", "Casp1", "Casp8", "Ccl3", "Ccl6", "Ccrl2", "Cd300c2", "Cd34", "Cd37", "Cd52", "Cd68", "Cfh", "Chil3", "Cklf", "Clec5a", "Clic1", "Crybb1", "Ctsh", "Ctss", "Ctsz", "Cttnbp2nl", "Cyba", "Cysltr1", "D17H6S56E-5", "Dapp1", "Dock2", "Ebi3", "Emp3", "Entpd1", "Erap1", "F11r", "Fam91a1", "Fcgr1", "Fcrl1", "Fcrls", "Fermt3", "Fes", "Fyb", "Gcnt1", "Ggta1", "Gmfg", "Gmip", "Golm1", "Gpsm3", "Grn", "Gusb", "H2-Ab1", "H2-K1", "H2-Oa", "Havcr2", "Hcls1", "Herpud1", "Hk2", "Hp", "Hps4", "Ier2", "Ier5", "Ifngr1", "Igsf6", "Il13ra1", "Il21r", "Il6ra", "Il7r", "Irf5", "Itgb2", "Junb", "Klf2", "Klf6", "Lag3", "Lgals3", "Lgals9", "Ltc4s", "Ly86", "Ly96", "Lyn", "Map3k1", "Mef2a", "Mlxipl", "Mrc1", "Msn", "Myo1b", "Myo7a", "Naip2", "Naip5", "Nckap1l", "Nrros", "Pag1", "Pald1", "Pdgfb", "Pf4", "Phxr1", "Phyhd1", "Pik3cd", "Pla2g15", "Plcg2", "Plekho1", "Plxdc2", "Pon3", "Ppp1r15a", "Prkab1", "Pros1", "Ptbp3", "Ptgs1", "Ptprc", "Rassf5", "Rcsd1", "Rel", "Rgs1", "Rin2", "Rnase4", "Sash3", "Siglecf", "Sipa1", "Skap2", "Slc11a1", "Slc7a7", "Snord22", "Spata13", "Spi1", "Srgap2", "Srsf7", "Stab1", "Stat6", "Tbxas1", "Tcn2", "Tgfb1", "Tgfbr2", "Tgif2", "Tlr1", "Tmc6", "Tob2", "Tor4a", "Trim12a", "Trim34a", "Tyrobp", "Vsir"], "Microglia_activation": ["Asxl1", "B4galt1", "Bach1", "Birc3", "C1qa", "C1qb", "Casp4", "Ccl12", "Ccl2", "Ccl4", "Ccl9", "Ccnl1", "Ccr5", "Cd14", "Cd53", "Cd83", "Cd86", "Cebpb", "Cep152", "Chst7", "Csf2rb2", "Ctla2b", "Cxcl10", "Cxcl16", "Cxcl2", "Egr2", "Fcer1g", "Fcgr2b", "Fcgr3", "Frrs1", "Glipr1", "Gpr84", "Hck", "Hfe", "Hlx", "Icam1", "Ier3", "Ifi30", "Ifih1", "Igtp", "Il17ra", "Il1a", "Il1b", "Il6", "Irf9", "Isg20", "Jmjd1c", "Klf10", "Lcp2", "Lrrfip1", "Map3k8", "Mcl1", "Mlph", "Mlxip", "Ms4a6b", "Ms4a6c", "Ms4a6d", "Myd88", "Ncf1", "Ncf2", "Ncf4", "Nfkbia", "Nfkbie", "Nfkbiz", "Npl", "P2ry6", "Parp10", "Parp14", "Parp9", "Per1", "Plaur", "Plek", "Pmaip1", "Rab20", "Rab3il1", "Rac2", "Rbm26", "Rhoh", "Ripk1", "Rnasel", "Rrad", "Runx1", "Samsn1", "Serpine1", "Sertad1", "Sh2b2", "Sla", "Slc15a3", "Smagp", "Socs3", "Spint1", "Srgn", "Syk", "Tap1", "Tlr2", "Tlr6", "Tlr7", "Tmem173", "Tnf", "Tnfaip2", "Tpp2", "Traf5", "Trim30a", "Tsc22d3", "Tubb6", "Vav1", "Zfp36"], "Microglia_deactivation": ["2810474O19Rik", "Abcc3", "Adcy7", "Adrb1", "Adrb2", "Afp", "Aif1", "Ang", "Arap3", "Arhgap17", "Arhgap4", "Arhgap9", "Arhgdib", "Atf3", "Batf3", "Blnk", "Btk", "Calhm2", "Camp", "Capn3", "Cd177", "Cd300a", "Cd33", "Cd48", "Cd79b", "Cebpa", "Clcf1", "Clec4a2", "Clec7a", "Cmtm6", "Cmtm7", "Csf3r", "Ctc1", "Cx3cr1", "Cytip", "Dock8", "Edem1", "Elf1", "Elk3", "Ets1", "Fam105a", "Fam111a", "Fgd2", "Fli1", "Gimap6", "Gna15", "Gpr34", "H2-Aa", "H2-DMa", "Hexb", "Hhex", "Hpgd", "Hpgds", "Hspa1a", "Hvcn1", "Ifitm6", "Il10ra", "Il10rb", "Il16", "Inpp5d", "Irf8", "Kctd12", "Klk8", "Lair1", "Lcn2", "Lgmn", "Lmo2", "Lpxn", "Lrba", "Lrmp", "Lrrk1", "Lsp1", "Ltf", "Lyl1", "Lyz1", "Mafb", "Man2b1", "Mcm3", "Mfng", "Mpeg1", "Mylip", "Myo1g", "Naalad2", "Naip6", "Nfam1", "Nfatc1", "Ngp", "Npnt", "Nrip1", "Olfml3", "P2ry12", "Parvg", "Pik3cg", "Plcl2", "Pld1", "Pld4", "Prkcd", "Psmb9", "Ptpn18", "Ptpn6", "Pycard", "Rasa4", "Rbl1", "Rgs10", "Rps6ka1", "S100a8", "S100a9", "Scamp2", "Selplg", "Sesn1", "Slamf9", "Slc16a6", "Slc25a37", "Slc25a45", "Slc2a5", "Slc37a2", "Slc40a1", "Slc46a3", "Snx5", "St3gal6", "Tcirg1", "Tec", "Tgfbi", "Tgfbr1", "Tgif1", "Themis2", "Tifa", "Tlr4", "Tmcc3", "Tmem119", "Tmem140", "Tnfrsf1b", "Tnfsf13b", "Trem2", "Trim47", "Uba7", "Unc93b1", "Vamp8", "Vrk2"], "Noradrenergic": ["4930550L24Rik", "Baiap3", "Cacng5", "Calcr", "Dbh", "Gstm6", "Mab21l1", "Maoa", "Mcub", "Ngb", "Ovgp1", "Phox2a", "Rab3b", "Slc6a2", "Sstr2", "Stbd1", "Tfap2b"], "Oligo": ["Anln", "Aspa", "Fa2h", "Gal3st1", "Gamt", "Gjb1", "Gltp", "Gsn", "Josd2", "Lims2", "Mag", "Mog", "Ninj2", "Olig2", "Pdlim2", "Phldb1", "Plekhh1", "Ppp1r14a", "Rab33a", "Sgk2", "Sox10", "Thbs3", "Trim59", "Tspan2", "Ugt8a"], "Serotonergic": ["Ceacam10", "Cited1", "Crct1", "Ctla2a", "Fev", "Gata3", "H2-Q1", "Htr5b", "Pcdhac1", "Ptger3", "Slc22a3", "Slc6a4", "Sln", "Trh"] }, "Cerebellum": { "Basket": ["Cxcl12", "Kit", "Ntn1", "Socs2", "Sorcs3", "Tfap2b"], "Bergmann": ["A2m", "A630072M18Rik", "Aard", "Abi3bp", "Axl", "Baalc", "Bcar3", "Btbd17", "Calml4", "Casp12", "Cd70", "Cldn10", "Cyp2d22", "Dao", "Elovl2", "Emp2", "Evc", "Fam181b", "Fam227b", "Fbln5", "Fxyd1", "Gli1", "Hist1h4i", "Ifitm2", "Irx2", "Irx5", "Kcne1l", "Lcat", "Lgi4", "Mdk", "Mob3b", "Msx2", "Myl9", "Npy", "Ntsr2", "Plce1", "Plscr1", "Pth1r", "Pxmp2", "Ramp2", "Rdh5", "S100a11", "Scara3", "Sdc4", "Slc14a1", "Slc7a10", "Sncaip", "Tmem30b", "Tmprss3", "Ttpa", "Vegfc", "Wif1"], "CerebGranule": ["Boc", "Calb2", "Car4", "Cbln3", "Crtam", "Dleu2", "Eomes", "Otx2", "Tbata", "Tesc", "Uncx"], "Golgi": ["2310030G06Rik", "Actn3", "Cacng3", "Ccnb1ip1", "Cda", "Ceacam10", "Cgref1", "Cited1", "Elavl2", "Flt4", "Gdnf", "Hspb8", "Kcnmb2", "Klk1b27", "Lgi1", "Lrrtm1", "Lypd1", "Mal2", "Mcub", "Nppc", "Rab3b", "Rasgrp2", "Resp18", "Serpinb1b", "Sgcg", "Slc35f4"], "Microglia": ["1700017B05Rik", "Abca1", "Abhd15", "Adamts1", "Adap2", "Adgre1", "Adgrg1", "Akna", "Alas2", "Alox5ap", "Ankrd44", "Anxa3", "Arhgap45", "Arrb2", "AW112010", "Btg2", "C1qc", "C3ar1", "Casp1", "Casp8", "Ccl3", "Ccl6", "Ccrl2", "Cd300c2", "Cd34", "Cd37", "Cd52", "Cd68", "Cfh", "Chil3", "Clec5a", "Clic1", "Coro1a", "Crybb1", "Ctsa", "Ctsc", "Ctsh", "Ctss", "Ctsz", "Cttnbp2nl", "Cyba", "Cysltr1", "D17H6S56E-5", "Dapp1", "Diaph2", "Dnajb1", "Dock2", "Dusp1", "Dusp6", "Ebi3", "Egr1", "Ehd4", "Emp3", "Entpd1", "Erap1", "F11r", "Fam91a1", "Fcgr1", "Fcrl1", "Fcrls", "Fermt3", "Fes", "Fyb", "Gcnt1", "Gdap10", "Ggta1", "Gmfg", "Gmip", "Gns", "Golm1", "Gpsm3", "Grn", "Gusb", "H2-Ab1", "H2-K1", "H2-Oa", "Hacd4", "Havcr2", "Hcls1", "Herpud1", "Hp", "Hps4", "Ier2", "Ier5", "Ifngr1", "Igsf6", "Il13ra1", "Il21r", "Il6ra", "Il7r", "Irf5", "Irgm2", "Itgb2", "Itpr2", "Junb", "Klf2", "Klf6", "Lag3", "Lcp1", "Lgals3bp", "Lgals9", "Lpcat3", "Ly86", "Ly96", "Lyn", "Mlxipl", "Morc3", "Mrc1", "Msn", "Myh9", "Myo7a", "Naip2", "Naip5", "Nckap1l", "Nrros", "Oaf", "Pag1", "Pald1", "Pbxip1", "Pdgfb", "Pf4", "Phxr1", "Phxr4", "Phyhd1", "Pik3cd", "Pla2g15", "Pla2g4a", "Plcg2", "Pnp", "Pnpla7", "Pon3", "Ppp1r15a", "Pros1", "Ptbp3", "Ptgs1", "Ptprc", "Rassf5", "Rcsd1", "Rel", "Rgs1", "Rgs19", "Rin2", "Rnase4", "Rrbp1", "Sash3", "Sgpl1", "Siglecf", "Sipa1", "Skap2", "Slc11a1", "Slc29a1", "Slc7a7", "Smim3", "Snord22", "Spata13", "Spi1", "Sppl2a", "Srsf7", "Stab1", "Stat6", "Stk26", "Swap70", "Tapbp", "Tbxas1", "Tcn2", "Tgfb1", "Tgfbr2", "Tlr1", "Tlr3", "Tmc6", "Tmem176a", "Tor4a", "Tpst2", "Trim12a", "Trim34a", "Trpv2", "Txnip", "Tyrobp", "Vsir", "Vwa5a", "Wsb1", "Zfhx3"], "Microglia_activation": ["Asxl1", "Atp7a", "B4galt1", "Birc3", "C1qa", "C1qb", "Casp4", "Ccl12", "Ccl2", "Ccl4", "Ccl9", "Ccnl1", "Ccr5", "Cd14", "Cd53", "Cd83", "Cd86", "Cebpb", "Cep152", "Chst7", "Csf2rb2", "Ctla2b", "Cxcl10", "Cxcl16", "Cxcl2", "Egr2", "Eif4ebp1", "Fcer1g", "Fcgr2b", "Fcgr3", "Fkbp5", "Frrs1", "Gas5", "Gbp3", "Gbp7", "Gcnt2", "Gem", "Glipr1", "Gpr84", "Hck", "Hfe", "Hlx", "Icam1", "Ier3", "Ifi30", "Ifi35", "Ifih1", "Igtp", "Il17ra", "Il1a", "Il1b", "Il6", "Irf9", "Isg20", "Klf10", "Klf4", "Lcp2", "Lrrfip1", "Maff", "Map3k8", "Mcl1", "Mlxip", "Mrc2", "Ms4a6b", "Ms4a6d", "Myd88", "Ncf1", "Ncf2", "Ncf4", "Nfkbia", "Nfkbiz", "Npl", "Nr4a1", "P2ry6", "Parp10", "Parp14", "Parp9", "Per1", "Plek", "Plk3", "Pmaip1", "Ptger4", "Rab20", "Rab3il1", "Rac2", "Relb", "Rhoh", "Ripk1", "Rnasel", "Rrad", "Runx1", "Samsn1", "Serpine1", "Sh2b2", "Slc15a3", "Slc39a8", "Smagp", "Socs3", "Spint1", "Sqrdl", "Srgn", "Sult1a1", "Syk", "Tap1", "Tgm2", "Tlr2", "Tlr6", "Tlr7", "Tmed5", "Tmem173", "Tnf", "Tnfaip2", "Tnfrsf1a", "Tpp2", "Traf5", "Trim30a", "Tsc22d3", "Tuba1c", "Tubb6", "Vasp", "Vav1", "Zfp36"], "Microglia_deactivation": ["1810011O10Rik", "2810474O19Rik", "Abcc3", "Adcy7", "Adrb1", "Adrb2", "Aif1", "Ang", "Anxa1", "Arap3", "Arhgap17", "Arhgap4", "Arhgap9", "Arhgdib", "Atf3", "Batf3", "Bco2", "Blnk", "Btk", "Calhm2", "Camp", "Capn3", "Cd177", "Cd2ap", "Cd300a", "Cd33", "Cd48", "Cd79b", "Cebpa", "Clcf1", "Clec4a2", "Clec7a", "Cmtm6", "Cmtm7", "Csf1r", "Csf3r", "Ctc1", "Ctsd", "Cx3cr1", "Cyfip1", "Cytip", "Dock8", "Edem1", "Elf1", "Elk3", "Ets1", "Fam105a", "Fam111a", "Fgd2", "Fli1", "Fmnl3", "Fosb", "Galnt4", "Gimap6", "Gna15", "Gpr34", "H2-Aa", "H2-DMa", "H2-M3", "Hexb", "Hhex", "Hpgds", "Hps3", "Hspa1a", "Hspa1b", "Hvcn1", "Ifitm6", "Il10ra", "Il10rb", "Inpp5d", "Irf8", "Itga6", "Jun", "Klk8", "Lair1", "Laptm5", "Lcn2", "Lgmn", "Lpxn", "Lrba", "Lrmp", "Lrp1", "Lrrk1", "Lst1", "Ltf", "Lyl1", "Lyz1", "Mafb", "Man2b1", "Mertk", "Mfng", "Mpeg1", "Mylip", "Myo1g", "Naalad2", "Naglu", "Nfam1", "Ngp", "Notch2", "Nrip1", "Nrp1", "Olfml3", "P2ry12", "Parvg", "Pik3cg", "Plcl2", "Pld1", "Pld4", "Plxnb2", "Psmb9", "Ptpn18", "Ptpn6", "Pycard", "Pygl", "Rbl1", "Rgl2", "Rgs10", "Rgs2", "S100a8", "S100a9", "Scamp2", "Selplg", "Sirpa", "Slamf9", "Slc15a4", "Slc16a6", "Slc16a7", "Slc25a37", "Slc25a45", "Slc29a3", "Slc2a5", "Slc37a2", "Slc40a1", "Slc7a8", "Snx5", "Srpk3", "St3gal6", "Stard8", "Tcirg1", "Tec", "Tgfbi", "Tgfbr1", "Tgif1", "Themis2", "Tifa", "Tlr4", "Tmem119", "Tmem140", "Tnfrsf1b", "Tnfsf13b", "Tor3a", "Trem2", "Trim47", "Uba7", "Unc93b1", "Vrk2", "Zfp36l2"], "Oligo": ["Anln", "Aspa", "Carhsp1", "Cldn11", "D16Ertd472e", "Ddc", "Efnb3", "Elovl7", "Enpp2", "Fa2h", "Gal3st1", "Gamt", "Gatm", "Gjb1", "Gpr37", "Grb14", "Gsn", "Hapln2", "Jam3", "Lpar1", "Mag", "Mobp", "Mog", "Ndrg1", "Nkx6-2", "Olig2", "Pdlim2", "Pex5l", "Plekhh1", "Pllp", "Pou3f1", "Psat1", "S1pr5", "Slain1", "Slc44a1", "Sox10", "Tmeff1", "Tmem98", "Trim59"], "Purkinje": ["Atp2a3", "B3gnt5", "Bcl11a", "Bean1", "Cacna1g", "Cacna2d2", "Calb1", "Casq2", "Cck", "Col18a1", "Dgkg", "Doc2b", "Ebf1", "Ebf2", "Eps8l2", "Fam174b", "Gipc2", "Gng13", "Grik1", "Homer3", "Icmt", "Igfbp3", "Igfbp6", "Itpka", "Kcnip1", "Krt25", "Lhx5", "Lmo7", "Nrk", "Ppp1r17", "Ptpn2", "Ptprr", "Rgs8", "Rhod", "Ryr1", "Slc1a6", "Slc5a1", "Smpx", "Stac", "Sycp1", "Tgfb2", "Trpc3", "Tuba8"] }, "Cerebrum": { "Astrocyte": ["2810459M11Rik", "4931406C07Rik", "Aass", "Abhd3", "Acaa2", "Acsbg1", "Acsl6", "Add3", "Adgrg1", "Adhfe1", "Agl", "AI464131", "Aldh1l1", "Aldh6a1", "Amot", "Antxr1", "Aox1", "Appl2", "Aqp4", "Atp1b2", "Axl", "Btbd17", "Cbs", "Ccdc80", "Cd38", "Cdc42ep4", "Cldn10", "Clu", "Col4a5", "Cpq", "Cth", "Cyp2d22", "Cyp2j6", "Cyp2j9", "Cyp4f14", "Cyp4f15", "Cyr61", "Ddhd1", "Dennd4c", "Dmd", "Dock1", "Dtna", "Ednrb", "Egfr", "Elovl2", "Elovl5", "Emp2", "Entpd2", "Ephx2", "Eva1a", "Ezr", "F3", "Fads2", "Fam181b", "Fgd6", "Fgfr2", "Fgfr3", "Fgfrl1", "Fjx1", "Fkbp10", "Fmo1", "Fxyd1", "Fzd2", "Gabrg1", "Gas1", "Gdf10", "Ginm1", "Gldc", "Gli2", "Glud1", "Gpld1", "Gpx8", "Grin2c", "Gstm1", "Hapln1", "Hsd11b1", "Il18", "Inhbb", "Itga7", "Itih5", "Jam2", "Kctd5", "Kif1c", "Klf15", "Lamb2", "Lap3", "Lcat", "Lgi4", "Lhx2", "Lmcd1", "Lpp", "Lrig1", "Lrp4", "Metrn", "Mfge8", "Mgst1", "Mlc1", "Mmp14", "Msmo1", "Mt2", "Myo10", "Myo6", "Naaa", "Nat8f4", "Ndp", "Ndrg2", "Nhsl1", "Notch1", "Nrarp", "Ntrk2", "Ntsr2", "Oaf", "Oplah", "Papss2", "Pax6", "Pdgfrb", "Pdk4", "Pdlim5", "Pdzph1", "Phka1", "Phkg1", "Pla2g7", "Ppara", "Ppp1r3c", "Prdx6", "Prkd1", "Prodh", "Ptpn13", "Ptprz1", "Pygb", "Rdh5", "Retsat", "Rftn2", "Rhbdf1", "Rlbp1", "S1pr1", "Sash1", "Scara3", "Sdc4", "Serhl", "Slc12a4", "Slc14a1", "Slc16a1", "Slc1a2", "Slc1a3", "Slc38a3", "Slc41a1", "Slc7a10", "Slco1c1", "Smo", "Smpd2", "Smpdl3a", "Soat1", "Sox21", "Sox9", "Srebf1", "Suclg2", "Tfcp2l1", "Tlcd1", "Tmem51", "Tnfrsf19", "Tril", "Trps1", "Ttpa", "Ttyh1", "Vcam1", "Vcl", "Wnt7a"], "DentateGranule": ["Ccdc85a", "Cdhr1", "Dsg2", "Dsp", "Iigp1", "Mcm6", "Neurod1", "Nfia", "Npy5r", "Pter", "Tdo2", "Trpc6"], "ForebrainCholin": ["Cartpt", "Crabp1", "Ecel1", "Gdnf", "Gpx3", "Hopx", "Lhx8", "Popdc3", "Ptger2", "Serpinb1b", "Slc18a3", "Slc5a7", "Sncg", "Tacr3", "Trpc3", "Zic3"], "GabaPV": ["Adamts15", "Cenpa", "Cox6a2", "Pip5kl1"], "GabaRelnCalb": ["Calb2", "Nppc", "Pcsk5"], "GabaSSTReln": ["Gna14", "Grpr", "Postn", "Ptprt"], "GabaVIPReln": ["Cplx3", "Htr3a", "Kit", "Tac2", "Vip", "Wnt5a"], "Gluta": ["Tshz2"], "Microglia": ["0610040J01Rik", "1700017B05Rik", "Abhd15", "Adap2", "Adgre1", "Akna", "Alas2", "Alox5ap", "Ankrd44", "Arhgap45", "Arrb2", "AW112010", "B2m", "BC028528", "Btg2", "C1qc", "C3ar1", "Cables1", "Casp1", "Casp8", "Ccl3", "Ccl6", "Ccrl2", "Cd300c2", "Cd34", "Cd37", "Cd52", "Cd68", "Cfh", "Cflar", "Chil3", "Cklf", "Clec5a", "Clic1", "Cr1l", "Creg1", "Crlf3", "Crybb1", "Ctsa", "Ctsh", "Ctsz", "Cttnbp2nl", "Cyba", "Cysltr1", "D17H6S56E-5", "Dapp1", "Dnajb1", "Dock2", "Ebi3", "Ehd4", "Entpd1", "Erap1", "F11r", "Fam91a1", "Fcgr1", "Fcrl1", "Fcrls", "Fermt3", "Fes", "Fkbp7", "Fyb", "Gcnt1", "Ggta1", "Gmfg", "Gmip", "Gpsm3", "Grk2", "Grn", "Gusb", "H2-Ab1", "H2-K1", "H2-Oa", "Havcr2", "Hcls1", "Herpud1", "Hk2", "Hp", "Ier2", "Ier5", "Ifngr1", "Igsf6", "Il13ra1", "Il21r", "Il6ra", "Il7r", "Irf5", "Irgm2", "Itgb2", "Junb", "Klf2", "Klf6", "Lag3", "Lcp1", "Lgals3", "Lgals9", "Ly86", "Ly96", "Lyn", "Map3k1", "Mlxipl", "Morc3", "Mrc1", "Msn", "Naip2", "Naip5", "Nckap1l", "Nmi", "Nrros", "Pag1", "Pald1", "Parp12", "Pdgfb", "Pf4", "Phyhd1", "Pla2g15", "Pla2g4a", "Plcg2", "Plekho1", "Plxdc2", "Pon3", "Ppp1r15a", "Pros1", "Ptbp3", "Ptgs1", "Rassf5", "Rbm39", "Rcsd1", "Rel", "Rgs1", "Rgs19", "Rin2", "Rnase4", "Rrbp1", "Sash3", "Serinc3", "Sfpq", "Sgpl1", "Sh3glb1", "Siglecf", "Sipa1", "Skap2", "Slc11a1", "Slc7a7", "Snord22", "Socs6", "Spi1", "Srsf7", "Stab1", "Stat6", "Stt3a", "Tapbp", "Tbxas1", "Tcn2", "Tgfb1", "Tgfbr2", "Tlr1", "Tmc6", "Tmem179b", "Tor1aip1", "Tor4a", "Tpst2", "Trim12a", "Trim34a", "Tyrobp", "Usp24", "Vsir", "Vwa5a", "Zfhx3", "Zfp869"], "Microglia_activation": ["Atp7a", "B4galt1", "Bach1", "Bcl10", "Birc3", "C1qa", "Casp4", "Ccdc86", "Ccl12", "Ccl2", "Ccl4", "Ccl9", "Ccr5", "Cd14", "Cd164", "Cd53", "Cd83", "Cd86", "Cebpb", "Cep152", "Chst7", "Csf2rb2", "Ctla2b", "Cxcl10", "Cxcl16", "Cxcl2", "Eif4ebp1", "Fcer1g", "Fcgr2b", "Fcgr3", "Frrs1", "Gas5", "Gbp7", "Gpr84", "Hck", "Hfe", "Hlx", "Icam1", "Ier3", "Ifi30", "Ifi35", "Ifih1", "Il17ra", "Il1a", "Il1b", "Il4ra", "Il6", "Irf9", "Isg20", "Jmjd1c", "Lcp2", "Lrrfip1", "Maff", "Map3k8", "Mcl1", "Mlph", "Mlxip", "Mrc2", "Ms4a6b", "Ms4a6d", "Myd88", "Ncf1", "Ncf2", "Ncf4", "Nfkbie", "Nfkbiz", "Npl", "Osbpl11", "P2ry6", "Parp10", "Parp14", "Parp9", "Per1", "Plek", "Plk3", "Pmaip1", "Ptbp1", "Rab20", "Rbm26", "Rcan1", "Rela", "Relb", "Rhoh", "Ripk1", "Rnasel", "Rnf19b", "Rrad", "Runx1", "Sall3", "Samsn1", "Serpine1", "Sertad1", "Sh2b2", "Slc15a3", "Slc39a8", "Smagp", "Snx18", "Socs3", "Spint1", "Sqrdl", "Syk", "Tap1", "Tgm2", "Tlr2", "Tlr6", "Tlr7", "Tmem173", "Tnfaip2", "Tpp2", "Trim30a", "Tspo", "Tubb6", "Ucp2", "Vasp", "Vav1", "Zfp36"], "Microglia_deactivation": ["Abcc3", "Adrb1", "Adrb2", "Afp", "Aif1", "Ang", "Arap3", "Arhgap17", "Arhgap4", "Arhgap9", "Atf3", "Batf3", "Blnk", "Btk", "Calhm2", "Camp", "Capn3", "Cd177", "Cd2ap", "Cd300a", "Cd33", "Cd48", "Cd79b", "Cebpa", "Clcf1", "Clec4a2", "Clec7a", "Cln5", "Cmtm6", "Cmtm7", "Csf3r", "Ctc1", "Cx3cr1", "Cytip", "Daglb", "Dhrs3", "Dock8", "Dok1", "Ebf3", "Edem1", "Elf1", "Elk3", "Ets1", "Fam105a", "Fam111a", "Fgd2", "Fli1", "Fmnl3", "Gimap6", "Gna15", "Gpr34", "H2-Aa", "H2-DMa", "H2-M3", "Hexb", "Hhex", "Hpgd", "Hpgds", "Hps3", "Hspa1a", "Hvcn1", "Ifitm6", "Il10ra", "Il10rb", "Il16", "Inpp5d", "Irf8", "Klk8", "Lair1", "Lcn2", "Lgmn", "Lims1", "Lpxn", "Lrba", "Lrmp", "Lrrk1", "Ltf", "Lyl1", "Lyz1", "Man2b1", "Mcm3", "Mfng", "Mmp2", "Mpeg1", "Mylip", "Myo1g", "Naalad2", "Naglu", "Nfam1", "Ngp", "Olfml3", "P2ry12", "Parvg", "Pik3cg", "Pld1", "Pld4", "Plxdc1", "Plxnb2", "Prkcd", "Psmb9", "Ptpn18", "Ptpn6", "Pycard", "Pygl", "Rasa4", "Rbl1", "Rcbtb2", "Rnf135", "Rps6ka1", "S100a8", "S100a9", "Samhd1", "Scamp2", "Selplg", "Slamf9", "Slc15a4", "Slc16a6", "Slc25a37", "Slc37a2", "Slc40a1", "Slc46a1", "Snx20", "Snx5", "Srpk3", "St3gal6", "Tcirg1", "Tec", "Tgfbi", "Tgfbr1", "Tgif1", "Themis2", "Tifa", "Tlr4", "Tmcc3", "Tmem119", "Tmem140", "Tnfrsf1b", "Tnfsf13b", "Trem2", "Trim47", "Uba7", "Unc93b1", "Vrk2"], "Oligo": ["Adamts4", "Anln", "Aspa", "Cers2", "Cldn11", "Ddc", "Elovl7", "Fa2h", "Gal3st1", "Gamt", "Gatm", "Gjb1", "Gltp", "Grb14", "Gsn", "Hapln2", "Ick", "Jam3", "Josd2", "Lims2", "Lpar1", "Mag", "Mcam", "Mobp", "Mog", "Nkx2-2", "Nkx6-2", "Olig2", "Pdlim2", "Phldb1", "Pla2g16", "Plekhh1", "Pllp", "Ppp1r14a", "S1pr5", "Sept4", "Slain1", "Slc44a1", "Sox10", "Tesk2", "Thbs3", "Tmem163", "Tmem98", "Trim59", "Tspan2", "Ugt8a"], "Pyramidal Thy1 Amyg": ["Il1rapl2", "Mndal"], "Pyramidal Thy1 Hipp": ["Nr4a2"], "Pyramidal_Glt_25d2": ["Sox17", "Tsen15"], "Pyramidal_S100a10": ["Car4", "Csrp2", "Dkkl1", "Perp", "Tnnc1"], "PyramidalCorticoThalam": ["Col5a1", "Col6a1", "Prss12", "Rai14"], "Spiny": ["Arg2", "Cacnb2", "Dmkn", "Foxo1", "Gpr88", "Ido1", "Kcna5", "Kctd1", "Npas2", "Pde10a", "Pde7b", "Ppp1r1b", "Rarb"] }, "Cortex": { "Astrocyte": ["A2m", "Aass", "Abhd3", "Acot11", "Acsl6", "Agpat5", "Agt", "AI464131", "Akt2", "Aldh1l1", "Aldh6a1", "Aox1", "Aqp4", "Aqp9", "Btbd17", "Cbs", "Chrdl1", "Chst2", "Cideb", "Clu", "Cth", "Cyp4f14", "Cyp4f15", "Cyp7b1", "Ddhd1", "Ddo", "Dhrs11", "Dio2", "Egfl6", "Egfr", "Elmod3", "Elovl2", "Entpd2", "Fads2", "Fam181b", "Fgd6", "Fgfr3", "Fgfrl1", "Fkbp10", "Fzd2", "Fzd7", "Gas1", "Gdf10", "Gfap", "Gldc", "Glipr2", "Gramd3", "Gstm5", "Hopx", "Id4", "Itga7", "Kctd14", "Klf15", "Lfng", "Lix1", "Mlc1", "Msmo1", "Naaa", "Nat1", "Nat8", "Nat8f5", "Ndp", "Nrarp", "Oaf", "Papss2", "Pax6", "Pcsk6", "Pdk4", "Pdzph1", "Phkg1", "Prdx6", "Pxmp2", "Retsat", "Rfx2", "Rpe65", "Scara3", "Sdsl", "Sema4b", "Slc12a4", "Slc14a1", "Slc22a4", "Slc27a1", "Slc7a10", "Smim3", "Sox21", "Sox9", "St3gal4", "Tekt1", "Tmem51", "Tst", "Ttpa", "Ttyh1", "Ucp3", "Ugp2", "Upp1", "Vit", "Vnn1", "Wnt7b", "Zic5", "1600014C23Rik", "1700008J07Rik", "1700040N02Rik", "1700084C01Rik", "1700084J12Rik", "2010110P09Rik", "2210417K05Rik", "2900052N01Rik", "3110082J24Rik", "4930515L03Rik", "5033411D12Rik", "5930403L14Rik", "6720483E21Rik", "A330048O09Rik", "A330076C08Rik", "AB124611", "Acad12", "Acat3", "Acsl3", "Alpk1", "Apoc3", "Arhgef26", "Atp13a4", "Bdh2", "Bmpr1b", "C030018K13Rik", "C030037D09Rik", "c11_tRNA-Leu-TTG", "c2_tRNA-Ala-GCG", "C230035I16Rik", "Calr4", "Ccdc69", "Cml3", "cx_tRNA-Ala-GCG", "D630033O11Rik", "Dmp1", "Dok7", "E030003E18Rik", "Emx2", "Epo", "Epx", "Etnppl", "Exd1", "F2rl3", "Fam181a", "Fam198a", "Fam20a", "Fam69c", "Flt3l", "Gli3", "Gm10658", "Gm10731", "Gm13031", "Gm17660", "Gm5083", "Gm5475", "Gm973", "Hist1h2bq", "Hist1h2br", "Hist2h3c1", "Kirrel2", "Lgr4", "LOC433374", "Lonrf3", "Lpin3", "Lrrc9", "Mettl11b", "Mir99ahg", "Naprt", "Nphp3", "Nr2e1", "Nwd1", "Olfr287", "Olfr288", "Olfr461", "Olfr57", "Olfr688", "Otx1", "Paqr8", "Pax6os1", "Plcd4", "Plxnb1", "Ppil6", "Prr5", "Psd2", "Rmst", "Sctr", "Sfxn5", "Shpk", "Slc25a18", "Slc39a12", "Slc6a11", "Slco1b2", "Sohlh2", "Stag3", "Sycp2", "Syde2", "Taf4b", "Tex11", "Tmem52", "Trp63", "Ugt1a2", "Ugt1a6a", "Vmn2r-ps54", "Zfp389", "Zfp783", "Znrf3", "2810459M11Rik", "Acaa2", "Acsbg1", "Add3", "Adhfe1", "Agl", "Appl2", "Atp1b2", "Cd44", "Cldn10", "Crot", "Cyp2d22", "Cyp2j9", "Dennd4c", "Dtna", "Elovl5", "Eva1a", "Ezr", "F3", "Fjx1", "Fmo1", "Fxyd1", "Gabrg1", "Gli2", "Glud1", "Gpld1", "Grin2c", "Gstm1", "Hapln1", "Hsd11b1", "Igdcc4", "Lcat", "Lgi4", "Lhx2", "Lpp", "Mfge8", "Mmp14", "Nat8f1", "Nat8f4", "Ndrg2", "Ntrk2", "Ntsr2", "Oplah", "Phka1", "Pla2g7", "Ppara", "Ppp1r3c", "Prkd1", "Prodh", "Ptch1", "Pygb", "Rftn2", "Rhbdf1", "S1pr1", "Sash1", "Sdc4", "Serhl", "Slc15a2", "Slc1a2", "Slc1a3", "Slc38a3", "Slc41a1", "Slc4a4", "Slco1c1", "Smpd2", "Smpdl3a", "Soat1", "Sorcs2", "Tfcp2l1", "Tlcd1", "Tmem47", "Tril", "Trps1", "Vav3", "Vcam1"], "Endothelial": ["1810011O10Rik", "2200002D01Rik", "2210404O07Rik", "4930523C07Rik", "4930562F07Rik", "5430416O09Rik", "8430408G22Rik", "9530026P05Rik", "Abcb1a", "Acvrl1", "Adgre5", "Adgrf5", "Adgrl4", "Ahnak", "Amotl2", "Angptl2", "Apold1", "Arhgap29", "Arhgap6", "Atg4a", "Atp10a", "AU021092", "Bcl2l12", "Cast", "Ccdc109b", "Ccl19", "Cd40", "Cd93", "Cdh5", "Cgnl1", "Cldn5", "Clec14a", "Clic5", "Col4a1", "Col4a3", "Crip1", "Degs2", "Dennd3", "Dock6", "Ecm1", "Edn1", "Egfl7", "Egflam", "Emcn", "Emp1", "Eng", "Ephb4", "Esam", "Esyt1", "Fgd5", "Flt1", "Flt4", "Fn1", "Foxc1", "Foxq1", "Fxyd5", "Fzd6", "Gata2", "Gatsl3", "Gbp9", "Gimap5", "Gjc1", "Gm6548", "Gm9079", "Gpr182", "Gstm2", "Gstt2", "Hmgb2", "Hmgcs2", "Hrct1", "Hspb1", "Icam2", "Ifi44", "Ifi47", "Igfbp7", "Iigp1", "Il1r1", "Il2rg", "Iqgap1", "Irgm2", "Itga1", "Itih5", "Kank3", "Kdr", "Klf2", "Lamb2", "Lats2", "Layn", "Lef1", "LOC545261", "Lsr", "Ltbp4", "Ly6c2", "Map3k20", "Mecom", "Mfsd7c", "Mmrn2", "mt_AK140174", "Myct1", "Myl12a", "Nid1", "Nid2", "Nod1", "Nostrin", "Nxn", "Oasl2", "Ocln", "Osmr", "Paqr5", "Pdgfd", "Pdgfrb", "Pecam1", "Pglyrp1", "Plac9", "Plscr4", "Pltp", "Podxl", "Ppic", "Prom1", "Ptprb", "Ptrf", "Rassf9", "Rbms2", "Rbpms", "Ret", "Rflnb", "Rhoj", "Rnf125", "Robo4", "S100a11", "Samd9l", "Sdpr", "Sgms1", "She", "Sigirr", "Slc16a4", "Slc19a3", "Slc22a8", "Slc2a1", "Slc35f2", "Slc38a5", "Slc52a3", "Slc6a6", "Slc9a3r2", "Slco1a4", "Slfn2", "Smagp", "Snord35b", "Sox13", "Sox7", "Spc25", "St6galnac2", "St8sia6", "Stom", "Tbx3", "Tek", "Tgfbr3", "Tgtp1", "Tgtp2", "Thbd", "Tinagl1", "Tm4sf1", "Tmem123", "Tmem252", "Tns1", "Tns2", "Tpm4", "Trim34a", "Uaca", "Unc45b", "Utrn", "Vamp5", "Vtn", "Vwf", "Wwtr1", "Xdh", "Zbtb46", "Zic3"], "GabaPV": ["Cartpt", "Cox6a2", "Gpnmb", "Kcnmb2", "Mme", "Tcap", "Wif1", "Btn2a2", "Gpr176", "Lrrc38", "Ostn", "Tmem132c", "Adamts15", "Ank1", "Gabrd", "Pip5kl1", "Pvalb", "Tac1"], "GabaRelnCalb": ["Cacng5", "Gal", "Oxtr", "Sfrp2", "Trpc6", "AW551984", "Elfn1", "Fibcd1", "Gm889", "Hpse", "Prokr2", "Rxfp3", "Tnni3k", "Calb2", "Nppc"], "GabaVIPReln": ["Chrna3", "Cnr1", "Egln3", "Htr3a", "Npas1", "Rgn", "Sln", "Tac2", "Vip", "2810442N19Rik", "A530072M11Rik", "Agtr1a", "Bglap2", "Bpifb6", "C130030K03Rik", "Crispld2", "E130006D01Rik", "Gldn", "Gm13305", "Gm8773", "Mdh1b", "Pde11a", "Serpina3c", "Slc10a4", "Slc44a5", "Sp8", "Tnfaip8l3", "Zfp618", "Kit", "Nectin3", "Pnoc", "Sncg", "Sorcs3"], "Layer 2 3 Pyra": ["Clec18a", "Fam183b", "Myh7"], "Layer 4 Pyra": ["Endou", "Grm2", "Htr5b", "Prr16", "Rspo1"], "Layer 6a Pyra": ["Aldh3a1", "Foxp2", "Ly6d", "Mia", "Tbata", "Urah"], "Layer 6b Pyra": ["B430212C06Rik", "Cidea", "Glt28d2", "Gm12295", "Nxph3", "Nxph4", "Tmem40", "Tnmd", "Trh"], "Microglia": ["1700017B05Rik", "2510039O18Rik", "2610528A11Rik", "Adam17", "Adgre1", "Adgre4", "Alox5ap", "Apobec1", "Arhgap45", "Btg2", "C1qc", "C3ar1", "Cables1", "Ccl3", "Ccl6", "Cd37", "Cd52", "Cd80", "Chd7", "Chst14", "Clec5a", "Cntrl", "Creg1", "Crybb1", "Ctsa", "Ctss", "Cysltr1", "Dock2", "Dok3", "Dusp1", "Ebi3", "Epb41l2", "Epsti1", "Erap1", "F9", "Fcgr1", "Fcrl1", "Fcrls", "Fermt3", "Fes", "Fez2", "Fyb", "Galnt10", "Gcnt1", "Gmfg", "Gmip", "Gns", "Gp9", "Gpsm3", "Grn", "Gusb", "H2-DMb1", "Havcr2", "Hcar2", "Hcls1", "Hcst", "Hk2", "Ier5", "Igsf6", "Il7r", "Irf5", "Itgam", "Itgb2", "Junb", "Klrd1", "Lag3", "Lcp1", "Leng1", "Ly86", "Mir142", "Mlxipl", "Mrc1", "Myl2", "Naip5", "Nckap1l", "Nfkb1", "Nlrp3", "Nrm", "Ntpcr", "Pag1", "Phyhd1", "Pik3cd", "Plcg2", "Plekho1", "Plxdc2", "Pon3", "Ppcdc", "Ptgr1", "Ptprc", "Rab32", "Rab43", "Rassf5", "Rgs1", "Ripk3", "Rnf130", "Rp2", "Rrbp1", "Sash3", "Sfxn2", "Sh3tc1", "Siglecf", "Skap2", "Slc11a1", "Slc7a7", "Smad7", "Spata13", "Spg21", "Spi1", "Srgap2", "Srrd", "Stab1", "Stat6", "Tap2", "Tapbp", "Tbxas1", "Tlcd2", "Tlr1", "Tmem106a", "Tmem8c", "Tyrobp", "Zfp90", "0610039K10Rik", "1700011I03Rik", "1700110I01Rik", "1810011H11Rik", "2610020C07Rik", "2610203C22Rik", "4930594C11Rik", "4931431C16Rik", "4933406I18Rik", "5730435O14Rik", "6030468B19Rik", "6530439I21", "A430071A18Rik", "A830052D11Rik", "Adora3", "AF251705", "Arhgap22", "Arhgap30", "B230378P21Rik", "BC013712", "BC035044", "BC049352", "c10_tRNA-Asp-GAY", "c11_tRNA-Trp-TGG", "C1rl", "c5_SSU-rRNA_Hsa", "Card9", "Ccdc88b", "Cmklr1", "Cryba1", "Cyth4", "Dennd1c", "E130317F20Rik", "E230029C05Rik", "Frmd4a", "G530011O06Rik", "Gm10248", "Gm10413", "Gm10790", "Gm10825", "Gm14023", "Gm15880", "Gm20257", "Gm3002", "Gm3020", "Gm3317", "Gm3383", "Gm3494", "Gm4902", "Gm5086", "Gm5129", "Gm8348", "Gm9320", "Gvin1", "Hist1h4c", "I830077J02Rik", "Kng2", "Lrch4", "Lrrc34", "M1ap", "Mettl7a3", "Mgat4a", "Mir133a-2", "Mir1894", "Mir24-2", "Mir3101", "Mir5129", "mt_AK140187", "Myo18b", "Nagpa", "Nlrp1b", "Nlrp1c-ps", "Olfr1030", "Pde3b", "Phf11", "Psd4", "Qrfp", "Rab19", "Rasl2-9-ps", "Reep4", "Rnase12", "Rnaset2a", "Rnu11", "Sh2d4b", "Slc24a1", "Soga1", "Spata46", "Tagap", "Tex12", "Tnfaip8l2", "Tnfrsf22", "Uchl4", "Ugt1a6b", "Usp50", "Wasf2", "Xlr4b", "Zfp59", "Zfp619", "Abhd15", "Adap2", "Akna", "Ankrd44", "Arrb2", "B2m", "Casp1", "Casp8", "Ccrl2", "Cd300c2", "Cd68", "Cfh", "Cklf", "Clic1", "Ctsz", "Cttnbp2nl", "Cyba", "Dapp1", "Dnajb1", "Dusp6", "Ehd4", "Entpd1", "F11r", "Fam91a1", "Ggta1", "Grk2", "H2-K1", "H2-Oa", "Herpud1", "Ier2", "Ifngr1", "Il13ra1", "Il21r", "Il6ra", "Klf6", "Lgals9", "Ly96", "Lyn", "Msn", "Naip2", "Nrros", "Pdgfb", "Pla2g15", "Pla2g4a", "Ppp1r15a", "Pros1", "Ptgs1", "Rbm39", "Rel", "Rgs19", "Rin2", "Rnase4", "Serinc3", "Sipa1", "Snord22", "Tcn2", "Tpst2", "Trpv2", "Vsir", "Vwa5a", "Zfhx3", "Chil3", "D17H6S56E-5", "Pald1", "Tgfb1"], "Microglia_activation": ["C1qa", "C1qb", "C5ar1", "Ccl12", "Ccl4", "Ccl9", "Ccnl1", "Ccr5", "Cd14", "Cd164", "Cd53", "Cd74", "Cd86", "Creb3l2", "Csf2rb", "Cxcl16", "Fcer1g", "Fcgr2b", "Fcgr3", "Fcgr4", "Fgl2", "Glipr1", "Gpr84", "Hck", "Il17ra", "Il1a", "Il4ra", "Il6", "Lcp2", "Lefty1", "Mafk", "Ms4a6b", "Ms4a6d", "Mvp", "Myc", "Ncf1", "Ncf4", "Nfkbie", "Nfkbiz", "Osbpl11", "P2ry6", "Plek", "Ppp1r18", "Prr14", "Rab3il1", "Rac2", "Rhoh", "Rrad", "Runx1", "Samsn1", "Serpine1", "Slc15a3", "Spint1", "Syk", "Tlr2", "Tlr7", "Tnf", "Trim30d", "Vasp", "Vav1", "5031414D18Rik", "A630001G21Rik", "BC046404", "Bcl2a1b", "Bcl2a1d", "Gp49a", "Gpr77", "Mob3a", "Oas1a", "Pik3r5", "Ppp1r3b", "Rbm47", "Slco4a1", "Snora41", "Snora81", "Snord83b", "Zfp429", "B4galt1", "Bach1", "Casp4", "Ccl2", "Cd83", "Cebpb", "Cep152", "Csf2rb2", "Frrs1", "Gas5", "Hfe", "Icam1", "Ier3", "Ifi30", "Jmjd1c", "Map3k8", "Mcl1", "Mlph", "Mlxip", "Myd88", "Ncf2", "Nfkbia", "Npl", "Plk3", "Rela", "Rnasel", "Rnf19b", "Sh2b2", "Sqrdl", "Tlr6", "Tmem173", "Tpp2", "Trim30a", "Tubb6", "Ucp2", "Zfp36", "Cxcl10", "Cxcl2", "Hlx", "Rab20"], "Microglia_deactivation": ["Abcc3", "Abcd1", "Abl1", "Aif1", "Arhgap17", "Arhgap4", "Atf3", "Batf3", "Bin1", "Btk", "Camk1", "Capn3", "Cd180", "Cd300a", "Cd33", "Cd48", "Cd79b", "Cebpa", "Clcf1", "Clec4a2", "Cmtm7", "Cryba4", "Csf1r", "Csf3r", "Csk", "Ctc1", "Ctsd", "Cx3cr1", "Cyfip1", "Eno3", "Fam105a", "Fgd2", "Gna15", "Gpr34", "Guca1a", "H2-Ob", "Hexb", "Hpgd", "Hpgds", "Hps3", "Hspa1a", "Hvcn1", "Hyi", "Il10ra", "Il16", "Inpp5d", "Irf8", "Ivns1abp", "Khk", "Lair1", "Lat2", "Lgmn", "Lpxn", "Lrmp", "Lst1", "Lyl1", "Lyz1", "Man2b1", "Mpeg1", "Myo1f", "Myo1g", "Naglu", "Ndst2", "Parvg", "Pik3cg", "Plcb2", "Pld4", "Plxnb2", "Ppfia4", "Ptpn18", "Ptpn6", "Pycard", "Rgs2", "Rhob", "Rps6ka1", "Rreb1", "Sec16b", "Selplg", "Sema4d", "Slamf9", "Slc25a37", "Slc2a5", "Slc37a2", "Slc41a3", "Smpdl3b", "Snx5", "Tlr4", "Tmem119", "Tnfrsf17", "Tnni2", "Trem2", "Tspan32", "Tubgcp5", "Uba7", "9930111J21Rik2", "Abca9", "Abi3", "Arl11", "Bank1", "Cd84", "Clec4a3", "Col27a1", "Dhtkd1", "Dock11", "Fam46c", "Gal3st4", "Galnt12", "Gm10406", "Gm11545", "Gngt2", "Gpr183", "Heatr5a", "Hist1h1c", "Hist1h1d", "Hist1h2ac", "Hist1h2bg", "Hk3", "Irak2", "Lrrc25", "Lrrc3", "Lyz2", "P2ry13", "Ptafr", "Rnase6", "Scarf2", "Siglech", "Snx29", "Susd3", "Tifab", "Tlr5", "Tnfrsf13b", "Traf3ip3", "Trim65", "Ttc7", "Ttf2", "Upk1b", "Zfp229", "Zfp658", "Zfp710", "Adrb2", "Ang", "Arap3", "Blnk", "Cmtm6", "Daglb", "Dock8", "Ebf3", "Edem1", "Elf1", "Elk3", "Fmnl3", "H2-DMa", "Hhex", "Klk8", "Laptm5", "Lmo2", "Lrba", "Lrrk1", "Mfng", "Mylip", "Nfam1", "Olfml3", "P2ry12", "Pld1", "Pmepa1", "Pnrc1", "Prkcd", "Psmb9", "Rasa4", "Rbl1", "Samhd1", "Scamp2", "Slc15a4", "Slc16a6", "Srpk3", "St3gal6", "Tcirg1", "Tec", "Tgfbi", "Tgfbr1", "Tgif1", "Tifa", "Tmem140", "Tnfrsf1b", "Trim47", "Unc93b1", "Vrk2", "Afp", "Arhgap9", "Camp", "Cd177", "Clec7a", "Cytip", "Dok1", "H2-Aa", "Ltf", "Ngp", "S100a8", "S100a9", "Snx20", "Themis2"], "Oligo": ["Ada", "Adamts4", "Adamtsl4", "Anln", "Aspa", "Bpgm", "Chn2", "Cldn11", "Cldn14", "Cnmd", "Ctsk", "Dbndd2", "Desi1", "Dock5", "Efhd1", "Elovl7", "Fbxo36", "Fnbp1", "Gjc2", "Gss", "Hhip", "Il17rb", "Itgb4", "Josd2", "Kat2b", "Kif13a", "Klk6", "Lrrc46", "Mag", "Mbp", "Mob3b", "Mobp", "Myo1d", "Myrf", "Nfe2l3", "Nkain1", "Nkx6-2", "Pde8a", "Pex5l", "Plekhh1", "Plpp2", "Polr3e", "Ppp1r14a", "Prima1", "Qdpr", "Rffl", "Rnf13", "S1pr5", "Sept4", "Sgk2", "Slain1", "Slc12a2", "Slc44a1", "Slc48a1", "Slc6a9", "Spg20", "Taldo1", "Tmeff1", "Tnni1", "Tprn", "Trim59", "Wfdc18", "Wipi1", "Wrap53", "1500015L24Rik", "1700063D05Rik", "4930452G13Rik", "4930550C14Rik", "4933413G19Rik", "7630403G23Rik", "9330117O12", "A230001M10Rik", "Adamtsl1", "Adi1", "Ado", "AI463170", "Ankrd28", "Ankub1", "Ano4", "Arrdc3", "B230319C09Rik", "Ccdc13", "Ccdc89", "Ccp110", "Cdc42ep2", "Cep97", "Cyp2j12", "D7Ertd443e", "Defb47", "Eml1", "Enpp6", "Ermn", "Fam83d", "Fbxw15", "Foxn3", "Gm10220", "Gm10471", "Gm12530", "Gm13293", "Gm9895", "Gng8", "Gpr62", "Gstp1", "Hn1l", "Insc", "Kctd13", "Kif13b", "Kif6", "Kndc1", "Lgi3", "Ly6g6f", "Mamdc4", "Map6d1", "Mfsd13b", "Nipal4", "Nmral1", "Pigz", "Pik3c2b", "Pkd2l1", "Plekhg3", "Prr18", "Prr5l", "Sec14l5", "Slc26a11", "Sp7", "Speer4a", "Speer7-ps1", "Speer8-ps1", "Srd5a1", "St18", "Tmem125", "Tmem88b", "Wnt3", "Xrcc3", "Carhsp1", "Fa2h", "Gal3st1", "Gamt", "Gjb1", "Gltp", "Grb14", "Gsn", "Lpar1", "Mcam", "Mog", "Pdlim2", "Phldb1", "Pllp", "Thbs3", "Tmem98", "Tspan2", "Ugt8a", "Hapln2"], "OligoPrecursors": ["1110015O18Rik", "1700018G05Rik", "1700112E06Rik", "1810034E14Rik", "2900005J15Rik", "3632451O06Rik", "4930517E11Rik", "4933406J10Rik", "A330041J22Rik", "A930009A15Rik", "Abtb2", "Acan", "Adam12", "Adam9", "Adamts6", "Adamtsl3", "Amigo3", "Ampd3", "Angptl1", "Ap5b1", "B3gnt5", "BC096441", "Bmp4", "Bmp7", "Boll", "Bub1", "C1ql1", "C1ql2", "C1qtnf6", "Capn11", "Car8", "Caskin2", "Ccdc114", "Ccl5", "Cd70", "Cdc14a", "Cdc42ep5", "Cdk2", "Cdo1", "Cep41", "Cercam", "Cftr", "Chaf1b", "Chst11", "Chst5", "Col9a3", "Cpa4", "Cpxm1", "Creb3l3", "Cspg5", "D430020J02Rik", "Derl3", "Dll1", "Dna2", "Dpyd", "E2f8", "Emid1", "Epn2", "Erbb3", "Evi5l", "Ezh2", "Fam114a1", "Fam71f2", "Fam89a", "Fbn2", "Fignl1", "Fosb", "Frmd7", "Fzd1", "Fzd9", "Galnt3", "Gfra1", "Gins2", "Gm10391", "Gm10394", "Gm16617", "Gm2a", "Gm8787", "Gm9839", "Gpr82", "Gpt2", "Hps1", "Htra3", "Inhbc", "Iqcj", "Itga9", "Itgb8", "Kcnh8", "Kctd12b", "Klhl5", "Krt17", "Lad1", "Lgals2", "LOC100040223", "LOC434825", "LOC626693", "Lpo", "Ly6g6d", "Mapk7", "Matn4", "Mc5r", "Mcm3", "Melk", "Metrn", "Mir9-3hg", "Mkrn3", "mt_AK159184", "Muc1", "Murc", "Myt1", "Nckap5", "Ncmap", "Neil3", "Neu4", "Nkiras2", "Nradd", "Nt5dc1", "Ntn1", "Odf3l1", "Otos", "Pabpc4l", "Pabpc5", "Pcdh15", "Pcdhga5", "Pcyox1l", "Peg12", "Pgpep1", "Phxr4", "Plekhg6", "Plekho2", "Plxna3", "Pmel", "Pold1", "Ppp1r14b", "Pxn", "Rab13", "Rassf8", "Rgs9", "Rhcg", "Rnf180", "Rnf43", "S100a3", "Sema3d", "Sfmbt2", "Sfn", "Shc4", "Shmt1", "Slc13a5", "Slc25a29", "Slc2a12", "Slc35b2", "Slc5a11", "Slc6a19", "Slc7a2", "Slitrk6", "Smoc1", "Sncaip", "Snx22", "Snx8", "Sox8", "Spsb4", "Srebf1", "Stamos", "Stk32a", "Svil", "Ticam1", "Tmc6", "Tmco4", "Tmem132e", "Tmem146", "Tnfrsf11b", "Tnfsf9", "Tnr", "Traf1", "Traf4", "Vcan", "Vipr2", "Vmn2r57", "Vps37b", "Wipf1", "Zcchc16", "Zeb1", "Zfp423", "Zfp521"], "Pyramidal_Glt_25d2": ["Chia1", "Samd3", "Npr3"], "Pyramidal_S100a10": ["Dkkl1", "Perp"], "PyramidalCorticoThalam": ["Car12", "Col6a1"] }, "Hippocampus": { "Astrocyte": ["Aass", "Abhd3", "Acaa2", "Acsbg1", "Acsl6", "Adgrg1", "Adhfe1", "AI464131", "Aldh1l1", "Amot", "Antxr1", "Aox1", "Aqp4", "Atp1a2", "Atp1b2", "Axl", "Bcar3", "Btbd17", "Cbs", "Ccdc80", "Cd38", "Cd44", "Chil1", "Cldn10", "Clu", "Col4a5", "Cpq", "Cspg5", "Cth", "Cyp2d22", "Cyp2j9", "Cyp4f14", "Cyp4f15", "Cyr61", "Ddhd1", "Dio2", "Egfr", "Elovl2", "Emp2", "Entpd2", "Ephx2", "Eva1a", "Ezr", "F3", "Fads2", "Fgd6", "Fgf1", "Fgfr3", "Fgfrl1", "Fjx1", "Fkbp10", "Fmo1", "Fxyd1", "Fzd2", "Gabrg1", "Gdf10", "Gjb6", "Gldc", "Gli2", "Glud1", "Gpld1", "Grin2c", "Hapln1", "Hsd11b1", "Igdcc4", "Igfbp2", "Itga7", "Itih5", "Kcnn2", "Klf15", "Lamb2", "Lcat", "Lgi4", "Lhx2", "Lmcd1", "Lpp", "Lrig1", "Lrp4", "Mfge8", "Mlc1", "Mmp14", "Myo10", "Myo6", "Nat8f4", "Ndp", "Notch1", "Ntrk2", "Ntsr2", "Oaf", "Oplah", "Papss2", "Pax6", "Pdgfrb", "Pdk4", "Pdlim5", "Pdzph1", "Phka1", "Phkg1", "Pla2g7", "Pou3f4", "Ppara", "Ppic", "Ppp1r3c", "Prelp", "Prodh", "Ptprz1", "Pygm", "Rdh5", "Rorb", "S1pr1", "Scara3", "Scg3", "Sdc4", "Sema4a", "Serhl", "Slc12a4", "Slc14a1", "Slc15a2", "Slc1a2", "Slc1a3", "Slc1a4", "Slc38a3", "Slc41a1", "Slc7a10", "Slco1c1", "Smpd2", "Smpdl3a", "Sorcs2", "Sox9", "Tfcp2l1", "Tlcd1", "Tmem47", "Tmem51", "Tnfrsf19", "Tril", "Trps1", "Ttpa", "Vcam1", "Vegfa", "Wwtr1"], "DentateGranule": ["Cdhr1", "Dsg2", "Dsp", "Ehd1", "Eml5", "Neurod1", "Npnt", "Npy5r", "Ogn", "Pter", "Rwdd3", "Spint2", "St8sia4", "Stx3", "Tdo2", "Tiam1", "Trpc6"], "GabaSSTReln": ["Ache", "Alk", "Cacna2d2", "Cacng2", "Camk1g", "Cdh13", "Clstn3", "Col19a1", "Cort", "Cygb", "Dlx1", "Dlx1as", "Elavl2", "Entpd4", "Flywch1", "Gad2", "Gna14", "Gp5", "Grpr", "Igfbp4", "Il34", "Kcnc1", "Kcnmb2", "Klf5", "Lgals1", "Lhx6", "Lynx1", "Moxd1", "Nefh", "Nnmt", "Npy", "Nxph1", "Olfm3", "Pappa", "Pcdh18", "Pnoc", "Postn", "Ptprt", "Pvalb", "Rab3b", "Ramp3", "Reln", "Rgs8", "Rph3a", "Rpp25", "Sez6", "Slc1a6", "Slc27a2", "Slc32a1", "Slc38a1", "Slc8a1", "Socs5", "Sst", "Syngr1"], "Microglia": ["1700017B05Rik", "Abhd15", "Adap2", "Adgre1", "Akna", "Alas2", "Alox5ap", "Ankrd44", "Anxa3", "Arhgap45", "Arrb2", "AW112010", "B2m", "C1qc", "C3ar1", "Casp1", "Casp8", "Ccl3", "Ccl6", "Ccrl2", "Cd300c2", "Cd34", "Cd37", "Cd52", "Cd68", "Cfh", "Chil3", "Clec5a", "Clic1", "Crybb1", "Ctsh", "Ctsz", "Cttnbp2nl", "Cyba", "Cysltr1", "D17H6S56E-5", "Dapp1", "Dnajb1", "Dock2", "Ebi3", "Ehbp1l1", "Ehd4", "Emp3", "Entpd1", "F11r", "Fam91a1", "Fcgr1", "Fcrl1", "Fcrls", "Fermt3", "Fes", "Fyb", "Gcnt1", "Ggta1", "Gmfg", "Gmip", "Golm1", "Gpsm3", "Grk2", "Grn", "Gusb", "H2-Ab1", "H2-K1", "H2-Oa", "Havcr2", "Hcls1", "Herpud1", "Hk2", "Hp", "Ier5", "Ifngr1", "Igsf6", "Il13ra1", "Il21r", "Il6ra", "Il7r", "Irf5", "Irgm2", "Itgb2", "Junb", "Klf2", "Klf6", "Lag3", "Lcp1", "Lgals3", "Lgals9", "Ly86", "Ly96", "Lyn", "Mef2a", "Mlxipl", "Mrc1", "Msn", "Myh9", "Myo1b", "Naip2", "Naip5", "Nckap1l", "Nrros", "Pald1", "Pdgfb", "Pf4", "Phyhd1", "Pik3cd", "Pla2g15", "Plcg2", "Plekho1", "Plxdc2", "Pon3", "Ppp1r15a", "Pros1", "Ptbp3", "Ptgs1", "Ptprc", "Rassf5", "Rbm39", "Rcsd1", "Rel", "Rgs1", "Rgs19", "Rnase4", "S100a11", "Sash3", "Serinc3", "Sh3glb1", "Siglecf", "Sipa1", "Skap2", "Slc11a1", "Slc7a7", "Snord22", "Spi1", "Srgap2", "Srsf7", "Stab1", "Stat6", "Tapbp", "Tbxas1", "Tcn2", "Tfpi", "Tgfb1", "Tgfbr2", "Tlr1", "Tm6sf1", "Tmc6", "Tor4a", "Trim12a", "Trim34a", "Trpv2", "Tyrobp", "Vsir", "Zfhx3", "Zfp90"], "Microglia_activation": ["B4galt1", "Birc3", "C1qa", "Casp4", "Ccdc86", "Ccl12", "Ccl2", "Ccl4", "Ccl9", "Ccr5", "Cd14", "Cd53", "Cd83", "Cd86", "Cdkn1a", "Cebpb", "Cep152", "Chst7", "Csf2rb2", "Ctla2b", "Cxcl10", "Cxcl16", "Cxcl2", "Egr2", "Fcer1g", "Fcgr2b", "Fcgr3", "Frrs1", "Glipr1", "Gpr84", "Hck", "Hfe", "Hlx", "Icam1", "Ier3", "Ifi30", "Ifi35", "Ifih1", "Il17ra", "Il1a", "Il1b", "Il4ra", "Il6", "Irf9", "Isg20", "Jmjd1c", "Klf10", "Lcp2", "Lrrfip1", "Maff", "Map3k8", "Mcl1", "Mlph", "Mlxip", "Mrc2", "Ms4a6b", "Ms4a6c", "Ms4a6d", "Myc", "Myd88", "Ncf1", "Ncf2", "Ncf4", "Nfkbia", "Nfkbie", "Nfkbiz", "Npl", "P2ry6", "Parp10", "Parp14", "Per1", "Plek", "Pmaip1", "Rab20", "Rab3il1", "Rap1b", "Rcan1", "Rela", "Rhoh", "Ripk1", "Rnasel", "Rnf19b", "Rrad", "Runx1", "Samsn1", "Serpine1", "Sertad1", "Sh2b2", "Sla", "Slc15a3", "Slc39a8", "Smagp", "Socs3", "Spint1", "Sqrdl", "Srgn", "Syk", "Tap1", "Tgm2", "Tlr2", "Tlr6", "Tlr7", "Tmem173", "Tnfaip2", "Tpp2", "Trim30a", "Tspo", "Tubb6", "Ucp2", "Vasp", "Vav1", "Zfp36"], "Microglia_deactivation": ["Abcc3", "Adcy7", "Adrb2", "Afp", "Aif1", "Ang", "Anxa1", "Arap3", "Arhgap17", "Arhgap4", "Arhgap9", "Arhgdib", "Atf3", "Batf3", "Blnk", "Btk", "Calhm2", "Camp", "Capn3", "Cd177", "Cd300a", "Cd33", "Cd48", "Cd79b", "Cebpa", "Clcf1", "Clec4a2", "Clec7a", "Cmtm7", "Cmtm8", "Csf3r", "Ctc1", "Cx3cr1", "Cytip", "Dock8", "Ebf3", "Edem1", "Elk3", "Ets1", "Fam105a", "Fam111a", "Fgd2", "Fli1", "Fmnl3", "Fosb", "Gimap6", "Gna15", "Gpr34", "H2-Aa", "H2-DMa", "H2-M3", "Hexb", "Hhex", "Hpgd", "Hpgds", "Hvcn1", "Ifitm6", "Il10ra", "Il10rb", "Il16", "Inpp5d", "Irf8", "Ivns1abp", "Kctd12", "Klk8", "Lair1", "Lcn2", "Lgmn", "Lmo2", "Lpxn", "Lrba", "Lrmp", "Lrrk1", "Ltf", "Lyl1", "Lyz1", "Mafb", "Man2b1", "Mcm3", "Mfng", "Mpeg1", "Mylip", "Myo1g", "Naalad2", "Nfam1", "Ngp", "Olfml3", "P2ry12", "Parvg", "Pik3cg", "Pld1", "Pld4", "Plxdc1", "Pmepa1", "Prkcd", "Psmb9", "Ptpn18", "Ptpn6", "Pycard", "Rasa4", "Rgl1", "Rgs2", "Rps6ka1", "S100a8", "S100a9", "Samhd1", "Scamp2", "Selplg", "Slamf9", "Slc16a6", "Slc25a37", "Slc2a5", "Slc35c2", "Slc37a2", "Slc40a1", "Snx5", "St3gal6", "Tcirg1", "Tec", "Tgfbi", "Tgfbr1", "Tgif1", "Themis2", "Tifa", "Tlr4", "Tmcc3", "Tmem119", "Tmem140", "Tnfrsf1b", "Tnfsf13b", "Trem2", "Trim47", "Uba7", "Unc93b1", "Vamp8", "Vrk2"], "Oligo": ["Adamts4", "Adssl1", "Anln", "Apod", "Aspa", "Chn2", "Cldn11", "Ctsk", "Ddc", "Elovl7", "Fa2h", "Gal3st1", "Gamt", "Gjb1", "Gltp", "Gsn", "Hapln2", "Ick", "Josd2", "Kazn", "Lims2", "Lpar1", "Mag", "Mal", "Mobp", "Mog", "Nkx2-2", "Nkx6-2", "Olig2", "Pdlim2", "Phldb1", "Plekhf1", "Plekhh1", "Pllp", "Ppp1r14a", "Ptgds", "S1pr5", "Sept4", "Sgk2", "Slain1", "Slc44a1", "Sox10", "Tmem163", "Tmem98", "Tppp3", "Trim59", "Tspan2", "Ugt8a"], "Pyramidal Thy1 Hipp": ["Crim1", "Dcn", "Fezf2", "Gabrb3", "Grp", "Kit", "Ldb2", "Nov", "Npr3", "Nr4a2", "Nts", "Pde1a", "Ppp3ca", "Psrc1", "Rspo2", "Slc17a6", "Sorcs3"] }, "LocusCoeruleus": { "Astrocyte": ["Aass", "Acsbg1", "Acsl6", "Add3", "Adhfe1", "Adora2b", "AI464131", "Aldh1l1", "Aldh6a1", "Amot", "Antxr1", "Aox1", "Aqp4", "Atp1a2", "Atp1b2", "Axl", "Bcar3", "Bhlhe40", "Btbd17", "Cbs", "Ccdc80", "Ccnd2", "Cd38", "Cd44", "Cldn10", "Clu", "Col4a5", "Csgalnact1", "Cth", "Cyp2d22", "Cyp2j9", "Cyp4f14", "Cyp4f15", "Cyp7b1", "Cyr61", "Dclk1", "Dio2", "Ednrb", "Egfr", "Elovl2", "Emp2", "Entpd2", "Ephx2", "Eva1a", "Ezr", "F3", "Fads2", "Fbln1", "Fgd6", "Fgfr3", "Fjx1", "Fkbp10", "Fmo1", "Fstl1", "Fxyd1", "Fzd2", "Gabrg1", "Gdf10", "Gjb6", "Gldc", "Gli2", "Gpld1", "Grin2c", "Hapln1", "Hsd11b1", "Igdcc4", "Igfbp2", "Igfbp5", "Itih5", "Kcnk1", "Kcnn2", "Lamb2", "Lcat", "Lgi4", "Lhx2", "Lpp", "Lrig1", "Mfge8", "Mlc1", "Nat8f4", "Ncan", "Oaf", "Papss2", "Pax6", "Pbxip1", "Pdgfrb", "Pdk4", "Pdzph1", "Phkg1", "Pla2g7", "Pou3f4", "Ppara", "Ppic", "Ppp1r3c", "Prelp", "Prkd1", "Prodh", "Ptch1", "Ptprz1", "Pygb", "Pygm", "Rorb", "S1pr1", "Sash1", "Scara3", "Scg3", "Sdc4", "Serhl", "Serpinh1", "Slc14a1", "Slc15a2", "Slc1a2", "Slc1a3", "Slc1a4", "Slc38a3", "Slc41a1", "Slc4a4", "Slc7a10", "Slco1c1", "Smpdl3a", "Sorcs2", "Sox5", "Sox9", "Sparcl1", "St6galnac5", "Tfcp2l1", "Tgfb2", "Timp3", "Tlcd1", "Tmem47", "Tnfrsf19", "Tril", "Trps1", "Ttpa", "Vcam1", "Vegfa", "Wnt7a", "Wwtr1", "Yap1"], "Microglia": ["1700017B05Rik", "Abhd15", "Adap2", "Akna", "Alas2", "Alox5ap", "Ankrd44", "Anxa3", "Apobec1", "Arhgap45", "Arrb2", "AW112010", "B2m", "C1qc", "C3ar1", "Casp1", "Casp8", "Ccl3", "Ccl6", "Ccrl2", "Cd300c2", "Cd34", "Cd37", "Cd52", "Cd68", "Cfh", "Chil3", "Clec5a", "Clic1", "Crybb1", "Ctsh", "Ctss", "Ctsz", "Cttnbp2nl", "Cyba", "Cysltr1", "D17H6S56E-5", "Dapp1", "Dock2", "Ebi3", "Emp3", "Entpd1", "F11r", "Fcgr1", "Fcrl1", "Fcrls", "Fermt3", "Fes", "Fyb", "Gcnt1", "Ggta1", "Gmfg", "Gmip", "Golm1", "Gpsm3", "Grn", "Gusb", "H2-Ab1", "H2-K1", "H2-Oa", "Hacd4", "Havcr2", "Hcls1", "Herpud1", "Hk2", "Hp", "Hps4", "Ier2", "Ier5", "Ifngr1", "Igsf6", "Il13ra1", "Il21r", "Il6ra", "Il7r", "Irf5", "Irgm2", "Itgb2", "Junb", "Klf2", "Klf6", "Lag3", "Lcp1", "Lgals3", "Lgals9", "Ltc4s", "Ly86", "Ly96", "Lyn", "Mef2a", "Mlxipl", "Mrc1", "Msn", "Myh9", "Myo7a", "Naip2", "Naip5", "Nckap1l", "Nrros", "Pald1", "Pdgfb", "Pf4", "Phyhd1", "Pik3cd", "Pla2g15", "Plcg2", "Plekho1", "Plxdc2", "Pon3", "Ppp1r15a", "Prkab1", "Pros1", "Ptbp3", "Ptprc", "Rassf5", "Rbm39", "Rcsd1", "Rel", "Rgs1", "Rnase4", "Sash3", "Serinc3", "Siglecf", "Sipa1", "Skap2", "Slc11a1", "Slc7a7", "Snord22", "Spata13", "Spi1", "Srgap2", "Srsf7", "Stab1", "Stat6", "Tbxas1", "Tfpi", "Tgfb1", "Tgfbr2", "Tlr1", "Tm6sf1", "Tmc6", "Tor4a", "Trim12a", "Trim34a", "Tyrobp", "Vsir", "Zfhx3"], "Microglia_activation": ["B4galt1", "Birc3", "C1qa", "C1qb", "Casp4", "Ccl12", "Ccl2", "Ccl4", "Ccl9", "Ccnl1", "Ccr5", "Cd14", "Cd53", "Cd83", "Cd86", "Cebpb", "Cep152", "Csf2rb2", "Ctla2b", "Cxcl10", "Cxcl16", "Cxcl2", "Egr2", "Fcer1g", "Fcgr2b", "Fcgr3", "Frrs1", "Glipr1", "Gpr84", "Hck", "Hfe", "Hlx", "Icam1", "Ier3", "Ifi30", "Ifi35", "Igtp", "Il17ra", "Il1a", "Il1b", "Il4ra", "Il6", "Isg20", "Jmjd1c", "Klf10", "Lcp2", "Lrrfip1", "Map3k8", "Mcl1", "Mlph", "Mlxip", "Mrc2", "Ms4a6b", "Ms4a6c", "Ms4a6d", "Myd88", "Ncf1", "Ncf2", "Ncf4", "Nfkbia", "Nfkbie", "Nfkbiz", "P2ry6", "Parp10", "Parp14", "Parp9", "Per1", "Plek", "Pmaip1", "Rab20", "Rab3il1", "Rac2", "Rhoh", "Ripk1", "Rnasel", "Rnf19b", "Rrad", "Runx1", "Samsn1", "Serpine1", "Sertad1", "Sh2b2", "Sla", "Slc15a3", "Slc39a8", "Smagp", "Socs3", "Spint1", "Srgn", "Syk", "Tap1", "Tgm2", "Tlr2", "Tlr6", "Tlr7", "Tmem173", "Tnf", "Tnfaip2", "Tpp2", "Trim30a", "Tsc22d3", "Tubb6", "Ucp2", "Vav1", "Zfp36"], "Microglia_deactivation": ["Abcc3", "Adcy7", "Adrb1", "Adrb2", "Afp", "Aif1", "Ang", "Anxa1", "Arap3", "Arhgap17", "Arhgap4", "Arhgap9", "Arhgdib", "Atf3", "Batf3", "Blnk", "Btk", "Calhm2", "Camp", "Capn3", "Cd177", "Cd300a", "Cd33", "Cd48", "Cd79b", "Cebpa", "Cited2", "Clcf1", "Clec4a2", "Clec7a", "Cmtm7", "Cmtm8", "Csf1r", "Csf3r", "Ctc1", "Cx3cr1", "Cytip", "Dock8", "Ebf3", "Edem1", "Elk3", "Ets1", "Fam105a", "Fam111a", "Fgd2", "Fli1", "Fmnl3", "Fosb", "Gimap6", "Gna15", "Gpr34", "H2-Aa", "H2-DMa", "H2-M3", "Hexb", "Hhex", "Hpgd", "Hpgds", "Hvcn1", "Ifitm6", "Il10ra", "Il10rb", "Il16", "Inpp5d", "Irf8", "Kctd12", "Klk8", "Lair1", "Laptm5", "Lcn2", "Lgmn", "Lmo2", "Lpxn", "Lrba", "Lrmp", "Lrrk1", "Lst1", "Ltf", "Lyl1", "Lyz1", "Mafb", "Man2b1", "Mfng", "Mpeg1", "Mylip", "Myo1g", "Naalad2", "Naip6", "Nfam1", "Ngp", "Npnt", "Nrip1", "Olfml3", "P2ry12", "Parvg", "Pik3cg", "Plcl2", "Pld4", "Prkcd", "Psmb9", "Ptpn18", "Ptpn6", "Pycard", "Rasa4", "Rgl1", "Rgs10", "Rgs2", "Rps6ka1", "S100a8", "S100a9", "Selplg", "Slamf9", "Slc16a6", "Slc25a37", "Slc25a45", "Slc2a5", "Slc37a2", "Slc40a1", "Slc7a8", "Snx5", "St3gal6", "Tcirg1", "Tec", "Tgfbi", "Tgfbr1", "Tgif1", "Themis2", "Tifa", "Tlr4", "Tmem119", "Tmem140", "Tnfrsf1b", "Tnfsf13b", "Trem2", "Trim47", "Uba7", "Unc93b1", "Vamp8", "Vrk2"], "Noradrenergic": ["4930550L24Rik", "5330417C22Rik", "Abcc8", "Ache", "Actl6b", "Adcyap1", "AF357355", "Arhgdig", "Asb4", "Atp1a1", "Baiap3", "Cacna2d2", "Cacna2d3", "Cacng5", "Cadm3", "Calca", "Calcr", "Cartpt", "Cbarp", "Cd24a", "Cda", "Cdh13", "Cdh22", "Cdh8", "Cdhr1", "Cdkl2", "Celf4", "Cgref1", "Chga", "Chgb", "Chodl", "Chrna6", "Ckmt1", "Cmbl", "Cntn6", "Cntnap2", "Cntnap4", "Crmp1", "Cyb561", "Cygb", "Dbh", "Dlk1", "Dpp6", "Dpysl5", "Elavl2", "Emb", "Fabp3", "Fkbp1b", "Flywch2", "Gal", "Gap43", "Gch1", "Gng4", "Gpx3", "Grb10", "Grem2", "Gstm6", "Ina", "Kcnh2", "Kcnip4", "L1cam", "Lin7b", "Ly6h", "Mab21l1", "Maoa", "Map1b", "Map4", "Mapk8ip2", "Mcub", "Meg3", "Napb", "Nefh", "Nefl", "Ngb", "Nipsnap1", "Nrip3", "Ntng1", "Nucb2", "Ovgp1", "Pacsin1", "Pak3", "Pcbd1", "Pcbp3", "Pcsk1", "Pcsk2", "Peg3", "Phox2a", "Pkp2", "Pmfbp1", "Pnck", "Ptprn", "Rab15", "Rab3b", "Rab3c", "Rasgrf1", "Rbp4", "Resp18", "Rgs11", "Rian", "Rph3a", "S100a10", "Scg2", "Scn2a", "Scn3b", "Sept6", "Slc29a4", "Slc6a15", "Slc6a17", "Slc6a2", "Sncg", "Snhg11", "Spint2", "Sstr2", "St8sia2", "St8sia4", "Stbd1", "Stk32c", "Stmn2", "Stx3", "Susd2", "Syn2", "Syngr3", "Syt17", "Syt4", "Tenm2", "Tfap2b", "Th", "Tmsb10", "Trpc3", "Tubb3", "Tubg2", "Usp29", "Vat1"], "Oligo": ["Adamts4", "Adssl1", "Anln", "Apod", "Aspa", "C1ql3", "Chn2", "Cldn11", "Efnb3", "Ell2", "Elovl7", "Fa2h", "Gal3st1", "Gjb1", "Gng11", "Grb14", "Gsn", "Hapln2", "Josd2", "Kazn", "Kctd4", "Lims2", "Lpar1", "Lrrn1", "Mag", "Mal", "Mbp", "Mobp", "Mog", "Ndrg1", "Ninj2", "Nkx2-2", "Nkx6-2", "Olig2", "Pdlim2", "Plekhf1", "Plekhh1", "Pllp", "Pou3f1", "Ppp1r14a", "Ptgds", "Rab33a", "S1pr5", "Sgk2", "Sh3gl3", "Slain1", "Slc44a1", "Sox10", "Tmeff2", "Tmem98", "Tnni1", "Trim59", "Tspan2", "Ugt8a"] }, "Midbrain": { "Astrocyte": ["Aass", "Acsbg1", "Acsl6", "Acss1", "Add3", "Adhfe1", "AI464131", "Aldh1l1", "Aldh6a1", "Antxr1", "Aox1", "Apoe", "Aqp4", "Axl", "Btbd17", "Cbs", "Ccdc80", "Ccdc88a", "Ccnd2", "Cd38", "Cd44", "Cldn10", "Col4a5", "Crot", "Cspg5", "Cth", "Cyp2d22", "Cyp2j9", "Cyp4f14", "Cyp4f15", "Cyp7b1", "Cyr61", "Dag1", "Dclk1", "Dtna", "Ednrb", "Egfr", "Elovl2", "Emp2", "Entpd2", "Ephx2", "Eva1a", "Ezr", "F3", "Fads2", "Farp1", "Fgd6", "Fgfr3", "Fjx1", "Fkbp10", "Fmo1", "Fzd2", "Fzd4", "Gdf10", "Gjb6", "Gldc", "Gli2", "Grin2c", "Hsd11b1", "Igfbp2", "Itga7", "Itih5", "Kcnn2", "Lcat", "Lhx2", "Lmcd1", "Lpp", "Mfge8", "Mmp14", "Myo10", "Naaa", "Nat8f4", "Ndp", "Nkain4", "Notch1", "Ntrk2", "Ntsr2", "Oaf", "Oplah", "Papss2", "Pax6", "Pbxip1", "Pdlim5", "Pdzph1", "Phka1", "Phkg1", "Pla2g7", "Plpp3", "Ppara", "Ppic", "Ppp1r3c", "Prdx6", "Prelp", "Prkd1", "Prodh", "Ptprz1", "Pygm", "Rorb", "Sash1", "Scara3", "Sdc4", "Slc12a4", "Slc14a1", "Slc15a2", "Slc1a3", "Slc38a3", "Slc41a1", "Slc7a10", "Slc9a3r1", "Slco1c1", "Smpd2", "Smpdl3a", "Sorcs2", "Sox5", "Srebf1", "Tfcp2l1", "Timp3", "Tlcd1", "Tmem51", "Tnfrsf19", "Tril", "Trps1", "Ttpa", "Vcam1", "Vcl", "Vegfa", "Wnt7a", "Wwtr1"], "BrainstemCholin": ["2310030G06Rik", "Anxa2", "Cabp1", "Calca", "Calcb", "Cd24a", "Cd55", "Cda", "Chodl", "Ecel1", "Fxyd7", "Hebp2", "Hspb1", "Hspb8", "Irx3", "Isl1", "Kcnj14", "Lgals1", "Nts", "Patj", "Pcp4l1", "Pip5kl1", "Popdc3", "Ppcs", "Prph", "Prss12", "Rspo2", "Sh3bgr", "Slc18a3", "Slc29a4", "Spp1", "Stbd1", "Tesc", "Uts2"], "Dopaminergic": ["Cacna2d2", "Cadps2", "Chrna6", "Mapk8ip2", "Nr4a2", "Ntn1", "Prkcg", "Rian", "Scn2a", "Slc6a3", "Snhg11", "Tenm1", "Th", "Zim3"], "Microglia": ["1700017B05Rik", "Abhd15", "Adap2", "Adgre1", "Akna", "Alas2", "Alox5ap", "Ankrd44", "Anxa3", "Apobec1", "Arhgap45", "Arrb2", "AW112010", "B2m", "Btg2", "C1qc", "C3ar1", "Casp1", "Casp8", "Ccl3", "Ccl6", "Ccrl2", "Cd300c2", "Cd34", "Cd37", "Cd52", "Cd68", "Cfh", "Chil3", "Cklf", "Clec5a", "Clic1", "Crybb1", "Ctsh", "Ctss", "Ctsz", "Cttnbp2nl", "Cyba", "Cysltr1", "D17H6S56E-5", "Dapp1", "Dnajb1", "Dock2", "Dusp6", "Ebi3", "Emp3", "Entpd1", "Erap1", "F11r", "Fcgr1", "Fcrl1", "Fcrls", "Fermt3", "Fes", "Fyb", "Gcnt1", "Ggta1", "Gmfg", "Gmip", "Golm1", "Gpsm3", "Grn", "Gusb", "H2-Ab1", "H2-K1", "H2-Oa", "Havcr2", "Hcls1", "Herpud1", "Hk2", "Hp", "Hps4", "Ier2", "Ier5", "Ifngr1", "Igsf6", "Il13ra1", "Il21r", "Il6ra", "Il7r", "Irf5", "Itgb2", "Junb", "Klf2", "Klf6", "Lag3", "Lgals3", "Lgals9", "Ltc4s", "Ly86", "Ly96", "Lyn", "Map3k1", "Mef2a", "Mlxipl", "Mrc1", "Msn", "Myo1b", "Myo7a", "Naip2", "Naip5", "Nckap1l", "Nrros", "Pag1", "Pald1", "Pdgfb", "Pf4", "Phxr1", "Phyhd1", "Pik3cd", "Pla2g15", "Plcg2", "Plekho1", "Plxdc2", "Pon3", "Ppp1r15a", "Prkab1", "Pros1", "Ptbp3", "Ptgr1", "Ptgs1", "Ptprc", "Rassf5", "Rcsd1", "Rel", "Rgs1", "Rin2", "Rnase4", "Sash3", "Siglecf", "Sipa1", "Slc11a1", "Slc7a7", "Snord22", "Spata13", "Spi1", "Srgap2", "Srsf7", "Stab1", "Stat6", "Stk26", "Tbxas1", "Tcn2", "Tgfb1", "Tgfbr2", "Tgif2", "Tlr1", "Tmc6", "Tob2", "Tor4a", "Trim12a", "Trim34a", "Tyrobp", "Vsir"], "Microglia_activation": ["Asxl1", "Atp7a", "B4galt1", "Bach1", "Birc3", "C1qa", "C1qb", "Casp4", "Ccl12", "Ccl2", "Ccl4", "Ccl9", "Ccnl1", "Ccr5", "Cd14", "Cd53", "Cd83", "Cd86", "Cebpb", "Cep152", "Chst7", "Csf2rb2", "Ctla2b", "Cxcl10", "Cxcl16", "Cxcl2", "Egr2", "Fcer1g", "Fcgr2b", "Fcgr3", "Frrs1", "Glipr1", "Gpr84", "Hck", "Hfe", "Hlx", "Icam1", "Ier3", "Ifi30", "Igtp", "Il17ra", "Il1a", "Il1b", "Il4ra", "Il6", "Irf9", "Isg20", "Jmjd1c", "Klf10", "Lcp2", "Lrrfip1", "Map3k8", "Mcl1", "Mlph", "Mlxip", "Ms4a6b", "Ms4a6c", "Ms4a6d", "Myd88", "Ncf1", "Ncf2", "Ncf4", "Nfkbia", "Nfkbie", "Nfkbiz", "Npl", "P2ry6", "Parp10", "Parp14", "Parp9", "Per1", "Plaur", "Plek", "Pmaip1", "Rab20", "Rab3il1", "Rac2", "Rbm26", "Rhoh", "Ripk1", "Rrad", "Runx1", "Samsn1", "Serpine1", "Sertad1", "Sh2b2", "Sla", "Slc15a3", "Smagp", "Socs3", "Spint1", "Srgn", "Syk", "Tap1", "Tgm2", "Tlr2", "Tlr6", "Tlr7", "Tmem173", "Tnf", "Tnfaip2", "Tpp2", "Traf5", "Trim30a", "Tsc22d3", "Tubb6", "Usp2", "Vav1", "Zfp36"], "Microglia_deactivation": ["2810474O19Rik", "Abcc3", "Adrb1", "Adrb2", "Afp", "Aif1", "Ang", "Arap3", "Arhgap17", "Arhgap4", "Arhgap9", "Arhgdib", "Atf3", "Batf3", "Blnk", "Btk", "Calhm2", "Camp", "Capn3", "Cd177", "Cd300a", "Cd33", "Cd48", "Cd79b", "Cebpa", "Clcf1", "Clec4a2", "Clec7a", "Cmtm6", "Cmtm7", "Csf3r", "Ctc1", "Cx3cr1", "Cytip", "Dock8", "Edem1", "Elf1", "Elk3", "Ets1", "Fam105a", "Fam111a", "Fgd2", "Fli1", "Gimap6", "Gna15", "Gpr34", "H2-Aa", "H2-DMa", "Hexb", "Hhex", "Hpgd", "Hpgds", "Hspa1a", "Hvcn1", "Ifitm6", "Il10ra", "Il10rb", "Il16", "Inpp5d", "Irf8", "Kctd12", "Klk8", "Lair1", "Lcn2", "Lgmn", "Lmo2", "Lpxn", "Lrba", "Lrmp", "Lrrk1", "Lsp1", "Ltf", "Lyl1", "Lyz1", "Mafb", "Man2b1", "Mfng", "Mpeg1", "Mylip", "Myo1g", "Naalad2", "Naglu", "Naip6", "Nfam1", "Nfatc1", "Ngp", "Npnt", "Nrip1", "Olfml3", "P2ry12", "Parvg", "Pik3cg", "Plcl2", "Pld1", "Pld4", "Plxdc1", "Prkcd", "Psmb9", "Ptpn18", "Ptpn6", "Pycard", "Rasa4", "Rbl1", "Rgs10", "Rps6ka1", "S100a8", "S100a9", "Selplg", "Slamf9", "Slc16a6", "Slc25a37", "Slc2a5", "Slc37a2", "Slc40a1", "Slc46a3", "Slc7a8", "Snx5", "Srpk3", "St3gal6", "Tcirg1", "Tec", "Tgfbi", "Tgfbr1", "Tgif1", "Themis2", "Tifa", "Tlr4", "Tmcc3", "Tmem119", "Tmem140", "Tnfrsf1b", "Tnfsf13b", "Trem2", "Trim47", "Uba7", "Unc93b1", "Vamp8", "Vrk2"], "Oligo": ["Gal3st1", "Gamt", "Gjb1", "Gsn", "Josd2", "Lims2", "Mog", "Olig2", "Pdlim2", "Phldb1", "Plekhh1", "Ppp1r14a", "Rab33a", "Sox10", "Thbs3", "Trim59", "Tspan2", "Ugt8a"], "Serotonergic": ["2010204K13Rik", "Ceacam10", "Cited1", "Crct1", "Ctla2a", "Fev", "Fxyd2", "Gata3", "H2-Q1", "Htr5b", "Klk1b27", "Mcub", "Pcdhac1", "Ptger3", "Slc22a3", "Slc6a4", "Sln", "Trh"] }, "SpinalCord": { "Astrocyte": ["Aass", "Abat", "Acsbg1", "Acsl6", "Add3", "Adhfe1", "Adora2b", "AI464131", "Ak4", "Aldh1l1", "Aldh6a1", "Amot", "Antxr1", "Aox1", "Aqp4", "Atp1a2", "Atp1b2", "Axl", "Bcar3", "Btbd17", "Cbs", "Ccdc80", "Ccdc88a", "Ccnd2", "Cd38", "Cd44", "Cldn10", "Clu", "Col4a5", "Cth", "Cyp2d22", "Cyp2j9", "Cyp4f14", "Cyp4f15", "Cyp7b1", "Cyr61", "Dag1", "Dclk1", "Dio2", "Dmd", "Dtna", "Ednrb", "Egfr", "Elovl2", "Emp2", "Entpd2", "Ephx2", "Ezr", "F3", "Fads2", "Farp1", "Fbln1", "Fgd6", "Fgfr3", "Fjx1", "Fkbp10", "Fmo1", "Fxyd1", "Fzd2", "Gabrb1", "Gabrg1", "Gdf10", "Gjb6", "Gldc", "Gli2", "Gpld1", "Grhl1", "Grin2c", "Hapln1", "Hsd11b1", "Igdcc4", "Igfbp2", "Igfbp5", "Itih5", "Kcnn2", "Lcat", "Lhx2", "Lpp", "Lrig1", "Mfge8", "Mlc1", "Myo10", "Nat8f4", "Ncan", "Ntrk2", "Ntsr2", "Oaf", "Papss2", "Pax6", "Pbxip1", "Pdgfrb", "Pdk4", "Pdzph1", "Phka1", "Phkg1", "Pla2g7", "Pou3f4", "Ppara", "Ppic", "Prelp", "Prkd1", "Prodh", "Ptch1", "Ptprz1", "Pygb", "Rorb", "S1pr1", "Sash1", "Scara3", "Scg3", "Sdc4", "Serpinh1", "Slc14a1", "Slc15a2", "Slc1a2", "Slc1a3", "Slc1a4", "Slc38a3", "Slc41a1", "Slc4a4", "Slc7a10", "Slco1c1", "Smpdl3a", "Sorcs2", "Sox5", "St6galnac5", "Tfcp2l1", "Tgfb2", "Timp3", "Tlcd1", "Tmem47", "Tmem51", "Tnfrsf19", "Tril", "Ttpa", "Vcam1", "Vegfa", "Wwtr1", "Yap1"], "Microglia": ["1700017B05Rik", "Abhd15", "Adap2", "Adgre1", "Akna", "Alas2", "Alox5ap", "Ankrd44", "Anxa3", "Apobec1", "Arhgap45", "Arrb2", "AW112010", "B2m", "C1qc", "C3ar1", "Casp1", "Casp8", "Ccl3", "Ccl6", "Ccrl2", "Cd300c2", "Cd34", "Cd37", "Cd52", "Cd68", "Cfh", "Chil3", "Clec5a", "Clic1", "Coro1a", "Crybb1", "Ctsh", "Ctss", "Ctsz", "Cttnbp2nl", "Cyba", "Cysltr1", "D17H6S56E-5", "Dapp1", "Dock2", "Ebi3", "Ehd4", "Entpd1", "F11r", "Fcgr1", "Fcrl1", "Fcrls", "Fermt3", "Fes", "Fyb", "Gcnt1", "Ggta1", "Gmfg", "Gmip", "Golm1", "Gpsm3", "Grn", "Gusb", "H2-Ab1", "H2-K1", "H2-Oa", "Havcr2", "Hcls1", "Herpud1", "Hk2", "Hp", "Hps4", "Ier2", "Ier5", "Ifngr1", "Igsf6", "Il13ra1", "Il21r", "Il6ra", "Il7r", "Irf5", "Irgm2", "Itgb2", "Junb", "Klf2", "Klf6", "Lag3", "Lgals9", "Ltc4s", "Ly86", "Ly96", "Lyn", "Mef2a", "Mlxipl", "Mrc1", "Myh9", "Myo1b", "Myo7a", "Naip2", "Naip5", "Nckap1l", "Nrros", "Pald1", "Pdgfb", "Pf4", "Phxr1", "Phyhd1", "Pik3cd", "Pla2g15", "Plcg2", "Plekho1", "Plxdc2", "Pon3", "Ppp1r15a", "Pros1", "Ptbp3", "Ptprc", "Rassf5", "Rbm39", "Rcsd1", "Rel", "Rgs1", "Rgs19", "Rnase4", "Sash3", "Serinc3", "Siglecf", "Sipa1", "Slc11a1", "Slc7a7", "Snord22", "Spata13", "Spi1", "Srgap2", "Srsf7", "Stab1", "Stat6", "Stk26", "Tbxas1", "Tgfb1", "Tgfbr2", "Tlr1", "Tm6sf1", "Tmc6", "Tor4a", "Trim12a", "Trim34a", "Trpv2", "Tyrobp", "Vsir", "Zfhx3"], "Microglia_activation": ["Asxl1", "B4galt1", "Birc3", "C1qa", "C1qb", "Casp4", "Ccl12", "Ccl2", "Ccl4", "Ccl9", "Ccnl1", "Ccr5", "Cd14", "Cd53", "Cd83", "Cd86", "Cebpb", "Cep152", "Csf2rb2", "Ctla2b", "Cxcl10", "Cxcl16", "Cxcl2", "Egr2", "Fcer1g", "Fcgr2b", "Fcgr3", "Frrs1", "Glipr1", "Gpr84", "Hck", "Hfe", "Hlx", "Icam1", "Ier3", "Ifi30", "Ifi35", "Igtp", "Il17ra", "Il1a", "Il1b", "Il4ra", "Il6", "Irf9", "Isg20", "Jmjd1c", "Klf10", "Lcp2", "Lrrfip1", "Map3k8", "Mcl1", "Mlph", "Mrc2", "Ms4a6b", "Ms4a6c", "Ms4a6d", "Myd88", "Ncf1", "Ncf2", "Ncf4", "Nfkbia", "Nfkbiz", "P2ry6", "Parp10", "Parp14", "Parp9", "Per1", "Plaur", "Plek", "Pmaip1", "Rab20", "Rab3il1", "Rac2", "Rhoh", "Ripk1", "Rnasel", "Rnf19b", "Rrad", "Runx1", "Samsn1", "Serpine1", "Sh2b2", "Sla", "Slc15a3", "Slc39a8", "Smagp", "Socs3", "Spint1", "Srgn", "Syk", "Tap1", "Tgm2", "Tlr2", "Tlr6", "Tlr7", "Tmem173", "Tnf", "Tnfaip2", "Tpp2", "Trim30a", "Ucp2", "Vav1", "Zfp36"], "Microglia_deactivation": ["2810474O19Rik", "Abcc3", "Adcy7", "Adrb1", "Adrb2", "Afp", "Aif1", "Ang", "Anxa1", "Arap3", "Arhgap17", "Arhgap4", "Arhgap9", "Arhgdib", "Atf3", "Batf3", "Blnk", "Btk", "Calhm2", "Camp", "Capn3", "Cd177", "Cd300a", "Cd33", "Cd48", "Cd79b", "Cebpa", "Clcf1", "Clec4a2", "Clec7a", "Cmtm7", "Cmtm8", "Csf1r", "Csf3r", "Ctc1", "Cx3cr1", "Cytip", "Dock8", "Ebf3", "Edem1", "Elk3", "Ets1", "Fam105a", "Fam111a", "Fgd2", "Fli1", "Fmnl3", "Gimap6", "Gna15", "Gpr34", "H2-Aa", "H2-DMa", "H2-M3", "Hexb", "Hhex", "Hpgd", "Hpgds", "Hvcn1", "Ifitm6", "Il10ra", "Il10rb", "Il16", "Inpp5d", "Irf8", "Kctd12", "Klk8", "Lair1", "Laptm5", "Lcn2", "Lmo2", "Lpxn", "Lrba", "Lrmp", "Lrrk1", "Lsp1", "Ltf", "Lyl1", "Lyz1", "Mafb", "Man2b1", "Mfng", "Mpeg1", "Mylip", "Myo1g", "Naalad2", "Naip6", "Nfam1", "Ngp", "Npnt", "Nrip1", "Olfml3", "P2ry12", "Parvg", "Pik3cg", "Plcl2", "Pld4", "Psmb9", "Ptpn18", "Ptpn6", "Pycard", "Rasa4", "Rgs10", "Rgs2", "Rps6ka1", "S100a8", "S100a9", "Selplg", "Slamf9", "Slc16a6", "Slc25a37", "Slc25a45", "Slc2a5", "Slc37a2", "Slc40a1", "Slc7a8", "Snx5", "St3gal6", "Tcirg1", "Tec", "Tgfbi", "Tgfbr1", "Tgif1", "Themis2", "Tifa", "Tlr4", "Tmem119", "Tmem140", "Tnfrsf1b", "Trem2", "Trim47", "Uba7", "Unc93b1", "Vamp8", "Vrk2"], "Oligo": ["Adamts4", "Anln", "Aspa", "Chn2", "Cldn11", "Ddc", "Efnb3", "Fa2h", "Gal3st1", "Gjb1", "Gnb4", "Gsn", "Josd2", "Kazn", "Larp6", "Lims2", "Lpar1", "Mag", "Mobp", "Mog", "Ndrg1", "Ninj2", "Nkain1", "Nkx2-2", "Nkx6-2", "Olig2", "Pdlim2", "Phldb1", "Plekhh1", "Pllp", "Pou3f1", "Ppp1r14a", "Rab33a", "S1pr5", "Sgk2", "Sh3gl3", "Slain1", "Sox10", "Stmn4", "Tmem163", "Tnni1", "Trim59", "Tspan2", "Tubb4a"], "SpinalCordCholinergic": ["1110008P14Rik", "2310030G06Rik", "Aard", "Ache", "Agmat", "AI506816", "Anxa2", "Anxa4", "Arhgdig", "Arl16", "Bean1", "Cacfd1", "Cacna2d3", "Calca", "Calcb", "Caln1", "Cartpt", "Cbln1", "Ccdc28a", "Ccdc92", "Ccl19", "Cd24a", "Cd55", "Cda", "Cdh22", "Cdhr1", "Chac1", "Chd3os", "Chga", "Chodl", "Ckmt1", "Clvs1", "Cntnap4", "Cops9", "Cpne6", "Cst6", "Cyb561", "Dffa", "Dmtn", "Dpcd", "Dpp6", "Elavl2", "Fabp3", "Fgf18", "Fkbp1b", "Fxyd7", "Gabrg2", "Gna14", "Gng13", "Gpx3", "Habp4", "Hcn1", "Hebp2", "Hoxa9", "Hoxb5", "Hoxc8", "Hs6st2", "Hspb1", "Hspb8", "Irx3", "Isl1", "Kazald1", "Kcnh2", "Kcnj14", "Kcnk3", "L1cam", "Lgals1", "Lin7b", "Lrrc49", "Lynx1", "Mapk12", "Medag", "Mmp9", "Mycbp", "Nefh", "Nefl", "Nefm", "Nell2", "Nol3", "Npr3", "Nrip3", "Ntng1", "Nts", "Patj", "Pcp4l1", "Perp", "Pip5kl1", "Popdc3", "Prph", "Prss12", "Rasl10a", "Resp18", "Rgs11", "Rhov", "Rph3a", "Rspo2", "Ryr2", "S100a10", "Scn1a", "Sema3a", "Sh3bgr", "Sh3bgrl2", "Slc17a6", "Slc18a3", "Slc29a4", "Slc6a15", "Sln", "Sncg", "Spock1", "Spp1", "Srxn1", "Stbd1", "Stmn2", "Sult4a1", "Susd2", "Tdrp", "Tesc", "Tmsb10", "Tpd52l1", "Trhr", "Uts2", "Vamp1", "Wnk4", "Ykt6"] }, "Striatum": { "Astrocyte": ["2810459M11Rik", "Aass", "Abhd3", "Acaa2", "Acsbg1", "Acsl6", "Acss1", "Add3", "Adgrg1", "Adhfe1", "Adora2b", "AI464131", "Ak4", "Aldh1a1", "Aldh1l1", "Aldh6a1", "Amot", "Antxr1", "Aox1", "Apoe", "Appl2", "Aqp4", "Atp1a2", "Atp1b2", "Axl", "Btbd17", "Cbs", "Ccdc80", "Cd38", "Cldn10", "Clu", "Col4a5", "Crot", "Cspg5", "Cth", "Cyp2d22", "Cyp2j9", "Cyp4f14", "Cyp4f15", "Cyp7b1", "Cyr61", "Dag1", "Dclk1", "Dio2", "Dkk3", "Dtna", "Ednrb", "Efemp1", "Egfr", "Elovl2", "Emp2", "Entpd2", "Ephx2", "Eps8", "Eva1a", "Ezr", "F3", "Fads1", "Fads2", "Fam181b", "Farp1", "Fbln1", "Fgd6", "Fgf1", "Fgfr1", "Fgfr3", "Fjx1", "Fkbp10", "Fmo1", "Fxyd1", "Fzd2", "Fzd4", "Gabrb1", "Gabrg1", "Gas1", "Gdf10", "Ghr", "Gja1", "Gjb2", "Gjb6", "Gldc", "Gli2", "Gpld1", "Gprc5b", "Grin2c", "Gstm1", "Hapln1", "Hsd11b1", "Id3", "Igdcc4", "Igfbp2", "Igfbp5", "Inhbb", "Itga7", "Itih5", "Kcnn2", "Kif1c", "Lamb2", "Lcat", "Lgi4", "Lhx2", "Lmcd1", "Lpp", "Lrig1", "Lxn", "Macf1", "Mfge8", "Mgst1", "Mlc1", "Mmp14", "Myo10", "Myo6", "Naaa", "Nat8f4", "Ncan", "Ndp", "Nfib", "Nhsl1", "Nkain4", "Notch1", "Nrarp", "Ntrk2", "Ntsr2", "Oaf", "Oplah", "Papss2", "Pax6", "Pdgfrb", "Pdk4", "Pdzph1", "Phka1", "Phkg1", "Pla2g7", "Ppara", "Ppic", "Ppp1r3c", "Prelp", "Prkd1", "Prodh", "Ptpn13", "Ptprz1", "Pygb", "Pygm", "Rasa2", "Rftn2", "Rhbdf1", "Rorb", "S1pr1", "Sash1", "Scara3", "Scg3", "Sdc4", "Sema4a", "Serhl", "Serpinh1", "Slc12a4", "Slc14a1", "Slc15a2", "Slc1a2", "Slc1a3", "Slc1a4", "Slc38a3", "Slc41a1", "Slc6a1", "Slc7a10", "Slc9a3r1", "Slco1c1", "Smo", "Smpd2", "Smpdl3a", "Soat1", "Sorcs2", "Sox21", "Sox5", "Spag1", "Sparcl1", "Srebf1", "Suclg2", "Tfcp2l1", "Tgfb2", "Timp3", "Tlcd1", "Tmem47", "Tmem51", "Tnfrsf19", "Tril", "Ttpa", "Vcam1", "Vcl", "Vegfa", "Wnt7a", "Wwtr1"], "ForebrainCholin": ["1110008P14Rik", "Ache", "Arhgdig", "Cartpt", "Cda", "Clstn2", "Coprs", "Crabp2", "Csrp2", "Dbndd1", "Ecel1", "Fkbp1b", "Flywch2", "Gal", "Gdnf", "Gng2", "Gng4", "Gpx3", "Hspb1", "Hspb8", "Klhdc8a", "Lhx6", "Lhx8", "Mcub", "Ngfr", "Nrip3", "Ntsr1", "Pcbd1", "Pcsk1", "Pkib", "Popdc3", "Ptger2", "Resp18", "Rhov", "S100a11", "Slc18a3", "Slc5a7", "Sln", "Sncg", "Stmn2", "Susd2", "Tacr3", "Trpc3", "Unc119", "Zic1"], "Microglia": ["1700017B05Rik", "Abhd15", "Adap2", "Adgre1", "Akna", "Alas2", "Alox5ap", "Ankrd44", "Anxa3", "Apobec1", "Apobr", "Arhgap45", "Arrb2", "AW112010", "B2m", "BC028528", "Btg2", "C1qc", "C3ar1", "Casp1", "Casp8", "Ccl3", "Ccl6", "Ccrl2", "Cd300c2", "Cd34", "Cd37", "Cd52", "Cd68", "Cfh", "Chil3", "Cklf", "Clec5a", "Clic1", "Col6a3", "Coro1a", "Creg1", "Crybb1", "Ctsh", "Ctss", "Ctsz", "Cttnbp2nl", "Cyba", "Cysltr1", "D17H6S56E-5", "Dapp1", "Dnajb1", "Dock2", "Dusp6", "Ebi3", "Ehd4", "Emp3", "Entpd1", "Erap1", "Esyt1", "F11r", "Fcgr1", "Fcrl1", "Fcrls", "Fermt3", "Fes", "Fyb", "Gcnt1", "Ggta1", "Gmfg", "Gmip", "Gns", "Golm1", "Gpsm3", "Grn", "Gusb", "H2-Ab1", "H2-K1", "H2-Oa", "Hacd4", "Havcr2", "Hcls1", "Herpud1", "Hk2", "Hp", "Hps4", "Ier2", "Ier5", "Ifngr1", "Igsf6", "Il13ra1", "Il21r", "Il6ra", "Il7r", "Ints6l", "Irf5", "Irgm2", "Itgb2", "Junb", "Klf2", "Klf6", "Lag3", "Lcp1", "Lgals3", "Lgals9", "Ltc4s", "Ly86", "Ly96", "Lyn", "Mlxipl", "Mrc1", "Msn", "Myh9", "Myo7a", "Naip2", "Naip5", "Nckap1l", "Nrm", "Nrros", "Pag1", "Pald1", "Pdgfb", "Pf4", "Phxr1", "Phyhd1", "Pik3cd", "Pla2g15", "Pla2g4a", "Plcg2", "Plekho1", "Plxdc2", "Pon3", "Ppp1r15a", "Prkab1", "Pros1", "Ptbp3", "Ptgr1", "Ptgs1", "Ptprc", "Rassf5", "Rcsd1", "Rel", "Rgs1", "Rgs19", "Rnase4", "Sash3", "Siglecf", "Sipa1", "Slc11a1", "Slc7a7", "Snord22", "Spi1", "Srgap2", "Srsf7", "Stab1", "Stat6", "Tapbp", "Tbxas1", "Tcn2", "Tfpi", "Tgfb1", "Tgfbr2", "Tgif2", "Tlr1", "Tm6sf1", "Tmc6", "Tob2", "Tor4a", "Trim12a", "Trim34a", "Trpv2", "Tyrobp", "Vsir", "Wsb1", "Zfhx3"], "Microglia_activation": ["Atp7a", "B4galt1", "Birc3", "C1qa", "C1qb", "Casp4", "Ccl12", "Ccl2", "Ccl4", "Ccl9", "Ccnl1", "Ccr5", "Cd14", "Cd53", "Cd83", "Cd86", "Cebpb", "Cep152", "Chst7", "Csf2rb2", "Ctla2b", "Cxcl10", "Cxcl16", "Cxcl2", "Egr2", "Fcer1g", "Fcgr2b", "Fcgr3", "Frrs1", "Gas5", "Glipr1", "Gpr84", "Hck", "Hfe", "Hlx", "Icam1", "Ier3", "Ifi30", "Ifi35", "Ifih1", "Igtp", "Il17ra", "Il1a", "Il1b", "Il4ra", "Il6", "Isg20", "Klf10", "Lcp2", "Lrrfip1", "Maff", "Map3k8", "Mcl1", "Mlph", "Mlxip", "Mrc2", "Ms4a6b", "Ms4a6c", "Ms4a6d", "Myd88", "Ncf1", "Ncf2", "Ncf4", "Nfkbia", "Nfkbie", "Nfkbiz", "Npl", "P2ry6", "Parp10", "Parp14", "Parp9", "Plaur", "Plek", "Plk3", "Pmaip1", "Rab20", "Rab3il1", "Rac2", "Rela", "Rhoh", "Ripk1", "Rnasel", "Rrad", "Rsad2", "Runx1", "Samsn1", "Serpine1", "Sh2b2", "Sla", "Slc15a3", "Slc39a8", "Smagp", "Socs3", "Spint1", "Srgn", "Syk", "Tap1", "Tgm2", "Tlr2", "Tlr6", "Tlr7", "Tmem173", "Tnf", "Tnfaip2", "Tnfrsf1a", "Tpp2", "Traf5", "Trim30a", "Tsc22d3", "Tuba1c", "Tubb6", "Ucp2", "Vav1", "Zfp36"], "Microglia_deactivation": ["1810011O10Rik", "2810474O19Rik", "Abcc3", "Adcy7", "Adrb2", "Afp", "Aif1", "Ang", "Anxa1", "Arap3", "Arhgap17", "Arhgap4", "Arhgap9", "Atf3", "Batf3", "Blnk", "Btk", "Calhm2", "Camp", "Capn3", "Cd177", "Cd300a", "Cd33", "Cd48", "Cd79b", "Cebpa", "Clcf1", "Clec4a2", "Clec7a", "Cmtm6", "Cmtm7", "Cmtm8", "Csf1r", "Csf3r", "Ctc1", "Cx3cr1", "Cytip", "Dhrs3", "Dock8", "Ebf3", "Edem1", "Elf1", "Elk3", "Ets1", "Fam105a", "Fam111a", "Fgd2", "Fli1", "Fmnl3", "Fosb", "Gimap6", "Gna15", "Gpr34", "H2-Aa", "H2-DMa", "H2-M3", "Hexb", "Hhex", "Hpgd", "Hpgds", "Hvcn1", "Ifitm6", "Il10ra", "Il10rb", "Il16", "Inpp5d", "Irf8", "Kctd12", "Klk8", "Lair1", "Laptm5", "Lcn2", "Lgmn", "Lpxn", "Lrba", "Lrmp", "Lrrk1", "Ltf", "Lyl1", "Lyz1", "Mafb", "Man2b1", "Mcm3", "Mfng", "Mpeg1", "Mylip", "Myo1g", "Naalad2", "Naip6", "Nfam1", "Nfatc1", "Ngp", "Nrip1", "Olfml3", "P2ry12", "Parvg", "Pik3cg", "Pld1", "Pld4", "Plxnb2", "Prkcd", "Psmb9", "Ptpn18", "Ptpn6", "Ptpre", "Pycard", "Rasa4", "Rbl1", "Rgs10", "Rps6ka1", "Rreb1", "S100a8", "S100a9", "Scamp2", "Selplg", "Slamf9", "Slc16a6", "Slc25a37", "Slc25a45", "Slc2a5", "Slc37a2", "Slc40a1", "Slc7a8", "Snx5", "Srpk3", "St3gal6", "Tcirg1", "Tec", "Tgfbi", "Tgfbr1", "Tgif1", "Themis2", "Tifa", "Tlr4", "Tmcc3", "Tmem119", "Tmem140", "Tmem37", "Tnfrsf1b", "Tnfsf13b", "Trem2", "Trim47", "Uba7", "Unc93b1", "Vamp8", "Vrk2"], "Oligo": ["Adamts4", "Anln", "Apod", "Aspa", "Cldn11", "Cryab", "Ctsk", "Ddc", "Elovl7", "Fa2h", "Gal3st1", "Gamt", "Gjb1", "Gltp", "Grb14", "Gsn", "Hapln2", "Josd2", "Lad1", "Lims2", "Lpar1", "Mag", "Mal", "Mbp", "Mcam", "Mobp", "Mog", "Ndrg1", "Nkain1", "Nkx2-2", "Nkx6-2", "Olig2", "Pdlim2", "Phldb1", "Plekhf1", "Plekhh1", "Pllp", "Plp1", "Ppp1r14a", "S1pr5", "Sept4", "Sgk2", "Slain1", "Slc44a1", "Sox10", "Thbs3", "Tmeff2", "Tmem163", "Tmem98", "Trim59", "Tspan2", "Ugt8a"], "Spiny": ["Actn2", "Arg2", "Arhgap20", "Arpp19", "Arpp21", "Atp2b2", "Baiap2", "Bcl11a", "Bcl11b", "Cacnb2", "Camk2b", "Camkv", "Cap2", "Ccsap", "Chn1", "Chst15", "Ckmt1", "Coch", "Dlx5", "Dmkn", "Dmtn", "Etl4", "Fgf14", "Foxp1", "Gabrd", "Gpr88", "Hpca", "Ido1", "Itpka", "Itpr1", "Kalrn", "Kcna5", "Kcnab1", "Kcnq5", "Krt12", "Lamp5", "Lmo7", "Meis2", "Myh7", "Myo5b", "Nefl", "Nefm", "Npas2", "Nrgn", "Nsg2", "Pcp4l1", "Pde10a", "Pde1b", "Pde2a", "Pde7b", "Pgam2", "Plk2", "Ppp1r1b", "Ptpn5", "Rab15", "Rab3c", "Rab40b", "Rarb", "Rbfox1", "Rbfox3", "Rerg", "Rgs8", "Rgs9", "Rin1", "Rxrg", "Scn2a", "Slc12a5", "Slc32a1", "Sowaha", "St8sia3", "Synpo", "Synpr", "Tmem158", "Usp29"] }, "Subependymal": { "Astrocyte": ["Aass", "Acsbg1", "Acsl6", "Adcy2", "Adhfe1", "Agt", "AI464131", "Aldh1l1", "Aox1", "Aqp4", "Atp1a2", "Atp1b2", "Axl", "Btbd17", "Cbs", "Ccdc80", "Cd38", "Cldn10", "Clu", "Col4a5", "Cth", "Cyp2d22", "Cyp2j9", "Cyp4f14", "Cyp4f15", "Cyp7b1", "Cyr61", "Dio2", "Dkk3", "Dmd", "Egfr", "Elovl2", "Emp2", "Entpd2", "Ephx2", "F3", "Fads2", "Fgf1", "Fgfr1", "Fgfr3", "Fjx1", "Fkbp10", "Fmo1", "Fzd2", "Gabrb1", "Gabrg1", "Gdf10", "Ghr", "Gjb2", "Gjb6", "Gldc", "Gli2", "Gpld1", "Grhl1", "Grin2c", "Hapln1", "Hsd11b1", "Igdcc4", "Igfbp2", "Itga7", "Itih5", "Kcnk1", "Kcnn2", "Lamb2", "Lcat", "Lhx2", "Lpp", "Lrig1", "Lrrk2", "Mlc1", "Nat8f4", "Ntsr2", "Papss2", "Pdgfrb", "Pdzph1", "Phkg1", "Pla2g7", "Ppara", "Ppic", "Prelp", "Prodh", "Pygb", "Pygm", "Rgs5", "Rorb", "S1pr1", "Scara3", "Scg3", "Slc14a1", "Slc15a2", "Slc1a2", "Slc1a3", "Slc1a4", "Slc38a3", "Slc41a1", "Slc4a4", "Slc7a10", "Slco1c1", "Smpdl3a", "Sorcs2", "Tfcp2l1", "Tgfb2", "Timp3", "Tlcd1", "Tlr3", "Tmem47", "Tmem51", "Tnfrsf19", "Tril", "Ttpa", "Vav3", "Vcam1", "Vcl", "Vegfa", "Wwtr1"], "Ependymal": ["Aspm", "Aurka", "Bcl11b", "Cacng5", "Ccr6", "Cd1d1", "Cd24a", "Cdc20", "Cdca7", "Celsr3", "Cenpe", "Cenpf", "Chd4", "Cplx2", "Csrp2", "D930015E06Rik", "Dcbld1", "Dcx", "Dlx1", "Dlx1as", "Dlx2", "Dlx5", "Elavl2", "Gad2", "Gdpd3", "Igfbpl1", "Isg20", "Kif2c", "Map1b", "Mis18bp1", "Mki67", "Myt1", "Ncaph", "Nrep", "Nusap1", "Rbfox2", "Rian", "Rnd3", "Shcbp1", "Slco5a1", "Sox11", "St8sia2", "Tiam2", "Tmsb10", "Tmtc4", "Top2a", "Ube2c", "Zcchc14", "Zfp704", "Zwilch"], "Microglia": ["1700017B05Rik", "Abhd15", "Acsl5", "Adap2", "Adgre1", "Akna", "Ankrd44", "Anxa3", "Arhgap45", "Arrb2", "AW112010", "C3ar1", "Casp1", "Casp8", "Ccl6", "Cd300c2", "Cd34", "Cd37", "Cd52", "Cd68", "Cfh", "Chil3", "Clec5a", "Clic1", "Coro1a", "Crybb1", "Ctsh", "Cttnbp2nl", "Cyba", "Cysltr1", "Dapp1", "Dock2", "Ebi3", "Ehd4", "Emp3", "Entpd1", "F11r", "Fcgr1", "Fcrl1", "Fes", "Fyb", "Gcnt1", "Ggta1", "Gmfg", "Gmip", "Golm1", "Gpsm3", "H2-Oa", "Havcr2", "Hcls1", "Hk2", "Hps4", "Ier5", "Igsf6", "Il13ra1", "Il21r", "Il6ra", "Il7r", "Irf5", "Itgb2", "Junb", "Klf6", "Lag3", "Lcp1", "Lgals9", "Ltc4s", "Ly96", "Lyn", "Mef2a", "Mlxipl", "Mrc1", "Myh9", "Myo7a", "Naip2", "Naip5", "Nrros", "Pald1", "Pdgfb", "Pf4", "Pik3cd", "Pla2g15", "Plcg2", "Plekho1", "Plxdc2", "Pon3", "Pros1", "Rassf5", "Rcsd1", "Rel", "Rgs19", "Sash3", "Serinc3", "Siglecf", "Sipa1", "Slc11a1", "Slc7a7", "Spata13", "Spi1", "Srgap2", "Stab1", "Stat6", "Stk26", "Tapbp", "Tbxas1", "Tfpi", "Tgfb1", "Tlr1", "Tm6sf1", "Tmc6", "Trim12a", "Trim34a", "Trpv2", "Vsir"], "Microglia_activation": ["B4galt1", "Birc3", "Casp4", "Ccl12", "Ccl2", "Ccl9", "Ccr5", "Cd86", "Cebpb", "Csf2rb2", "Ctla2b", "Cxcl10", "Cxcl16", "Cxcl2", "Fcer1g", "Fcgr2b", "Glipr1", "Gpr84", "Hck", "Hfe", "Hlx", "Ier3", "Ifi30", "Ifi35", "Il1a", "Il4ra", "Il6", "Irf9", "Klf10", "Lcp2", "Map3k8", "Mlph", "Mrc2", "Ms4a6b", "Ms4a6c", "Ms4a6d", "Myd88", "Ncf1", "Ncf2", "Ncf4", "Nfkbie", "Nfkbiz", "P2ry6", "Parp10", "Parp14", "Plaur", "Pmaip1", "Rab20", "Rab3il1", "Rac2", "Rhoh", "Rnf19b", "Rrad", "Runx1", "Samsn1", "Serpine1", "Sh2b2", "Slc15a3", "Slc39a8", "Smagp", "Socs3", "Spint1", "Syk", "Tgm2", "Tlr2", "Tlr7", "Tmem173", "Tnf", "Tnfaip2", "Tpp2", "Trim30a", "Tubb6", "Vav1", "Zfp36"], "Microglia_deactivation": ["Abcc3", "Adrb2", "Afp", "Aif1", "Ang", "Anxa1", "Arap3", "Arhgap17", "Arhgap4", "Arhgap9", "Arhgdib", "Batf3", "Btk", "Calhm2", "Camp", "Capn3", "Cd177", "Cd300a", "Cd33", "Cd48", "Cd79b", "Clcf1", "Clec4a2", "Clec7a", "Cmtm7", "Cmtm8", "Csf3r", "Ctc1", "Cytip", "Dock8", "Ebf3", "Edem1", "Elk3", "Ets1", "Fam105a", "Fam111a", "Fgd2", "Fli1", "Gimap6", "Gna15", "H2-Aa", "H2-DMa", "H2-M3", "Hhex", "Hpgd", "Hpgds", "Hvcn1", "Ifitm6", "Il10ra", "Il10rb", "Il16", "Inpp5d", "Kctd12", "Klk8", "Lair1", "Lcn2", "Lmo2", "Lpxn", "Lrmp", "Lrrk1", "Lst1", "Ltf", "Lyl1", "Mafb", "Man2b1", "Mfng", "Mylip", "Myo1g", "Naalad2", "Nfam1", "Npnt", "Parvg", "Pik3cg", "Plcl2", "Pld4", "Plxdc1", "Psmb9", "Ptpn18", "Ptpn6", "Rasa4", "Rps6ka1", "Slamf9", "Slc2a5", "Slc40a1", "Slc7a8", "Smap2", "Snx5", "St3gal6", "Tcirg1", "Tec", "Tgfbi", "Tgif1", "Themis2", "Tlr4", "Tmem140", "Tnfrsf1b", "Tnfsf13b", "Trem2", "Trim47", "Uba7", "Unc93b1", "Vamp8"], "Oligo": ["Acot7", "Ank3", "Anln", "Apod", "Aspa", "Cdk18", "Cldn11", "Ddc", "Dusp15", "Dusp26", "Ell2", "Elovl7", "Fa2h", "Gal3st1", "Gamt", "Gjb1", "Grb14", "Hapln2", "Josd2", "Kazn", "Kcna1", "Larp6", "Lims2", "Lpar1", "Mag", "Map4", "Mcam", "Mobp", "Mog", "Ndrg1", "Ninj2", "Nkx6-2", "Olig2", "Pdlim2", "Plekhh1", "Pllp", "Pou3f1", "Ppp1r14a", "Prkcz", "Rab33a", "S1pr5", "Sept4", "Sgk2", "Slain1", "Sox10", "Sytl2", "Tmeff2", "Tmem163", "Tnni1", "Tspan17", "Tspan2", "Tubb4a", "Wfdc18"] }, "SubstantiaNigra": { "Astrocyte": ["Abhd3", "Acsbg1", "Acsl6", "Acss1", "Adhfe1", "AI464131", "Aldh1l1", "Aox1", "Aqp4", "Bcan", "Btbd17", "Cbs", "Ccdc80", "Ccnd2", "Cd38", "Cldn10", "Clu", "Col4a5", "Cspg5", "Cth", "Cyp2d22", "Cyp2j9", "Cyp4f14", "Cyp4f15", "Cyp7b1", "Cyr61", "Dtna", "Egfr", "Elovl2", "Emp2", "Entpd2", "Ephx2", "Eva1a", "Ezr", "F3", "Fgd6", "Fgfr3", "Fjx1", "Fkbp10", "Fmo1", "Fzd2", "Gdf10", "Gjb6", "Gldc", "Gli2", "Grin2c", "Hsd11b1", "Igfbp2", "Itga7", "Itih5", "Kcnn2", "Klf15", "Lcat", "Lhx2", "Lmcd1", "Lpp", "Lxn", "Nat8f4", "Ndp", "Notch1", "Ntsr2", "Oaf", "Papss2", "Pax6", "Pbxip1", "Pdzph1", "Phkg1", "Pla2g7", "Plpp3", "Ppara", "Ppp1r3c", "Prelp", "Prkd1", "Prodh", "Ptprz1", "Rorb", "Scara3", "Scg3", "Slc14a1", "Slc15a2", "Slc1a3", "Slc38a3", "Slc41a1", "Slc7a10", "Slco1c1", "Smpdl3a", "Sorcs2", "Tfcp2l1", "Tlcd1", "Tnfrsf19", "Tril", "Trps1", "Ttpa", "Vcam1", "Vcl", "Vegfa", "Wnt7a", "Wwtr1"], "Dopaminergic": ["Adcyap1", "Atp2b2", "Cacna2d2", "Cadps2", "Calb2", "Cd200", "Cdk5r2", "Celf4", "Cers4", "Chga", "Chgb", "Chrna6", "Clstn2", "Cntnap2", "Cplx1", "Cyb561", "Dlk1", "Dpp6", "Elavl2", "Eno2", "Epb41l1", "Gabrg2", "Grb10", "Kcnab2", "Klhl1", "Lin7b", "Mapk8ip2", "Napb", "Nr4a2", "Nrip3", "Nsg2", "Ntng1", "Pcbp3", "Pcsk1", "Prkcg", "Resp18", "Ret", "Rgs8", "Rian", "Rnf157", "Scg2", "Scn1a", "Scn2a", "Slc12a5", "Slc4a10", "Slc6a17", "Slc6a3", "Sms", "Sncg", "Snhg11", "Spint2", "Spock1", "Syt4", "Tacr3", "Tenm1", "Th", "Usp29", "Zim3"], "Microglia": ["1700017B05Rik", "Abhd15", "Adap2", "Adgre1", "Akna", "Alas2", "Alox5ap", "Ankrd44", "Anxa3", "Arhgap45", "Arrb2", "AW112010", "C1qc", "C3ar1", "Casp1", "Casp8", "Ccl3", "Ccl6", "Ccrl2", "Cd300c2", "Cd34", "Cd37", "Cd52", "Cd68", "Cfh", "Chil3", "Clec5a", "Clic1", "Crybb1", "Ctsh", "Ctss", "Ctsz", "Cttnbp2nl", "Cyba", "Cysltr1", "D17H6S56E-5", "Dapp1", "Dnajb1", "Dock2", "Ebi3", "Emp3", "Entpd1", "Erap1", "F11r", "Fcgr1", "Fcrl1", "Fcrls", "Fermt3", "Fes", "Fyb", "Gcnt1", "Ggta1", "Gmfg", "Gmip", "Golm1", "Gpsm3", "Grn", "Gusb", "H2-Ab1", "H2-K1", "H2-Oa", "Havcr2", "Hcls1", "Herpud1", "Hk2", "Hp", "Hps4", "Ier2", "Ier5", "Ifngr1", "Igsf6", "Il13ra1", "Il21r", "Il6ra", "Il7r", "Irf5", "Itgb2", "Junb", "Klf2", "Klf6", "Lag3", "Lcp1", "Lgals3", "Lgals9", "Ltc4s", "Ly86", "Ly96", "Lyn", "Mef2a", "Mlxipl", "Mrc1", "Msn", "Myo1b", "Myo7a", "Naip2", "Naip5", "Nckap1l", "Nrros", "Pald1", "Pdgfb", "Pf4", "Phyhd1", "Pik3cd", "Pla2g15", "Plcg2", "Plekho1", "Plxdc2", "Pon3", "Ppp1r15a", "Prkab1", "Pros1", "Ptgr1", "Ptgs1", "Ptprc", "Rassf5", "Rcsd1", "Rel", "Rgs1", "Rgs19", "Rnase4", "Sash3", "Siglecf", "Sipa1", "Slc11a1", "Slc7a7", "Snord22", "Spata13", "Spi1", "Srgap2", "Srsf7", "Stab1", "Stat6", "Stk26", "Tbxas1", "Tcn2", "Tgfb1", "Tgfbr2", "Tlr1", "Tm6sf1", "Tmc6", "Tor4a", "Trim12a", "Trim34a", "Tyrobp", "Vsir"], "Microglia_activation": ["B4galt1", "Birc3", "C1qa", "C1qb", "Casp4", "Ccl12", "Ccl2", "Ccl4", "Ccl9", "Ccnl1", "Ccr5", "Cd14", "Cd53", "Cd83", "Cd86", "Cebpb", "Cep152", "Csf2rb2", "Ctla2b", "Cxcl10", "Cxcl16", "Cxcl2", "Egr2", "Fcer1g", "Fcgr2b", "Fcgr3", "Frrs1", "Glipr1", "Gpr84", "Hck", "Hfe", "Hlx", "Icam1", "Ier3", "Ifi30", "Ifi35", "Il1a", "Il1b", "Il4ra", "Il6", "Irf9", "Isg20", "Klf10", "Lcp2", "Lrrfip1", "Map3k8", "Mcl1", "Mlph", "Mlxip", "Ms4a6b", "Ms4a6c", "Ms4a6d", "Myd88", "Ncf1", "Ncf2", "Ncf4", "Nfkbia", "Nfkbie", "Nfkbiz", "Npl", "P2ry6", "Parp10", "Parp14", "Plaur", "Plek", "Pmaip1", "Rab20", "Rab3il1", "Rac2", "Rhoh", "Rrad", "Runx1", "Samsn1", "Serpine1", "Sertad1", "Sh2b2", "Sla", "Slc15a3", "Smagp", "Socs3", "Spint1", "Srgn", "Syk", "Tlr2", "Tlr6", "Tlr7", "Tmem173", "Tnf", "Tnfaip2", "Tpp2", "Trim30a", "Tsc22d3", "Tubb6", "Ucp2", "Vav1", "Zfp36"], "Microglia_deactivation": ["Abcc3", "Adrb1", "Adrb2", "Afp", "Aif1", "Ang", "Arap3", "Arhgap17", "Arhgap4", "Arhgap9", "Arhgdib", "Atf3", "Batf3", "Blnk", "Btk", "Calhm2", "Camp", "Capn3", "Cd177", "Cd300a", "Cd33", "Cd48", "Cd79b", "Cebpa", "Clcf1", "Clec4a2", "Clec7a", "Cmtm7", "Csf3r", "Ctc1", "Cx3cr1", "Cytip", "Dock8", "Edem1", "Elk3", "Ets1", "Fam105a", "Fam111a", "Fgd2", "Fli1", "Fosb", "Gimap6", "Gna15", "Gpr34", "Gtf2h2", "H2-Aa", "H2-DMa", "H2-M3", "Hexb", "Hhex", "Hpgd", "Hpgds", "Hvcn1", "Ifitm6", "Il10ra", "Il10rb", "Il16", "Inpp5d", "Irf8", "Kctd12", "Klk8", "Lair1", "Lcn2", "Lgmn", "Lmo2", "Lpxn", "Lrba", "Lrmp", "Lrrk1", "Lsp1", "Lst1", "Ltf", "Lyl1", "Lyz1", "Mafb", "Man2b1", "Mfng", "Mpeg1", "Mylip", "Myo1g", "Naalad2", "Nfam1", "Ngp", "Nrip1", "Olfml3", "P2ry12", "Parvg", "Pik3cg", "Plcl2", "Pld4", "Plxdc1", "Prkcd", "Psmb9", "Ptpn18", "Ptpn6", "Pycard", "Rasa4", "Rgs10", "Rps6ka1", "S100a8", "S100a9", "Selplg", "Slamf9", "Slc16a6", "Slc2a5", "Slc37a2", "Slc40a1", "Slc7a8", "Snx5", "St3gal6", "Tcirg1", "Tec", "Tgfbi", "Tgfbr1", "Tgif1", "Themis2", "Tifa", "Tlr4", "Tmcc3", "Tmem119", "Tmem140", "Tnfrsf1b", "Tnfsf13b", "Trem2", "Trim47", "Uba7", "Unc93b1", "Vamp8", "Vrk2"], "Oligo": ["Adssl1", "Anln", "Ell2", "Gal3st1", "Gamt", "Gjb1", "Grb14", "Hist3h2ba", "Josd2", "Lims2", "Mog", "Olig2", "Pdlim2", "Plekhh1", "Ppp1r14a", "Rab33a", "Tnni1", "Trim59", "Tspan2"] }, "Thalamus": { "Astrocyte": ["Aass", "Acaa2", "Acsbg1", "Acsl6", "Add3", "Adhfe1", "Adora2b", "Agl", "AI464131", "Ak4", "Aldh1l1", "Amot", "Antxr1", "Aox1", "Aqp4", "Atp1a2", "Atp1b2", "Axl", "Btbd17", "Cbs", "Ccdc80", "Ccdc88a", "Ccnd2", "Cd38", "Cldn10", "Clu", "Col4a5", "Csgalnact1", "Cspg5", "Cth", "Cyp2d22", "Cyp2j9", "Cyp4f14", "Cyp4f15", "Cyp7b1", "Cyr61", "Dag1", "Dclk1", "Dio2", "Dkk3", "Dtna", "Ednrb", "Egfr", "Elovl2", "Emp2", "Entpd2", "Ephx2", "Eva1a", "Ezr", "F3", "Fads2", "Farp1", "Fbln1", "Fgd6", "Fgfr1", "Fgfr3", "Fgfrl1", "Fjx1", "Fkbp10", "Fmo1", "Fxyd1", "Fzd2", "Fzd4", "Gabrg1", "Gdf10", "Gjb2", "Gjb6", "Gldc", "Gli2", "Gpld1", "Grin2c", "Hapln1", "Hsd11b1", "Igdcc4", "Igfbp2", "Igfbp5", "Itga7", "Itih5", "Itsn1", "Klf15", "Lamb2", "Lcat", "Lgi4", "Lmcd1", "Lpp", "Lrig1", "Lrp4", "Mfge8", "Mlc1", "Myo10", "Myo6", "Nat8f4", "Ncan", "Ndp", "Nfib", "Nhsl1", "Nkain4", "Notch1", "Nrarp", "Ntrk2", "Ntsr2", "Oaf", "Oplah", "Papss2", "Pax6", "Pbxip1", "Pdgfrb", "Pdk4", "Pdlim5", "Pdzph1", "Phka1", "Phkg1", "Pla2g7", "Ppara", "Ppic", "Ppp1r3c", "Prelp", "Prodh", "Ptprz1", "Pygb", "Rgs5", "S1pr1", "Sash1", "Scara3", "Scg3", "Sdc4", "Serhl", "Serpinh1", "Slc12a4", "Slc14a1", "Slc15a2", "Slc1a2", "Slc1a3", "Slc1a4", "Slc38a3", "Slc41a1", "Slc4a4", "Slc7a10", "Slco1c1", "Smpdl3a", "Soat1", "Sorcs2", "Sox9", "Sparcl1", "Tfcp2l1", "Timp3", "Tlcd1", "Tmem47", "Tmem51", "Tnfrsf19", "Tril", "Trps1", "Ttpa", "Vcam1", "Vcl", "Vegfa", "Wnt7a", "Wwtr1"], "GabaReln": ["6430548M08Rik", "Adgrb1", "AF357355", "Arg2", "Arhgap20", "Cacna1d", "Cacna1g", "Cacna2d2", "Cacng2", "Cadm3", "Cda", "Cdhr1", "Chrna6", "Cplx3", "Gabrr1", "Gabrr2", "Gad2", "Gata3", "Gria1", "Hcn1", "Igf1", "Kcnc1", "Kcnmb2", "Lgr5", "Lhx1", "Lmo1", "Meg3", "Nr2f2", "Nsf", "Otx2", "Parm1", "Pcbp3", "Pcdh20", "Pcdhb21", "Pclo", "Pnoc", "Ppargc1b", "Ptprt", "Reln", "Rpp25", "Ryr3", "Scgn", "Sez6", "Slc2a3", "Slc4a10", "Slc6a17", "Snhg11", "Ssbp2", "Tacr3", "Tal1", "Tenm2", "Tnnt1", "Uncx"], "Hypocretinergic": ["2010005H15Rik", "Arhgdig", "Avpr1a", "Cacng3", "Cckar", "Cdh9", "Cgref1", "Cidea", "Crhr2", "Dlk1", "Doc2b", "Gch1", "Gck", "Gpx3", "Hap1", "Hcrt", "Hmx2", "Hspb3", "Igfbp3", "Kcna5", "Kcnip4", "Lor", "Mal2", "Ngb", "Nts", "Ntsr1", "Pcsk1", "Pdyn", "Rab3b", "Rhov", "Rspo1", "S100a10", "Slc6a3", "Spint2", "Trhr"], "Microglia": ["1700017B05Rik", "Abhd15", "Adap2", "Adgre1", "Akna", "Alas2", "Alox5ap", "Ankrd44", "Anxa3", "Apobec1", "Arhgap45", "Arrb2", "AW112010", "B2m", "C1qc", "C3ar1", "Casp1", "Casp8", "Ccl3", "Ccl6", "Ccrl2", "Cd300c2", "Cd34", "Cd37", "Cd52", "Cd68", "Cfh", "Chil3", "Cklf", "Clec5a", "Clic1", "Coro1a", "Crybb1", "Ctsh", "Ctss", "Ctsz", "Cttnbp2nl", "Cyba", "Cysltr1", "D17H6S56E-5", "Dapp1", "Dnajb1", "Dock2", "Ebi3", "Emp3", "Entpd1", "Erap1", "F11r", "Fcgr1", "Fcrl1", "Fcrls", "Fermt3", "Fes", "Fyb", "Gcnt1", "Ggta1", "Gmfg", "Gmip", "Golm1", "Gpsm3", "Grn", "Gusb", "H2-Ab1", "H2-K1", "H2-Oa", "Hacd4", "Havcr2", "Hcls1", "Hk2", "Hp", "Hps4", "Ier2", "Ier5", "Ifngr1", "Igsf6", "Il13ra1", "Il21r", "Il6ra", "Il7r", "Irf5", "Irgm2", "Itgb2", "Junb", "Klf2", "Klf6", "Lag3", "Lcp1", "Lgals9", "Ltc4s", "Ly86", "Ly96", "Lyn", "Mef2a", "Mlxipl", "Mrc1", "Msn", "Myh9", "Myo1b", "Myo7a", "Naip2", "Naip5", "Nckap1l", "Nrros", "Pald1", "Pdgfb", "Pf4", "Phxr1", "Phyhd1", "Pik3cd", "Pla2g15", "Plcg2", "Plekho1", "Plxdc2", "Pon3", "Ppp1r15a", "Prkab1", "Pros1", "Ptbp3", "Ptgr1", "Ptgs1", "Ptprc", "Rassf5", "Rbm39", "Rcsd1", "Rel", "Rgs1", "Rin2", "Rnase4", "Sash3", "Serinc3", "Siglecf", "Sipa1", "Skap2", "Slc11a1", "Slc7a7", "Snord22", "Spata13", "Spi1", "Srgap2", "Srsf7", "Stab1", "Stat6", "Stk26", "Tbxas1", "Tcn2", "Tgfb1", "Tgfbr2", "Tlr1", "Tm6sf1", "Tmc6", "Tob2", "Tor4a", "Trim12a", "Trim34a", "Tyrobp", "Vsir", "Zfhx3"], "Microglia_activation": ["Asxl1", "Atp7a", "B4galt1", "Birc3", "C1qa", "C1qb", "Casp4", "Ccl12", "Ccl2", "Ccl4", "Ccl9", "Ccnl1", "Ccr5", "Cd14", "Cd53", "Cd83", "Cd86", "Cebpb", "Cep152", "Chst7", "Csf2rb2", "Ctla2b", "Cxcl10", "Cxcl16", "Cxcl2", "Egr2", "Fcer1g", "Fcgr2b", "Fcgr3", "Frrs1", "Gcnt2", "Glipr1", "Gpr84", "Hck", "Hfe", "Hlx", "Icam1", "Ier3", "Ifi30", "Ifi35", "Ifih1", "Il17ra", "Il1a", "Il1b", "Il4ra", "Il6", "Irf9", "Isg20", "Jmjd1c", "Klf10", "Lcp2", "Lrrfip1", "Map3k8", "Mcl1", "Mlph", "Mlxip", "Mrc2", "Ms4a6b", "Ms4a6c", "Ms4a6d", "Myd88", "Ncf1", "Ncf2", "Ncf4", "Nfkbia", "Nfkbie", "Nfkbiz", "Npl", "P2ry6", "Parp10", "Parp14", "Parp9", "Per1", "Plaur", "Plek", "Pmaip1", "Rab20", "Rab3il1", "Rac2", "Rela", "Rhoh", "Ripk1", "Rnasel", "Rnf19b", "Runx1", "Samsn1", "Serpine1", "Sh2b2", "Sla", "Slc15a3", "Slc39a8", "Smagp", "Snx18", "Socs3", "Spint1", "Srgn", "Syk", "Tgm2", "Tlr2", "Tlr6", "Tlr7", "Tmem173", "Tnf", "Tpp2", "Trim30a", "Tsc22d3", "Tspo", "Tubb6", "Ucp2", "Usp2", "Vav1", "Zfp36"], "Microglia_deactivation": ["2810474O19Rik", "Abcc3", "Adcy7", "Adrb1", "Adrb2", "Afp", "Aif1", "Ang", "Anxa1", "Arap3", "Arhgap17", "Arhgap4", "Arhgap9", "Arhgdib", "Atf3", "Batf3", "Blnk", "Btk", "Calhm2", "Camp", "Capn3", "Cd177", "Cd300a", "Cd33", "Cd48", "Cd79b", "Cebpa", "Clcf1", "Clec4a2", "Clec7a", "Cmtm6", "Cmtm7", "Csf1r", "Csf3r", "Ctc1", "Cx3cr1", "Daglb", "Dock8", "Edem1", "Elf1", "Elk3", "Ets1", "Fam105a", "Fam111a", "Fgd2", "Fli1", "Gimap6", "Gna15", "Gpr34", "H2-Aa", "H2-DMa", "H2-M3", "Hexb", "Hhex", "Hpgd", "Hpgds", "Hspa1a", "Hvcn1", "Ifitm6", "Il10ra", "Il10rb", "Il16", "Inpp5d", "Irf8", "Kctd12", "Klk8", "Lair1", "Laptm5", "Lcn2", "Lgmn", "Lpxn", "Lrba", "Lrmp", "Lrrk1", "Ltf", "Lyl1", "Lyz1", "Mafb", "Man2b1", "Mcm3", "Mfng", "Mpeg1", "Mylip", "Myo1g", "Naalad2", "Naip6", "Ngp", "Npnt", "Nrip1", "Olfml3", "P2ry12", "Parvg", "Pik3cg", "Plcl2", "Pld1", "Pld4", "Plxdc1", "Psmb9", "Ptpn18", "Ptpn6", "Pycard", "Rasa4", "Rps6ka1", "S100a8", "S100a9", "Scamp2", "Selplg", "Slamf9", "Slc16a6", "Slc25a37", "Slc25a45", "Slc2a5", "Slc37a2", "Slc40a1", "Slc7a8", "Snx5", "St3gal6", "Tcirg1", "Tec", "Tgfbi", "Tgfbr1", "Tgif1", "Themis2", "Tifa", "Tlr4", "Tmcc3", "Tmem119", "Tmem140", "Tnfrsf1b", "Tnfsf13b", "Trem2", "Trim47", "Uba7", "Unc93b1", "Vamp8", "Vrk2"], "Oligo": ["Adamts4", "Anln", "Apod", "Aspa", "Cldn11", "Elovl7", "Fa2h", "Gal3st1", "Gamt", "Gjb1", "Gng11", "Gsn", "Hapln2", "Josd2", "Kazn", "Lims2", "Lpar1", "Mag", "Mobp", "Mog", "Nkx6-2", "Olig2", "Pdlim2", "Plekhh1", "Pllp", "Ppp1r14a", "S1pr5", "Sept4", "Sgk2", "Slain1", "Slc44a1", "Sox10", "Tmem163", "Tmem98", "Trim59"], "ThalamusCholin": ["2310030G06Rik", "C130026I21Rik", "Cacnb3", "Cadps2", "Chrna3", "Cxcl11", "Cytip", "Ebf1", "Grip1", "Htr5b", "Irx2", "Irx3", "Irx5", "Kcnip1", "Kcnma1", "Kitl", "Lrrc3b", "Mab21l1", "Map3k6", "Mme", "Myh7", "Necab3", "Neurod1", "Nppa", "Nr4a2", "Pde2a", "Sema3e", "Sh3bgrl2", "Slc18a3", "Sncg", "Socs2", "Sostdc1", "Spa17", "Sstr2", "Tac2", "Tcf7", "Tex15", "Tnfaip2", "Tyrp1", "Zic4"] } }