#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT
chr1	20133785	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=38;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=38;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=13;IC=14;IHP=15;SomaticEVS=10.56	.
chr1	27527459	.	AG	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=79;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=79;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=G;RC=5;IC=4;IHP=5;SomaticEVS=17.27	.
chr1	34079318	.	ACTTTTATT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=75;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=75;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=CTTTTATT;RC=1;IC=0;IHP=6;SomaticEVS=17.22	.
chr1	35866431	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=64;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=64;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=8;IC=9;IHP=16;SomaticEVS=12.99	.
chr1	38775259	.	CTA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=43;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=43;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TA;RC=2;IC=1;IHP=2;SomaticEVS=17.28	.
chr1	43009678	.	G	GA	.	PASS	SOMATIC;QSI=78;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=78;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=9;IC=10;IHP=10;SomaticEVS=15.51	.
chr1	48353434	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=85;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=85;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=12;IC=11;IHP=12;SomaticEVS=10.94	.
chr1	63721695	.	TCTGAAGTCACAACC	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=68;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=68;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=CTGAAGTCACAACC;RC=1;IC=0;IHP=3;SomaticEVS=16.27	.
chr1	69142435	.	A	AG	.	PASS	SOMATIC;QSI=37;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=37;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=G;RC=0;IC=1;IHP=2;SomaticEVS=16.7	.
chr1	79562291	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=73;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=73;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=3;IC=2;IHP=4;SomaticEVS=17.27	.
chr1	89466840	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=66;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=66;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=8;IC=7;IHP=8;SomaticEVS=17.27	.
chr1	90295052	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=70;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=70;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=1;IC=0;IHP=3;SomaticEVS=17.21	.
chr1	90782882	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=91;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=91;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=5;IC=4;IHP=6;SomaticEVS=16.96	.
chr1	94127467	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=105;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=105;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=2;IC=1;IHP=4;SomaticEVS=17.27	.
chr1	94905542	.	TTCTTGATCC	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=99;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=99;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TCTTGATCC;RC=1;IC=0;IHP=4;SomaticEVS=17.22	.
chr1	101044784	.	GT	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=79;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=79;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=5;IC=4;IHP=7;SomaticEVS=17.27	.
chr1	101254661	.	CG	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=61;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=61;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=G;RC=2;IC=1;IHP=2;SomaticEVS=17.27	.
chr1	102998372	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=51;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=51;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=10;IC=9;IHP=11;SomaticEVS=15	.
chr1	110154263	.	T	TA	.	PASS	SOMATIC;QSI=102;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=102;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=2;IC=3;IHP=5;SomaticEVS=17.27	.
chr1	111569480	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=48;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=48;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=2;IC=3;IHP=2;SomaticEVS=17.27	.
chr1	112992378	.	CAA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=57;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=57;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=58.53;MQ0=2;RU=A;RC=17;IC=15;IHP=17;SomaticEVS=7.93	.
chr1	113219512	.	G	GA	.	PASS	SOMATIC;QSI=57;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=57;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=1;IC=2;IHP=3;SomaticEVS=17.27	.
chr1	113239414	.	ATATCCAGCTT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=70;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=70;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.77;MQ0=0;RU=TATCCAGCTT;RC=1;IC=0;IHP=4;SomaticEVS=17.22	.
chr1	116841339	.	G	GC	.	PASS	SOMATIC;QSI=89;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=89;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=59.75;MQ0=0;RU=C;RC=0;IC=1;IHP=2;SomaticEVS=16.59	.
chr1	118453625	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=41;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=41;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.76;MQ0=0;RU=A;RC=15;IC=14;IHP=16;SomaticEVS=10.33	.
chr1	124960726	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=127;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=126;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.27;MQ0=1;RU=A;RC=1;IC=2;IHP=5;SomaticEVS=17.27	.
chr1	196910171	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=120;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=118;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.51;MQ0=1;RU=A;RC=11;IC=10;IHP=14;SomaticEVS=11.27	.
chr1	234613196	.	CAG	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=149;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=148;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=AG;RC=1;IC=0;IHP=2;SomaticEVS=17.22	.
chr1	241305528	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=158;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=151;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.6;MQ0=1;RU=T;RC=16;IC=15;IHP=17;SomaticEVS=9.61	.
chr2	4311187	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=74;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=74;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=59.8;MQ0=0;RU=T;RC=15;IC=14;IHP=18;SomaticEVS=9.6	.
chr2	9521006	.	GTT	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=29;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=29;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=54.29;MQ0=9;RU=T;RC=5;IC=3;IHP=10;SomaticEVS=12.57	.
chr2	47459223	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=44;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=44;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=10;IC=11;IHP=10;SomaticEVS=13.96	.
chr2	51739324	.	T	TA	.	PASS	SOMATIC;QSI=71;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=71;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=8;IC=9;IHP=11;SomaticEVS=16.28	.
chr2	52944281	.	AAATTTAT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=95;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=95;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=AATTTAT;RC=1;IC=0;IHP=5;SomaticEVS=17.22	.
chr2	58581181	.	CCA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=44;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=44;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=CA;RC=2;IC=1;IHP=3;SomaticEVS=17.28	.
chr2	59307405	.	CTG	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=55;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=55;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TG;RC=1;IC=0;IHP=2;SomaticEVS=17.22	.
chr2	66055973	.	CTG	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=82;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=82;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TG;RC=1;IC=0;IHP=3;SomaticEVS=17.22	.
chr2	71467540	.	TTC	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=81;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=81;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TC;RC=1;IC=0;IHP=4;SomaticEVS=17.22	.
chr2	86415585	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=81;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=81;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=12;IC=13;IHP=13;SomaticEVS=10.35	.
chr2	88471711	.	TTTATGATTC	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=60;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=60;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TTATGATTC;RC=1;IC=0;IHP=8;SomaticEVS=17.22	.
chr2	93313251	.	ACT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=58;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=58;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=27.03;MQ0=34;RU=CT;RC=2;IC=1;IHP=6;SomaticEVS=15.56	.
chr2	96200092	.	G	GT	.	PASS	SOMATIC;QSI=72;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=72;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=9;IC=10;IHP=12;SomaticEVS=13.36	.
chr2	101691772	.	T	TA	.	PASS	SOMATIC;QSI=68;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=68;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.51;MQ0=0;RU=A;RC=11;IC=12;IHP=11;SomaticEVS=6.86	.
chr2	103499247	.	G	GT	.	PASS	SOMATIC;QSI=72;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=72;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=12;IC=13;IHP=12;SomaticEVS=10.64	.
chr2	103901133	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=86;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=86;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=1;IC=0;IHP=2;SomaticEVS=17.21	.
chr2	104334800	.	TC	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=77;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=77;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=C;RC=2;IC=1;IHP=7;SomaticEVS=9.36	.
chr2	107748817	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=82;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=82;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=6;IC=5;IHP=12;SomaticEVS=14.22	.
chr2	121271200	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=74;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=74;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=58.89;MQ0=2;RU=A;RC=13;IC=12;IHP=19;SomaticEVS=9.97	.
chr2	126867224	.	CACAT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=29;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=29;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=ACAT;RC=3;IC=2;IHP=2;SomaticEVS=6.08	.
chr2	136106387	.	GT	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=68;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=68;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.77;MQ0=0;RU=T;RC=15;IC=14;IHP=17;SomaticEVS=9.71	.
chr2	147003494	.	CA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=62;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=62;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=5;IC=4;IHP=6;SomaticEVS=17.27	.
chr2	154597824	.	CA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=70;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=70;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=17;IC=16;IHP=17;SomaticEVS=7.53	.
chr2	156789827	.	CA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=122;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=122;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.94;MQ0=0;RU=A;RC=3;IC=2;IHP=6;SomaticEVS=17.27	.
chr2	168773048	.	ATTG	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=100;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=100;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TTG;RC=1;IC=0;IHP=5;SomaticEVS=17.22	.
chr2	172142431	.	TTC	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=70;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=70;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TC;RC=1;IC=0;IHP=7;SomaticEVS=17.22	.
chr2	183949123	.	GTAACTAGTAATCTATGAAACAAAGCATAACATCAAAT	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=75;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=75;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TAACTAGTAATCTATGAAACAAAGCATAACATCAAAT;RC=1;IC=0;IHP=3;SomaticEVS=17.22	.
chr2	187795006	.	AG	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=93;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=93;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.97;MQ0=0;RU=G;RC=1;IC=0;IHP=4;SomaticEVS=17.21	.
chr2	205928828	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=91;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=91;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=59.6;MQ0=1;RU=T;RC=6;IC=7;IHP=10;SomaticEVS=17.27	.
chr2	207685326	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=76;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=76;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.79;MQ0=0;RU=T;RC=17;IC=16;IHP=18;SomaticEVS=7.35	.
chr2	213708795	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=73;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=73;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.67;MQ0=1;RU=A;RC=6;IC=5;IHP=6;SomaticEVS=17.27	.
chr2	221498618	.	G	GT	.	PASS	SOMATIC;QSI=33;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=33;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=11;IC=12;IHP=12;SomaticEVS=11.6	.
chr2	239540723	.	GC	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=67;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=67;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=C;RC=1;IC=0;IHP=6;SomaticEVS=17.21	.
chr3	3754436	.	TAAG	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=104;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=104;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=AAG;RC=1;IC=0;IHP=4;SomaticEVS=17.22	.
chr3	7532875	.	T	TA	.	PASS	SOMATIC;QSI=85;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=85;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=59.7;MQ0=0;RU=A;RC=15;IC=16;IHP=16;SomaticEVS=9.67	.
chr3	7734257	.	GT	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=67;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=67;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=3;IC=2;IHP=14;SomaticEVS=13.18	.
chr3	8329832	.	CTG	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=58;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=58;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.55;MQ0=0;RU=TG;RC=1;IC=0;IHP=3;SomaticEVS=17.22	.
chr3	12632737	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=97;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=97;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=4;IC=5;IHP=5;SomaticEVS=17.27	.
chr3	15207298	.	T	TA	.	PASS	SOMATIC;QSI=65;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=65;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=10;IC=11;IHP=11;SomaticEVS=13.38	.
chr3	44481165	.	A	ATTTATTTATTTATTTATTTATTTC	.	PASS	SOMATIC;QSI=81;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=81;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=58.4;MQ0=0;RU=TTTATTTATTTATTTATTTATTTC;RC=0;IC=1;IHP=6;SomaticEVS=16.61	.
chr3	44495107	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=35;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=35;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=59.6;MQ0=1;RU=A;RC=11;IC=12;IHP=12;SomaticEVS=11.57	.
chr3	70285014	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=85;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=85;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=58.94;MQ0=3;RU=T;RC=7;IC=6;IHP=13;SomaticEVS=13.57	.
chr3	71875665	.	CTGTTATCCTCTGGATCACA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=66;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=66;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TGTTATCCTCTGGATCACA;RC=1;IC=0;IHP=6;SomaticEVS=17.22	.
chr3	75091976	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=81;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=81;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=57.83;MQ0=0;RU=T;RC=10;IC=9;IHP=13;SomaticEVS=13.24	.
chr3	78105741	.	GT	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=69;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=69;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.84;MQ0=0;RU=T;RC=17;IC=16;IHP=17;SomaticEVS=7.46	.
chr3	78241203	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=36;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=36;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.77;MQ0=0;RU=A;RC=8;IC=7;IHP=9;SomaticEVS=16.97	.
chr3	78264125	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=78;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=78;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=10;IC=9;IHP=12;SomaticEVS=13.56	.
chr3	106011061	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=72;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=72;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=4;IC=3;IHP=6;SomaticEVS=17.27	.
chr3	115497119	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=65;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=65;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=15;IC=16;IHP=15;SomaticEVS=9.71	.
chr3	125677845	.	CCA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=28;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=28;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=57.25;MQ0=0;RU=CA;RC=6;IC=5;IHP=4;SomaticEVS=16.27	.
chr3	141453963	.	T	TA	.	PASS	SOMATIC;QSI=80;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=80;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=6;IC=7;IHP=8;SomaticEVS=17.27	.
chr3	164777832	.	AG	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=71;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=71;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=G;RC=1;IC=0;IHP=4;SomaticEVS=17.21	.
chr3	173408911	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=76;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=76;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=59.9;MQ0=0;RU=A;RC=16;IC=17;IHP=18;SomaticEVS=9.12	.
chr3	178492617	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=66;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=66;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=1;IC=0;IHP=3;SomaticEVS=17.21	.
chr3	178492617	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=66;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=66;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=1;IC=0;IHP=3;SomaticEVS=17.21	.
chr3	181960435	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=81;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=81;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=14;IC=13;IHP=14;SomaticEVS=9.97	.
chr3	191876071	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=35;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=35;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.93;MQ0=0;RU=A;RC=12;IC=11;IHP=13;SomaticEVS=11.39	.
chr3	193523304	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=65;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=65;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=59.52;MQ0=0;RU=A;RC=13;IC=14;IHP=13;SomaticEVS=10.07	.
chr4	521203	.	T	TC	.	PASS	SOMATIC;QSI=115;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=115;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=C;RC=0;IC=1;IHP=3;SomaticEVS=16.59	.
chr4	15071360	.	TCTTCTTAAGTAATTTCATTTCCTTGAAATGAAATTACTTAAGAA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=80;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=80;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=CTTCTTAAGTAATTTCATTTCCTTGAAATGAAATTACTTAAGAA;RC=1;IC=0;IHP=4;SomaticEVS=17.22	.
chr4	21093688	.	TC	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=85;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=85;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=C;RC=1;IC=0;IHP=7;SomaticEVS=9.41	.
chr4	30186857	.	CA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=62;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=62;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.77;MQ0=0;RU=A;RC=10;IC=9;IHP=10;SomaticEVS=15.51	.
chr4	30889061	.	G	GTCCC	.	PASS	SOMATIC;QSI=40;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=40;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=58.56;MQ0=0;RU=TCCC;RC=1;IC=2;IHP=3;SomaticEVS=17.31	.
chr4	38439802	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=75;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=75;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.51;MQ0=0;RU=A;RC=10;IC=9;IHP=12;SomaticEVS=13.62	.
chr4	41843327	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=51;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=51;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=59.58;MQ0=1;RU=A;RC=9;IC=10;IHP=15;SomaticEVS=12.62	.
chr4	59928290	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=41;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=41;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.69;MQ0=0;RU=A;RC=17;IC=16;IHP=17;SomaticEVS=8.01	.
chr4	62514085	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=70;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=70;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.59;MQ0=1;RU=T;RC=7;IC=6;IHP=7;SomaticEVS=17.27	.
chr4	62778123	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=83;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=83;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=6;IC=7;IHP=6;SomaticEVS=17.27	.
chr4	88974270	.	TG	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=55;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=55;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=G;RC=4;IC=3;IHP=4;SomaticEVS=17.27	.
chr4	99339045	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=56;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=56;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=9;IC=10;IHP=10;SomaticEVS=15.51	.
chr4	99339045	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=56;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=56;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=9;IC=10;IHP=10;SomaticEVS=15.51	.
chr4	102972784	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=99;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=99;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=6;IC=7;IHP=6;SomaticEVS=17.27	.
chr4	105567138	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=70;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=70;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=6;IC=7;IHP=6;SomaticEVS=17.27	.
chr4	109727413	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=72;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=72;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.86;MQ0=0;RU=T;RC=10;IC=9;IHP=10;SomaticEVS=15.51	.
chr4	121180244	.	CA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=49;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=49;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=58.09;MQ0=2;RU=A;RC=6;IC=5;IHP=7;SomaticEVS=15.92	.
chr4	121547626	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=87;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=87;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=7;IC=8;IHP=8;SomaticEVS=17.27	.
chr4	135987613	.	AG	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=72;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=72;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.87;MQ0=0;RU=G;RC=1;IC=0;IHP=2;SomaticEVS=17.21	.
chr4	146790183	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=100;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=100;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.35;MQ0=1;RU=T;RC=13;IC=14;IHP=22;SomaticEVS=9.66	.
chr4	154310276	.	AG	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=59;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=59;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.51;MQ0=0;RU=G;RC=2;IC=1;IHP=3;SomaticEVS=17.27	.
chr4	159525552	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=77;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=77;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=5;IC=6;IHP=7;SomaticEVS=17.27	.
chr4	163539870	.	GT	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=88;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=88;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=2;IC=1;IHP=3;SomaticEVS=17.27	.
chr4	177797448	.	G	GA	.	PASS	SOMATIC;QSI=64;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=64;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=0;IC=1;IHP=3;SomaticEVS=16.59	.
chr4	179803392	.	TATTA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=80;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=80;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=ATTA;RC=1;IC=0;IHP=3;SomaticEVS=17.22	.
chr4	186564110	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=80;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=80;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=59.61;MQ0=0;RU=T;RC=11;IC=10;IHP=15;SomaticEVS=11.19	.
chr4	187671296	.	T	TG	.	PASS	SOMATIC;QSI=84;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=84;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.84;MQ0=0;RU=G;RC=7;IC=8;IHP=8;SomaticEVS=17.21	.
chr5	8268903	.	G	GA	.	PASS	SOMATIC;QSI=75;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=75;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=6;IC=7;IHP=7;SomaticEVS=17.27	.
chr5	12044010	.	CA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=71;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=71;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=4;IC=3;IHP=5;SomaticEVS=17.27	.
chr5	12901167	.	G	GA	.	PASS	SOMATIC;QSI=42;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=42;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=6;IC=7;IHP=7;SomaticEVS=17.27	.
chr5	16654358	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=60;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=60;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=54.66;MQ0=1;RU=T;RC=16;IC=15;IHP=16;SomaticEVS=9.6	.
chr5	22511933	.	T	TTG	.	PASS	SOMATIC;QSI=65;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=65;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TG;RC=12;IC=13;IHP=3;SomaticEVS=11.85	.
chr5	23743531	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=65;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=65;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=11;IC=12;IHP=13;SomaticEVS=10.73	.
chr5	26507212	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=65;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=65;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.71;MQ0=0;RU=A;RC=14;IC=15;IHP=14;SomaticEVS=9.71	.
chr5	52202970	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=43;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=43;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=15;IC=14;IHP=15;SomaticEVS=10.28	.
chr5	59558369	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=102;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=102;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=2;IC=1;IHP=2;SomaticEVS=17.27	.
chr5	62664086	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=62;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=62;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.49;MQ0=0;RU=T;RC=13;IC=14;IHP=13;SomaticEVS=10.07	.
chr5	68499257	.	G	GT	.	PASS	SOMATIC;QSI=83;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=83;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=8;IC=9;IHP=8;SomaticEVS=16.98	.
chr5	76802357	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=90;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=90;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.96;MQ0=0;RU=A;RC=10;IC=11;IHP=11;SomaticEVS=13.38	.
chr5	81287271	.	AC	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=78;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=78;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.95;MQ0=0;RU=C;RC=1;IC=0;IHP=3;SomaticEVS=17.21	.
chr5	90635902	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=41;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=41;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=15;IC=14;IHP=17;SomaticEVS=10.09	.
chr5	107082103	.	GAAT	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=83;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=83;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=AAT;RC=2;IC=1;IHP=4;SomaticEVS=17.28	.
chr5	118788205	.	TC	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=55;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=55;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=C;RC=4;IC=3;IHP=8;SomaticEVS=17.27	.
chr5	126074364	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=61;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=61;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.95;MQ0=0;RU=A;RC=9;IC=8;IHP=11;SomaticEVS=16.31	.
chr5	129527616	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=75;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=75;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.64;MQ0=1;RU=T;RC=17;IC=16;IHP=17;SomaticEVS=7.49	.
chr5	138336687	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=76;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=76;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.67;MQ0=0;RU=A;RC=13;IC=14;IHP=14;SomaticEVS=9.92	.
chr5	138336687	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=76;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=76;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.67;MQ0=0;RU=A;RC=13;IC=14;IHP=14;SomaticEVS=9.92	.
chr5	148499873	.	CCT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=59;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=59;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=CT;RC=3;IC=2;IHP=5;SomaticEVS=17.28	.
chr5	154515580	.	G	GA	.	PASS	SOMATIC;QSI=61;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=61;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.51;MQ0=1;RU=A;RC=11;IC=12;IHP=15;SomaticEVS=10.61	.
chr5	158193813	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=65;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=65;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.79;MQ0=0;RU=T;RC=15;IC=14;IHP=16;SomaticEVS=9.84	.
chr5	159965841	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=55;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=55;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=3;IC=4;IHP=6;SomaticEVS=9.64	.
chr5	165848878	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=83;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=83;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=13;IC=12;IHP=16;SomaticEVS=10.23	.
chr5	166135763	.	C	CAG	.	PASS	SOMATIC;QSI=48;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=48;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=AG;RC=11;IC=12;IHP=2;SomaticEVS=7.34	.
chr5	175013639	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=57;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=57;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.79;MQ0=0;RU=T;RC=18;IC=17;IHP=18;SomaticEVS=7.16	.
chr5	178171872	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=78;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=78;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.22;MQ0=0;RU=A;RC=13;IC=12;IHP=18;SomaticEVS=9.94	.
chr5	178443778	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=114;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=114;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.8;MQ0=0;RU=T;RC=10;IC=9;IHP=12;SomaticEVS=13.62	.
chr5	180664055	.	G	GT	.	PASS	SOMATIC;QSI=73;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=73;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=13;IC=14;IHP=17;SomaticEVS=9.74	.
chr6	3775082	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=97;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=97;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=5;IC=4;IHP=7;SomaticEVS=17.27	.
chr6	5993507	.	CA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=83;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=83;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.78;MQ0=0;RU=A;RC=3;IC=2;IHP=6;SomaticEVS=17.27	.
chr6	6197237	.	TG	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=64;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=64;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=G;RC=6;IC=5;IHP=7;SomaticEVS=17.27	.
chr6	9338130	.	GGAGGTT	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=96;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=96;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.62;MQ0=1;RU=GAGGTT;RC=1;IC=0;IHP=5;SomaticEVS=17.22	.
chr6	16446628	.	TTC	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=98;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=98;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TC;RC=1;IC=0;IHP=8;SomaticEVS=17.22	.
chr6	23391003	.	TTC	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=103;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=103;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TC;RC=4;IC=3;IHP=5;SomaticEVS=17.28	.
chr6	46656347	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=79;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=79;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.54;MQ0=1;RU=T;RC=19;IC=18;IHP=19;SomaticEVS=6.93	.
chr6	48439239	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=98;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=98;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=1;IC=0;IHP=2;SomaticEVS=17.21	.
chr6	57882897	.	G	GA	.	PASS	SOMATIC;QSI=47;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=47;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=40.92;MQ0=0;RU=A;RC=9;IC=10;IHP=10;SomaticEVS=15.51	.
chr6	69640437	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=76;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=76;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=10;IC=9;IHP=14;SomaticEVS=12.92	.
chr6	73535984	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=56;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=56;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=15;IC=14;IHP=15;SomaticEVS=9.93	.
chr6	91579230	.	GT	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=75;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=75;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=14;IC=13;IHP=14;SomaticEVS=9.97	.
chr6	92099282	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=62;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=62;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=10;IC=11;IHP=12;SomaticEVS=12.29	.
chr6	101610062	.	TTG	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=80;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=80;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TG;RC=1;IC=0;IHP=6;SomaticEVS=17.22	.
chr6	115067630	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=74;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=74;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.66;MQ0=0;RU=T;RC=10;IC=9;IHP=10;SomaticEVS=15.51	.
chr6	124872182	.	T	TA	.	PASS	SOMATIC;QSI=78;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=78;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.73;MQ0=0;RU=A;RC=7;IC=8;IHP=9;SomaticEVS=17.27	.
chr6	132662447	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=86;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=86;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=8;IC=7;IHP=10;SomaticEVS=17.27	.
chr6	141054266	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=81;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=81;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=2;IC=1;IHP=3;SomaticEVS=17.27	.
chr6	145993600	.	G	GT	.	PASS	SOMATIC;QSI=57;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=57;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.78;MQ0=0;RU=T;RC=11;IC=12;IHP=12;SomaticEVS=6.63	.
chr6	163659689	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=68;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=68;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=8;IC=9;IHP=8;SomaticEVS=16.98	.
chr6	164587830	.	T	TTTTA	.	PASS	SOMATIC;QSI=86;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=86;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TTTA;RC=0;IC=1;IHP=3;SomaticEVS=16.61	.
chr6	164850194	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=87;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=87;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.83;MQ0=0;RU=A;RC=15;IC=14;IHP=15;SomaticEVS=9.83	.
chr6	168506013	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=78;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=78;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=13;IC=12;IHP=13;SomaticEVS=10.27	.
chr7	5527511	.	AAACAAC	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=82;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=82;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.95;MQ0=0;RU=AAC;RC=2;IC=0;IHP=9;SomaticEVS=17.22	.
chr7	17111102	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=65;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=65;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.77;MQ0=0;RU=T;RC=8;IC=9;IHP=12;SomaticEVS=14.15	.
chr7	22189545	.	TTC	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=49;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=49;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TC;RC=3;IC=2;IHP=3;SomaticEVS=17.28	.
chr7	22677333	.	GGAGGTAAA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=99;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=99;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=GAGGTAAA;RC=1;IC=0;IHP=5;SomaticEVS=17.22	.
chr7	28569156	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=78;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=78;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=11;IC=10;IHP=17;SomaticEVS=11.18	.
chr7	40879944	.	AAAGC	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=76;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=76;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=AAGC;RC=1;IC=0;IHP=3;SomaticEVS=17.22	.
chr7	56656648	.	G	GA	.	PASS	SOMATIC;QSI=56;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=56;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=8;IC=9;IHP=10;SomaticEVS=16.98	.
chr7	103835954	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=92;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=92;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=18;IC=17;IHP=19;SomaticEVS=7.05	.
chr7	125472514	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=145;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=145;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=11;IC=12;IHP=14;SomaticEVS=10.68	.
chr7	140010975	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=108;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=108;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=13;IC=14;IHP=14;SomaticEVS=10.05	.
chr7	142168271	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=91;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=91;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=58.16;MQ0=3;RU=T;RC=15;IC=14;IHP=18;SomaticEVS=9.69	.
chr7	142636693	.	G	GA	.	PASS	SOMATIC;QSI=81;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=81;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=59.58;MQ0=0;RU=A;RC=12;IC=13;IHP=13;SomaticEVS=10.46	.
chr7	150493224	.	GT	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=150;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=150;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=12;IC=11;IHP=12;SomaticEVS=10.98	.
chr7	153762616	.	CA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=85;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=85;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=54.4;MQ0=0;RU=A;RC=14;IC=13;IHP=15;SomaticEVS=10.06	.
chr8	3401957	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=86;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=86;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=11;IC=12;IHP=11;SomaticEVS=11.8	.
chr8	4366593	.	G	GT	.	PASS	SOMATIC;QSI=105;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=105;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.84;MQ0=0;RU=T;RC=8;IC=9;IHP=10;SomaticEVS=16.98	.
chr8	13756446	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=61;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=61;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=58.54;MQ0=3;RU=T;RC=16;IC=17;IHP=21;SomaticEVS=9.21	.
chr8	24658037	.	ATC	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=123;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=123;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.76;MQ0=0;RU=TC;RC=2;IC=1;IHP=2;SomaticEVS=17.28	.
chr8	34234047	.	C	CAT	.	PASS	SOMATIC;QSI=69;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=69;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=AT;RC=5;IC=6;IHP=2;SomaticEVS=17.28	.
chr8	50711972	.	T	TA	.	PASS	SOMATIC;QSI=90;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=90;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=2;IC=3;IHP=3;SomaticEVS=17.27	.
chr8	59073761	.	GT	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=84;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=84;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=2;IC=1;IHP=3;SomaticEVS=17.27	.
chr8	68764930	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=70;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=70;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=2;IC=3;IHP=4;SomaticEVS=17.27	.
chr8	69635869	.	CA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=68;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=68;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=14;IC=13;IHP=14;SomaticEVS=9.95	.
chr8	72960872	.	T	TA	.	PASS	SOMATIC;QSI=73;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=73;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=10;IC=11;IHP=10;SomaticEVS=13.61	.
chr8	80750512	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=81;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=81;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=58.9;MQ0=2;RU=T;RC=12;IC=11;IHP=19;SomaticEVS=10.39	.
chr8	82849282	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=81;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=81;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=1;IC=2;IHP=2;SomaticEVS=17.27	.
chr8	100661007	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=75;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=75;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.22;MQ0=1;RU=T;RC=16;IC=15;IHP=17;SomaticEVS=9.48	.
chr8	103670289	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=102;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=102;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=7;IC=8;IHP=7;SomaticEVS=17.27	.
chr8	131290502	.	AC	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=70;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=70;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=C;RC=2;IC=1;IHP=3;SomaticEVS=17.27	.
chr8	137597407	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=69;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=69;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.54;MQ0=1;RU=T;RC=15;IC=14;IHP=17;SomaticEVS=9.71	.
chr9	1715722	.	ACT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=85;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=85;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.34;MQ0=1;RU=CT;RC=2;IC=1;IHP=3;SomaticEVS=17.28	.
chr9	8904667	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=55;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=55;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.95;MQ0=0;RU=A;RC=17;IC=16;IHP=17;SomaticEVS=7.47	.
chr9	9915685	.	G	GA	.	PASS	SOMATIC;QSI=52;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=52;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=9;IC=10;IHP=12;SomaticEVS=13.39	.
chr9	12585586	.	AAGAC	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=65;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=65;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=AGAC;RC=3;IC=2;IHP=3;SomaticEVS=17.28	.
chr9	14279347	.	ACT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=61;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=61;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=CT;RC=1;IC=0;IHP=3;SomaticEVS=17.22	.
chr9	22404813	.	AATTGATATATTAAACATC	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=84;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=84;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=ATTGATATATTAAACATC;RC=1;IC=0;IHP=5;SomaticEVS=17.22	.
chr9	22410956	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=47;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=47;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.8;MQ0=0;RU=T;RC=17;IC=16;IHP=17;SomaticEVS=7.61	.
chr9	25687101	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=56;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=56;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=3;IC=4;IHP=4;SomaticEVS=17.27	.
chr9	36493868	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=70;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=70;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.82;MQ0=0;RU=A;RC=13;IC=14;IHP=14;SomaticEVS=6.13	.
chr9	63579673	.	AC	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=42;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=42;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=53.98;MQ0=1;RU=C;RC=1;IC=0;IHP=11;SomaticEVS=8.57	.
chr9	68426613	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=84;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=84;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=15;IC=14;IHP=17;SomaticEVS=9.5	.
chr9	89750266	.	AG	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=71;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=71;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=G;RC=11;IC=10;IHP=12;SomaticEVS=11.59	.
chr9	90287985	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=55;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=55;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=13;IC=12;IHP=13;SomaticEVS=10.46	.
chr9	101117658	.	T	TA	.	PASS	SOMATIC;QSI=93;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=93;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.97;MQ0=0;RU=A;RC=16;IC=17;IHP=16;SomaticEVS=9.64	.
chr9	105554086	.	CAG	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=79;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=79;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=AG;RC=3;IC=2;IHP=2;SomaticEVS=17.28	.
chr9	111428940	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=76;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=76;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=8;IC=9;IHP=8;SomaticEVS=16.98	.
chr9	113722215	.	CA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=70;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=70;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.8;MQ0=0;RU=A;RC=10;IC=9;IHP=11;SomaticEVS=15	.
chr9	120623527	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=87;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=87;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=3;IC=2;IHP=7;SomaticEVS=17.27	.
chr9	124582579	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=123;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=123;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.88;MQ0=0;RU=A;RC=13;IC=12;IHP=16;SomaticEVS=10.23	.
chr9	128329702	.	CAG	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=83;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=83;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=AG;RC=1;IC=0;IHP=4;SomaticEVS=17.22	.
chr9	129426263	.	CCT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=69;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=69;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.45;MQ0=0;RU=CT;RC=3;IC=2;IHP=3;SomaticEVS=17.28	.
chr9	136006824	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=46;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=46;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=11;IC=12;IHP=12;SomaticEVS=11.4	.
chr9	136130015	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=89;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=89;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=59.81;MQ0=0;RU=T;RC=11;IC=12;IHP=16;SomaticEVS=10.61	.
chr10	8498989	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=76;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=76;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=0;IC=1;IHP=3;SomaticEVS=16.59	.
chr10	16461987	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=54;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=54;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=59.8;MQ0=0;RU=T;RC=15;IC=14;IHP=15;SomaticEVS=10.01	.
chr10	19605934	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=69;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=69;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=8;IC=9;IHP=9;SomaticEVS=16.98	.
chr10	22468347	.	T	TA	.	PASS	SOMATIC;QSI=71;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=71;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=11;IC=12;IHP=11;SomaticEVS=11.8	.
chr10	45444992	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=109;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=109;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=7;IC=8;IHP=8;SomaticEVS=17.27	.
chr10	51850489	.	T	TTA	.	PASS	SOMATIC;QSI=47;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=47;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.58;MQ0=1;RU=TA;RC=7;IC=8;IHP=5;SomaticEVS=17.28	.
chr10	52792742	.	CAA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=66;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=66;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=5;IC=3;IHP=6;SomaticEVS=17.27	.
chr10	57278668	.	T	TA	.	PASS	SOMATIC;QSI=78;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=78;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.67;MQ0=0;RU=A;RC=15;IC=16;IHP=15;SomaticEVS=9.69	.
chr10	65565559	.	T	TA	.	PASS	SOMATIC;QSI=89;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=89;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=0;IC=1;IHP=2;SomaticEVS=16.59	.
chr10	67478845	.	T	TA	.	PASS	SOMATIC;QSI=63;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=63;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.86;MQ0=0;RU=A;RC=13;IC=14;IHP=15;SomaticEVS=8.83	.
chr10	69790299	.	GT	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=113;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=113;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.95;MQ0=0;RU=T;RC=2;IC=1;IHP=4;SomaticEVS=17.27	.
chr10	78345076	.	GTAA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=92;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=92;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TAA;RC=1;IC=0;IHP=3;SomaticEVS=17.22	.
chr10	82250151	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=87;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=87;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.91;MQ0=0;RU=A;RC=4;IC=3;IHP=7;SomaticEVS=17.27	.
chr10	82890127	.	G	GT	.	PASS	SOMATIC;QSI=87;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=87;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.86;MQ0=0;RU=T;RC=18;IC=19;IHP=18;SomaticEVS=7.14	.
chr10	84260107	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=101;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=101;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=13;IC=12;IHP=13;SomaticEVS=10.3	.
chr10	89727914	.	ATT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=82;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=82;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=4;IC=2;IHP=8;SomaticEVS=17.27	.
chr10	93942766	.	G	GT	.	PASS	SOMATIC;QSI=98;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=98;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=4;IC=5;IHP=5;SomaticEVS=17.27	.
chr10	94506204	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=80;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=80;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.4;MQ0=0;RU=T;RC=6;IC=7;IHP=7;SomaticEVS=17.27	.
chr10	94506204	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=80;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=80;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.4;MQ0=0;RU=T;RC=6;IC=7;IHP=7;SomaticEVS=17.27	.
chr10	98655230	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=72;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=72;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=11;IC=12;IHP=12;SomaticEVS=11.02	.
chr10	100080085	.	CA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=65;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=65;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.92;MQ0=0;RU=A;RC=15;IC=14;IHP=15;SomaticEVS=8.11	.
chr10	102914835	.	GT	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=79;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=79;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.46;MQ0=0;RU=T;RC=15;IC=14;IHP=15;SomaticEVS=9.83	.
chr10	103252841	.	G	GA	.	PASS	SOMATIC;QSI=72;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=72;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.82;MQ0=0;RU=A;RC=12;IC=13;IHP=18;SomaticEVS=9.73	.
chr10	103538584	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=94;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=94;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.59;MQ0=1;RU=T;RC=8;IC=9;IHP=8;SomaticEVS=9.32	.
chr10	104241489	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=56;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=56;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=10;IC=11;IHP=15;SomaticEVS=6.31	.
chr10	105079539	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=88;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=88;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.87;MQ0=0;RU=T;RC=6;IC=7;IHP=9;SomaticEVS=17.27	.
chr10	113397989	.	TTC	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=116;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=116;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TC;RC=3;IC=2;IHP=5;SomaticEVS=17.28	.
chr10	115641463	.	ATT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=83;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=83;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=2;IC=0;IHP=4;SomaticEVS=17.21	.
chr10	129307144	.	CA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=86;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=86;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.84;MQ0=0;RU=A;RC=12;IC=11;IHP=12;SomaticEVS=10.94	.
chr11	2103848	.	GC	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=90;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=90;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=C;RC=2;IC=1;IHP=2;SomaticEVS=17.27	.
chr11	12877730	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=82;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=82;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.4;MQ0=1;RU=T;RC=6;IC=7;IHP=6;SomaticEVS=17.21	.
chr11	20937736	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=47;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=47;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=4;IC=5;IHP=5;SomaticEVS=17.27	.
chr11	23237812	.	CAA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=60;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=60;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=2;IC=0;IHP=4;SomaticEVS=17.21	.
chr11	32983934	.	CAA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=90;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=90;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=2;IC=0;IHP=5;SomaticEVS=17.21	.
chr11	37362980	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=80;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=80;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.22;MQ0=2;RU=A;RC=12;IC=11;IHP=12;SomaticEVS=10.94	.
chr11	40062427	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=83;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=83;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=12;IC=11;IHP=12;SomaticEVS=10.94	.
chr11	41605031	.	CA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=69;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=69;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=8;IC=7;IHP=8;SomaticEVS=17.21	.
chr11	49271884	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=52;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=52;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.14;MQ0=0;RU=T;RC=12;IC=11;IHP=12;SomaticEVS=11.14	.
chr11	69176664	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=67;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=67;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.65;MQ0=0;RU=T;RC=12;IC=13;IHP=14;SomaticEVS=10.25	.
chr11	69320851	.	CTG	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=116;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=116;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TG;RC=1;IC=0;IHP=4;SomaticEVS=8.15	.
chr11	83223554	.	CG	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=93;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=93;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=G;RC=1;IC=0;IHP=2;SomaticEVS=17.21	.
chr11	90810652	.	AC	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=59;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=59;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=C;RC=1;IC=0;IHP=9;SomaticEVS=9.41	.
chr11	94400889	.	ATCATTATG	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=62;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=62;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TCATTATG;RC=1;IC=0;IHP=2;SomaticEVS=9.47	.
chr11	98021406	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=83;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=83;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.94;MQ0=0;RU=A;RC=14;IC=13;IHP=15;SomaticEVS=9.93	.
chr11	98688580	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=73;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=73;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=5;IC=4;IHP=6;SomaticEVS=17.27	.
chr11	99567366	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=104;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=104;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.65;MQ0=0;RU=T;RC=10;IC=11;IHP=11;SomaticEVS=13.38	.
chr11	104113376	.	CAG	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=54;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=54;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=AG;RC=1;IC=0;IHP=4;SomaticEVS=17.22	.
chr11	107054133	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=72;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=72;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.65;MQ0=1;RU=T;RC=9;IC=8;IHP=10;SomaticEVS=17.02	.
chr11	107595153	.	G	GT	.	PASS	SOMATIC;QSI=78;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=78;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=13;IC=14;IHP=14;SomaticEVS=9.92	.
chr11	109969216	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=89;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=89;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=4;IC=5;IHP=6;SomaticEVS=17.27	.
chr11	119974765	.	G	GA	.	PASS	SOMATIC;QSI=50;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=50;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=7;IC=8;IHP=8;SomaticEVS=17.27	.
chr12	10392524	.	G	GGAAAGACTTAACACGCAGCCAACTTGTGGTT	.	PASS	SOMATIC;QSI=68;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=68;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=GAAAGACTTAACACGCAGCCAACTTGTGGTT;RC=1;IC=2;IHP=3;SomaticEVS=16.85	.
chr12	14645828	.	G	GT	.	PASS	SOMATIC;QSI=60;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=60;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=9;IC=10;IHP=13;SomaticEVS=7.64	.
chr12	16464423	.	CTG	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=158;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=145;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TG;RC=2;IC=1;IHP=2;SomaticEVS=17.28	.
chr12	17345052	.	GT	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=64;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=64;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=15;IC=14;IHP=15;SomaticEVS=9.85	.
chr12	17382360	.	ACT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=72;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=72;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=CT;RC=3;IC=2;IHP=2;SomaticEVS=17.28	.
chr12	19620832	.	GGAAAAATGCTCTTGCCACAGGAGGGAAAAATGA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=67;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=67;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=GAAAAATGCTCTTGCCACAGGAGGGAAAAATGA;RC=1;IC=0;IHP=5;SomaticEVS=9.54	.
chr12	20121076	.	CA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=78;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=78;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.88;MQ0=0;RU=A;RC=1;IC=0;IHP=3;SomaticEVS=17.21	.
chr12	22825346	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=71;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=71;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=15;IC=14;IHP=16;SomaticEVS=9.84	.
chr12	27650164	.	C	CCTCT	.	PASS	SOMATIC;QSI=51;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=51;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=CT;RC=8;IC=10;IHP=5;SomaticEVS=15.69	.
chr12	31159766	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=93;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=93;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=58.73;MQ0=1;RU=T;RC=10;IC=9;IHP=11;SomaticEVS=15	.
chr12	32098710	.	GT	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=53;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=53;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=1;IC=0;IHP=3;SomaticEVS=17.21	.
chr12	40873480	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=68;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=68;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=2;IC=3;IHP=3;SomaticEVS=17.27	.
chr12	58199445	.	AAG	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=90;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=90;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.97;MQ0=0;RU=AG;RC=1;IC=0;IHP=2;SomaticEVS=17.22	.
chr12	67463344	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=48;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=48;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.24;MQ0=0;RU=T;RC=18;IC=19;IHP=19;SomaticEVS=7.24	.
chr12	95973211	.	A	AG	.	PASS	SOMATIC;QSI=93;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=93;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=G;RC=1;IC=2;IHP=2;SomaticEVS=17.27	.
chr12	98521962	.	CTT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=96;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=96;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=3;IC=1;IHP=4;SomaticEVS=17.27	.
chr12	108406821	.	G	GA	.	PASS	SOMATIC;QSI=62;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=62;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.79;MQ0=0;RU=A;RC=12;IC=13;IHP=13;SomaticEVS=10.35	.
chr12	112483879	.	TGAG	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=81;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=81;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=GAG;RC=1;IC=0;IHP=3;SomaticEVS=17.22	.
chr12	117836049	.	T	TA	.	PASS	SOMATIC;QSI=50;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=50;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=5;IC=6;IHP=6;SomaticEVS=17.27	.
chr13	23232626	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=43;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=43;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=58.91;MQ0=0;RU=A;RC=6;IC=7;IHP=7;SomaticEVS=17.27	.
chr13	24565891	.	TG	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=61;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=61;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=59.28;MQ0=1;RU=G;RC=1;IC=0;IHP=3;SomaticEVS=17.11	.
chr13	26656248	.	T	TA	.	PASS	SOMATIC;QSI=82;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=82;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=8;IC=9;IHP=8;SomaticEVS=16.98	.
chr13	46301784	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=57;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=57;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=11;IC=12;IHP=11;SomaticEVS=6.71	.
chr13	47832002	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=84;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=84;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=1;IC=0;IHP=6;SomaticEVS=17.21	.
chr13	53692698	.	TC	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=71;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=71;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=C;RC=1;IC=0;IHP=11;SomaticEVS=8.91	.
chr13	57061619	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=70;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=70;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.92;MQ0=0;RU=T;RC=9;IC=8;IHP=9;SomaticEVS=17.02	.
chr13	58516486	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=70;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=70;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=10;IC=9;IHP=13;SomaticEVS=13.24	.
chr13	69551063	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=87;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=87;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=10;IC=11;IHP=16;SomaticEVS=11.65	.
chr13	79720759	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=84;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=84;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=1;IC=0;IHP=2;SomaticEVS=17.21	.
chr13	90743494	.	CAT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=81;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=81;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.96;MQ0=0;RU=AT;RC=1;IC=0;IHP=2;SomaticEVS=17.22	.
chr13	96371409	.	CCA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=43;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=43;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=CA;RC=2;IC=1;IHP=3;SomaticEVS=11.26	.
chr13	100790369	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=84;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=84;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=16;IC=15;IHP=16;SomaticEVS=9.63	.
chr14	29739002	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=76;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=76;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=5;IC=4;IHP=6;SomaticEVS=17.27	.
chr14	31069936	.	T	TAA	.	PASS	SOMATIC;QSI=91;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=91;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=2;IC=4;IHP=3;SomaticEVS=17.27	.
chr14	41001382	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=54;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=54;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.52;MQ0=0;RU=T;RC=8;IC=9;IHP=12;SomaticEVS=14.12	.
chr14	41136403	.	AAT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=75;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=75;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.6;MQ0=1;RU=AT;RC=1;IC=0;IHP=14;SomaticEVS=12.16	.
chr14	54366844	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=72;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=72;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.72;MQ0=0;RU=T;RC=2;IC=3;IHP=6;SomaticEVS=17.27	.
chr14	71419660	.	GCTAATTT	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=80;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=80;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=49.96;MQ0=2;RU=CTAATTT;RC=1;IC=0;IHP=7;SomaticEVS=17.22	.
chr14	77164756	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=86;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=86;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.99;MQ0=0;RU=A;RC=13;IC=12;IHP=15;SomaticEVS=10.22	.
chr14	81959979	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=64;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=64;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=11;IC=10;IHP=12;SomaticEVS=11.59	.
chr14	82306226	.	T	TA	.	PASS	SOMATIC;QSI=65;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=65;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=9;IC=10;IHP=10;SomaticEVS=15.51	.
chr14	82413104	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=61;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=61;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=3;IC=2;IHP=4;SomaticEVS=17.27	.
chr14	87102427	.	T	TAC	.	PASS	SOMATIC;QSI=78;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=78;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=AC;RC=13;IC=14;IHP=2;SomaticEVS=11.65	.
chr14	96658001	.	G	GT	.	PASS	SOMATIC;QSI=62;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=62;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=11;IC=12;IHP=11;SomaticEVS=11.8	.
chr14	102289262	.	CAG	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=49;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=49;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.58;MQ0=1;RU=AG;RC=2;IC=1;IHP=11;SomaticEVS=16.53	.
chr15	33151120	.	CAG	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=84;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=84;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=AG;RC=2;IC=1;IHP=3;SomaticEVS=17.28	.
chr15	36492883	.	TATGATCACTCACATTAAAAAAAATAGTCATAAAATGACTAGATC	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=123;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=123;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=ATGATCACTCACATTAAAAAAAATAGTCATAAAATGACTAGATC;RC=1;IC=0;IHP=4;SomaticEVS=17.22	.
chr15	40168070	.	G	GA	.	PASS	SOMATIC;QSI=71;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=71;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.53;MQ0=0;RU=A;RC=15;IC=16;IHP=20;SomaticEVS=9.21	.
chr15	46283417	.	G	GA	.	PASS	SOMATIC;QSI=54;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=54;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=10;IC=11;IHP=12;SomaticEVS=12.49	.
chr15	46492623	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=78;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=78;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.91;MQ0=0;RU=T;RC=0;IC=1;IHP=7;SomaticEVS=16.59	.
chr15	47118879	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=58;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=58;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=59.58;MQ0=0;RU=T;RC=9;IC=8;IHP=9;SomaticEVS=17.02	.
chr15	47613652	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=76;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=76;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.92;MQ0=0;RU=T;RC=11;IC=12;IHP=11;SomaticEVS=11.8	.
chr15	47709880	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=63;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=63;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.94;MQ0=0;RU=A;RC=14;IC=15;IHP=14;SomaticEVS=9.71	.
chr15	49244247	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=69;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=69;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=10;IC=11;IHP=10;SomaticEVS=13.61	.
chr15	66664830	.	G	GT	.	PASS	SOMATIC;QSI=65;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=65;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=11;IC=12;IHP=15;SomaticEVS=6.17	.
chr15	81117543	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=72;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=72;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.79;MQ0=0;RU=T;RC=20;IC=19;IHP=20;SomaticEVS=6.94	.
chr15	83103618	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=64;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=64;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.41;MQ0=0;RU=T;RC=16;IC=15;IHP=21;SomaticEVS=9.31	.
chr15	84078886	.	CA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=82;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=82;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.17;MQ0=1;RU=A;RC=14;IC=13;IHP=18;SomaticEVS=9.69	.
chr15	94290152	.	CA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=38;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=38;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=12;IC=11;IHP=12;SomaticEVS=6.01	.
chr16	9085165	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=71;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=71;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.39;MQ0=0;RU=A;RC=15;IC=16;IHP=15;SomaticEVS=9.69	.
chr16	20341692	.	GC	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=56;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=56;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=C;RC=1;IC=0;IHP=3;SomaticEVS=17.21	.
chr16	28264571	.	CA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=93;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=93;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=16;IC=15;IHP=16;SomaticEVS=6.18	.
chr16	29842019	.	TCTGC	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=80;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=80;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.82;MQ0=0;RU=CTGC;RC=2;IC=1;IHP=2;SomaticEVS=17.28	.
chr16	46916126	.	CA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=46;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=46;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.55;MQ0=1;RU=A;RC=1;IC=0;IHP=3;SomaticEVS=17.21	.
chr16	54814534	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=71;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=71;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=10;IC=9;IHP=10;SomaticEVS=15.51	.
chr16	58763203	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=65;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=65;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=59.81;MQ0=0;RU=A;RC=11;IC=10;IHP=23;SomaticEVS=10.11	.
chr16	61012751	.	CA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=87;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=87;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=10;IC=9;IHP=10;SomaticEVS=15.51	.
chr16	62693054	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=102;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=102;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.68;MQ0=1;RU=T;RC=10;IC=9;IHP=10;SomaticEVS=15.51	.
chr16	63591454	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=82;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=82;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.85;MQ0=0;RU=A;RC=13;IC=12;IHP=13;SomaticEVS=10.3	.
chr16	69205316	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=64;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=64;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.15;MQ0=1;RU=T;RC=23;IC=22;IHP=23;SomaticEVS=6.81	.
chr16	69205316	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=64;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=64;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.15;MQ0=1;RU=T;RC=23;IC=22;IHP=23;SomaticEVS=6.81	.
chr16	71680094	.	A	AG	.	PASS	SOMATIC;QSI=95;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=95;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=G;RC=1;IC=2;IHP=18;SomaticEVS=7.36	.
chr16	76001475	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=83;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=83;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.81;MQ0=0;RU=A;RC=10;IC=9;IHP=10;SomaticEVS=15.51	.
chr17	1819013	.	TG	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=93;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=93;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=59.77;MQ0=0;RU=G;RC=2;IC=1;IHP=3;SomaticEVS=17.27	.
chr17	10946319	.	G	GT	.	PASS	SOMATIC;QSI=44;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=44;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.9;MQ0=0;RU=T;RC=11;IC=12;IHP=12;SomaticEVS=6.39	.
chr17	11131453	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=48;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=48;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=58.9;MQ0=0;RU=T;RC=15;IC=16;IHP=19;SomaticEVS=9.35	.
chr17	12818335	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=64;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=64;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.77;MQ0=0;RU=A;RC=18;IC=17;IHP=22;SomaticEVS=7.13	.
chr17	13149368	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=102;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=102;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=15;IC=14;IHP=16;SomaticEVS=9.84	.
chr17	20364533	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=64;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=64;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=53.99;MQ0=0;RU=A;RC=13;IC=12;IHP=13;SomaticEVS=10.3	.
chr17	21601635	.	T	TG	.	PASS	SOMATIC;QSI=67;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=67;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=G;RC=7;IC=8;IHP=11;SomaticEVS=16.52	.
chr17	27062699	.	T	TA	.	PASS	SOMATIC;QSI=74;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=74;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=12;IC=13;IHP=12;SomaticEVS=6.37	.
chr17	36478922	.	T	TA	.	PASS	SOMATIC;QSI=58;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=58;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=12;IC=13;IHP=14;SomaticEVS=10.32	.
chr17	40736449	.	A	AC	.	PASS	SOMATIC;QSI=72;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=72;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=C;RC=10;IC=11;IHP=10;SomaticEVS=13.61	.
chr17	51407146	.	TAAC	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=84;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=84;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=AAC;RC=1;IC=0;IHP=4;SomaticEVS=17.22	.
chr17	51957432	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=65;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=65;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=13;IC=12;IHP=14;SomaticEVS=10.24	.
chr17	53430644	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=65;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=65;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=13;IC=14;IHP=14;SomaticEVS=9.93	.
chr17	56321461	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=51;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=51;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=15;IC=14;IHP=17;SomaticEVS=9.82	.
chr17	58868369	.	CA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=76;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=76;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.6;MQ0=1;RU=A;RC=9;IC=8;IHP=9;SomaticEVS=17.02	.
chr17	59070442	.	G	GA	.	PASS	SOMATIC;QSI=53;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=53;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=9;IC=10;IHP=9;SomaticEVS=8.78	.
chr17	59653778	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=70;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=70;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.65;MQ0=0;RU=T;RC=14;IC=15;IHP=15;SomaticEVS=9.68	.
chr17	67216797	.	ACTC	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=60;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=60;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=CTC;RC=2;IC=1;IHP=3;SomaticEVS=17.28	.
chr17	71540178	.	CAG	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=49;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=49;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=AG;RC=2;IC=1;IHP=2;SomaticEVS=17.28	.
chr17	72634015	.	GTC	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=42;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=42;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TC;RC=2;IC=1;IHP=2;SomaticEVS=17.28	.
chr17	77221397	.	TTG	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=82;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=82;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TG;RC=1;IC=0;IHP=6;SomaticEVS=17.22	.
chr18	1386059	.	AAC	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=58;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=58;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=AC;RC=2;IC=1;IHP=8;SomaticEVS=17.28	.
chr18	1391441	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=81;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=81;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=11;IC=10;IHP=11;SomaticEVS=12.42	.
chr18	4575397	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=87;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=87;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=12;IC=13;IHP=13;SomaticEVS=10.38	.
chr18	8052613	.	ATC	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=76;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=76;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TC;RC=2;IC=1;IHP=2;SomaticEVS=17.28	.
chr18	28399803	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=49;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=49;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=11;IC=10;IHP=12;SomaticEVS=11.7	.
chr18	32979163	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=77;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=77;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.8;MQ0=0;RU=T;RC=11;IC=10;IHP=11;SomaticEVS=12.42	.
chr18	33697269	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=66;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=66;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.75;MQ0=0;RU=T;RC=4;IC=3;IHP=5;SomaticEVS=17.27	.
chr18	34504019	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=48;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=48;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=10;IC=9;IHP=13;SomaticEVS=13.24	.
chr18	38501150	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=87;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=87;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.65;MQ0=1;RU=A;RC=3;IC=2;IHP=3;SomaticEVS=17.27	.
chr18	62677539	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=83;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=83;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=9;IC=8;IHP=9;SomaticEVS=17.02	.
chr18	64780135	.	G	GT	.	PASS	SOMATIC;QSI=39;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=39;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=8;IC=9;IHP=8;SomaticEVS=8.78	.
chr18	64970071	.	ATATAT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=96;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=96;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=59.47;MQ0=0;RU=TATAT;RC=2;IC=1;IHP=3;SomaticEVS=17.28	.
chr18	69999647	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=57;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=57;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=14;IC=15;IHP=14;SomaticEVS=9.77	.
chr18	71424922	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=83;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=83;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=11;IC=10;IHP=11;SomaticEVS=12.42	.
chr18	76011343	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=64;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=64;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.78;MQ0=0;RU=T;RC=4;IC=3;IHP=4;SomaticEVS=17.27	.
chr18	77108035	.	GGTAA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=79;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=79;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.85;MQ0=0;RU=GTAA;RC=1;IC=0;IHP=2;SomaticEVS=17.22	.
chr19	905207	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=43;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=43;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=58.78;MQ0=0;RU=A;RC=11;IC=12;IHP=11;SomaticEVS=12.28	.
chr19	5094942	.	T	TA	.	PASS	SOMATIC;QSI=81;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=81;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=0;IC=1;IHP=2;SomaticEVS=16.59	.
chr19	7235087	.	T	TA	.	PASS	SOMATIC;QSI=76;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=76;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.81;MQ0=0;RU=A;RC=8;IC=9;IHP=12;SomaticEVS=14.12	.
chr19	16808371	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=47;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=47;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=3;IC=2;IHP=3;SomaticEVS=17.27	.
chr19	28751844	.	TTTC	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=72;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=72;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TTC;RC=2;IC=1;IHP=5;SomaticEVS=17.28	.
chr19	30163306	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=69;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=69;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.01;MQ0=1;RU=T;RC=10;IC=11;IHP=13;SomaticEVS=11.95	.
chr19	34547589	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=70;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=70;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.73;MQ0=0;RU=A;RC=4;IC=3;IHP=4;SomaticEVS=17.27	.
chr19	35169297	.	CTG	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=72;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=72;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TG;RC=2;IC=1;IHP=3;SomaticEVS=17.28	.
chr19	38465764	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=46;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=46;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.59;MQ0=0;RU=A;RC=10;IC=11;IHP=13;SomaticEVS=12.19	.
chr19	42484977	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=78;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=78;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=9;IC=8;IHP=12;SomaticEVS=14.09	.
chr19	51300309	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=53;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=53;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.5;MQ0=1;RU=A;RC=13;IC=14;IHP=13;SomaticEVS=10.21	.
chr20	3005983	.	C	CA	.	PASS	SOMATIC;QSI=62;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=62;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=12;IC=13;IHP=12;SomaticEVS=10.64	.
chr20	5810258	.	GA	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=74;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=74;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=13;IC=12;IHP=13;SomaticEVS=6.28	.
chr20	14752083	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=64;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=64;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=59.6;MQ0=1;RU=T;RC=19;IC=18;IHP=20;SomaticEVS=6.93	.
chr20	22704932	.	CTTAACTATTTT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=118;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=118;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=TTAACTATTTT;RC=1;IC=0;IHP=5;SomaticEVS=14.35	.
chr20	24027295	.	AGT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=122;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=122;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=GT;RC=2;IC=1;IHP=5;SomaticEVS=17.28	.
chr20	31642328	.	G	GT	.	PASS	SOMATIC;QSI=86;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=86;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.71;MQ0=0;RU=T;RC=2;IC=3;IHP=2;SomaticEVS=17.27	.
chr20	42711741	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=60;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=60;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=10;IC=11;IHP=11;SomaticEVS=13.35	.
chr20	54744714	.	TA	T	.	PASS	SOMATIC;QSI=73;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=73;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=8;IC=7;IHP=8;SomaticEVS=17.27	.
chr20	55323396	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=64;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=64;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=13;IC=12;IHP=14;SomaticEVS=10.23	.
chr20	55385065	.	AT	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=64;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=64;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=59.61;MQ0=1;RU=T;RC=13;IC=12;IHP=14;SomaticEVS=10.23	.
chr20	60787793	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=73;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=73;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.32;MQ0=0;RU=T;RC=17;IC=16;IHP=19;SomaticEVS=7.34	.
chr21	19356222	.	G	GT	.	PASS	SOMATIC;QSI=114;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=114;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=10;IC=11;IHP=13;SomaticEVS=11.95	.
chr21	23387403	.	CA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=55;TQSI=2;NT=ref;QSI_NT=55;TQSI_NT=2;SGT=ref->het;MQ=59.79;MQ0=0;RU=A;RC=16;IC=15;IHP=16;SomaticEVS=9.73	.
chr21	32684018	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=83;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=83;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=4;IC=5;IHP=4;SomaticEVS=17.27	.
chr21	39979690	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=53;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=53;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.91;MQ0=0;RU=T;RC=9;IC=10;IHP=13;SomaticEVS=12.92	.
chr21	41743759	.	CAA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=108;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=108;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=3;IC=1;IHP=5;SomaticEVS=17.27	.
chr21	46373765	.	CTG	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=47;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=47;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=55.67;MQ0=7;RU=TG;RC=1;IC=0;IHP=2;SomaticEVS=8.95	.
chr22	17515677	.	CT	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=72;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=72;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.79;MQ0=0;RU=T;RC=16;IC=15;IHP=16;SomaticEVS=9.6	.
chr22	19503619	.	GAC	G	.	PASS	SOMATIC;QSI=96;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=96;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.36;MQ0=1;RU=AC;RC=1;IC=0;IHP=7;SomaticEVS=17.22	.
chr22	24927630	.	AC	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=86;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=86;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.76;MQ0=0;RU=C;RC=1;IC=0;IHP=13;SomaticEVS=7.92	.
chrX	26275215	.	A	AT	.	PASS	SOMATIC;QSI=105;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=95;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.54;MQ0=0;RU=T;RC=8;IC=9;IHP=9;SomaticEVS=16.98	.
chrX	30558808	.	C	CT	.	PASS	SOMATIC;QSI=82;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=82;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=T;RC=15;IC=16;IHP=15;SomaticEVS=9.82	.
chrX	41516861	.	G	GA	.	PASS	SOMATIC;QSI=92;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=90;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=11;IC=12;IHP=11;SomaticEVS=7.08	.
chrX	44168536	.	G	GA	.	PASS	SOMATIC;QSI=74;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=74;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=57.72;MQ0=3;RU=A;RC=14;IC=15;IHP=18;SomaticEVS=9.45	.
chrX	73950696	.	AAG	A	.	PASS	SOMATIC;QSI=102;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=102;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=AG;RC=4;IC=3;IHP=3;SomaticEVS=17.28	.
chrX	119269090	.	CA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=82;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=82;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=59.92;MQ0=0;RU=A;RC=12;IC=11;IHP=12;SomaticEVS=10.98	.
chrX	139584055	.	CAA	C	.	PASS	SOMATIC;QSI=123;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=107;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=2;IC=0;IHP=5;SomaticEVS=17.21	.
chrX	147799240	.	T	TA	.	PASS	SOMATIC;QSI=52;TQSI=1;NT=ref;QSI_NT=52;TQSI_NT=1;SGT=ref->het;MQ=60;MQ0=0;RU=A;RC=12;IC=13;IHP=15;SomaticEVS=6.37	.