# Created with reconstruction/ecoli/scripts/metabolite_concentrations/merge_files.py reconstruction/ecoli/flat/metabolite_concentrations.tsv reconstruction/ecoli/scripts/metabolite_concentrations/out/park_concentrations.tsv reconstruction/ecoli/scripts/metabolite_concentrations/out/lempp_concentrations.tsv reconstruction/ecoli/scripts/metabolite_concentrations/out/kochanowski_concentrations.tsv reconstruction/ecoli/scripts/metabolite_concentrations/out/sander_concentrations.tsv on Sat May 29 14:20:11 2021 "Metabolite" "Bennett Concentration (units.mol/units.L)" "Park Concentration (units.mol/units.L)" "Lempp Concentration (units.mol/units.L)" "Kochanowski Concentration (units.mol/units.L)" "Sander Concentration (units.mol/units.L)" "2-3-DIHYDROXYBENZOATE" 1.40e-4 1.38e-4 NaN NaN NaN "2-KETOGLUTARATE" 4.40e-4 4.43e-4 NaN 2.63e-4 NaN "2-PG" NaN 9.18e-5 NaN NaN NaN "23-DIPHOSPHOGLYCERATE" NaN 8.29e-5 NaN NaN NaN "2K-4CH3-PENTANOATE" NaN NaN 1.38e-4 NaN NaN "4-AMINO-BUTYRATE" NaN NaN 3.04e-4 NaN NaN "4-hydroxybenzoate" 5.20e-5 5.22e-5 NaN NaN NaN "ACETOACETYL-COA" 2.20e-5 2.18e-5 NaN NaN NaN "ACETYL-COA" 6.10e-4 6.06e-4 1.51e-3 NaN NaN "ACETYL-P" 1.10e-3 1.07e-3 NaN NaN NaN "ADENINE" 1.50e-6 1.47e-6 8.98e-6 NaN NaN "ADENOSINE" 1.30e-7 1.31e-7 NaN NaN NaN "ADP" 5.60e-4 5.55e-4 2.58e-4 6.74e-4 NaN "ADP-D-GLUCOSE" 4.30e-6 4.27e-6 NaN NaN NaN "AMP" 2.80e-4 2.81e-4 7.07e-5 NaN NaN "ANTHRANILATE" 3.50e-6 3.48e-6 NaN NaN NaN "APS" 6.60e-6 6.63e-6 NaN NaN NaN "ARG" 5.70e-4 5.69e-4 1.53e-4 NaN 1.38e-4 "ASN" 5.10e-4 5.11e-4 4.99e-4 2.64e-4 4.52e-4 "ATP" 9.60e-3 9.63e-3 1.55e-3 1.31e-3 NaN "CAMP" 3.50e-5 3.52e-5 2.97e-6 2.00e-6 NaN "CARBAMYUL-L-ASPARTATE" 5.90e-4 5.90e-4 NaN NaN NaN "CARBON-DIOXIDE" NaN 7.52e-5 NaN NaN NaN "CDP" NaN NaN 3.07e-5 NaN NaN "CIS-ACONITATE" 1.60e-5 1.61e-5 NaN 1.00e-5 NaN "CIT" 2.00e-3 1.96e-3 1.71e-3 NaN NaN "CMP" 3.60e-4 3.60e-4 7.88e-4 NaN NaN "CO-A" 1.40e-3 1.37e-3 1.05e-4 NaN NaN "CPD-12575" 2.50e-3 2.50e-3 NaN NaN NaN "CPD-13469" 1.20e-3 1.15e-3 NaN NaN NaN "CPD-2961" 3.80e-3 3.77e-3 NaN 3.84e-4 NaN "CPD0-2032" NaN 2.71e-4 NaN NaN NaN "CTP" 2.70e-3 2.73e-3 8.62e-4 NaN NaN "CYTIDINE" 2.60e-6 2.59e-6 1.09e-6 NaN NaN "CYTOSINE" 1.40e-5 1.41e-5 4.85e-6 NaN NaN "D-ALA-D-ALA" NaN NaN 1.03e-4 NaN NaN "D-SEDOHEPTULOSE-7-P" NaN 8.82e-4 1.62e-4 9.20e-5 NaN "DAMP" 8.80e-6 8.84e-6 NaN NaN NaN "DATP" 1.60e-5 1.55e-5 NaN NaN NaN "DCTP" 3.50e-5 3.45e-5 NaN NaN NaN "DEOXY-RIBOSE-5P" NaN 3.03e-4 NaN NaN NaN "DEOXYADENOSINE" 2.80e-6 2.82e-6 NaN NaN NaN "DEOXYGUANOSINE" 5.20e-7 5.22e-7 NaN NaN NaN "DGMP" 5.10e-5 5.07e-5 NaN NaN NaN "DI-H-OROTATE" 1.20e-5 1.19e-5 3.88e-3 NaN NaN "DIHYDROXY-ACETONE-PHOSPHATE" 3.70e-4 3.06e-3 1.67e-3 9.28e-4 NaN "DPG" NaN 1.65e-5 NaN 1.50e-5 NaN "ERYTHROSE-4P" NaN 4.90e-5 4.84e-5 NaN NaN "FAD" 1.70e-4 1.73e-4 NaN NaN NaN "FMN" NaN 5.37e-5 NaN NaN NaN "FRUCTOSE-16-DIPHOSPHATE" 1.50e-2 1.52e-2 2.54e-3 1.38e-3 NaN "FRUCTOSE-6P" NaN 2.52e-3 NaN 3.18e-4 NaN "FUM" 1.20e-4 2.88e-4 1.50e-3 4.59e-4 NaN "G3P" 1.50e-3 1.54e-3 NaN NaN NaN "GDP" 6.80e-4 6.76e-4 1.89e-5 5.55e-4 NaN "GLC-6-P" NaN 7.88e-3 NaN 9.87e-4 NaN "GLC-D-LACTONE" 1.00e-3 1.04e-3 NaN NaN NaN "GLN" 3.80e-3 3.81e-3 3.81e-3 1.85e-3 6.61e-3 "GLT" 9.60e-2 9.60e-2 3.30e-2 1.68e-2 6.57e-2 "GLUCONATE" 4.20e-5 4.16e-5 NaN NaN NaN "GLUTATHIONE" 1.70e-2 1.66e-2 6.92e-3 NaN NaN "GLY" NaN NaN 4.32e-4 NaN 8.15e-4 "GLYCERATE" 1.40e-3 1.41e-3 NaN NaN NaN "GLYCEROL-3P" 4.90e-5 4.90e-5 NaN 3.00e-4 NaN "GMP" 2.40e-5 2.37e-5 4.13e-6 2.50e-5 NaN "GTP" 4.90e-3 4.87e-3 3.65e-4 1.17e-3 NaN "GUANINE" 1.90e-4 1.88e-4 4.03e-6 NaN NaN "GUANOSINE" 1.60e-6 1.62e-6 5.22e-7 NaN NaN "HIS" 6.80e-5 6.76e-5 6.97e-5 NaN 8.25e-5 "HISTIDINOL" 1.30e-5 1.28e-5 1.07e-5 NaN NaN "HOMO-CYS" 3.70e-4 3.70e-4 NaN NaN NaN "HOMO-SER" NaN NaN 2.38e-4 NaN NaN "HYPOXANTHINE" NaN NaN 7.70e-7 NaN NaN "IDP" NaN 2.38e-5 NaN NaN NaN "ILE" NaN 1.52e-4 NaN NaN NaN "IMP" NaN 2.72e-4 5.04e-5 1.99e-3 NaN "INOSINE" NaN NaN 7.00e-7 NaN NaN "ITP" NaN 2.05e-4 NaN NaN NaN "L-ALPHA-ALANINE" 2.60e-3 2.55e-3 3.96e-4 NaN 4.01e-4 "L-ARGININO-SUCCINATE" NaN NaN 1.76e-4 NaN NaN "L-ASPARTATE" 4.20e-3 4.23e-3 2.00e-3 9.72e-4 2.93e-3 "L-CITRULLINE" 1.40e-3 1.35e-3 1.76e-4 NaN NaN "L-ORNITHINE" 1.00e-5 1.01e-5 NaN NaN NaN "LEU" NaN 1.52e-4 NaN NaN NaN "LL-DIAMINOPIMELATE" NaN NaN 1.08e-4 NaN NaN "LYS" 4.10e-4 4.05e-4 6.67e-4 NaN 1.54e-3 "MAL" 1.70e-3 1.68e-3 2.12e-3 2.15e-3 NaN "MALONYL-COA" 3.50e-5 3.54e-5 NaN NaN NaN "MET" 1.50e-4 1.45e-4 5.50e-5 NaN 4.35e-5 "MYO-INOSITOL" 5.70e-6 5.72e-6 NaN NaN NaN "N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE-1-P" 8.20e-5 8.19e-5 NaN NaN NaN "N-ALPHA-ACETYLORNITHINE" 4.30e-5 4.33e-5 NaN NaN NaN "NAD" 2.60e-3 2.55e-3 2.12e-3 NaN NaN "NADH" 8.30e-5 8.36e-5 2.59e-5 NaN NaN "NADP" 2.10e-6 2.08e-6 2.19e-4 NaN NaN "NADPH" 1.20e-4 1.21e-4 1.80e-4 NaN NaN "OROTATE" NaN NaN 5.47e-3 NaN NaN "OXALACETIC_ACID" NaN 4.87e-7 NaN NaN NaN "OXIDIZED-GLUTATHIONE" NaN 2.37e-3 3.25e-4 NaN NaN "PANTOTHENATE" NaN NaN 6.59e-5 2.70e-5 NaN "PHE" 1.80e-5 1.82e-5 1.03e-4 5.60e-5 1.19e-4 "PHENYL-PYRUVATE" 9.00e-5 8.98e-5 NaN NaN NaN "PHOSPHO-ENOL-PYRUVATE" 1.80e-4 1.84e-4 1.44e-4 4.90e-5 NaN "PRO" 3.90e-4 3.85e-4 3.90e-4 NaN 4.40e-4 "PROPIONYL-COA" 5.30e-6 5.32e-6 NaN NaN NaN "PRPP" NaN 2.58e-4 NaN NaN NaN "PYRUVATE" NaN 3.66e-3 NaN NaN NaN "QUINOLINATE" 1.20e-5 1.15e-5 NaN NaN NaN "RIBOFLAVIN" 1.90e-5 1.90e-5 NaN NaN NaN "RIBOSE-1P" NaN NaN NaN 3.00e-6 NaN "RIBOSE-5P" NaN 7.87e-4 NaN 1.93e-4 NaN "RIBULOSE-5P" NaN 1.12e-4 NaN 3.44e-4 NaN "S-ADENOSYLMETHIONINE" 1.80e-4 1.84e-4 NaN NaN NaN "SER" 6.80e-5 1.13e-3 4.50e-4 NaN 8.87e-4 "SHIKIMATE" 1.40e-5 1.41e-5 NaN NaN NaN "SUC" 5.70e-4 5.69e-4 2.18e-4 6.28e-4 NaN "SUC-COA" 2.30e-4 2.33e-4 NaN NaN NaN "TDP" 3.80e-4 3.78e-4 NaN NaN NaN "THR" 1.80e-4 1.26e-3 NaN NaN 2.93e-4 "THREO-DS-ISO-CITRATE" NaN 3.67e-5 NaN 5.07e-4 NaN "TRP" 1.20e-5 1.21e-5 2.44e-5 NaN 2.86e-5 "TTP" 4.60e-3 4.62e-3 NaN NaN NaN "TYR" 2.90e-5 2.89e-5 2.16e-4 5.10e-5 2.29e-4 "UDP" 1.80e-3 1.79e-3 1.21e-4 NaN NaN "UDP-GLUCURONATE" 5.70e-4 5.66e-4 NaN NaN NaN "UDP-N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE" 9.20e-3 9.24e-3 6.71e-4 NaN NaN "UMP" NaN NaN 7.09e-5 NaN NaN "URIDINE" 2.10e-3 2.09e-3 NaN NaN NaN "UTP" 8.30e-3 8.29e-3 1.14e-3 NaN NaN "VAL" 4.00e-3 4.02e-3 5.66e-4 NaN 3.05e-4 "XYLULOSE-5-PHOSPHATE" NaN 1.81e-4 NaN 1.58e-4 NaN