[![Open Science Desktop — Local-first AI research workbench](./docs/assets/banner.webp)](https://github.com/ai4s-research/open-science) # Open Science Desktop **Atelier de recherche IA local-first et agnostique au modèle pour macOS, Windows & Linux.** Formerly Open Science. Une alternative desktop open source à Claude Science et aux workbenches AI-for-science similaires, construite avec Tauri, MCP, agent skills et des artefacts reproductibles. Elle relie agents, notebooks, fichiers, figures, rapports, exécutions et revue dans un flux desktop auditable.

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--- ## Actualités - **2026-10-29** — 🖥️ **Des terminaux qui restent, des agents côte à côte.** Les terminaux tournent désormais hors de l'app et survivent aux mises à jour, redémarrages et plantages ; Claude Code, Codex et pi fonctionnent comme des conversations à côté d'OpenCode, et une session passe du terminal à la conversation en un clic. Avec aussi plusieurs comptes par agent, des variantes de thème, les nouveaux modèles sur les réseaux lents et une ponctuation chinoise qui passe du premier coup. *(v0.7.1)* - **2026-10-26** — 🌐 **Tout l'atelier depuis n'importe quel navigateur, et des agents qui se parlent.** Panneaux divisés, Screens et terminaux fonctionnent désormais via l'accès à distance, sur téléphone aussi, avec des comptes nom et mot de passe ; définissez vos propres spécialistes avec leurs instructions, compétences, connecteurs et modèle ; et les agents lisent les conversations et terminaux des autres et leur écrivent via `osd`. Plus des messages mis en file pendant que l'agent travaille, et une installation Linux sans root. *(v0.7.0)* - **2026-10-04** — 🖱️ **Computer Use, terminaux et éditeurs.** L'agent pilote désormais des applications de bureau comme ImageJ, Origin ou les logiciels d'instruments ; les panneaux accueillent terminaux, fichiers et un éditeur de code, où Claude Code / Codex reprennent après un redémarrage ; plus la recherche (⌘F), le saut vers n'importe quelle session ou projet (⌘J) et Linux ARM64 pour DGX Spark. *(v0.6.0)* - **2026-08-18** — 🖥️ **Fonctionne sans écran.** `osd server` lance tout l'atelier — workspace, runtime de l'agent et la *même* UI web — sur une machine sans affichage, et `osd session send … --wait` le pilote depuis un script ou depuis un autre agent. Une archive, pas d'installateur. `osd` est inclus dans l'installeur du bureau et se place sur votre PATH au premier démarrage ; sur un serveur, l'archive suffit. Modèles, clés et approbations se configurent depuis le terminal (`osd model`, `osd auth`, `osd approval`). - **2026-08-13** — 🔌 **Parle l'Agent Client Protocol, dans les deux sens.** Pilotez Codex, Gemini CLI, Claude Code ou tout autre agent ACP depuis cette application — avec ses propres modèles, son historique et vos connecteurs MCP — ou pilotez Open Science depuis Zed, JetBrains ou Neovim. *(v0.4.0)* - **2026-08-01** — 🗂️ **Projets, mémoire et historique complet.** Regroupez les sessions dans des projets nommés (un dépôt existant est importé *sur place*, sans copie), donnez à l'agent une mémoire persistante globale et par projet, et retrouvez chaque conversation passée dans un historique cherchable avec archivage, restauration et export. *(v0.3.1)* - **2026-07-24** — 🪟 **Panneaux divisés.** Disposez les sessions côte à côte, faites glisser les panneaux pour les réancrer, gardez plusieurs écrans indépendants et utilisez un modèle différent par panneau. *(v0.3.0)* - **2026-07-21** — 🌐 **Accès depuis n'importe où — même votre téléphone.** Une passerelle authentifiée par jeton sert l'*vraie* UI desktop à une CLI, à un navigateur sur votre réseau local ou à votre téléphone (loopback par défaut ; le LAN est opt-in). Lancez une exécution à votre bureau et lisez la figure et le rapport terminés sur votre téléphone. *(v0.2.3)* - **2026-07-21** — 🧭 **Contrôle du navigateur.** L'agent peut piloter votre propre Chrome — profil et sessions intacts — pour lire le web en direct comme vous le faites, ou un navigateur privé isolé à la demande. *(v0.2.3)* - **2026-07-09** — 🎉 **N° 1 sur ResearchClawBench.** Open Science Desktop est n° 1 au score moyen des tâches évaluées sur [ResearchClawBench](https://internscience.github.io/ResearchClawBench-Home/), un benchmark de bout en bout pour agents autonomes de recherche scientifique (classement Pass@1). --- ## Sommaire - [✨ Ce que fait Open Science](#ce-que-fait-open-science) - [🎬 Captures](#captures) - [🧪 Fonctionnalités actuelles](#fonctionnalités-actuelles) - [🔌 Skills et connecteurs](#skills-et-connecteurs) - [📦 Installation](#installation) - [🖥️ Sans écran & CLI (`osd`)](#sans-écran--cli-osd) - [🚀 Construire depuis le code source](#construire-depuis-le-code-source) - [🔒 Sécurité et confidentialité](#sécurité-et-confidentialité) - [🗂️ Structure du dépôt](#structure-du-dépôt) - [📌 État](#état) ## Ce que fait Open Science **Déroule toute la boucle de recherche** — d'une direction large à un article terminé : exploration, revue de littérature, hypothèse, code d'expérience, analyse, figures et rédaction, en une seule session continue et auditable. - **Agents de recherche autonomes** : le `ai4s-agent` intégré enchaîne des skills spécialisés de bout en bout (explorer → revue → expérience → rédaction), et chaque étape dépose un artefact réel et inspectable dans votre workspace, pas seulement une réponse de chat. - **Tout est traçable** : figures, tables, rapports, notebooks et sorties d'exécution renvoient au code, aux entrées, à l'environnement, à la sortie du modèle et à la conversation exacts qui les ont produits. - **Local-first et à vous** : sessions, données, provenance, notebooks et run records vivent dans des dossiers locaux sur votre machine. Rien ne sort par défaut. - **Runtime agnostique au modèle** : l'UI passe par `packages/sdk` vers un sidecar OpenCode épinglé et intégré. Apportez votre propre modèle ; fournisseurs, skills et serveurs MCP restent remplaçables. - **Reproductible par conception** : les exécutions locales, SSH/Slurm, Modal et notebook-batch sont enregistrées comme run records reproductibles, pas comme sortie de terminal éparse. - **Accessible depuis n'importe où** : une passerelle intégrée et authentifiée par jeton sert l'*vraie* UI desktop à un navigateur sur votre réseau local ou votre téléphone (ou, via un tunnel, depuis n'importe où) — lancez une exécution à votre bureau et suivez-la depuis votre téléphone pendant le déjeuner. Désactivée par défaut ; loopback uniquement tant que vous n'y consentez pas, et les clés API ne quittent jamais la machine. - **Pilote votre propre navigateur** : l'agent peut contrôler votre vrai Chrome, avec votre profil et vos sessions intacts, pour lire le web en direct comme vous le faites — ou un navigateur privé isolé quand vous préférez qu'il s'en abstienne. - **Extensible** : skills d'agent, serveurs MCP et connecteurs scientifiques en un clic, commandes `/`, mode shell `!` et un SDK agnostique au modèle. ## Captures **Un prompt → une figure de qualité publication, et chaque point renvoie au code et aux entrées exacts qui l'ont produit.** Pas de boîtes noires : ouvrez n'importe quel artefact pour voir le script qui l'a généré, ses fichiers de données et la conversation qui l'a produit. ![Une figure d'atlas inter-espèces rendue, à côté de son script générateur et de ses fichiers d'entrée dans l'inspecteur d'artefacts](./docs/assets/showcase-provenance.webp) **La littérature → un rapport vérifiable.** Déployez la recherche sur plusieurs sources, rédigez un manuscrit rendu en PDF, et soumettez-le à une revue des citations — DOIs résolus, chiffres sans source et incohérences figure/code signalés — avant toute publication. ![Une revue de littérature sur les modèles de langage des protéines compilée en un manuscrit PDF, avec un vérificateur de citations confirmant que chaque DOI se résout](./docs/assets/showcase-literature.webp) **Pilote votre propre Chrome.** L'agent lit le web en direct via votre profil de navigateur réel — sessions comprises — puis transforme ce qu'il trouve en une figure et un CSV triable. ![L'agent pilotant le propre Chrome de l'utilisateur via le contrôle du navigateur pour collecter des préprints bioRxiv dans un graphique et un CSV](./docs/assets/showcase-browser.webp) **Faire de la recherche depuis n'importe où — même votre téléphone.** Une passerelle intégrée et authentifiée sert l'*vraie* UI desktop à un navigateur sur votre réseau local (ou via un tunnel), pour que vous puissiez lancer une exécution à votre bureau et lire la figure et le rapport terminés sur votre téléphone.

_{Nouvelle session}

Une analyse dose-réponse terminée — script, résultats, figure et rapport — sur un téléphone

_{Une analyse terminée}

Reproduction d'un benchmark scVI, avec sa figure ARI-vs-époque, vue sur un téléphone

_{Un benchmark reproduit}

Autres captures

![Reproduction d'un benchmark d'intégration scVI sur un A100 distant avec un environnement épinglé, un journal d'exécution et la provenance](./docs/assets/showcase-remote.webp) ![Un tableau de balayage d'hyperparamètres scVI à 8 branches à côté d'un notebook d'analyse en direct partageant le kernel de l'agent](./docs/assets/showcase-experiment.webp)

## Fonctionnalités actuelles **La boucle de recherche, sous forme de skills.** Un méta-skill déroule tout le pipeline ; chaque étape est un skill autonome qui produit un artefact réel et évaluable — exécutable sur n'importe quel modèle pris en charge par OpenCode : | Skill | Rôle | Sortie principale | | --- | --- | --- | | `ai4s-agent` | Exécute les quatre skills ci-dessous, dans l'ordre | Le package de recherche complet | | `research-explorer` | Transformer une direction large en sujets concrets | `research_exploration.md`, `topic_matrix.md`, `literature_pre_survey.md` | | `literature-survey` | Rédiger une revue de littérature | PDF de 6–20 p, 60+ citations réelles, source LaTeX, figures de taxonomie | | `experiment-suite` | Construire un package d'expérience | Document de conception, code exécutable, `results.json` avec provenance, figures, rapport | | `paper-writer` | Rédiger un article de recherche | PDF de 8–14 p, 200+ citations, 4–8 figures, tables | | `mindmap-render` | Rendre une carte mentale | Image générée à partir d'un `topic_matrix.md` | | `integrity-auditor` | Auditer l'intégrité d'un article | Constats image/numériques/logiques, évaluation en 4 niveaux, `audit_report.md` | Ils sont fournis dans le pack `ai4s-skills`, aux côtés des skills de revue maison et des skills Office/documents ci-dessous. ### Plateforme | Domaine | État actuel | | --- | --- | | Desktop | Tauri 2 + React + TypeScript + Vite, avec cibles macOS, Windows et Linux. | | Runtime | Sidecar OpenCode inclus, démarré par l'app et isolé de la configuration/données OpenCode de l'utilisateur. | | Projets | Workspaces de projet nommés qui regroupent leurs sessions ; importez un dossier existant sur place (jamais copié) ou adoptez-en un déjà présent dans le workspace ; déplacez une session existante dans un projet. | | Sessions | Chat multi-session, historique cherchable avec archivage/restauration/export, dossiers datés, références `@` aux fichiers et `#` aux conversations, commandes `/` et mode shell `!`. | | Disposition | Pavage de panneaux n-aire avec glisser-déposer pour réancrer, écrans indépendants, modèle et effort de raisonnement par panneau, glissement de panneaux entre écrans. | | Modes de l'agent | `/plan` pour planifier puis exécuter, `/goal` pour l'objectif et les critères d'acceptation, statut des sous-agents dans son propre panneau, et Stop qui reflète l'état réel du serveur. | | Mémoire | Couches de mémoire globale et par projet, activables, plus compactage automatique du contexte à l'approche de la fenêtre du modèle. | | Calcul distant | Enregistrez des machines depuis votre `~/.ssh/config`, testez-les et soumettez, suivez ou annulez des tâches depuis l'app. | | Apparence | Thèmes Light, Warm et Dark avec leurs accents, et zoom de l'interface. | | Fichiers | Navigation globale et par session, menu contextuel, ouvrir/révéler, copier le chemin, serveur local de preview. | | Sans écran & CLI | `osd server` fait tourner l'atelier sans fenêtre — même workspace, même runtime, même UI web, servis depuis un seul répertoire autonome — et `osd` le pilote (ou pilote une app de bureau en cours d'exécution) depuis un terminal : sessions, projets, exécutions, fichiers, approbations, `--wait`, `--json`. | | Accès distant | Passerelle authentifiée par jeton qui sert la vraie UI à une CLI, à un navigateur web du réseau local ou à votre téléphone (loopback par défaut, LAN opt-in) ; modes lecture seule ou accès complet ; copiez un lien avec le jeton intégré pour vous connecter en un tap. Les clés API ne transitent jamais par le réseau. | | Interopérabilité éditeur (ACP) | Parle l'Agent Client Protocol dans les deux sens : n'importe quel agent ACP (Codex, Gemini CLI, Claude Code, …) tourne comme runtime derrière l'UI habituelle, avec ses propres sélecteurs de modèle et d'effort de raisonnement, la relecture de l'historique et les connecteurs MCP de cette application ; ou un éditeur externe (Zed, JetBrains, Neovim, …) pilote Open Science en réutilisant le jeton de la passerelle. | | Contrôle du navigateur | L'agent pilote votre propre Chrome — profil et état de connexion préservés — en lisant les pages via l'arbre d'accessibilité, ou un navigateur isolé/privé à la demande. | | Notebooks | Fichiers `.ipynb` réels, création Python/R, kernel local, environnement Jupyter géré via `uv`, action Open JupyterLab. | | Exécutions | Run logs append-only, index SQLite global, recherche/facettes/pagination, surfaces locales/distantes, liens de sorties, logs et prompts de reproduction. | | Provenance | `.openscience/provenance.jsonl` enregistre les versions de fichiers et relie les artefacts à l'exécution ou l'édition qui les a créés. | | Visionneuses | PDF, image, vidéo, HTML, Markdown, code, CSV/TSV avec graphiques, DOCX, XLSX, PPTX, molécules, 3D mesh, génome, FITS, DOS/DOSCAR, EIGENVAL bands, qcode, cartes d'anomalies et fichiers phase. | | Langues de l'UI | English, 简体中文, 日本語, Español, Deutsch, Français et 한국어. Portuguese (Brazil) et Arabic sont enregistrés mais pas encore sélectionnables. | ## Skills et connecteurs Au build, le projet récupère `ai4s-skills`, les skills `docx`/`pdf`/`pptx`/`xlsx` de `anthropics/skills`, et les skills internes de `runtime/skills/core/` : `traceability-review`, `stats-integrity`, `domain-check`, `large-file`, `publication-figures`, `remote-compute` et `modal-run`. Connecteurs MCP scientifiques en un clic : recherche bibliographique, bases biomédicales, Materials Project, FRED, Space weather, Open-Meteo et USGS water data. Tout serveur MCP local ou distant peut aussi être ajouté depuis Settings. ## Installation Téléchargez la dernière version depuis [Releases](https://github.com/ai4s-research/open-science/releases/latest). - **macOS** : `.dmg` / `.app`, Apple Silicon et Intel, macOS 13 Ventura ou plus récent. - **Windows** : `.exe` NSIS, Windows 10/11 x64 — installation par utilisateur, sans droits administrateur. Un `.msi` est aussi publié pour les déploiements gérés par la DSI ; choisissez un format et conservez-le. - **Linux** : `.deb` et `.rpm` pour x86_64. Les paquets macOS sont signés avec un Developer ID, notarisés et agrafés : ils s'ouvrent normalement, sans passer par `xattr`. Les builds Windows et Linux ne sont pas encore signés. Sous Windows, choisissez **More info -> Run anyway** dans SmartScreen. ## Sans écran & CLI (`osd`) Une machine de recherche n'a en général pas d'écran. `osd`, c'est le même atelier sans écran : même organisation du workspace, même runtime d'agent, mêmes projets, même UI web — servie en HTTP au lieu d'être dessinée dans une fenêtre. **Sur un serveur, prenez l'archive.** `osd--` des Releases se décompresse et fonctionne sans rien installer — vérifié dans un conteneur Ubuntu nu, sans ajouter un seul paquet. ```bash # Configurer la machine (possible avant qu'un serveur tourne) ./osd auth set anthropic --key sk-… # reste sur cette machine, jamais sur le réseau ./osd model set anthropic/claude-opus-4-5 # le modèle par défaut de chaque tour ./osd server --lan # affiche son URL et son jeton d'accès ``` Les clés n'ont pas à toucher un fichier : le runtime de l'agent hérite de l'environnement de ce processus, donc `ANTHROPIC_API_KEY=sk-… ./osd server` se passe de `auth set`. Un endpoint auto-hébergé ou derrière un proxy tient dans la même commande (`--base-url https://my-gateway.internal/v1`), et `osd auth ls` n'affiche que des noms de fournisseurs — aucune clé n'est jamais affichée. Changer une clé demande un redémarrage ; la CLI le dit plutôt que de vous laisser deviner. Ouvrez l'URL affichée : c'est la vraie UI de bureau dans un navigateur, téléphone compris. Ou pilotez-le depuis un terminal — sur la même machine, en SSH, ou depuis votre portable : ```bash osd project new "Reef survey" id=$(osd session new --project "Reef survey") osd session send "$id" "Fit the 2015–2024 bleaching trend and write report.md" \ --model anthropic/claude-sonnet-4-5 --wait osd fs ls figures/ osd fs get report.md --output ./report.md ``` Sous Windows, les mêmes commandes fonctionnent dans PowerShell ; seule la syntaxe du shell change : ```powershell $id = osd session new --project "Reef survey" osd session send $id "Fit the 2015-2024 bleaching trend and write report.md" --wait ``` **Sur votre propre machine, il est déjà installé.** L'installeur du bureau embarque `osd`, et l'application le place sur votre PATH au premier démarrage : un nouveau terminal a la commande, sans rien à configurer. Elle écrit un petit script d'appel (`~/.local/bin/osd`, ou `~/bin` si un terminal le consulte déjà) — jamais un lien symbolique, car `osd` trouve son runtime à côté de son véritable exécutable. Si ce dossier n'est pas dans le PATH, l'application l'ajoute à votre profil de connexion et Paramètres → Accès distant indique le fichier modifié. Rien d'autre dans votre shell n'est touché. `--wait` revient quand le tour est terminé, pas quand il a été accepté, et échoue explicitement s'il n'a rien produit. `--json` affiche la réponse de l'API elle-même, pour les scripts. Les approbations restent en vigueur — l'agent demande avant d'exécuter des commandes, et `osd permission ls` / `osd permission allow ` sert à répondre sans fenêtre. ### Concurrence et configuration par projet Le travail en parallèle n'exige ni un second serveur ni un second workspace : un seul `osd server` exécute déjà plusieurs sessions à la fois. La passerelle fonctionne avec un fil par connexion et rien sur le chemin d'une session ne retient de verrou global — ce qui sépare le travail d'une session de celui d'une autre, c'est le dossier auquel chacune est épinglée. `osd session new --project NAME` lance une session dans un dossier de projet du workspace (créé avec `osd project new NAME`), et `osd session new --directory DIR` l'épingle à n'importe quel autre dossier. Le MCP par projet suit le dossier : un serveur MCP déclaré dans `/.opencode/opencode.json` ne s'applique qu'aux sessions qui travaillent dans ce dossier, et toutes les sessions partagent le même sidecar. Une règle de cache rend l'ordre important : la configuration opencode d'un dossier est lue une seule fois — la première fois que le sidecar utilise ce dossier — puis mise en cache. Écrivez cette configuration avant de diriger la moindre session vers ce dossier : `osd session new --project NAME` (ou `--directory DIR`) la lit et la met déjà en cache, avant qu'un seul tour n'ait été exécuté — « avant le premier tour » est donc déjà trop tard. La modifier ensuite ne prend effet qu'après un redémarrage du serveur, et jusqu'alors la session s'exécute, signale un succès et a utilisé la configuration précédente. Rien de tout cela n'exige une seconde installation de l'atelier. ### Répertoires d'état isolés (--state-dir) `osd server --state-dir DIR` — ou `OSD_STATE_DIR=DIR` — range tout ce qu'une instance écrit (base de sessions, configuration du sidecar, enregistrement du workspace, journaux) sous DIR au lieu du répertoire de données de la plateforme. Rien d'autre ne change : le workspace par défaut reste votre vrai dossier Documents, et l'app de bureau n'est pas affectée, car elle ne passe jamais par la dérogation headless. Ce n'est PAS un moyen d'obtenir plus de concurrence — un seul serveur exécute déjà plusieurs sessions à la fois (ci-dessus). C'est pour des installations vraiment séparées sur une même machine : une shard sans surveillance à côté de l'app de bureau, un cluster de benchmarks. Les identifiants restent par instance et ne sont jamais copiés : un DIR neuf n'en a aucun, donc le premier serveur démarré là affiche une note et la commande d'une ligne qui en ajoute un — `OSD_STATE_DIR=DIR osd auth set --key …` — ou vous exportez la variable du fournisseur lui-même (`ANTHROPIC_API_KEY=…`) avant de lancer, et le sidecar l'hérite. ### Quel modèle, et qui approuve `osd model` affiche le modèle par défaut, `osd model ls` liste ce que le runtime **peut réellement servir** (les fournisseurs dont cette machine a les identifiants ; le modèle courant est marqué) et `osd model set ` le change — via la passerelle, donc aussi contre un serveur distant. Chaque tour peut passer outre avec `osd session send --model … --agent … --effort …`. Les approbations restent en vigueur : l'agent demande avant d'exécuter des commandes, supprimer des fichiers, installer des dépendances ou sortir sur le réseau. Sans fenêtre, `--wait` dit **ce qu'il** attend et propose les deux réponses — dans le terminal `osd permission ls` / `osd permission allow `, ou l'URL de la passerelle qu'il affiche, qui porte le jeton pour qu'un navigateur sur votre portable ou votre téléphone approuve. Pour une machine sans personne devant, sortez-en explicitement : ```bash osd approval # ce qui doit être demandé aujourd'hui osd approval set full # ne jamais demander : commandes, suppressions, installations, réseau ``` `full` est un choix délibéré, pas un défaut : l'agent reste confiné au workspace, mais plus rien ne s'arrête pour vous. `osd approval set approve` remet toutes les règles. `osd approval set full` réécrit la configuration du runtime sur cette machine et doit donc être exécuté sur la machine elle-même — en SSH, pas via `--gateway` : la passerelle refuse délibérément les écritures de configuration, et le dit plutôt que de ne rien faire en silence. ### En tant que service `osd server` est un processus de premier plan ordinaire ; systemd l'exécute tel quel. Cette unit a été menée de bout en bout sur Ubuntu — activation, redémarrage, plantage, arrêt : ```ini # /etc/systemd/system/osd.service [Unit] Description=Open Science Desktop (headless) After=network-online.target [Service] Type=simple User=ubuntu Environment=HOME=/home/ubuntu ExecStart=/opt/osd/osd server --port 4788 Restart=on-failure RestartSec=3 [Install] WantedBy=multi-user.target ``` `sudo systemctl enable --now osd`, et l'URL affichée avec son jeton arrive dans `journalctl -u osd`. Une unit est aussi la façon la plus propre de l'exploiter : systemd arrête tout le cgroup, donc le runtime de l'agent ne survit jamais au serveur, quelle que soit la manière dont il meurt. Sans `--gateway`, `osd` parle à une passerelle déjà lancée sur la même machine — y compris celle de l'app de bureau : app ouverte, `osd session ls` fonctionne tel quel. Sinon, pointez-le où vous voulez avec `osd login --gateway --token `. Ce qui *manque* sans bureau : les kernels Jupyter locaux, les dialogues de fichiers natifs et le gestionnaire de fichiers du système — l'UI web les masque au lieu de proposer des commandes vouées à l'échec. Deux points de plus : **la provenance et les enregistrements d'exécution sont écrits par le client de bureau** ; un serveur sans écran conserve donc l'historique des fichiers via les snapshots git, mais n'ajoute rien à `provenance.jsonl` ni à l'index des exécutions. ## Construire depuis le code source ```bash git clone https://github.com/ai4s-research/open-science cd open-science pnpm install bash scripts/dev/fetch-opencode.sh bash scripts/dev/fetch-uv.sh bash scripts/dev/fetch-skills.sh # Le client terminal osd est aussi embarqué : il est à nous, donc compilé et non téléchargé. bash scripts/dev/build-osd-sidecar.sh $(rustc -vV | sed -n 's/host: //p') pnpm --filter @ai4s/desktop tauri dev pnpm --filter @ai4s/desktop tauri build ``` Vérifications : ```bash pnpm test pnpm typecheck pnpm lint ``` ## Sécurité et confidentialité Les fichiers du workspace, données brutes, historique, provenance, notebooks et run records restent locaux par défaut. Exécution de commandes, suppression de fichiers, installation de dépendances et connexions distantes passent par une approbation humaine. Les identifiants sont stockés dans la configuration privée de l'app, pas dans le workspace, la provenance, git, les exports ni la configuration OpenCode globale. ## Structure du dépôt | Chemin | Rôle | | --- | --- | | `apps/desktop/` | App desktop Tauri + React. | | `packages/sdk/` | `OpenCodeClient`, couche qui évite les appels directs UI -> OpenCode. | | `packages/shared/` | Types partagés et palette de graphiques. | | `runtime/skills/core/` | Skills scientifiques internes. | | `runtime/skills/external/` | Skills externes récupérés au build. | | `examples/` | Workspaces d'exemple inclus. | | `crates/osd-core/` | Le cœur serveur — workspace, sidecar, passerelle. Sans Tauri, donc utilisable sans écran. | | `crates/osd-cli/` | `osd` : le serveur sans écran et son client. | | `scripts/dev/` | Fetchers sidecar, `uv`, skills et tests ciblés. | | `docs/` | Notes produit, technique, operator, connecteurs et recherche. | ## État Le journal d'implémentation le plus fiable est [`PROGRESS.md`](./PROGRESS.md). Les prochains travaux portent sur la signature de code Windows, l'auto-update, une vérification Windows/Linux plus large, le durcissement des connecteurs et la revue de reproductibilité. Les releases macOS sont déjà signées et notarisées. Pour discuter du projet, rejoignez le [Discord Open Science](https://discord.gg/fWNMDKcd5P). [MIT](./LICENSE). Open Science Desktop est un outil de recherche beta : traitez les sorties comme des brouillons et vérifiez nombres, citations, code et conclusions avant publication ou décision. ## Citation Si vous utilisez Open Science Desktop dans vos recherches, merci de le citer ainsi : ```bibtex @software{open_science_desktop, author = {{The Open Science Desktop Contributors}}, title = {Open Science Desktop: a local-first, model-agnostic AI research workbench}, year = {2026}, version = {0.7.1}, doi = {10.5281/zenodo.23755472}, url = {https://github.com/ai4s-research/open-science}, license = {MIT} } ``` Le bouton **« Cite this repository »** de GitHub (généré depuis [`CITATION.cff`](./CITATION.cff)) fournit la même référence en APA et BibTeX.