Python Module Index

p
 
p
pymatgen
    pymatgen.alchemy
    pymatgen.alchemy.filters
    pymatgen.alchemy.materials
    pymatgen.alchemy.transmuters
    pymatgen.analysis
    pymatgen.analysis.adsorption
    pymatgen.analysis.bond_dissociation
    pymatgen.analysis.bond_valence
    pymatgen.analysis.chemenv
    pymatgen.analysis.chemenv.connectivity
    pymatgen.analysis.chemenv.connectivity.connected_components
    pymatgen.analysis.chemenv.connectivity.connectivity_finder
    pymatgen.analysis.chemenv.connectivity.environment_nodes
    pymatgen.analysis.chemenv.connectivity.structure_connectivity
    pymatgen.analysis.chemenv.coordination_environments
    pymatgen.analysis.chemenv.coordination_environments.chemenv_strategies
    pymatgen.analysis.chemenv.coordination_environments.coordination_geometries
    pymatgen.analysis.chemenv.coordination_environments.coordination_geometries_files
    pymatgen.analysis.chemenv.coordination_environments.coordination_geometry_finder
    pymatgen.analysis.chemenv.coordination_environments.structure_environments
    pymatgen.analysis.chemenv.coordination_environments.voronoi
    pymatgen.analysis.chemenv.utils
    pymatgen.analysis.chemenv.utils.chemenv_config
    pymatgen.analysis.chemenv.utils.chemenv_errors
    pymatgen.analysis.chemenv.utils.coordination_geometry_utils
    pymatgen.analysis.chemenv.utils.defs_utils
    pymatgen.analysis.chemenv.utils.func_utils
    pymatgen.analysis.chemenv.utils.graph_utils
    pymatgen.analysis.chemenv.utils.math_utils
    pymatgen.analysis.chemenv.utils.scripts_utils
    pymatgen.analysis.cost
    pymatgen.analysis.defects
    pymatgen.analysis.defects.core
    pymatgen.analysis.defects.corrections
    pymatgen.analysis.defects.defect_compatibility
    pymatgen.analysis.defects.dilute_solution_model
    pymatgen.analysis.defects.generators
    pymatgen.analysis.defects.thermodynamics
    pymatgen.analysis.defects.utils
    pymatgen.analysis.diffraction
    pymatgen.analysis.diffraction.core
    pymatgen.analysis.diffraction.neutron
    pymatgen.analysis.diffraction.tem
    pymatgen.analysis.diffraction.xrd
    pymatgen.analysis.diffusion_analyzer
    pymatgen.analysis.dimensionality
    pymatgen.analysis.elasticity
    pymatgen.analysis.elasticity.elastic
    pymatgen.analysis.elasticity.strain
    pymatgen.analysis.elasticity.stress
    pymatgen.analysis.energy_models
    pymatgen.analysis.eos
    pymatgen.analysis.ewald
    pymatgen.analysis.excitation
    pymatgen.analysis.ferroelectricity
    pymatgen.analysis.ferroelectricity.polarization
    pymatgen.analysis.find_dimension
    pymatgen.analysis.fragmenter
    pymatgen.analysis.functional_groups
    pymatgen.analysis.gb
    pymatgen.analysis.gb.grain
    pymatgen.analysis.graphs
    pymatgen.analysis.hhi
    pymatgen.analysis.interface
    pymatgen.analysis.interface_reactions
    pymatgen.analysis.local_env
    pymatgen.analysis.magnetism
    pymatgen.analysis.magnetism.analyzer
    pymatgen.analysis.magnetism.heisenberg
    pymatgen.analysis.magnetism.jahnteller
    pymatgen.analysis.molecule_matcher
    pymatgen.analysis.molecule_structure_comparator
    pymatgen.analysis.nmr
    pymatgen.analysis.path_finder
    pymatgen.analysis.phase_diagram
    pymatgen.analysis.piezo
    pymatgen.analysis.piezo_sensitivity
    pymatgen.analysis.pourbaix_diagram
    pymatgen.analysis.prototypes
    pymatgen.analysis.quasiharmonic
    pymatgen.analysis.reaction_calculator
    pymatgen.analysis.solar
    pymatgen.analysis.solar.slme
    pymatgen.analysis.structure_analyzer
    pymatgen.analysis.structure_matcher
    pymatgen.analysis.structure_prediction
    pymatgen.analysis.structure_prediction.dopant_predictor
    pymatgen.analysis.structure_prediction.substitution_probability
    pymatgen.analysis.structure_prediction.substitutor
    pymatgen.analysis.structure_prediction.volume_predictor
    pymatgen.analysis.substrate_analyzer
    pymatgen.analysis.surface_analysis
    pymatgen.analysis.thermochemistry
    pymatgen.analysis.topological
    pymatgen.analysis.topological.spillage
    pymatgen.analysis.transition_state
    pymatgen.analysis.wulff
    pymatgen.analysis.xas
    pymatgen.analysis.xas.spectrum
    pymatgen.apps
    pymatgen.apps.battery
    pymatgen.apps.battery.analyzer
    pymatgen.apps.battery.battery_abc
    pymatgen.apps.battery.conversion_battery
    pymatgen.apps.battery.insertion_battery
    pymatgen.apps.battery.plotter
    pymatgen.apps.borg
    pymatgen.apps.borg.hive
    pymatgen.apps.borg.queen
    pymatgen.cli
    pymatgen.cli.feff_plot_cross_section
    pymatgen.cli.feff_plot_dos
    pymatgen.cli.gaussian_analyzer
    pymatgen.cli.get_environment
    pymatgen.cli.pmg
    pymatgen.cli.pmg_analyze
    pymatgen.cli.pmg_config
    pymatgen.cli.pmg_plot
    pymatgen.cli.pmg_potcar
    pymatgen.cli.pmg_query
    pymatgen.cli.pmg_structure
    pymatgen.command_line
    pymatgen.command_line.bader_caller
    pymatgen.command_line.critic2_caller
    pymatgen.command_line.enumlib_caller
    pymatgen.command_line.gulp_caller
    pymatgen.command_line.mcsqs_caller
    pymatgen.command_line.vampire_caller
    pymatgen.core
    pymatgen.core.bonds
    pymatgen.core.composition
    pymatgen.core.ion
    pymatgen.core.lattice
    pymatgen.core.libxcfunc
    pymatgen.core.molecular_orbitals
    pymatgen.core.operations
    pymatgen.core.periodic_table
    pymatgen.core.sites
    pymatgen.core.spectrum
    pymatgen.core.structure
    pymatgen.core.surface
    pymatgen.core.tensors
    pymatgen.core.trajectory
    pymatgen.core.units
    pymatgen.core.xcfunc
    pymatgen.dao
    pymatgen.electronic_structure
    pymatgen.electronic_structure.bandstructure
    pymatgen.electronic_structure.boltztrap
    pymatgen.electronic_structure.cohp
    pymatgen.electronic_structure.core
    pymatgen.electronic_structure.dos
    pymatgen.electronic_structure.plotter
    pymatgen.entries
    pymatgen.entries.compatibility
    pymatgen.entries.computed_entries
    pymatgen.entries.correction_calculator
    pymatgen.entries.entry_tools
    pymatgen.entries.exp_entries
    pymatgen.ext
    pymatgen.ext.cod
    pymatgen.ext.crystalsai
    pymatgen.ext.jhu
    pymatgen.ext.matproj
    pymatgen.ext.optimade
    pymatgen.io
    pymatgen.io.abinit
    pymatgen.io.abinit.abiinspect
    pymatgen.io.abinit.abiobjects
    pymatgen.io.abinit.abitimer
    pymatgen.io.abinit.inputs
    pymatgen.io.abinit.netcdf
    pymatgen.io.abinit.pseudos
    pymatgen.io.abinit.variable
    pymatgen.io.adf
    pymatgen.io.aiida
    pymatgen.io.ase
    pymatgen.io.atat
    pymatgen.io.babel
    pymatgen.io.cif
    pymatgen.io.cp2k
    pymatgen.io.cp2k.inputs
    pymatgen.io.cp2k.outputs
    pymatgen.io.cp2k.sets
    pymatgen.io.cp2k.utils
    pymatgen.io.cssr
    pymatgen.io.cube
    pymatgen.io.exciting
    pymatgen.io.exciting.inputs
    pymatgen.io.feff
    pymatgen.io.feff.inputs
    pymatgen.io.feff.outputs
    pymatgen.io.feff.sets
    pymatgen.io.fiesta
    pymatgen.io.gaussian
    pymatgen.io.jarvis
    pymatgen.io.lammps
    pymatgen.io.lammps.data
    pymatgen.io.lammps.inputs
    pymatgen.io.lammps.outputs
    pymatgen.io.lammps.utils
    pymatgen.io.lmto
    pymatgen.io.lobster
    pymatgen.io.lobster.inputs
    pymatgen.io.lobster.lobsterenv
    pymatgen.io.lobster.outputs
    pymatgen.io.nwchem
    pymatgen.io.phonopy
    pymatgen.io.prismatic
    pymatgen.io.pwscf
    pymatgen.io.qchem
    pymatgen.io.qchem.inputs
    pymatgen.io.qchem.outputs
    pymatgen.io.qchem.sets
    pymatgen.io.qchem.utils
    pymatgen.io.shengbte
    pymatgen.io.vasp
    pymatgen.io.vasp.help
    pymatgen.io.vasp.inputs
    pymatgen.io.vasp.outputs
    pymatgen.io.vasp.sets
    pymatgen.io.wannier90
    pymatgen.io.xcrysden
    pymatgen.io.xr
    pymatgen.io.xyz
    pymatgen.io.zeopp
    pymatgen.optimization
    pymatgen.optimization.linear_assignment
    pymatgen.optimization.linear_assignment_numpy
    pymatgen.optimization.neighbors
    pymatgen.phonon
    pymatgen.phonon.bandstructure
    pymatgen.phonon.dos
    pymatgen.phonon.ir_spectra
    pymatgen.phonon.plotter
    pymatgen.settings
    pymatgen.symmetry
    pymatgen.symmetry.analyzer
    pymatgen.symmetry.bandstructure
    pymatgen.symmetry.groups
    pymatgen.symmetry.kpath
    pymatgen.symmetry.maggroups
    pymatgen.symmetry.settings
    pymatgen.symmetry.site_symmetries
    pymatgen.symmetry.structure
    pymatgen.transformations
    pymatgen.transformations.advanced_transformations
    pymatgen.transformations.defect_transformations
    pymatgen.transformations.site_transformations
    pymatgen.transformations.standard_transformations
    pymatgen.transformations.transformation_abc
    pymatgen.util
    pymatgen.util.convergence
    pymatgen.util.coord
    pymatgen.util.coord_cython
    pymatgen.util.io_utils
    pymatgen.util.num
    pymatgen.util.plotting
    pymatgen.util.provenance
    pymatgen.util.sequence
    pymatgen.util.serialization
    pymatgen.util.string
    pymatgen.util.testing
    pymatgen.util.typing
    pymatgen.vis
    pymatgen.vis.plotters
    pymatgen.vis.structure_chemview
    pymatgen.vis.structure_vtk